检索结果-南通市图书馆

中国汉族人群DNA修复基因XRCC1多态性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基础医学与临床 2009年第9期29卷 994-995页

作者：宋宝刘杰宋现让谢丽吕丽燕郑燕山东省肿瘤医院基础研究中心山东济南250117 山东省肿瘤医院内三科山东济南250117

X射线交错互补修复基因1(X-ray repair cross comp lement-mg gene ***1)是一种重要的DNA修复基因,参与DNA单链断裂和碱基损伤修复.目前发现XRCC1基因编码区有3个单核苷酸多态性位点,分别为C26304T(Arg194Trp)、G27466A(Arg280His)和G28152A(Arg399Gln)[1],可导致相应的编码氨基酸发生改变.这些变异可能影响XRCC1蛋白的活性,从而影响个体DNA修复能力.本研究采用限制性片段长度多态分析方法(PCR-RFLP)对汉族人群XRCC1基因多态性进行检测.

关键词：单核苷酸多态性位点 DNA修复基因中国汉族人群 XRCC1 DNA单链断裂基因编码区 gene 损伤修复

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

CCR5在慢性乙型肝炎中的研究进展

中国免疫学杂志 2015年第9期31卷 1269-1273页

作者：乔兵孙学华张鑫周振华李曼高月求(指导) 上海中医药大学附属曙光医院上海市中医临床重点实验室上海201203

趋化因子受体5（ CCR5）是一类趋化因子受体，它之所以现在受到世界医学界的日益关注，主要由于十几年前它作为HIV的辅助受体之一［1］， CCR5基因编码区32 bp片段的缺失（即CCR5Δ32）导致其不表达在 T 细胞表面，从而能够阻止 HIV 感... 详细信息

趋化因子受体5（ CCR5）是一类趋化因子受体，它之所以现在受到世界医学界的日益关注，主要由于十几年前它作为HIV的辅助受体之一［1］， CCR5基因编码区32 bp片段的缺失（即CCR5Δ32）导致其不表达在 T 细胞表面，从而能够阻止 HIV 感染［2］。研究发现CCR5作为一个免疫反应的调节因子受体主要通过调节炎症［3］，调整免疫细胞的运动及其功能而发挥重要作用［4-8］。 CCR5及其配体能够吸引效应T细胞进入肝脏并且调节炎性细胞分泌的炎性细胞因子如IFN-γ和细胞表面分子FasL等，这就为研究T细胞介导的肝脏炎症性疾病，如自身免疫性肝炎（ AIH）以及HCV、HBV等引起的病毒性肝病提供了可能的治疗靶点和方向［9，10］。本文主要针对CCR5在慢乙肝研究领域中的一些研究进展进行阐述。

关键词： CCR5 慢性乙型肝炎趋化因子受体5 细胞表面分子炎性细胞因子自身免疫性肝炎炎症性疾病基因编码区

巴马猪BECN2基因的克隆及其mRNA组织表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

黑龙江畜牧兽医 2022年第1期 60-65,70,134,135页

作者：王玥郭晓晨姜超前牟彦双刘忠华东北农业大学黑龙江省动物细胞与遗传工程实验室哈尔滨150030

为了探究巴马猪BECN2基因编码蛋白的生物学特性及其mRNA在巴马猪不同组织中表达水平,试验采用PCR方法扩增并克隆巴马猪BECN2基因CDS全长序列;通过生物信息学方法对其编码蛋白进行分析并构建系统进化树;应用实时荧光定量PCR方法检测巴马... 详细信息

