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威宁绵羊和贵州半细毛羊STAT5b基因部分外显子SNP研究

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基因组学与应用生物学 2015年第5期34卷 938-944页

作者：王振申小云盘道兴谢海强孙岩岩刘若余贵州大学动物科学学院贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省扶贫办公室外资项目管理中心贵阳550004 西南科技大学生命科学院绵阳621010

为给贵州本地绵羊选种选育提供更好的科学依据,本试验利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计4对引物扩增其STAT5b基因部分外显子及内含子序列。PCR产物经纯化后进行双向测序。利用DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息... 详细信息

为给贵州本地绵羊选种选育提供更好的科学依据,本试验利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计4对引物扩增其STAT5b基因部分外显子及内含子序列。PCR产物经纯化后进行双向测序。利用DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5b基因RNA二级结构、STAT5b蛋白二级及三级结构的影响。结果表明,在扩增的STAT5b基因中筛选到6个SNPs:exon5-G12A、exon8-G56A、exon8-C104T、intron2-A3164C、intron4-C1026T和intron5-T3323C,其中exon8-G56A为错义突变,导致编码的谷氨酸(Glu)变为赖氨酸(Lys);exon5-G12A和exon8-C104T多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变;intron2-A3164C、intron4-C1026T和intron5-T3323C均在内含子区,不参与氨基酸编码。

关键词： STAT5b SNPs 贵州半细毛羊威宁绵羊

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威宁绵羊GHR基因克隆及组织表达

基因组学与应用生物学 2019年第1期38卷 1-6页

作者：吴雪易鸣程朝友付正仙杨德文程均华王振王金洲刘若余贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 威宁县畜禽品种改良站威宁553100 威宁县畜牧产业局威宁553100

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊GHR基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析,此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对GHR基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、... 详细信息

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊GHR基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析,此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对GHR基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及背最长肌6个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究,结果显示:威宁绵羊GHR基因CDS区序列长度为1 905 bp,发现2个SNP位点。GHR基因在威宁绵羊各组织均有不同程度的表达,在不同性别、不同生长阶段相同组织中的表达具有一定的显著性差异。

关键词：威宁绵羊 GHR基因克隆组织表达

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威宁绵羊GHR基因多态性分析

基因组学与应用生物学 2016年第8期35卷 2027-2031页

作者：王振申小云王金洲盘道兴熊勇刘若余贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省扶贫办公室外资项目管理中心.贵阳550004 西南科技大学生命科学院绵阳621010

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种,本试验利用威宁绵羊构建DNA池,设计8对引物扩增威宁绵羊GHR基因外显子及部分内含子序列。将PCR产物纯化并进行双向测序,通过DNAStar和BLAST等生物软件分析确定SNP位点。利用生物信息... 详细信息

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种,本试验利用威宁绵羊构建DNA池,设计8对引物扩增威宁绵羊GHR基因外显子及部分内含子序列。将PCR产物纯化并进行双向测序,通过DNAStar和BLAST等生物软件分析确定SNP位点。利用生物信息学软件分析SNPs对GHR基因的m RNA二级结构的影响、生长激素受体二级和三级结构的改变。结果表明,在扩增的GHR基因中筛选到4个SNPs:Exon1-C^(112)T、Exon4-C^7T、Exon8-A^(27)T、Intron4-C^(27)T,其中Exon8-A^(27)T为错义突变,导致编码的异亮氨酸(Ile)变为苯丙氨酸(Phe);Exon1-C^(112)T和Exon4-C^7T位点对其编码的氨基酸没有影响,是同义突变;Intron4-C^(27)T在内含子区,不参与氨基酸编码。本研究将为更好地保护和开发利用威宁绵羊提供一些参考。

关键词： GHR基因 SNPs 威宁绵羊

威宁绵羊SOCS7和GFAP基因组织表达研究

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中国畜牧兽医 2019年第7期46卷 1899-1906页

作者：张继易鸣程朝友程均华付正仙杨德文吴雪邱淦远刘若余贵州大学动物科学学院贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 威宁县畜禽品种改良站威宁553100 威宁县畜牧产业局威宁553100

