检索结果-南通市图书馆

一株引起大弹涂鱼出血症的维氏气单胞菌的分离及鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

农业生物技术学报 2022年第2期30卷 344-355页

作者：王维李长红詹萍萍陈炯宁波大学农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室宁波大学海洋学院/生物化学与分子生物学实验室

2020年8～9月,浙江慈溪市某大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)养殖场发生爆发性病害,病鱼主要表现出典型的出血症症状,给养殖户造成严重的经济损失。为了鉴定该病害的病原,本研究通过解剖观察、细菌分离培养、电镜观察、生化鉴... 详细信息

2020年8～9月,浙江慈溪市某大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)养殖场发生爆发性病害,病鱼主要表现出典型的出血症症状,给养殖户造成严重的经济损失。为了鉴定该病害的病原,本研究通过解剖观察、细菌分离培养、电镜观察、生化鉴定、药敏实验、动物回归感染实验、16S rRNA及DNA旋回酶亚基B (DNA gyrase subunit B, gyrB)基因系统发育分析等方法对病原进行鉴定。结果从发病鱼体内分离得到一株优势菌,将其命名为AV20211212。通过革兰氏染色的光镜观察及扫描与透视电镜的超微结构观察发现,AV20211212为革兰氏阴性短杆菌,两端钝圆,可见中空极生单鞭毛。生理生化特征鉴定结果显示,AV20211212与维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)的生理生化特征相似。16S rRNA核苷酸序列及gyrB编码氨基酸序列同源性分析显示,AV20211212与维氏气单胞菌的16S rRNA的同源性为93.6%～99.4%,gyrB同源性为99.5%～99.7%。16S rRNA核苷酸序列及gyrB编码氨基酸序列的系统发育分析结果均显示,AV20211212与维氏气单胞菌紧密成簇。推测AV20211212为维氏气单胞菌。药敏实验结果显示,AV20211212对青霉素、氨苄西林等7种抗生素高度耐药,对阿奇霉素中度敏感,而对诺氟沙星、丁胺卡那等12种抗菌药物敏感。对健康大弹涂鱼进行回归感染,结果显示症状与养殖场发病鱼体一致,半致死剂量为4.56×103 CFU/g。本研究首次将维氏气单胞菌鉴定为大弹涂鱼的致病菌,研究结果为慈溪地区细菌性鱼类病害的有效预防及合理用药提供了理论依据及技术支持。

关键词：大弹涂鱼维氏气单胞菌形态观察生理生化特征系统发育分析

中国沿海大弹涂鱼的种群地理格局与适应性分化研究

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国沿海大弹涂鱼的种群地理格局与适应性分化研究

作者：赵世杰浙江海洋大学

学位级别：硕士

大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)是一种极为独特的水陆两栖鱼类,被世界自然基金会(WWF)列为“海洋十宝”之一,广泛分布于我国黄海、东海及南海海域。近年来,由于环境污染和过度采捕等人类活动的影响给大弹涂鱼的生存造成极大威... 详细信息