为了探究巴马猪BECN2基因编码蛋白的生物学特性及其mRNA在巴马猪不同组织中表达水平,试验采用PCR方法扩增并克隆巴马猪BECN2基因CDS全长序列;通过生物信息学方法对其编码蛋白进行分析并构建系统进化树;应用实时荧光定量PCR方法检测巴马猪BECN2基因mRNA在不同组织中表达情况。结果表明:经PCR扩增巴马猪BECN2基因CDS全长序列大小为1302 bp;巴马猪BECN2蛋白是一种结构较不稳定的亲水性蛋白,由433个氨基酸组成,亮氨酸含量最高,占比为13.2%。巴马猪BECN2蛋白二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、β-折叠和β-转角构成,占比分别为50.04%、34.41%、10.16%、1.39%,其氨基酸主要存在于细胞膜外;亚细胞主要定位在细胞核和线粒体中,占比为56.5%和21.7%;存在16个磷酸化位点,分别为10个丝氨酸、5个苏氨酸、1个酪氨酸位点,在第1~20个编码氨基酸位点可能存在信号肽结构。巴马猪BECN2基因核苷酸序列与江豚、海豚的同源性较高,为84.3%。巴马猪BECN2蛋白氨基酸序列与牛和羊的遗传距离较近。BECN2基因mRNA在巴马猪不同组织中均有表达,且在卵巢、肺脏、心脏、睾丸、空肠、大脑、小脑、胃、皮肤、骨骼肌组织中表达量较高。说明巴马猪BECN2基因在细胞中发挥关键作用。

关键词： BECN2基因巴马猪克隆组织表达基因编码区进化树

辣椒温和斑点病毒(PMMV)外壳蛋白基因的克隆和序列测定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物生理学通讯 2005年第2期41卷 205-207页

作者：黄粤马荣群翟晓灵岳文辉潘忠强李梅崔健李显日青岛市农业科学研究院青岛市农业生物技术重点实验室青岛266100

从本院分离的辣椒温和斑点病毒株系PMMV-QD中提取RNA。根据已有报道的外壳蛋白(CP)自行设计引物P1、P2,用RT-PCR扩增PMMV-QD的CP基因的cDNA,插入pMD18-T载体,转化感受态受体菌XL1-Blue,以蓝白菌落筛选转化株,用PCR检测白色菌落,确认获... 详细信息

从本院分离的辣椒温和斑点病毒株系PMMV-QD中提取RNA。根据已有报道的外壳蛋白(CP)自行设计引物P1、P2,用RT-PCR扩增PMMV-QD的CP基因的cDNA,插入pMD18-T载体,转化感受态受体菌XL1-Blue,以蓝白菌落筛选转化株,用PCR检测白色菌落,确认获得了含cDNA的阳性重组子。序列测定和比较的结果表明该片段确含有PMMV的CP基因编码区,此种cDNA与国外报道的PMMV病毒株系核苷酸序列的同源性达到97.7%。

关键词：序列测定外壳蛋白基因病毒斑点辣椒克隆 cDNA PCR扩增 PCR检测基因编码区核苷酸序列自行设计 CP基因 RNA pMD T载体受体菌感受态重组子同源性株系转化菌落引物

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于谱分析的DNA序列识别算法研究

数学的实践与认识 2013年第14期43卷 94-104页

作者：魏毅王开华郑建超王平陶晓臻解放军理工大学通信工程学院江苏南京210007

对基于谱分析的DNA序列识别中相关问题建立了数学模型,并进行了计算及结果分析.提出了一种基于频数二次型的功率谱快速算法和基于帕斯瓦尔定理的信噪比快速算法,建立了基于模糊逻辑的自适应阈值模型,提出了基于重复序列的边界搜索算法,... 详细信息

对基于谱分析的DNA序列识别中相关问题建立了数学模型,并进行了计算及结果分析.提出了一种基于频数二次型的功率谱快速算法和基于帕斯瓦尔定理的信噪比快速算法,建立了基于模糊逻辑的自适应阈值模型,提出了基于重复序列的边界搜索算法,最后利用谱分析对基因突变中的伪鞍部进行了识别.

