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天祝白牦牛ADIPOQ基因的克隆及生物信息学分析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第13期 105-110+115页

作者：若周么石斌刚王向彦祁有鹏胡江玛沁县大武镇农牧业技术服务站甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室

脂联素(ADIPOQ)是一种主要由脂肪组织分泌的内源性细胞因子，在调节脂类代谢中发挥重要作用，该基因通过调控脂质代谢影响动物机体脂肪沉积。为探讨ADIPOQ基因编码蛋白序列特征及组织表达模式，试验对天祝白牦牛ADIPOQ基因编码序列(CDS... 详细信息

脂联素(ADIPOQ)是一种主要由脂肪组织分泌的内源性细胞因子，在调节脂类代谢中发挥重要作用，该基因通过调控脂质代谢影响动物机体脂肪沉积。为探讨ADIPOQ基因编码蛋白序列特征及组织表达模式，试验对天祝白牦牛ADIPOQ基因编码序列(CDS)进行克隆测序，获得天祝白牦牛ADIPOQ基因CDS区，利用生物信息学软件预测天祝白牦牛ADIPOQ基因及其编码氨基酸序列特征。结果表明：天祝白牦牛ADIPOQ基因CDS区全长723 bp,编码240个氨基酸，其中甘氨酸含量(14.17%)最高，具有亲水性，蛋白质二级结构和三级结构以无规则卷曲和延伸链为主。ADIPOQ基因编码蛋白具有一个信号肽，无跨膜结构，属于分泌蛋白，其可能与ADIPOR1、ADIPORZ、RETN、PLIN1和LEP等10个蛋白质存在相互作用，与山羊的氨基酸序列相似性为91.6%,与绵羊、山羊亲缘关系最近，具有一定的保守性。说明试验成功克隆了天祝白牦牛ADIPOQ基因的CDS区，ADIPOQ基因可能在脂肪沉积过程中发挥重要作用。

关键词：天祝白牦牛 ADIPOQ基因克隆 CDS区生物信息学分析

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天祝白牦牛全线粒体基因组母系遗传多样性

青海大学学报 2024年第2期42卷 28-34页

作者：曹萍徐宇辉刘瑞林陈生梅李瑞哲薛斌马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016

为从基因组水平上揭示天祝白牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和母系遗传背景,本研究利用基因组重测序技术,测定42头天祝白牦牛的全基因组序列,获取其线粒体基因组全序列,并从GenBank中下载1条已公布的天祝白牦牛线粒体基因组全序列... 详细信息

为从基因组水平上揭示天祝白牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和母系遗传背景,本研究利用基因组重测序技术,测定42头天祝白牦牛的全基因组序列,获取其线粒体基因组全序列,并从GenBank中下载1条已公布的天祝白牦牛线粒体基因组全序列,对共计43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列进行综合分析。结果表明:从43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列中共识别出971个变异位点,包括25个单一多态位点和946个简约信息位点;通过序列间核苷酸变异确定了20种单倍型,单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.907和0.013,表明天祝白牦牛拥有较为丰富的母系遗传多样性。与野牦牛及环湖、雪多、玉树、青海高原、帕米尔等牦牛品种相比,天祝白牦牛母系遗传多样性相对较低。利用美洲野牛作为参考外群进行系统发育分析,20种单倍型分布于5种单倍型组(A、B、C、E和G)中,归属于3个母系遗传支系(Mt-Ⅰ、Mt-Ⅱ和Mt-Ⅲ),以Mt-Ⅰ支系为主,推测其有3个母系起源。

关键词：天祝白牦牛线粒体基因组遗传多样性群体结构系统发育

天祝白牦牛退行期毛囊细胞亚群鉴定以及特征基因生物信息学分析

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生物技术通报 2022年第10期38卷 262-272页

作者：郑青波叶娜张哓兰包鹏甲王福彬任稳稳廖月姣阎萍潘和平西北民族大学生命科学与工程学院兰州730030 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室兰州730050