试验旨在检测细胞因子信号传导抑制蛋白7(suppressor of cytokine signaling 7,SOCS7)和胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP)基因在威宁绵羊不同组织中的表达水平。以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公、母羊为研究... 详细信息

试验旨在检测细胞因子信号传导抑制蛋白7(suppressor of cytokine signaling 7,SOCS7)和胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP)基因在威宁绵羊不同组织中的表达水平。以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公、母羊为研究对象,采用实时荧光定量PCR测定威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及脑6个组织中SOCS7和GFAP基因的相对表达量,从mRNA水平上的探究两个基因之间的表达规律。结果显示,SOCS7基因在威宁绵羊不同组织中均有不同程度的表达,其中脾脏中相对表达量最高,其次是肺脏、肾脏、心脏、肝脏和脑组织,随着威宁绵羊年龄的增大,SOCS7基因在组织中的相对表达量呈现小幅度上升的趋势;GFAP基因在威宁绵羊脑组织中相对表达量最高,其余组织中表达量较低,随着年龄增长总体呈现下降趋势。从性别差异来看,威宁绵羊SOCS7基因相对表达量母羊普遍高于公羊,而GFAP基因则是公羊普遍高于母羊,推测SOCS7基因很有可能负向调控GFAP基因的表达。

关键词：威宁绵羊 SOCS7基因 GFAP基因实时荧光定量PCR 组织表达

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小尾寒羊与威宁绵羊杂交利用研究

畜牧业环境 2023年第19期 10-11页

作者：杨雪龚婷婷毕节市畜牧兽医科学研究所贵州毕节551700

小尾寒羊是我国优良的肉用绵羊品种,具有耐粗饲、抗病、适应性强、耐粗饲、肉质好等特点,尤其是在我国北方寒冷地区,具有较好的适应性和良好的肉品质。小尾寒羊是以本地大尾寒羊为母本,与德国杜泊肉用绵羊和德伯里兹肉用绵羊进行杂交而... 详细信息

小尾寒羊是我国优良的肉用绵羊品种,具有耐粗饲、抗病、适应性强、耐粗饲、肉质好等特点,尤其是在我国北方寒冷地区,具有较好的适应性和良好的肉品质。小尾寒羊是以本地大尾寒羊为母本,与德国杜泊肉用绵羊和德伯里兹肉用绵羊进行杂交而获得的肉用绵羊品种,具有繁殖率高、产羔率高、肉质好等特点。小尾寒羊是我国最早推广的优良肉用绵羊品种之一,目前在全国各地均有分布,是我国重要的肉用绵羊品种资源。本文介绍了小尾寒羊的生物学特性、饲养管理要点以及杂交利用技术,以期为广大养殖户提供参考。

关键词：小尾寒羊饲养管理威宁绵羊杂交

威宁绵羊体尺体重和肉用性能测定及其相关分析

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黑龙江畜牧兽医 2018年第2期 63-64页

作者：易鸣刘章忠程朝友杨德文程均华付正仙苏结富威宁县畜禽品种改良站毕节市畜禽遗传资源管理站威宁县畜牧产业局

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种资源,项目组成员采用现场测定方法对威宁绵羊体尺体重及肉用性能进行测定,并进行相关分析。结果表明:威宁绵羊育成羊体重、胸深、胸宽的变异系数较大,特别是体重的变异系数高达33.04%... 详细信息

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种资源,项目组成员采用现场测定方法对威宁绵羊体尺体重及肉用性能进行测定,并进行相关分析。结果表明:威宁绵羊育成羊体重、胸深、胸宽的变异系数较大,特别是体重的变异系数高达33.04%;体重与体长和胸深相关性显著(P威宁绵羊育成羊的选择潜力较大,可以通过选择体长和胸深较大的羊来选择体重,减少测定指标,通过选择体重大的羊可提高胴体重。