大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)是一种极为独特的水陆两栖鱼类,被世界自然基金会(WWF)列为“海洋十宝”之一,广泛分布于我国黄海、东海及南海海域。近年来,由于环境污染和过度采捕等人类活动的影响给大弹涂鱼的生存造成极大威胁,为了有效保护我国大弹涂鱼的种质资源,有必要研究其现有种群的谱系地理分布格局及进化机制,探讨其成因,为中国大弹涂鱼资源的有效保护、合理开发和科学管理提供数据基础。为此,本研究分别采用了线粒体D-loop区、线粒体全基因组及核基因转录组作为分子标记,分析了我国沿海大弹涂鱼种群地理格局和历史动态,探讨了古地理历史和现今生态隔离及人类活动对其种群分化的驱动,揭示中性和适应性进化在其种群进化的相对重要性,取得主要结果如下:1、利用线粒体控制区片段对中国沿海9个大弹涂鱼群体(山东乳山、山东城阳、江苏赣榆、浙江岱山、浙江奉化、福建龙海、广东珠江口、广西合浦和海南龙华)进行了种群地理格局与遗传分化研究,共测定了185条长度为696bp的D-loop序列。结果表明我国沿海弹涂鱼存在较高的遗传多样性,共检测到6个插入或缺失位点和112个多态位点,其中单一突变位点62个,简约信息位点50个;总体单倍型多样性(H)为0.985,核苷酸多样性π为0.012,平均核苷酸差异数(k)为8.371;各群体相比较,山东乳山(H=0.810,π=0.0058)和城阳群体(H=0.747,π=0.0037)遗传多样性相对较低,而其它群体相对较高。种群遗传结构分析表明:我国9个大弹涂鱼群体可分为两大类群:类群A为山东乳山群体;类群B由除乳山群体外所有群体组成,而B类群内部有存在亚类群BI(山东城阳群体)和亚类群BII(山东以南所有群体)的分化。中性检验和核苷酸错配分析都表明中国大弹涂鱼群体经历了种群扩张事件,类群A、亚类群BI和亚类群BII的扩张时间分别为0.456～0.911、0.513～1.026和2.599～5.197万年前。2、利用线粒体全基因组对中国沿海9个大弹涂鱼群体(山东乳山、山东城阳、江苏赣榆、浙江岱山、浙江奉化、福建龙海、广东珠江口、广西合浦和海南龙华)进行了种群地理格局与适应性进化分析,共测定了61条长度为16980～17243bp的线粒体全长序列。结果支持上述线粒体D-loop区的研究结果:共检测到670个多态位点,其中单一突变位点444个,简约信息位点226个;总体的单倍型数(N)为61,单倍型多样性(H)为1,核苷酸多样性π为0.0033,平均核苷酸差异数(k)为55.972,表明我国大弹涂鱼总体遗传多样性水平较高;各群体相比山东乳山(H=1,π=0.0004)和城阳群体(H=1,π=0.0005)遗传多样性较其它群体相对较低。种群遗传结果分析表明,我国9个大弹涂鱼群体可分为两大类群:类群A为山东乳山群体;类群B由除乳山群体外所有群体组成,包括BI(山东城阳群体)和BII(山东以南所有群体)两个亚类群的分化。类群A与类群B之间遗传距离相对较远(0.0052～0.0057);遗传分化指数达到0.652～0.920;适应性进化分析表明,我国大弹涂鱼线粒体13个蛋白编码基因中均未筛选到受到正选择的基因及位点,但是我们在乳山群体和城阳分别检测到了4个和1个固定氨基酸改变,经检测这些改变对线粒体蛋白理化性质产生部分影响,其确切生物学意义有待于今后深入研究。3、利用核基因转录组对中国沿海5个大弹涂鱼群体(山东乳山、山东城阳、浙江平阳、福建龙海和广西合浦)进行了种群地理格局与适应性进化分析,通过对原始数据的过滤和比对,共获得了24个个体中高质量的1210408个SNPs。遗传多样性分析表情,5个群体总体的平均核苷酸多样性指数(Pi)为0.243,平均杂合度观测值(H)为0.089,平均杂合度(H)为0.215。山东乳山(H=0.039,H=0.054)和山东城阳群体(H=0.076,H=0.106)的杂合度较其它群体相对较低。主成份分析(PCA)和NJ聚类结果都显示,我国5个大弹涂鱼群体可分为三大类群,山东乳山群体和山东城阳各自为一类群,山东以南三个群体组成第三个类群。群体间遗传距离在0.0336～0.0620之间,其中乳山与城阳群体(0.0530),乳山与南方三个群(0.0503～0.0620)及城阳与南方三个群体的遗传距离均较远(0.0494～0.0542),而南方三个群体内部的遗传距离较近。适应性进化分析表明,乳山和城阳群体相较于南方群体分别存在41个和182个正选择位点,功能注释和富集分析表明,这些正选择位点对应的候选基因多与能量发生、脂肪代谢、糖类代谢、生物膜功能、神经突触发育及免疫有关,这可能与两地大弹涂鱼长期适应高纬度低温条件而产生适应性进化有关。该结果表明适应性进化可能在中国沿海大弹涂鱼种群进化中也扮演着重要角色。

