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“人的本质就是一条鱼”--记中国科学院院士舒德干

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西部大开发 2022年第5期310卷 134-137页

作者：王遂社黄明不详

如果用一句话形容舒德干的科研事业,那就是:冷门研究爆出了一颗颗充盈着生命温度的“热炸弹”中国学者在中国土地上发现的“云南虫”“华夏鳗”“西大动物”“昆明鱼”“海口鱼”“长江海鞘”等一系列具有原始生命性状的半索动物、头索... 详细信息

如果用一句话形容舒德干的科研事业,那就是:冷门研究爆出了一颗颗充盈着生命温度的“热炸弹”中国学者在中国土地上发现的“云南虫”“华夏鳗”“西大动物”“昆明鱼”“海口鱼”“长江海鞘”等一系列具有原始生命性状的半索动物、头索动物、脊椎动物、尾索动物早期生命化石,首次勾勒出脊椎动物实证起源演化的基本轮廓,在基础科学的研究中取得了世界一流的成果,留下了中国人的名字。

关键词：科研事业中国科学院院士云南虫舒德干半索动物生命温度头索动物原始生命

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动物

生物进化 2022年第3期 16-20页

皱囊虫退出后口动物行列后口动物包括棘皮动物(海百合、海星、海胆等)、半索动物(肠鳃类和羽鳃类等)、头索动物(文昌鱼等)、尾索动物(海鞘等)和脊椎动物(鱼、青蛙、鳄鱼、恐龙、鸟、老虎、熊猫和人类等)。皱囊虫生活于5.35亿年前,产自... 详细信息

皱囊虫退出后口动物行列后口动物包括棘皮动物(海百合、海星、海胆等)、半索动物(肠鳃类和羽鳃类等)、头索动物(文昌鱼等)、尾索动物(海鞘等)和脊椎动物(鱼、青蛙、鳄鱼、恐龙、鸟、老虎、熊猫和人类等)。皱囊虫生活于5.35亿年前,产自陕南西乡县张家沟剖面寒武系幸运阶宽川铺组的含磷灰岩中。

关键词：半索动物头索动物后口动物棘皮动物西乡县张家沟

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白氏文昌鱼单个体基因组BAC文库的构建

遗传 2010年第1期32卷 67-72页

作者：张巨永黄盛丰王蔚徐安龙王义权厦门大学生命科学学院厦门361005 中山大学生命科学学院广州510275 国家海洋局海洋研究三所厦门361003

隶属于头索动物亚门的文昌鱼是现存生物中最近似于脊椎动物亚门直接祖先的一个类群,具有重要的进化地位,是研究脊椎动物原始祖先的重要材料和模式动物。随着文昌鱼实验室连续繁殖的成功,全基因组测序成为中国文昌鱼模式化急需完成的工... 详细信息

隶属于头索动物亚门的文昌鱼是现存生物中最近似于脊椎动物亚门直接祖先的一个类群,具有重要的进化地位,是研究脊椎动物原始祖先的重要材料和模式动物。随着文昌鱼实验室连续繁殖的成功,全基因组测序成为中国文昌鱼模式化急需完成的工作之一。文章从单条雄性白氏文昌鱼精巢组织中提取高质量的基因组DNA,经EcoRⅠ限制性内切酶和EcoRⅠ甲基化酶酶切,脉冲场电泳选择合适酶切DNA片段,连接线性磷酸化的载体pCC1BAC,转化大肠杆菌EPI300 E.coli,构建了含有44706个克隆的全基因组BAC(Bacterial artificial chromosome)文库,该文库平均插入片段80kb,具有9倍的基因组覆盖率,基本能够满足功能基因等研究需要,为中国文昌鱼全基因组测序打下基础。

关键词：头索动物白氏文昌鱼基因组文库 BAC文库

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最原始脊椎动物是它! 001

最原始脊椎动物是它!

中国科学报

作者：沈春蕾

虽然有点不可思议，但此前的研究已经证实，生命的演化是从水生动物到两栖动物，再到陆生动物，最后出现了人类。在生命的演化历程中，人类所属谱系——脊椎动物的演化是最为壮丽的篇章之一，有关脊椎动物起源的问题始终是最吸引人的... 详细信息

虽然有点不可思议，但此前的研究已经证实，生命的演化是从水生动物到两栖动物，再到陆生动物，最后出现了人类。在生命的演化历程中，人类所属谱系——脊椎动物的演化是最为壮丽的篇章之一，有关脊椎动物起源的问题始终是最吸引人的科学热点。 20世纪90年代，中科院南京地?