关键词：威宁绵羊体尺体重肉用性能相关分析

威宁绵羊GH基因cDNA克隆及组织表达研究

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黑龙江畜牧兽医 2018年第17期 86-88页

作者：王金洲易鸣程朝友付正仙杨德文程均华王振吴雪刘若余贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 威宁县畜禽品种改良站贵州威宁553100 威宁县畜牧产业局贵州威宁553100

为了保护威宁绵羊品种,为威宁绵羊生长激素（GH）基因原核表达、组织表达谱构建提供基础资料,试验对6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊GH基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析;同时采用实时荧光定量PCR方法对GH基因在威宁绵... 详细信息

为了保护威宁绵羊品种,为威宁绵羊生长激素（GH）基因原核表达、组织表达谱构建提供基础资料,试验对6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊GH基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析;同时采用实时荧光定量PCR方法对GH基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及背最长肌6个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究。结果表明：威宁绵羊GH基因CDS区序列长度为754 bp,发现2个SNP位点;GH基因在威宁绵羊不同组织中均有不同程度的表达,但不同性别和不同生长阶段的表达有一定的差异,随着威宁绵羊年龄的增大,其GH基因在部分组织器官中的相对表达量呈现小幅度下降的趋势。

关键词：威宁绵羊 qPCR GH基因克隆组织表达

威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7、GFAP基因克隆、组织表达及可变剪接体分析

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威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7、GFAP基因克隆、组织表达及可变剪...

作者：王金洲贵州大学

学位级别：硕士

本试验以6月龄、1周岁和两周岁的威宁绵羊和贵州半细毛羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊和贵州半细毛羊JAK/STAT信号转导通路相关基因(SOCS7和GFAP)编码区序列进行克隆,并进行生物信息学性分析。此外,本试验同时采用实时荧光... 详细信息

本试验以6月龄、1周岁和两周岁的威宁绵羊和贵州半细毛羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊和贵州半细毛羊JAK/STAT信号转导通路相关基因(SOCS7和GFAP)编码区序列进行克隆,并进行生物信息学性分析。此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对SOCS7和GFAP两个基因在威宁绵羊和贵州半细毛羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠及脑组织7个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究,以期得到SOCS7和GFAP两个基因在威宁绵羊和贵州半细毛羊各组织内的表达规律。试验的主要研究结果如下:(1)本试验成功克隆得到威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因的CDS区全序列,并发现了的两种不同的可变剪接体,分别命名为SOCS7-V1和SOCS7-V2,进一步对序列进行比对发现两种可变剪接体CDS区长度的不同是由于发生剪接时绵羊SOCS7基因第五外显子和部分第六外显子是否保留所引起的。SOCS7-V1基因CDS区长度为1827bp,编码609个氨基酸,SOCS7-V2基因CDS区长度为1662bp,共编码554个氨基酸,SOCS7-V2相比于SOCS7-V1缺少165bp碱基对,55个氨基酸。通过进一步分析发现,不同的可变剪接体引起了最终翻译出蛋白质的等电点、分子质量、二级结构、三级结构的改变。(2)本试验成功克隆得到威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因的CDS区全序列,威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因CDS区序列长度为1407bp,共编码469个氨基酸。(3)通过对威宁绵羊和贵州半细毛羊的SOCS7基因两种可变剪接体在mRNA水平上的表达规律的探索发现,SOCS7基因两种可变剪接体在威宁绵羊及贵州半细毛羊中均有不同程度的表达,其中SOCS7基因两种可变剪接体在威宁绵羊和贵州半细毛羊中表达量总体规律几乎一致,即在脾脏内相对表达量最高,其次是肺脏、肾脏、心脏、肝脏和脑组织等组织,威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因在不同性别、不同生长阶段相同组织中的表达具有一定的显著性差异,并且随着威宁绵羊和贵州半细毛羊年龄的增大,其SOCS7基因可变剪接体在组织中的相对表达量呈现小幅度上升的趋势。威宁绵羊和贵州半细毛羊公羊在脾脏、心脏、肺脏、肝脏和脑组织五个组织中SOCS7基因表达量都略低于母羊。(4)通过对威宁绵羊和贵州半细毛羊的GFAP基因在mRNA水平上的表达规律的探索发现,GFAP基因在威宁绵羊及贵州半细毛羊中均有不同程度的表达,但是威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因仅在脑组织中相对表达量最高,其余组织中表达量极低。

