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HBV DNA整合与肝癌关系的研究进展

山东医药 2017年第42期57卷 102-104页

作者：方向邓伟广西医科大学附属肿瘤医院广西壮族自治区肿瘤防治研究所南宁530021

乙型肝炎病毒(HBV)与人基因组整合在肝细胞癌发生和发展过程中发挥关键作用。目前研究表明,HBV包含编码表面(S)、核心(C)、聚合酶(P)和X蛋白的4个开放阅读框(ORF),均可以形成断裂位点整合到人基因组,其整合率从高至低依次是X区、S区、C... 详细信息

乙型肝炎病毒(HBV)与人基因组整合在肝细胞癌发生和发展过程中发挥关键作用。目前研究表明,HBV包含编码表面(S)、核心(C)、聚合酶(P)和X蛋白的4个开放阅读框(ORF),均可以形成断裂位点整合到人基因组,其整合率从高至低依次是X区、S区、C区和P区。HBV在人染色体上的整合位点并非随机分布,而是存在与肝癌相关的潜在优势整合位点,这些优势整合位点附近的基因常常涉及到细胞生长、增殖、分化和永生化。HBV DNA整合入人基因组后,通过影响整合位点周围基因功能、形成具有致癌作用的HBV截短蛋白以及增加人染色体的不稳定性促使肝细胞的癌变。

关键词：乙型肝炎病毒 DNA整合肝细胞癌宿主基因组遗传信息染色体异位碱基缺失

MAPS：基因整合位点高通量测序分析的新方法

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MAPS：基因整合位点高通量测序分析的新方法

作者：丁东浙江大学

学位级别：硕士

基因整合是指外来的DNA分子插入到宿主基因组中的基因突变事件,包括转座子、逆转录病毒、逆转录基因治疗载体等在自然或人工过程中的整合行为。基因整合组从全基因组水平分析整合事件,是病毒致癌机制研究,癌基因整合突变筛选和基因治疗... 详细信息

基因整合是指外来的DNA分子插入到宿主基因组中的基因突变事件,包括转座子、逆转录病毒、逆转录基因治疗载体等在自然或人工过程中的整合行为。基因整合组从全基因组水平分析整合事件,是病毒致癌机制研究,癌基因整合突变筛选和基因治疗载体开发等研究领域重要的遗传学分析手段。目前,基因整合位点主要通过PCR方法分离并经测序鉴定。第二代测序技术的出现简化了整合位点分析的过程。反向PCR,接头PCR,线性扩增PCR等各种翼侧序列扩增技术与高通量的454测序技术结合,为相关领域的研究积累了大量宝贵的整合信息。为了获取更全面的基因整合信息,更新的方法应该达到基因整合组分析的要求。虽然,最新的非限制性线性扩增PCR和Mu噬菌体介导PCR具有分析全基因组整合位点的潜能,但是两者都存在一定的技术难度。本论文开发的大规模锚定平行测序(massive anchored parallel sequencing, MAPS)能够从全基因组水平分离和鉴定整合序列。MAPS利用机械能将DNA片段化,从而避免了酶切引起的整合位点分离偏好并为后期整合位点的识别增加置信。本法改造Illumina的测序接头使之介导整合序列的分离和扩增,并由此结合Illumina双端测序技术用以高通量鉴定整合位点。以乙肝阳性的肝癌组织DNA样品为例,单次多元化测序分析成功地在6对(癌和癌旁)组织样品中鉴定了68个整合位点,而且结果定量地反映了各个整合位点的克隆频率。最后,本文也分析了非限制性和半定量的MAPS方法具有很强的拓展性和移植性。

关键词：整合位点 MAPS 测序技术基因整合转座子基因组分析基因组水平宿主基因组整合序列基因治疗载体

The LTR of endogenous retrovirus ev21 retains promoter activity and exhibits tissue specific transcription in chicken