关键词：大弹涂鱼 D-loop序列线粒体基因组转录组分子系统地理学适应性进化

大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)单核巨噬细胞低氧胁迫比较转录组学分析

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋与湖沼 2020年第2期51卷 335-344页

作者：朱婷芳管峰苗亮史雨红陈炯宁波大学农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室宁波315832 宁波大学海洋学院生物化学与分子生物学实验室宁波315832 宁波大学海洋学院应用海洋生物技术教育部重点实验室宁波315832

低氧是鱼类在水生环境中的关键压力之一。而大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,mudskipper)可能是少数能在低氧中自然呼吸的脊椎动物。本研究中,我们分析了低氧胁迫8h后大弹涂鱼头肾源单核巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ... 详细信息

低氧是鱼类在水生环境中的关键压力之一。而大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,mudskipper)可能是少数能在低氧中自然呼吸的脊椎动物。本研究中,我们分析了低氧胁迫8h后大弹涂鱼头肾源单核巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ)转录组变化。采用Illumina Hiseq 4000平台进行高通量测序,获得了大弹涂鱼MO/MΦ短时低氧胁迫相关的转录组数据,并将获得的原始数据上传至NCBI获得ID号:SRR9771486-SRR9771491(Bioproject PRJNA543702)。分析结果显示,P大弹涂鱼MO/MΦ基因表达及信号通路调控机制。

关键词：低氧胁迫基因表达信号通路比较转录组学分析大弹涂鱼

大弹涂鱼白细胞介素-8基因分子进化及不同病原体刺激对其表达的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

水产学报 2019年第11期43卷 2290-2303页

作者：李健孟繁星黎明王日昕石戈浙江海洋大学海洋科学与技术学院宁波大学海洋学院

实验从大弹涂鱼皮肤组织转录组中筛选出大弹涂鱼IL-8基因,并分析了其序列特征,构建了系统发生树,评估了IL-8基因在健康个体不同组织中的表达差异,以及在不同病原体刺激下IL-8基因在机体主要免疫器官肝脏和脾脏中的表达情况。结果显示,... 详细信息

实验从大弹涂鱼皮肤组织转录组中筛选出大弹涂鱼IL-8基因,并分析了其序列特征,构建了系统发生树,评估了IL-8基因在健康个体不同组织中的表达差异,以及在不同病原体刺激下IL-8基因在机体主要免疫器官肝脏和脾脏中的表达情况。结果显示,该基因的开放阅读框由306个碱基组成,编码101个氨基酸残基,包含典型的由18个氨基酸残基组成的信号肽,和1个由62个氨基酸残基组成的SCY结构域,该结构域还包含了4个保守的半胱氨酸残基,分别为Cys-30、Cys-32、Cys-57和Cys-73。大弹涂鱼IL-8氨基酸序列中的受体结合位点基序ELR (Glu-Leu-Arg)被Asn-Ser-His (NSH)取代,系统进化分析表明,纯化选择影响了鱼类该基序的多样性,且IL-8基因在大弹涂鱼乃至硬骨鱼中不可取代。荧光定量实验结果显示,IL-8基因在大弹涂鱼的健康组织中广泛表达,在鳃和脑中表达量最高。细菌和poly(I∶C)注射实验表明,在受到感染后,肝、脾和脑组织中IL-8的表达量均上调,说明IL-8基因在大弹涂鱼肝、脾和脑组织的炎性反应和免疫应答中起到了重要作用,为大弹涂鱼免疫基因的后续研究提供了参考。