关键词：脊椎动物头索动物分类位置文昌鱼云南虫帽天山

来源： cnki报纸评论

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文昌鱼实验室饲养与繁殖

海洋科学 2014年第1期38卷 107-113页

作者：张劲松王昌留张月圆张晓燕鲁东大学教育科学学院山东烟台264025 鲁东大学生命科学学院山东烟台264025

文昌鱼（amphioxas或lancelet）属于脊索动物门（Chordata）、头索动物亚门（Subphylum Cephalochordata）、文昌鱼纲（Amphioxi）、文昌鱼目（Amphioxiforms）、文昌鱼科（Amphioxidae），有2属或3属（有争议），它们是鳃口文昌鱼属（B... 详细信息

关键词：文昌鱼科实验室饲养繁殖脊索动物门头索动物鱼纲鳃

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文昌鱼PAO基因的鉴定、表达和功能研究

文昌鱼PAO基因的鉴定、表达和功能研究

作者：刘宝宝中国海洋大学

学位级别：硕士

多胺氧化酶（Polyamine oxidase, PAO）是单体的可溶性蛋白，FAD分子作为辅酶与PAO蛋白非共价结合,可以催化多胺和乙酰多胺的的氧化。因为多胺是细胞生长和分化的基础调节者，它们的体内平衡对细胞生命是非常重要的。酵母菌的多胺氧化酶... 详细信息

多胺氧化酶（Polyamine oxidase, PAO）是单体的可溶性蛋白，FAD分子作为辅酶与PAO蛋白非共价结合,可以催化多胺和乙酰多胺的的氧化。因为多胺是细胞生长和分化的基础调节者，它们的体内平衡对细胞生命是非常重要的。酵母菌的多胺氧化酶（PAO）可以氧化精胺（Spermine，Spm）、N1-乙酰精胺（N1-acetylSpm）和N1-乙酰亚精胺（N1-acetylSpd）。在脊椎动物里，存在两种不同的酶，即精胺氧化酶（Spermine oxidase，SMO）和乙酰多胺氧化酶（N1-acetylpolyamine oxidase，APAO），可以特异性地分别催化精胺和N-乙酰精胺以及N-乙酰亚精胺的氧化。目前，在非脊椎动物中没有关于PAO功能的研究，所以现在急需非脊椎动物PAO结构和功能研究。头索动物文昌鱼，是介于脊椎动物与无脊椎动物之间的一个过渡物种，一直以来被认为是脊椎动物的祖先，也是研究脊椎动物起源和进化的重要模式生物。本文首次克隆得到了青岛文昌鱼（Branchiostoma japonicum）的PAO基因（Bjpao），并对其进行了相关生物信息学分析和功能研究。首先，对PAO进行了克隆、生物信息学分析和组织表达研究。我们克隆得到了长度为1428bp的BjPAO开放性阅读框架（ORF）的序列，可编码长度为475个氨基酸的蛋白质（BjPAO），分子量约为52.0kDa。该蛋白质包含一个FAD结合结构域和一个多胺氧化酶多结构域，具有已知物种SMO、APAO和PAO基因的保守活性位点Trp62、His64、Lys301、Tyr412和Thr460，是典型的PAO家族成员。随后，我们利用实时荧光定量PCR技术检测了Bjpao在各组织中的表达情况。Bjpao在脊索中的表达量最高，其次是精巢和卵巢，在后肠和肌肉中的表达量最低，表现出组织特异性。其次，研究了BjPAO的生理功能。我们将文昌鱼Bjpao基因插入到原核表达载体pET-28a中，然后将构建好的表达载体转化进入大肠杆菌中进行体外大量诱导表达，随后对表达得到的蛋白进行纯化和复性。对纯化复性后的蛋白的底物特异性及酶活进行了检测。结果显示rBjPAO可以高效氧化精胺和亚精胺，而在氧化N1-乙酰精胺时，效率很低。此外，我们还分析测定了rBjPAO的Km和Vmax值。最后，我们使用定点突变的方法，研究了rBjPAO的活性位点。我们将rBjPAO中第64位的氨基酸H、第301位的氨基酸K和第460位的氨基酸T进行了突变，并构建了rBjPAO/H64Q、rBjPAO/H64E、rBjPAO/K301M、rBjPAO/T460Y和rBjPAO/T460S五个突变体。对突变体的酶活性进行了检测。发现酶活均有不同程度的降低，表明H64、K301和T460三个氨基酸对rBjPAO的酶活性是必不可少的。