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Chinese Science Bulletin 2009年第24期54卷 4664-4670页

作者： LU XiaoQing HAN JinRun LIU XiaoFang LIN TongHui LI YuLin HU XiaoXiang LI Ning State Key Laboratory of Agrobiotechnology College of Biological Sciences China Agricultural University Beijing 100193 China College of Animal Science & Technology China Agricultural University Beijing 100193 China

Endogenous viruses integrate into the host genome and influence the expression of neighboring genes through their long terminal repeats (LTRs). In this study, we analyzed the promoter, enhancer and transcriptional activities of the chicken endogenous retrovirus ev21 LTR. The LTR was cloned into pGL3-basic and pGL3-promoter luciferase vectors in forward and reverse orientation separately. The luciferase activities were detected respectively in chicken embryonic fibroblast cell, human embryonic kidney cell line, human lung carcinoma cell line, Chinese hamster ovary cell line, and murine melanoma cell line. Relative luciferase activity analysis indicated that the ev21 LTR retained bi-directional promoter activity but no detectable enhancer activity in these cells. The constructs containing the LTR and F1 region show stronger promoter activity than the constructs containing only LTR. The transcriptional pattern of ev21 LTR varied in tissues of late feathering White Leghorn chicken at post-hatch day one. Skin exhibits the highest expression in the tissues examed. Collectively, our results indicate that the ev21 LTR exhibits tissue-type specific expression in White Leghorn chicken, and it also have regulatory potential.

关键词：内源性逆转录病毒启动子活性白来航鸡组织特异性展品铁胚胎成纤维细胞宿主基因组

分子植物卓越中心等解析植物中独特的双链RNA合成机制

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粮油与饲料科技 2022年第1期 51-52页

转座子(transposon)最早由美国遗传学家Barbara McClintock在玉米中发现,在细菌、病毒以及真核生物的基因组中广泛分布。转座子类似内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的DNA,以达到其自我“繁殖”的目的。活跃的转座子对... 详细信息

转座子(transposon)最早由美国遗传学家Barbara McClintock在玉米中发现,在细菌、病毒以及真核生物的基因组中广泛分布。转座子类似内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的DNA,以达到其自我“繁殖”的目的。活跃的转座子对基因组的稳定构成严重威胁,高等生物通过对转座子DNA进行甲基化修饰将其沉默来维持基因组的稳定性。

关键词：内源性病毒遗传学家合成机制高等生物甲基化修饰宿主基因组转座子双链RNA

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Rep蛋白介导的定点整合研究进展

国外医学（遗传学分册） 2004年第6期27卷 334-337页

作者：冯登敏朱焕章薛京伦复旦大学遗传所上海200433

建立安全可靠的、治疗基因能长期表达的系统是基因治疗的重要目标,这一目标可以通过促进目的DNA序列定点整合至宿主基因组的特定位置而达到。腺相关病毒的非结构蛋白Rep与顺式元件联合运用可以介导外源基因定点整合至人类基因组19号染色... 详细信息

建立安全可靠的、治疗基因能长期表达的系统是基因治疗的重要目标,这一目标可以通过促进目的DNA序列定点整合至宿主基因组的特定位置而达到。腺相关病毒的非结构蛋白Rep与顺式元件联合运用可以介导外源基因定点整合至人类基因组19号染色体AAVS1位点,本文就Rep蛋白的特性、介导整合机制及近年来在介导定点整合方面的研究作一综述。

关键词：介导非结构蛋白合方腺相关病毒联合基因治疗表达宿主基因组人类基因组 DNA序列

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逆转录病毒将首先试用于人基因疗法

国外医学情报 1985年第3期 44-44页

作者：林漓

在目前进行基因治疗的研究中,有可能选择逆转录病毒首先用于人体,就是将克隆的基因输送至骨髓细胞内。对于一些由于骨髓细胞缺乏某种基因,不能产生某种特异性酶的疾病将开展研究。在每种疾病中,酶的产生并不需要过细地调节;在任何水平... 详细信息