关键词：大弹涂鱼白细胞介素-8 分子进化分析表达分析 ELR基序

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

大弹涂鱼皮肤黏液的抑菌活性和蛋白质组学

水产学报 2019年第5期43卷 1271-1287页

作者：刘宏汉姜雨婷范美华王日昕廖智浙江海洋大学海洋科学与技术学院海洋生物蛋白质工程研究室宁波大学海洋学院鱼类健康与进化研究室

皮肤黏液是鱼类免疫防御的第一道防线。大弹涂鱼皮肤黏液对其免疫防御、渗透压维持以及适应水陆生活等方面具有重要意义。为深入了解大弹涂鱼皮肤黏液的蛋白质分子组成,对其皮肤黏液开展了抑菌活性分析和蛋白质组学分析。通过电刺激法... 详细信息

皮肤黏液是鱼类免疫防御的第一道防线。大弹涂鱼皮肤黏液对其免疫防御、渗透压维持以及适应水陆生活等方面具有重要意义。为深入了解大弹涂鱼皮肤黏液的蛋白质分子组成,对其皮肤黏液开展了抑菌活性分析和蛋白质组学分析。通过电刺激法收集大弹涂鱼皮肤黏液,采用打孔法比较了皮肤黏液和血清的抑菌活性差异;进一步利用鳗弧菌对大弹涂鱼进行诱导,采用生长曲线抑制法分析和比较了诱导前后皮肤黏液的抑菌活性差异。利用Shotgun质谱技术,结合大弹涂鱼皮肤转录组数据库,对大弹涂鱼皮肤黏液开展了蛋白质组学分析;进一步利用String软件对所鉴定的蛋白质开展了蛋白质相互作用预测。大弹涂鱼皮肤黏液具有广谱抑菌活性,鳗弧菌诱导后的大弹涂鱼皮肤黏液与诱导前相比,对部分革兰氏阴性菌的抑菌活性明显上升,但对其他菌株的抑菌活性差异不明显。从大弹涂鱼皮肤黏液中共鉴定各类蛋白质分子97种,基本分子组成与其他硬骨鱼类皮肤黏液蛋白相似,但也有少数蛋白如泛素蛋白、胸腺素蛋白等未在其他鱼类皮肤黏液中报道。此外,其他鱼类中所鉴定到的部分蛋白如热休克蛋白、抗菌肽等在大弹涂鱼皮肤黏液中未能鉴定到。大弹涂鱼皮肤黏液中已鉴定的蛋白多数具有与免疫功能相关的结构域,且存在一个以肌动蛋白为核心的相互作用网络。大弹涂鱼皮肤黏液具有明显的广谱抑菌活性,其蛋白质组成与其他鱼类皮肤黏液具有一定的相似性。本研究为深入了解大弹涂鱼皮肤黏液的分子多样性及功能机制奠定了基础。

关键词：大弹涂鱼皮肤黏液蛋白质组学免疫抑菌活性

大弹涂鱼TLR基因分子进化研究及其在鳗弧菌胁迫后的表达分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国水产科学 2019年第6期26卷 1049-1063页

作者：周建波孟繁星黎明王日昕石戈浙江海洋大学海洋科学与技术学院宁波大学海洋学院

大弹涂鱼(Boleophthalmuspectinirostris)是一种生活在潮间带的淤泥滩和红树林等两栖环境中的鱼类,其免疫系统面临比水生生活更大的选择压力。Toll样受体基因(简称TLR)是重要的先天免疫成员,一直是鱼类分子免疫学的研究热点之一。为了... 详细信息