关键词：基因编码区功率谱信噪比自适应阈值

多巴反应性肌张力障碍三磷酸鸟苷环化水解酶Ⅰ基因突变检测

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华神经科杂志 2005年第1期38卷 42-45页

作者：周海燕张本恕天津医科大学总医院神经科

目的　检测多巴反应性肌张力障碍 (dopa responsivedystonia,DRD)三磷酸鸟苷环化水解酶Ⅰ(guanosinetriphosphatecyclohydrolaseⅠ, GCH1)基因编码区的突变。方法　对 2个DRD家系的 5例患者和 6例散发患者及其 18名亲属和 20名健康对照... 详细信息

目的　检测多巴反应性肌张力障碍 (dopa responsivedystonia,DRD)三磷酸鸟苷环化水解酶Ⅰ(guanosinetriphosphatecyclohydrolaseⅠ, GCH1)基因编码区的突变。方法　对 2个DRD家系的 5例患者和 6例散发患者及其 18名亲属和 20名健康对照者的GCH1基因编码区进行聚合酶链反应单链构象多态性(PCR SSCP)分析;对PCR SSCP异常的外显子进行PCR产物直接测序,若患者 6个外显子PCR SSCP均无异常,则对所有外显子测序;为了确证突变,引入SphⅠ限制性内切酶位点进行聚合酶链反应限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)分析。结果　在 1个呈常染色体显性遗传DRD家系中发现 1个新的杂合型点突变(A224G)。此突变位于 1号外显子,由酪氨酸错义突变为半胱氨酸(Tyr75Cys), 20名健康对照者等位基因无此突变。另 1家系和其他散发患者在GCH1基因编码区未发现基因突变。序列分析提示与 2号外显子邻近的 1号内含子部分和与 3号外显子邻近的 3号内含子部分存在基因多态性。结论　我们描述了一个新的错义突变Tyr75Cys,GCH1基因编码区突变能解释部分DRD患者的发病原因。

关键词：患者 DRD 突变外显子多巴反应性肌张力障碍 PCR—SSCP 家系基因编码区水解酶鸟苷

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

随机DNA序列中ORF的分布

内蒙古大学学报（自然科学版） 2002年第5期33卷 515-519页

作者：李宏罗辽复内蒙古大学理论物理与理论生物学研究室内蒙古呼和浩特010021

研究了组分约束下的随机 DNA序列中 ORF数目、ORF的长度与随机序列总长度和GC含量之间的关系 .结果表明 ,ORF数目的对数与 ORF的长度之间存在很好的线性关系 ;ORF的最大长度随序列长度的增加而变长 ,ORF的总数与序列长度成正比 ;ORF的... 详细信息

研究了组分约束下的随机 DNA序列中 ORF数目、ORF的长度与随机序列总长度和GC含量之间的关系 .结果表明 ,ORF数目的对数与 ORF的长度之间存在很好的线性关系 ;ORF的最大长度随序列长度的增加而变长 ,ORF的总数与序列长度成正比 ;ORF的总数目随着 GC含量的增加明显减少 ;随着 GC含量的增加 ,长度较短的 ORF数目相对减少 ,长度较长的 ORF数目相对增加 ;随着序列长度的增加 ,长度较短的 ORF相对增多 .

关键词：随机DNA序列开阅读框架 GC含量分布规律人类基因组计划基因编码区基因组信息学

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

与基因工程有关的一些概念之辨析

生物学教学 2016年第2期41卷 62-64页

作者：陈卫东江苏省沭阳高级中学

1启动子、起始密码和复制原点启动子：是基因的一个组成部分，其化学本质是DNA的部分序列，控制基因转录的起始时间和基因表达的程度。启动子就像“开关”，决定基因的活动。启动子存在于基因编码区上游的非编码区，是位于结构基因5’... 详细信息

1启动子、起始密码和复制原点启动子：是基因的一个组成部分，其化学本质是DNA的部分序列，控制基因转录的起始时间和基因表达的程度。启动子就像“开关”，决定基因的活动。启动子存在于基因编码区上游的非编码区，是位于结构基因5’端上游的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。在启动子上有与RNA聚合酶结合的位点。