在目前进行基因治疗的研究中,有可能选择逆转录病毒首先用于人体,就是将克隆的基因输送至骨髓细胞内。对于一些由于骨髓细胞缺乏某种基因,不能产生某种特异性酶的疾病将开展研究。在每种疾病中,酶的产生并不需要过细地调节;在任何水平下如能保持稳定的产生,都能改善病人的状况。最有可能选作治疗用的三种酶是次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶、嘌呤核苷酸磷酸化酶和腺苷脱氨酶。缺乏上述第一种酶可导致Lesch-Nyhan综合征,缺乏其余任何一种酶均可引起严重的免疫缺损病。基因的传送有两个步骤。首先,将克隆的基因放入在培养中生长的有核的骨髓干细胞群中,然后将这些细胞移入病人骨髓中增殖,最

关键词：逆转录病毒磷酸化酶免疫缺损干细胞群特异性酶辅助病毒细胞缺乏嘌呤核苷酸启动子宿主基因组

慢性乙型肝炎患者抗病毒及时治、规范治疗的重要性

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肝博士 2020年第5期 28-29页

作者：郑蝶灵鲁晓擘新疆医科大学第一附属医院

慢性乙型活动性肝炎的患者若得不到及时有效的抗病毒治疗,则会进展为肝功能衰竭、肝硬化和肝细胞癌(HCC)。我国肝硬化和肝细胞癌患者中,由HBV感染引起者分别占60%和80%。由于HBV DNA可整合到宿主基因组之故,使得乙型肝炎病毒很难从患者... 详细信息

慢性乙型活动性肝炎的患者若得不到及时有效的抗病毒治疗,则会进展为肝功能衰竭、肝硬化和肝细胞癌(HCC)。我国肝硬化和肝细胞癌患者中,由HBV感染引起者分别占60%和80%。由于HBV DNA可整合到宿主基因组之故,使得乙型肝炎病毒很难从患者体内被完全清除。

关键词：肝细胞癌患者乙型肝炎病毒 HBV感染肝功能衰竭规范治疗慢性乙型肝炎患者抗病毒治疗宿主基因组

人乳头瘤病毒L1对预测宫颈癌发展过程的研究进展

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中国医师进修杂志 2012年第30期35卷 73-74页

作者：宋丹石琨哈尔滨医科大学附属第二医院妇产科一病房 150086

在全球妇女癌症病死率中，宫颈癌列居第二位。大多数宫颈低度鳞状上皮内瘤变（LSIL）和部分高度鳞状上皮内瘤变（HSIL）会自然消退，仅仅有少数会进展到癌。现行的宫颈癌筛查方法有很多，因此使浸润癌的病死率大大下降，但与此同时也导... 详细信息

在全球妇女癌症病死率中，宫颈癌列居第二位。大多数宫颈低度鳞状上皮内瘤变（LSIL）和部分高度鳞状上皮内瘤变（HSIL）会自然消退，仅仅有少数会进展到癌。现行的宫颈癌筛查方法有很多，因此使浸润癌的病死率大大下降，但与此同时也导致了一些宫颈癌前病变的过度治疗。目前研究结果表明，宫颈癌前病变进展到宫颈癌的主要原因是人乳头瘤病毒（HPV）的持续感染嘲。高危型HPV感染直至肿瘤的发生是一个缓慢的过程，其中HPVDNA与宿主基因组的整合是宫颈癌发生及进展的一个重要的标志田。

关键词：预测宫颈癌人乳头瘤病毒宫颈癌前病变上皮内瘤变 HPVDNA HPV感染宫颈癌发生宿主基因组

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遗传性疾病的产前诊断和基因治疗(上)

实用临床医药杂志 1997年第4期6卷 306-307页

作者：杨邦杰于家华扬州大学医学院扬州225001