从单细胞水平解析天祝白牦牛退行期毛囊发育过程主要细胞类型,旨在对主要细胞类群特异表达基因进行生物功能预测与生物信息学分析,探索退行期毛囊发育调控机制。采用单细胞转录组测序对退行期毛囊进行异质性分析,利用已知标记分子对细... 详细信息

从单细胞水平解析天祝白牦牛退行期毛囊发育过程主要细胞类型,旨在对主要细胞类群特异表达基因进行生物功能预测与生物信息学分析,探索退行期毛囊发育调控机制。采用单细胞转录组测序对退行期毛囊进行异质性分析,利用已知标记分子对细胞类群进行筛选鉴定,并对鉴定得到的主要细胞类群进行GO和KEGG分析,同时对毛囊形态发生过程中涉及的关键分子进行免疫组织分析。结果表明,天祝白牦牛退行期涉及IFE-DC细胞、表皮细胞系、黑色素细胞、INFU细胞等细胞类群。其特征基因主要参与表皮发育、上皮细胞分化、超纤维组织发育、组织形态发生以及细胞形态学发生等生物过程。KEGG富集分析发现,特征基因主要富集在黏附连接、细胞周期、RNA转运等与毛囊发育相关的通路中。涉及的不同细胞类型拥有GJA1、FKBP4、KRT1、KRT80、FGFR2等28个共同基因。该研究成功鉴定出天祝白牦牛退行期主要细胞类群,获得了特征基因富集通路,揭示了退行期毛囊发育机制。

关键词：天祝白牦牛退行期毛囊单细胞转录组测序生物信息学分析

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互助白牦牛与天祝白牦牛父系遗传差异分析

黑龙江畜牧兽医 2022年第13期 120-124页

作者：魏旭东马志杰陈生梅何得仓赵金财梁育林青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 海东市互助县畜牧兽医站青海互助810599 海东市互助县巴扎乡畜牧兽医站青海互助810599 天祝藏族自治县畜牧技术推广站甘肃天祝733200

为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、... 详细信息

为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、Arlequin 3.11和Network 10.1等软件综合分析2个白牦牛品种(群体)的父系遗传多样性、群体结构、分化状况及遗传背景。结果表明:在2个白牦牛品种(群体)中共确定了5种Y染色体单倍型。其中,在互助白牦牛中共确定了4种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2和H12Y2;在天祝白牦牛中共确定了5种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2、H12Y2和H13Y2。互助白牦牛和天祝白牦牛Y染色体单倍型多样度分别为0.7500±0.0349和0.6881±0.0614。2个白牦牛品种(群体)间的固定分化指数值为0.0186,无显著遗传分化(P>0.05)。2个白牦牛品种(群体)均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,天祝白牦牛以Y1支系(单倍型组,59%)为主,互助白牦牛以Y2支系(单倍型组,56%)为主。说明天祝白牦牛和互助白牦牛都具有丰富的父系遗传多样性,但互助白牦牛的父系遗传多样性水平略高于天祝白牦牛;2个白牦牛品种(群体)间父系遗传分化程度很低;白牦牛有两个父系起源,天祝白牦牛和互助白牦牛均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,但二者分别以Y1、Y2为优势支系(单倍型组),父系遗传结构存在一定程度的差异。

关键词：互助白牦牛天祝白牦牛父系遗传多样性群体结构起源

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天祝白牦牛养殖存在的问题及防控措施

畜牧兽医科学（电子版） 2022年第5期 37-39页

作者：白天霞赵延俊李万泽王占斌甘肃省天祝县石门镇畜牧兽医站甘肃天祝733200 甘肃省天祝县华藏寺镇畜牧兽医站甘肃天祝733299

天祝白牦牛养殖的生物安全主要存在在舍饲养殖和放牧养殖2方面。舍饲育肥白牦牛由于改变养殖方式,对养殖密度、圈舍要求、饲草料及免疫治疗等方面都提出较高要求,并且过度治疗,过度使用抗生素及免疫抗体达不到要求,是白牦牛养殖生物安... 详细信息

