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大黄鱼(Pseudosciaena crocea)leptin和cholecystokinin基因的克隆和表达特性研究

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海洋与湖沼 2017年第5期48卷 1071-1083页

作者：刘立芹王茂廷崔文涛刘婉吕振明龚理杨静文董迎辉浙江海洋大学海洋生物种质资源发掘与利用国家地方联合工程实验室舟山316022 浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室宁波315100

本文克隆了两种大黄鱼(Pseudosciaena crocea)摄食调控因子胆囊收缩素(CCK)、瘦素(LEP)基因的全长序列,并对其表达特性进行了研究。结果表明,克隆得到CCK基因属硬骨鱼类的CCK1亚家族,全长900nt,编码137个氨基酸,与其他鱼类的CCK1相比序... 详细信息

本文克隆了两种大黄鱼(Pseudosciaena crocea)摄食调控因子胆囊收缩素(CCK)、瘦素(LEP)基因的全长序列,并对其表达特性进行了研究。结果表明,克隆得到CCK基因属硬骨鱼类的CCK1亚家族,全长900nt,编码137个氨基酸,与其他鱼类的CCK1相比序列组成非常保守,特别是在20氨基酸的信号肽和8个氨基酸的CCK-8活性结构区域;而克隆得到LEP基因属硬骨鱼类的LEPA亚家族,全长1290nt,编码161个氨基酸,与其他鱼类LEP相比基因同源性较差,但在3D结构上却保留了LEP经典的4个α螺旋特征。两种因子在所检测的所有组织中均有表达,但尤以脑、胃、肠消化道、肝脏等摄食及能量平衡相关组织中表达活性最高。8天的饥饿能使大黄鱼脑、消化道组织的CCK和肝脏、脂肪组织中的LEP表达显著降低(P大黄鱼的摄食生理和能量平衡中起着重要的调控作用;本研究将为深入了解鱼类食欲调控的神经内分泌机理提供基础。

关键词：大黄鱼瘦素胆囊收缩素基因克隆表达

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可食性壳聚糖涂膜保鲜大黄鱼品质控制研究

中国食品学报 2013年第6期13卷 147-152页

作者：李婷婷励建荣胡文忠大连民族学院生命科学学院辽宁大连116600 渤海大学辽宁锦州121013

为了研究可食性壳聚糖涂膜对大黄鱼贮藏品质的影响,分别用0,1%,1.5%,2%,2.5%的壳聚糖涂膜保鲜大黄鱼,以细菌总数(TVC)、pH值、挥发性盐基氮(TVB-N)、硫代巴比妥酸值(TBA)、K值及感官评分为指标,测定大黄鱼冷藏过程中品质的变化。结果表... 详细信息

为了研究可食性壳聚糖涂膜对大黄鱼贮藏品质的影响,分别用0,1%,1.5%,2%,2.5%的壳聚糖涂膜保鲜大黄鱼,以细菌总数(TVC)、pH值、挥发性盐基氮(TVB-N)、硫代巴比妥酸值(TBA)、K值及感官评分为指标,测定大黄鱼冷藏过程中品质的变化。结果表明:4℃下无壳聚糖涂膜的大黄鱼储藏8 d,菌落总数达到6.04 log cfu/g,超过国标规定的卫生标准;而壳聚糖涂膜处理组细菌生长受到明显抑制,其中1.5%壳聚糖涂膜可使大黄鱼的货架期延长至12 d(TVC值5.98 log cfu/g)。各处理组的pH值、TVB-N、TBA、K值等指标均优于对照组,其中1.5%壳聚糖涂膜时,保鲜效果最好,能较好地保持大黄鱼感官品质。

关键词：可食性涂膜壳聚糖大黄鱼品质货架期

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大黄鱼源腐败菌的黏附特性与生物膜特性分析

食品科学 2019年第14期40卷 84-90页

作者：张雯卞丹阮成旭时祥柱倪莉福州大学食品科学技术研究所福建省食品生物技术创新工程技术研究中心福建福州350108 福建省新闽科生物科技开发有限公司福建福州350008

