检索结果-南通市图书馆

情报杂志 2003年第7期22卷 81-82页

作者：方向辉安徽医科大学图书馆合肥230032

阐述了基因数据库的建立背景及其数据来源和相关分类 ,基因数据库的数据类型及各相关数据库概况。

关键词：基因数据库建立背景数据来源数据类型

PHP技术支持的基因数据库Web平台构建(英文)

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计算机与应用化学 2006年第12期23卷 1215-1218页

作者：刘国祥董颖刘明银云南师范大学化学化工学院云南昆明650031 莱顿大学高级计算机学院荷兰莱顿2312HG 云南省医学信息研究所云南昆明650118 云南省昆明市第八中学云南昆明650118

PHP技术是高效的WEB设计技术之一,以快速、方便的设计、友好的界面和灵活的嵌入特性见长。本研究通过把各种不同存储形式的基因数据库转换为Oracle格式,然后在基因数据库之间建立数据连接,借助PHP技术搭建了基因数据库的Web服务平台,从... 详细信息

PHP技术是高效的WEB设计技术之一,以快速、方便的设计、友好的界面和灵活的嵌入特性见长。本研究通过把各种不同存储形式的基因数据库转换为Oracle格式,然后在基因数据库之间建立数据连接,借助PHP技术搭建了基因数据库的Web服务平台,从而实现了基因数据库的Web服务。解决了繁杂基因数据库共享使用难的问题,实现了通过高效、简单、快速的PHP操作平台检索基因数据库的功能,为发挥这些基因数据库的潜在价值创造了很好的检索环境。

关键词： Web服务 PHP技术基因数据库

江苏口岸鼠类监测与重点鼠类mtDNA-Cytb基因数据库的建立

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江苏口岸鼠类监测与重点鼠类mtDNA-Cytb基因数据库的建立

作者：周鹏程苏州大学

学位级别：硕士

[目的]监测江苏口岸本底鼠类的种类及其病原体携带情况,建立一套重要鼠类的mt DNA-Cytb基因数据库。[方法]2014年5月~2015年4月,在江苏17个口岸采用夹夜法捕获本底鼠样;首先通过形态特征鉴定捕获的鼠样,在生物安全柜中解剖鼠样取其肝脏... 详细信息

[目的]监测江苏口岸本底鼠类的种类及其病原体携带情况,建立一套重要鼠类的mt DNA-Cytb基因数据库。[方法]2014年5月~2015年4月,在江苏17个口岸采用夹夜法捕获本底鼠样;首先通过形态特征鉴定捕获的鼠样,在生物安全柜中解剖鼠样取其肝脏与肺脏,分别提取鼠类肝脏的DNA模板与肺脏的RNA模板;通过PCR扩增和测序,测定鼠类的Cytb基因序列,通过BLAST与NCBI的基因数据库比对,以同源性最高为分子鉴定结果。通过荧光PCR筛查捕获鼠样中的鼠疫杆菌和汉坦病毒感染情况,对阳性结果再进行测序验证与分型。最后将江苏各口岸代表性鼠样的Cytb基因序列信息与各口岸的地理分布信息结合,构建江苏口岸本底鼠类的基因特征数据库,建立Cytb基因的系统发育树。[结果]共采集鼠样418份,其中褐家鼠231只、黄胸鼠38只、小家鼠99只、黑线姬鼠44只和大麝鼩6只,其形态鉴定结果与分子鉴定结果完全一致。全部鼠样中鼠疫杆菌的荧光PCR检测均为阴性,而汉坦病毒的荧光PCR检测有18例阳性,阳性率4.31%,其中15例为汉城型（SEO）,其宿主均为来源于连云港口岸的褐家鼠;其余3例为汉滩型（HTN）,其宿主均为来源于南京龙潭港的黑线姬鼠。通过对各口岸的重要鼠种进行测序,构建成涵盖17个口岸的本底鼠类Cytb基因特征数据库,其中南通、扬州、南京、张家港、无锡、连云港、淮安有黑线姬鼠的地理代表种;南京、张家港、镇江、江阴、常州、泰州、常熟、宿迁有小家鼠的地理代表种;无锡、连云港、宿迁、太仓有褐家鼠的地理代表种;扬州、南京、张家港、泰州、太仓、吴江、昆山、苏州有黄胸鼠的地理代表种。通过基因特征数据建立的系统发育树能清楚的分辨各种鼠类,5种鼠种分别与参考鼠种的基因聚在一起,形成独立的5个类群。[结论]江苏口岸仍以黄胸鼠、褐家属、小家属和黑线姬鼠4中种鼠类为常见种,偶见大麝鼩,未见其他鼠类。基于鼠类Cytb基因序列信息的的分子鉴定方法准确率高,与本次常见鼠种的形态鉴定结达到100%的一致,可满足口岸鼠类鉴定工作的实际需求。在江苏口岸本底鼠类中未检出鼠疫杆菌,但连云港口岸的褐家鼠与南京龙潭港的黑线姬鼠中携带有汉坦病毒,存在流行性出血热发生和流行的风险,应及时进行卫生处理与重点监测。基于江苏口岸重点鼠类Cytb系统发育树的风险评估,提示南京、无锡、南通、扬州和连云港发生I型肾综合征出血热流行的风险较高,而连云港和宿迁发生II型肾综合征出血热流行的风险较高。