关键词：基因工程 RNA聚合酶 DNA序列启动子基因编码区模板DNA 复制原点组成部分

miR-20a通过靶向PKG1的编码区调控人肺动脉平滑肌细胞的表型的转换

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

miR-20a通过靶向PKG1的编码区调控人肺动脉平滑肌细胞的表型的转换

作者：潘燕平深圳大学

学位级别：硕士

背景:缺氧性肺动脉高压(hypoxic pulmonary hypertension,HPH)是慢性阻塞性肺疾病和高原心脏病等疾病发生的重要病理基础。慢性缺氧最终会导致肺血管重建,此过程伴随着肺动脉平滑肌细胞(pulmonary arterial smooth muscle cells,PASMCs... 详细信息

背景:缺氧性肺动脉高压(hypoxic pulmonary hypertension,HPH)是慢性阻塞性肺疾病和高原心脏病等疾病发生的重要病理基础。慢性缺氧最终会导致肺血管重建,此过程伴随着肺动脉平滑肌细胞(pulmonary arterial smooth muscle cells,PASMCs)从具收缩能力的分化表型向强增殖能力的合成表型的转换。近年来研究表明,micro RNA(mi RNA)通过影响PASMCs的分化、增殖、迁移和凋亡等方面,在肺血管重建中起重要的调控作用。然而,目前对于mi RNA在缺氧条件下调控PASMCs的分子机制的认识仍然十分有限。目的:研究mi R-20a在缺氧诱导的人肺动脉平滑肌细胞表型转换中的作用及调控机制。方法和结果:首先,通过定量PCR检测,发现mi R-20a在缺氧诱导的肺高压小鼠的肺组织和肺动脉中的表达显著上调;对体外培养的人肺动脉平滑肌细胞(human pulmonary arterial smooth muscle cells,HPASMCs)进行缺氧处理,发现mi R-20a的表达也显著上调;在HPASMCs中分别过表达或抑制mi R-20a,通过Ed U掺入实验、划痕实验及western blot方法分析其对HPASMCs功能的影响,发现mi R-20a能够抑制分化表型蛋白calponin、α-SMA、Smoothelin、MHC和SM-22的表达,促进细胞的增殖和迁移;以上结果表明mi R-20a在缺氧诱导的HPASMCs中表达上调,并促进细胞向去分化表型转换。其次,通过定量PCR和western blot方法,验证了与HPASMCs分化表型维持密切相关的c GMP依赖性蛋白激酶1(PKG 1)的m RNA和蛋白表达在缺氧条件下均显著下调;通过western blot检测发现在HPASMCs中过表达或抑制mi R-20a能够分别下调或上调PKG 1的蛋白表达水平,提示PKG 1可能是mi R-20a的靶基因;通过双荧光素酶报告基因分析,发现mi R-20a对PKG 1的3’-UTR及启动子没有明显的调控作用,进一步分析PKG 1的编码序列,通过定点突变和western blot检测,证明mi R-20a通过靶向PKG 1编码区的两个高保守的识别位点,在转录后水平上抑制其蛋白表达;细胞功能实验结果表明,PKG 1能够促进分化表型蛋白的表达,并抑制细胞的增殖和迁移,使细胞向分化表型转换;此外,通过定量PCR检测先天性心脏病相关的肺动脉高压患者血清中的mi RNA变化,发现mi R-20a的表达显著上调,提示其可能作为潜在的循环标志物在肺动脉高压的临床诊断中发挥作用。结论:本研究发现了mi R-20a在缺氧诱导的HPASMCs中表达上调,证明了其通过靶向PKG1编码区抑制其蛋白表达,从而促进细胞的增殖、迁移,使细胞向去分化表型转换。研究结果不仅揭示了缺氧下调PKG 1的表达及促进HPASMCs表型转换的分子机制,也为肺动脉高压的临床诊断和治疗提供了新思路。

关键词： micro RNA cGMP依赖性蛋白激酶I 基因编码区肺动脉平滑肌细胞缺氧