天祝白牦牛养殖的生物安全主要存在在舍饲养殖和放牧养殖2方面。舍饲育肥白牦牛由于改变养殖方式,对养殖密度、圈舍要求、饲草料及免疫治疗等方面都提出较高要求,并且过度治疗,过度使用抗生素及免疫抗体达不到要求,是白牦牛养殖生物安全的都潜在威胁。该文主要探讨构建白牦牛养殖区域的生物安全体系,保障天祝白牦牛产业健康快速发展,提高养殖效益。

关键词：天祝白牦牛养殖生物安全

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天祝白牦牛不同补饲配方饲喂效果研究

中国畜禽种业 2022年第8期18卷 10-12页

作者：李妍莲赵鑫赵延俊甘肃省天祝县华藏寺镇畜牧兽医站甘肃武威733299 天祝益牧动物药业有限公司甘肃武威733299

为改变天祝白牦牛靠天养殖现状,提高天祝白牦牛繁殖率和养殖效益,该研究通过在冬春季采用两种补饲配方,即秸秆+玉米补饲(对照组)和配合饲料+青干草(试验组)对比周岁牦牛及繁殖牦牛的饲喂效果,结果发现试验组牦牛体重损失均小于对照组,... 详细信息

为改变天祝白牦牛靠天养殖现状,提高天祝白牦牛繁殖率和养殖效益,该研究通过在冬春季采用两种补饲配方,即秸秆+玉米补饲(对照组)和配合饲料+青干草(试验组)对比周岁牦牛及繁殖牦牛的饲喂效果,结果发现试验组牦牛体重损失均小于对照组,从总损耗费用(体重+补饲)看,120d补饲期内,与对照组相比,试验组周岁公牦牛、母牦牛、繁殖母牛分别低出110元/头(17.4%)、 58元/头(10.7%)和618元/头(33.4%),试验组繁殖母牛繁殖率提高24个百分点,犊牛成活率提高7.5个百分点,成年母牛春乏死亡率下降2.8个百分点。可见,应用配合饲料进行补饲能有效减缓冬春季节牦牛体重损失,增加繁殖母牛抵抗力,减少死亡,提高繁殖率,经济效益显著。

关键词：天祝白牦牛补饲传统补饲配合饲料养殖效益

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天祝白牦牛犊牛腹泻的发病规律调查

中国草食动物科学 2022年第4期42卷 82-84页

作者：唐文雅聂福旭苏杰蔡文丽蔡志杰马玲甘肃畜牧工程职业技术学院武威733006 武威市凉州区畜牧兽医局武威733000

为了精准防控天祝白牦牛腹泻疾病的发生,笔者采取问卷调查、现场调查及临床症状检查等方法对甘肃省天祝县松山镇、西大滩镇、华藏寺镇、打柴沟镇、抓喜秀龙镇、安远镇、朵什镇和毛藏乡等8个乡镇天祝白牦牛腹泻的发病情况进行了调查研究... 详细信息

为了精准防控天祝白牦牛腹泻疾病的发生,笔者采取问卷调查、现场调查及临床症状检查等方法对甘肃省天祝县松山镇、西大滩镇、华藏寺镇、打柴沟镇、抓喜秀龙镇、安远镇、朵什镇和毛藏乡等8个乡镇天祝白牦牛腹泻的发病情况进行了调查研究。结果表明,天祝白牦牛腹泻发病率达3.8%(99/2649),以西大滩镇牦牛腹泻率最高(5.5%),华藏寺镇和毛藏乡牦牛腹泻率最低(2.9%)。因腹泻引起的犊牛死亡率达1.3%。春秋两季(3、4、10月)是天祝白牦牛腹泻发生的高峰期,尤其在春季发病率高达7.3%。随着年龄的增长,天祝白牦牛的腹泻发病率呈降低趋势,2周龄以内的犊牛腹泻发病率最高,达10.5%。