以分离纯化自冰鲜大黄鱼的3株希瓦氏菌(MA1-5、MA1-7、MA1-13)和3株假单胞菌(R3-1、R3-2、R3-5)为供试菌株,研究鱼源腐败菌的表面疏水性、自凝聚能力、生物膜和腐败菌对鱼体(鱼肠、鱼鳃和体表)黏液的黏附能力,探明黏附特性与不同部位黏... 详细信息

以分离纯化自冰鲜大黄鱼的3株希瓦氏菌(MA1-5、MA1-7、MA1-13)和3株假单胞菌(R3-1、R3-2、R3-5)为供试菌株,研究鱼源腐败菌的表面疏水性、自凝聚能力、生物膜和腐败菌对鱼体(鱼肠、鱼鳃和体表)黏液的黏附能力,探明黏附特性与不同部位黏附能力的相关性,并进一步研究生物膜在不同因素下的形成特性。研究表明,希瓦氏菌具有更强的表面疏水性和自凝聚能力,对鱼体黏液的黏附性强,并具有更强的生物膜形成能力。主成分分析和聚类分析说明黏附能力在属间存在差异性,属内具有相似性。腐败菌对鱼肠和鱼鳃的黏附能力与自凝聚能力和生物膜形成能力具有较高的相关性,对体表黏附能力只与生物膜形成能力有关。腐败菌生物膜的形成受初始菌浓度、培养时间、温度、pH值、盐含量等多种环境因素影响。希瓦氏菌在初始菌浓度106 CFU/mL以上、37℃、pH 7~8、0.8%NaCl时形成的生物膜量最多;生物膜在12~24 h期间快速形成,并在36 h达到峰值后,随培养时间延长而逐渐下降。经鱼体黏液包被后,生物膜形成量受到显著影响,鱼鳃黏液促进生物膜形成,鱼肠黏液抑制生物膜形成。

关键词：大黄鱼希瓦氏菌假单胞菌黏附特性生物膜

大黄鱼ATG10基因的分子特征及其在抗病毒免疫中的功能

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水生生物学报 2022年第4期46卷 521-528页

作者：魏祖运卢利霞任秋磊何天良陈新华福建农林大学海洋研究院福建省海洋生物技术重点实验室福州350002

为了研究自噬相关基因ATG10(Autophagy related gene 10)在鱼类免疫应答中的功能,研究克隆了大黄鱼(Larimichthys crocea)ATG10基因(LcATG10)的cDNA序列,其开放阅读框全长747个核苷酸,编码248个氨基酸的蛋白,包含1个Autophagy_act_C结构域。系统进化分析显示,LcATG10和其他硬骨鱼类ATG10聚成一支,与金头鲷和石斑鱼ATG10亲缘关系最近。LcATG10在所检测的正常大黄鱼各组织中都有表达。在病毒类似物poly(I:C)刺激后,大黄鱼脾脏和头肾组织中LcATG10的表达水平显著上调,分别在12h和6h达到峰值(9.4和5.9倍)。LcATG10在大黄鱼头肾细胞系(LYCK)、原代巨噬细胞、淋巴细胞和粒细胞中也均有表达,在原代粒细胞中的表达量相对较高;在poly(I:C)刺激后,大黄鱼原代头肾粒细胞和LYCK细胞中LcATG10的表达水平显著上调。过表达LcATG10的鲤上皮瘤(Epithelioma papulosum cyprinid,EPC)细胞受鲤春病毒血症病毒(Spring viremia of carp virus,SVCV)感染48h后,细胞病变效应(Cytopathic effects,CPEs)明显低于对照组;细胞培养上清中SVCV病毒滴度为103.55 TCID50/mL,显著少于对照组;SVCV标志基因SVCV-G、SVCV-M和SVCV-P的表达水平也显著低于对照组,分别是对照组的0.022、0.015和0.022倍。这些研究结果表明LcATG10在大黄鱼抗病毒免疫应答中发挥作用,为深入研究自噬在大黄鱼抗病毒免疫中的分子机制奠定了基础。