关键词：头索动物文昌鱼多胺氧化酶底物特异性酶活性

《中国海洋湖沼学报》(英文版,SCI-E收录)Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2011年第3期论文导读

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海洋科学 2011年第4期35卷 107-109页

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文昌鱼TLP基因的鉴定、表达和功能研究

文昌鱼TLP基因的鉴定、表达和功能研究

作者：李兆河中国海洋大学

学位级别：硕士

甲状腺素运载蛋白（Transthyretin）是人体中转运甲状腺素的重要蛋白，可与甲状腺素结合并将其转运至靶组织。Transthyretin（TTR）仅在脊椎动物中被鉴定。在探索TTR起源的过程中，发现了它的同系物TTR-likeProtein（TLP）的存在。TLP与... 详细信息

甲状腺素运载蛋白（Transthyretin）是人体中转运甲状腺素的重要蛋白，可与甲状腺素结合并将其转运至靶组织。Transthyretin（TTR）仅在脊椎动物中被鉴定。在探索TTR起源的过程中，发现了它的同系物TTR-likeProtein（TLP）的存在。TLP与TTR具有很高的结构相似性，可以形成同源四聚体，它存在于包括细菌、真菌、植物、无脊椎动物和脊椎动物在内的各类生物中。TLP是嘌呤代谢过程中的一种水解酶，可水解5-羟基异尿酸（5-HIU）。文昌鱼是现存的与脊椎动物原始祖先最接近的头索动物，一直被认为是研究脊椎动物起源和进化的模式动物。但是迄今对文昌鱼中TLP的了解甚少。本文首次克隆得到了青岛文昌鱼（Branchiostomajaponicum）TLP基因（Bjtlp），并对其结构、进化、表达和功能进行了研究。首先，对TLP进行了克隆、进化分析与组织表达研究。我们克隆得到了长度为757bp的Bjtlp全长cDNA序列，它包含一个480bp的开放阅读框，可编码长度为159个氨基酸的蛋白质（BjTLP），分子量约为17.9kDa。该蛋白质包含一个完整的TLP-HIUase结构域，C-端具有TLP家族共有的特征四肽Tyr-Arg-Gly-Ser，是典型的TLP家族成员。Bjtlp内含子外显子结构及系统进化分析发现，脊椎动物TTR可能是由TLP经过基因倍增进化而来的。随后，我们利用实时定量PCR技术检测Bjtlp在各组织的表达情况。Bjtlp在肝盲囊和后肠的表达量最高，鳃、精巢和卵巢的表达量相对较低，而在肌肉和脊索中仅有微量表达，表现为组织特异性。其次，研究了BjTLP的生理功能。我们构建了原核表达载体，转入E.Coli中大量诱导表达。将重组蛋白rBjTLP进行纯化复性后，对其5-HIU水解酶活性进行了检测，结果显示rBjTLP可水解5-HIU。此外，使用荧光淬灭的方法检测了rBjTLP与甲状腺素结合活性，发现甲状腺素不可以与rBjTLP结合。最后，我们使用定点突变的方法，研究了rBjTLP的活性位点及其TLP与TTR的进化机制。分别将rBjTLP的第93位的精氨酸（R）和116酪氨酸（Y）突变为人TTR对应位置的谷氨酸（E）和苏氨酸（T），并构建rBjTLP/R93E、rBjTLP/Y156T和rBjTLP/R93E-Y156T三个突变体。对突变体的酶活性进行了检测，发现rBjTLP/Y156T的酶活性降低了97%，rBjTLP/R93E和rBjTLP/R93E-Y156T两个突变体的酶活性几乎完全丧失，表明R93和Y156两个氨基酸对rBjTLP的酶活性是必不可少的。此外，测定了三个突变体与甲状腺素的结合活性，发现rBjTLP/R93E不能与甲状腺素结合，rBjTLP/Y156T具有了一定的结合甲状腺素的能力，双突变rBjTLP/R93E-Y156T与甲状腺素的结合能力有所加强。这一实验结果表明，Y156T突变对于rBjTLP转变为可转运甲状腺素的新蛋白是极为重要的，此后的一些氨基酸的转变可以使它与配体的结合更稳定。

关键词：头索动物文昌鱼 TLP蛋白 5-羟基异尿酸水解酶活性甲状腺素结合活性

《动物学研究》近年发表文章在2008年中被引频次最高的前43篇文章题录

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Zoological Research 2010年第1期31卷 26-26,49页