关键词：天祝白牦牛腹泻发病规律

天祝白牦牛裙毛、尾毛与人发的结构及性能比较

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毛纺科技 2014年第7期42卷 44-47页

作者：牛春娥张利平郭天芬杨博辉中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃兰州730050 业部动物毛皮及制品质量监督检验测试中心(兰州) 甘肃兰州730050 甘肃农业大学动物科技学院甘肃兰州730060

研究天祝白牦牛裙毛和尾毛的性能结构及其与人发的异同，为合理开发利用天祝白牦牛尾毛和裙毛提供科学依据。利用光学显微镜、扫描电镜、氨基酸分析仪、能谱分析仪等对天祝白牦牛裙毛、尾毛和人发的超微结构及各项性能进行观测。结果发... 详细信息

研究天祝白牦牛裙毛和尾毛的性能结构及其与人发的异同，为合理开发利用天祝白牦牛尾毛和裙毛提供科学依据。利用光学显微镜、扫描电镜、氨基酸分析仪、能谱分析仪等对天祝白牦牛裙毛、尾毛和人发的超微结构及各项性能进行观测。结果发现3种纤维的细度范围52．5-109．8μm，有髓毛含量1．8％-17．0％；单纤维断裂强力≥60cN、伸长率≥50％；3种纤维均由18种氨基酸组成，鳞片呈杂波状排列、横切面为椭圆或近圆形。天祝白牦牛裙毛、尾毛与人发的结构及各项性能比较相似，是制作高档假发和西服里衬的理想原料。

关键词：天祝白牦牛裙毛尾毛人发结构性能

天祝白牦牛DLX-3基因克隆及生物信息学与差异表达分析

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基因组学与应用生物学 2020年第11期39卷 5001-5009页

作者：郭雪峰常永芳包鹏甲张永峰李忠邦阎萍潘和平西北民族大学生命科学与工程学院兰州730030 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室兰州730050

本研究以天祝白牦牛体侧皮肤为实验材料,通过PCR扩增技术克隆DLX-3基因CDs区,将克隆获得的天祝白牦牛DLX-3基因CDs区序列与野牦牛序列比对并进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR检测天祝白牦牛DLX-3基因在毛囊发育不同月份的mRNA表... 详细信息

本研究以天祝白牦牛体侧皮肤为实验材料,通过PCR扩增技术克隆DLX-3基因CDs区,将克隆获得的天祝白牦牛DLX-3基因CDs区序列与野牦牛序列比对并进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR检测天祝白牦牛DLX-3基因在毛囊发育不同月份的mRNA表达水平。结果表明,天祝白牦牛DLX-3基因编码区序列长864 bp,编码287个氨基酸残基;天祝白牦牛DLX-3基因编码蛋白分子量31720.20 Da,理论等电点为8.98;蛋白质二级结构以无规卷曲(74.91%)和α-螺旋(15.33%)为主,序列分析显示,天祝白牦牛DLX-3蛋白为不稳定的亲水蛋白。实时荧光定量PCR检测天祝白牦牛DLX-3基因在毛囊发育1、3、6、10、12月份的表达量,检测结果表明DLX-3基因1、3、6、10、12月份均有表达,且在10月份的表达量显著高于其他月份(p牦牛皮肤毛囊发育活动开始进入生长期阶段;DLX-3基因在牦牛皮肤发育生长旺盛阶段的表达量最高,可能参与调控毛囊发育,并在毛囊活动中呈现明显的表达规律,表明DLX-3基因对天祝白牦牛毛囊发育周期的重要性,为进一步研究天祝白牦牛DLX-3基因对毛囊发育调控及其功能的研究提供了理论基础。

关键词： DLX-3基因天祝白牦牛生物信息学基因表达