关键词： ATG10 免疫相关细胞抗病毒免疫大黄鱼

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轻度盐腌大黄鱼的气味特征及形成途径

食品科学 2023年第24期44卷 235-244页

作者：关君兰姚雨萱伍菱王永兴沈细冰杜希萍倪辉集美大学海洋食品与生物工程学院福建厦门361021 大连工业大学海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心辽宁大连116034 福建省食品微生物与酶工程重点实验室福建厦门361021 漳州市科技情报研究所福建漳州363000 厦门市食品与生物工程与技术研究中心福建厦门361021

以大宗养殖海水鱼——冰鲜大黄鱼和轻度盐腌大黄鱼为对象,通过固相微萃取(solidphase microextraction,SPME)结合气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)联用、气相色谱-嗅闻(gas chromatography-olfactometry,GC-O)检测和气味强度值(odor activity value,OAV)分析,研究轻度盐腌对大黄鱼风味的影响。GC-MS分析表明,冰鲜大黄鱼和轻度盐腌大黄鱼中正己醛、壬醛、庚醛、1-辛烯-3-醇、茴香脑和正己醇含量高于其他挥发性化合物。GC-O和OAV分析表明,冰鲜大黄鱼中1-辛烯-3-醇、正辛醛、壬醛、正己醛、庚醛、(E,Z)-2,6-壬二烯醛、反-2-辛烯醛和茴香脑对风味有较大的影响(OAV>1);轻度盐腌大黄鱼中芳樟醇、壬醛、正己醛、正辛醛、1-辛烯-3-醇、茴香脑、(E,Z)-2,6-壬二烯醛和庚醛对风味有较大影响(OAV>1)。轻度盐腌后风味变化的原因是芳樟醇的OAV显著增加,以及1-辛烯-3-醇、正己醛、壬醛和正辛醛OAV显著降低。相关风味成分的变化可能和不饱和脂肪酸氧化降解、萜类的生物合成、芳香醇异构化、脂肪醛氧化及还原、酯化等反应相关。

关键词：大黄鱼轻度盐腌气相色谱-质谱联用特征香气成分反应途径

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大黄鱼高温适应的转录组学分析

水产学报 2018年第11期42卷 1673-1683页

作者：邓素贞韩兆方陈小明李庆昌肖世俊李佳凯刘贤德集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室

为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个生物学重复)和高温处理组(3个生物学重复)分别获得15.28和13.9... 详细信息

为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个生物学重复)和高温处理组(3个生物学重复)分别获得15.28和13.92 Gb测序数据,GC含量平均值约为51%。过滤后的高质量测序reads使用Bowtie2软件比对到大黄鱼参考转录组序列上估计基因表达量,进而进行基因表达差异统计学检验。以常温对照组为参比,高温处理组中阈值设为|log2(FC)|>2和FDR大黄鱼高温适应的调控机制提供了重要的参考材料。

关键词：大黄鱼转录组测序差异表达基因 qRT-PCR

大黄鱼slitrk3基因启动子克隆及转录调控分析

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南方水产科学 2023年第4期19卷 68-76页

作者：周锐涛岳珠峰纪焦军温靖姜丹王志勇方铭集美大学水产学院/农业农村部东海海水健康养殖重点实验室福建厦门361021

神经突触相关蛋白Slitrk3具有调节抑制性突触发育的作用。研究大黄鱼(Larimichthys crocea)神经突触黏附分子slitrk3基因的转录调控机制,可为解决大黄鱼养殖面临的生长、应激及抗逆等问题提供新思路。通过生物信息学方法对大黄鱼及其他... 详细信息

神经突触相关蛋白Slitrk3具有调节抑制性突触发育的作用。研究大黄鱼(Larimichthys crocea)神经突触黏附分子slitrk3基因的转录调控机制,可为解决大黄鱼养殖面临的生长、应激及抗逆等问题提供新思路。通过生物信息学方法对大黄鱼及其他物种的Slitrk3氨基酸进行多重序列比对和系统进化树分析,并预测大黄鱼slitrk3基因启动子区域相关的调控元件,采用双荧光素酶报告基因系统检测大黄鱼slitrk3基因启动子区域的转录活性。生物信息学分析结果显示,Slitrk3氨基酸序列在鱼类中具有较高的保守性;大黄鱼slitrk3基因启动子区域预测存在2个潜在的转录起始位点、2个CpG岛以及Sp1、GR、C/EBPα和C/EBPβ等多种转录因子结合位点。双荧光素酶报告基因系统结果显示,大黄鱼slitrk3基因启动子区域的−1970—−1614 bp、−1210—−667 bp存在正调控元件,−1614—−1210 bp、−667—−376 bp、−376—−147 bp存在负调控元件,推测−147—+16 bp为核心启动子。