关键词：威宁绵羊贵州半细毛羊 SOCS7基因 GFAP基因基因克隆可变剪接体组织表达

威宁绵羊GH、GHR、JAK2基因克隆、组织表达及可变剪接体分析

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威宁绵羊GH、GHR、JAK2基因克隆、组织表达及可变剪接体分析

作者：王振贵州大学

学位级别：硕士

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊JAK/STAT信号转导通路相关基因(GH、GHR和JAK2)编码区序列进行克隆,并进行生物信息学性分析。此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对GH、GHR和JAK... 详细信息

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊JAK/STAT信号转导通路相关基因(GH、GHR和JAK2)编码区序列进行克隆,并进行生物信息学性分析。此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对GH、GHR和JAK2三个基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及背最长肌6个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究,以期得到GH、GHR和JAK2三个基因在威宁绵羊各组织内的表达规律。试验的主要研究结果如下:(1)本试验成功克隆得到威宁绵羊GH和GHR两个基因的CDS区全序列,威宁绵羊GH基因和GHR基因CDS区序列长度分别为654bp和1905bp,分别编码217和634个氨基酸,并且克隆得到的威宁绵羊GHR基因CDS区序列和NCBI登录的一条绵羊的GHR基因CDS区序列(1839bp)长度不同,进一步对序列进行比对发现长度的不同是由于发生剪接时绵羊GHR基因第三外显子(66bp)保留与否引起。(2)将威宁绵羊GH和GHR两个基因通过混合DNA池测序对比,在威宁绵羊GH基因中发现G135C、G646C处发生单核苷酸突变,都为错义突变,分别导致氨基酸由Gln(谷氨酰胺)变为His(组氨酸)、Pro(脯氨酸)变为Ala(丙氨酸);在威宁绵羊GHR基因中发现T60C、A837T处发生单核苷酸突变,其中T60C为同义突变,对编码氨基酸无影响;A837T为错义突变,导致氨基酸由Phe(苯丙氨酸)变为Leu(亮氨酸)。进一步生物信息学分析可知,单核苷酸突变可能会导致威宁绵羊生长激素和生长激素受体的蛋白质二级结构和三级结构发生变化。(3)通过GH、GHR和JAK2三个基因在mRNA水平上的表达规律的探索发现,GH、GHR和JAK2三个基因在威宁绵羊中均有不同程度的表达,其中威宁绵羊GH基因在脾脏中相对表达量最高,其次是肺脏、肾脏、肝脏、背最长肌和心脏等组织,威宁绵羊GH基因在不同性别、不同生长阶段相同组织中的表达具有一定的显著性差异,并且随着威宁绵羊年龄的增大,其GH基因在组织中的相对表达量呈现小幅度下降的趋势。威宁绵羊GHR基因在背最长肌中相对表达量最高,其次是肝脏、心脏、肾脏、肺脏和脾脏等组织。威宁绵羊公羊在心脏、肺脏、肝脏和背最长肌三个组织中GHR基因表达量都略高于母羊,在脾脏中相对表达量低于母羊。威宁绵羊GHR基因在不同生长阶段相同组织中的表达具有一定的差异,随着威宁绵羊年龄的增长并没有呈现明显规律。威宁绵羊JAK2基因在肝脏中相对表达量最高,其次为背最长肌,心脏中最低,威宁绵羊公羊在心肝脏、脾脏和肾脏三个组织中JAK2基因表达量都略高于母羊,在背最长肌中相对表达量低于母羊,但是不同生长阶段威宁绵羊JAK2基因相对表达量没有明显规律,这可能和基因的功能和个体差异有关。

关键词：威宁绵羊 JAK/STAT信号通路克隆可变剪接体组织表达