大弹涂鱼(Boleophthalmuspectinirostris)是一种生活在潮间带的淤泥滩和红树林等两栖环境中的鱼类,其免疫系统面临比水生生活更大的选择压力。Toll样受体基因(简称TLR)是重要的先天免疫成员,一直是鱼类分子免疫学的研究热点之一。为了探究大弹涂鱼TLR基因是否因为其独特的生活环境而产生适应性进化以及其TLR基因在受到细菌攻击后的免疫应答模式,本研究从大弹涂鱼皮肤转录组中获得了TLR5, TLR8和TLR9完整序列以及TLR3和TLR7部分序列,采用分子生物信息学对大弹涂鱼TLR5, TLR8和TLR9基因序列以及氨基酸序列进行了分析,并根据所构建的系统发育树对5个TLR基因进行了分子进化分析,采用荧光定量PCR方法对大弹涂鱼5个TLR基因的组织表达分布和鳗弧菌攻击后5个TLR基因的免疫应答模式开展了研究。结果显示, TLR5基因全长3071 bp,包括长度为2646 bp的编码区,共编码882个氨基酸; TLR8基因全长3175 bp,包括长度为3033 bp的编码区,共编码1011个氨基酸; TLR9基因全长3398 bp,编码区长度为3093 bp,共编码1031个氨基酸。大弹涂鱼3个TLR基因与其他物种的TLR基因结构相似,具有高度保守性。位点模型结果表明,鱼类TLR3, TLR5和TLR8是高度保守的,而TLR7和TLR9在长期进化过程中产生了适应性进化;而进化枝–位点模型结果表明,为了适应更加复杂多变的两栖环境,大弹涂鱼TLR9基因可能产生了适应性进化。大弹涂鱼5个TLR基因在8个健康组织(肠,眼,肾,肝,脑,肌肉,脾和皮肤)中均有表达,在肝脏和脾脏中的表达量较高。在受到鳗弧菌(Vibrio anguillarum)攻击后的免疫表达模式表明了大弹涂鱼5个TLR基因在应对细菌入侵时起到了重要作用。

关键词：大弹涂鱼 Toll样受体基因序列分析分子进化分析鳗弧菌基因表达

大弹涂鱼幼鱼、成鱼肌肉营养成分及脂肪酸组成分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

养殖与饲料 2023年第4期22卷 14-18页

作者：李伟峰陈涛广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室(北部湾大学) 广西钦州535000 广西农业职业技术大学南宁530007

[目的]研究大弹涂鱼(Belephthalmus pectinirostris)不同生长阶段肌肉营养成分的变化。[方法]分析测定大弹涂鱼幼鱼、成鱼肌肉组织的常规营养成分、脂肪酸相对含量、消化酶活性及矿物元素含量。[结果]大弹涂鱼成鱼肌肉粗脂肪含量显著高... 详细信息

[目的]研究大弹涂鱼(Belephthalmus pectinirostris)不同生长阶段肌肉营养成分的变化。[方法]分析测定大弹涂鱼幼鱼、成鱼肌肉组织的常规营养成分、脂肪酸相对含量、消化酶活性及矿物元素含量。[结果]大弹涂鱼成鱼肌肉粗脂肪含量显著高于幼鱼,幼鱼、成鱼肌肉粗蛋白质含量丰富。大弹涂鱼幼鱼肌肉饱和脂肪酸ΣSFA显著高于成鱼,多不饱合脂肪酸ΣPUFA显著低于成鱼,特别是幼鱼肌肉二十碳五烯酸EPA(4.97%)、二十二碳六烯酸DHA(11.65%)相对含量均显著低于成鱼(分别为7.96%和18.67%),C18:2n-6、C20:4n-6相对含量显著高于成鱼。大弹涂鱼幼鱼胃蛋白酶、胃淀粉酶、肠脂肪酶活性显著低于成鱼,成鱼具有较强的消化能力,而幼鱼消化系统没有成鱼完善。大弹涂鱼成鱼肌肉P、Mg含量显著高于幼鱼,成鱼及幼鱼之间微量元素含量差异不显著,成鱼在长期的海洋生活中积累了大量的矿物元素。[结论]大弹涂鱼幼鱼、成鱼肌肉营养丰富,且成鱼在长期的海洋生活中积累了大量的矿物元素,属于优质海鱼。

关键词：大弹涂鱼幼鱼成鱼肌肉营养物质含量脂肪酸

大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)Gal-8L基因序列及其细菌凝集活性的鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋与湖沼 2018年第2期49卷 413-421页