关键词：大黄鱼 slitrk3基因启动子转录调控

基于SPME-GC-MS和电子鼻分析臭氧-流态冰处理对大黄鱼风味的影响

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食品科学技术学报 2023年第1期41卷 154-162页

作者：刘建华朱荣荣曾倩华唐炜丁玉庭浙江工业大学食品科学与工程学院/浙江省海洋渔业资源开发与利用重点实验室/国家远洋水产品加工研发分中心(杭州) 浙江杭州310014

为研究臭氧-流态冰(O-IS)处理中不同臭氧质量浓度(0、1、3、5 mg/L)对大黄鱼在优级品货架期内风味的影响,采用固相微萃取-气相色谱-质谱联用(SPME-GC-MS)结合电子鼻技术,以新鲜鱼块和传统碎冰保鲜的鱼块为对照,分析了挥发性风味物质变... 详细信息

为研究臭氧-流态冰(O-IS)处理中不同臭氧质量浓度(0、1、3、5 mg/L)对大黄鱼在优级品货架期内风味的影响,采用固相微萃取-气相色谱-质谱联用(SPME-GC-MS)结合电子鼻技术,以新鲜鱼块和传统碎冰保鲜的鱼块为对照,分析了挥发性风味物质变化规律。结果表明:SPME-GC-MS从大黄鱼样品中共检出35种挥发性成分,主要为醛类、烃类及醇类物质。己醛、庚醛及1-辛烯-3-醇等使鱼体呈腥味的挥发性物质含量分析证明,1 mg/L O-IS处理能够在降解大黄鱼腥味物质含量的同时,减轻臭氧对鱼肉的氧化作用。电子鼻分析发现:O-IS处理组的腥味物质响应程度显著低于对照组,且1 mg/L O-IS处理后电子鼻未识别到腥味物质。研究表明,在大黄鱼优级品货架期内,1 mg/L O-IS处理可以显著降低大黄鱼腥味物质含量。

关键词：臭氧-流态冰大黄鱼固相微萃取-气相色谱-质谱联用电子鼻风味

不同养殖模式大黄鱼非标记定量差异蛋白组学分析

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食品科学 2023年第8期44卷 137-142页

作者：翁丽萍张乐刘军波肖文斐汪前邹礼根杭州市农业科学研究院浙江杭州310024

通过非标记定量蛋白质组学技术研究不同养殖模式大黄鱼的蛋白质差异。选取普通网箱养殖大黄鱼和深水网箱养殖大黄鱼,提取肌肉总蛋白,通过高效液相色谱-质谱联用技术进行鉴定、分析。质谱数据使用MaxQuant软件将峰信号转化为肽段/蛋白的... 详细信息

通过非标记定量蛋白质组学技术研究不同养殖模式大黄鱼的蛋白质差异。选取普通网箱养殖大黄鱼和深水网箱养殖大黄鱼,提取肌肉总蛋白,通过高效液相色谱-质谱联用技术进行鉴定、分析。质谱数据使用MaxQuant软件将峰信号转化为肽段/蛋白的表达矩阵数据,然后使用Perseus软件可视化展示数据。不同养殖模式大黄鱼蛋白质进行Student’s t检验,筛选出差异表达蛋白后并对其进行基因功能分类、代谢通路富集和蛋白质相互作用网络分析,以P大黄鱼间存在显著差异表达,76个上调蛋白,54个下调蛋白,其中上调倍数最高的属于TCP伴侣蛋白,下调倍数最高的属于α-1(I)链状胶原蛋白。生物信息学分析发现,不同养殖模式大黄鱼蛋白质的差异主要在于热休克蛋白、伴侣蛋白、球蛋白及胶原蛋白等,而不同养殖模式中环境温度可能是导致大黄鱼蛋白质显著差异表达的主要因素。

关键词：大黄鱼非标记定量养殖模式蛋白组学