作者：梁亚芳史雨红苗亮陈炯宁波大学海洋学院生物化学与分子生物学实验室宁波315211

半乳糖凝集素-8基因(galectin-8,Gal-8)属于凝集素家族一员。已知Gal-8在哺乳动物的先天免疫中发挥重要作用,然而在鱼类中却鲜有报道。本研究通过转录组测序获得大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)半乳糖凝集素-8样基因(galectin-... 详细信息

半乳糖凝集素-8基因(galectin-8,Gal-8)属于凝集素家族一员。已知Gal-8在哺乳动物的先天免疫中发挥重要作用,然而在鱼类中却鲜有报道。本研究通过转录组测序获得大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)半乳糖凝集素-8样基因(galectin-8 like,Bp Gal-8L)c DNA序列。首先确定其序列特征,其次采用实时定量PCR(real-time quantitative PCR,q PCR)的方法鉴定Bp Gal-8L组织表达分布及其与迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感染相关性;最后分别通过原核表达获得N端和C端CRD区重组蛋白Bp Gal-8L-N和Bp Gal-8L-C,并采用玻片法观察这两个CRD区的细菌凝集活性和糖类结合特性。多重序列比对显示,Bp Gal-8L蛋白含有两个糖识别结构域(carbohydrate recognition domain,CRD),但只有C端的CRD区存在Gal家族典型的β-半乳糖苷糖类结合基序。系统进化树表明Bp Gal-8L属于鱼类Gal-8的一种亚型。q PCR结果显示,Bp Gal-8L基因m RNA在各组织中普遍表达,并且在迟缓爱德华氏菌感染后大弹涂鱼肝和脾中表达量呈上调趋势。细菌凝集实验结果显示,只有Bp Gal-8L-C重组蛋白对检测的5种革兰氏阴性菌及2种革兰氏阳性菌有凝集作用,并与乳糖和脂多糖特异性结合。综上所述,Bp Gal-8L与大弹涂鱼抗菌免疫密切相关,且其N端和C端CRD区发挥不同作用。

关键词：半乳糖凝集素-8样基因细菌凝集糖结合特异性大弹涂鱼

大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)piscidin 1的分子特征及功能分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋与湖沼 2018年第2期49卷 422-431页

作者：管峰李长红聂力苗亮陈炯宁波大学海洋学院宁波315211 浙江万里学院生物与环境学院宁波315100

Piscidin类抗菌肽具有广谱的抗菌活性,在鱼类先天性免疫中扮演重要角色。本文对大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)单核/巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ)转录组测序获得piscidin 1基因(Bppis1)c DNA全序列。Bppis1基因c DNA序列由327个核苷酸组成,开放阅读框为207bp,编码68个氨基酸,预测相对分子量为7.7k Da,等电点为5.51。氨基酸序列多重比对分析表明,Bppis1具有piscidin家族的特征结构,信号肽序列最为保守,终止于GEG序列后,与黄条(Seriola lalandi)piscidin同源性最高,为40.8%;系统进化树分析表明,Bppis1属于piscidin 1类,与黄条piscidin进化相关性最高。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-q PCR)结果显示,Bppis1m RNA在健康鱼鳃中表达量最高;迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感染后,大弹涂鱼肝、脾、肾、鳃和皮肤中Bppis1 m RNA表达量显著上调。体外抑菌实验结果表明,人工合成的Bppis1成熟肽抑菌活性较广泛,但对迟缓爱德华氏菌和3株革兰氏阳性菌无抑菌活性。大弹涂鱼MO/MΦ经1.0μg/m L Bppis1成熟肽处理后,对FITC标记的创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的吞噬活性显著增加。综上,Bppis1在大弹涂鱼先天免疫中发挥重要作用,可能作为抵抗病原体入侵的潜在治疗药物。

关键词：大弹涂鱼 Piscidin 迟缓爱德华氏菌抗菌活性吞噬活性