关键词：鼠类鼠疫汉坦病毒病原体 Cytb基因基因数据库

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木材基因数据库的建设

木材基因数据库的建设

作者：许挺兰州大学

学位级别：硕士

木材的主要成分是植物细胞的细胞壁,在当下生产和生活中扮演着不可或缺的角色。除了在房屋建造领域有着重要的作用之外,某些树种的木材还可以制成家具,在生活中有着广泛的应用。另外,木材也是制造纸张的原材料,是生活中不可或缺的重要... 详细信息

木材的主要成分是植物细胞的细胞壁,在当下生产和生活中扮演着不可或缺的角色。除了在房屋建造领域有着重要的作用之外,某些树种的木材还可以制成家具,在生活中有着广泛的应用。另外,木材也是制造纸张的原材料,是生活中不可或缺的重要资源。然而,我国的木材的人均拥有量非常低,每年都需要从国外大量的进口以填补缺口。为了提高木材的产量,细胞壁和木材形成过程的相关基因一直是植物学研究中的热点。木材基因数据库(http://***/woodfor mation/)收集了大量与木材形成过程相关的基因,并开发了一个综合性的数据库在线供科研工作者访问。为了创建这个数据库,本研究收集了大量的已发表的植物基因组数据,并用BLAST和HMMER对细胞壁和木材形成的相关基因做了预测和整理。至今为止,本数据库共收录丁’47个基因家族／超家族,和57个已发表的植物基因组(包括了28个草本植物,22个木本植物,7个非维管植物),总计40,000余万条基因序列。为了方便访问者对这些基因序列进行检索,本数据库提供了多种的检索方式并且检索的结果可以进行免费的下载,并且本数据库还支持在线的比对和建树分析的功能。木材基因数据库整合了当下已发表的植物基因组,并为科研工作者提供一个基因查询、下载和分析的综合性平台。因此,木材数据库对专注于细胞壁和木材研究的科学研究者有着很大的帮助。

关键词：基因数据库植物基因组细胞壁木材

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基因数据库:个人选择和社会利益

中国医学伦理学 2004年第1期17卷 7-8页

作者： Ruth Chadwick 鲍贻倩英国兰开斯特大学ESRC基因组计划经济学及社会学问题中心中国协和医科大学北京100005

引言2003年6月6日出版的《科学》杂志上有一个关于建立美国黑人基因库的建议。这一建议希望在五年内采集25000个志愿者的DNA样品，以“有助于从各种因素中区分基因差异和社会经济或其他环境因素对美国黑人疾病的影响”。同时希望这一研... 详细信息

引言2003年6月6日出版的《科学》杂志上有一个关于建立美国黑人基因库的建议。这一建议希望在五年内采集25000个志愿者的DNA样品，以“有助于从各种因素中区分基因差异和社会经济或其他环境因素对美国黑人疾病的影响”。同时希望这一研究可以改变Tuskegee梅毒试验以来美国黑人对医学研究的不信任。

关键词：基因数据库个人选择社会利益医学伦理学自主权个性

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我国人类基因数据库元数据规范的设计

中华医学图书情报杂志 2019年第7期28卷 1-6,20页

作者：刘一依王世民武琼赵飞胡建平沈丽宁华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院湖北武汉430030 国家卫生健康委统计信息中心北京100044

以我国人类基因数据库建设需求为导向,参考国内外人类基因数据库的元数据,设计了我国人类基因数据库元数据规范,包括标识维度、关系维度、文献维度、内容维度和管理维度,旨在为我国人类基因数据的采集和储存提供技术规范的支撑。

关键词：精准医学基因数据库元数据元数据规范

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人口基因数据库建设方兴未艾

国外科技动态 2002年第12期 11-13页

作者：任春红

1997年,冰岛一家名为deCODEGenetics的生物技术公司发布了一个惊人的声明:计划与冰岛政府签订一份合同,将冰岛全部27万公民的健康资料加密后输入一个数据库中,同时与个人的DNA资料相结合,从而建立一个庞大的全民基因数据库。此举即刻在... 详细信息

1997年,冰岛一家名为deCODEGenetics的生物技术公司发布了一个惊人的声明:计划与冰岛政府签订一份合同,将冰岛全部27万公民的健康资料加密后输入一个数据库中,同时与个人的DNA资料相结合,从而建立一个庞大的全民基因数据库。此举即刻在冰岛内外引起了广泛的争议。时至今日,对deCODEGenetics公司的质疑声仍未平息,包括美国在内的多个国家的卫生医疗部门却在纷纷仿效冰岛的做法,积极筹划在大范围人群中采集DNA样本,并与个人的健康记录相结合,建立一种新型的人口遗传资源数据库,并承诺将藉此为公民提供“个性化的医疗服务,而他们也面临着同样的科学与伦理学问题。

关键词：人类基因数据库医疗服务遗传学

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PHP技术支持的基因数据库Web平台构建

计算机光盘软件与应用 2012年第22期15卷 210-211页

作者：马力武汉软件工程职业学院武汉430205

PHP技术是计算机网页设计的重要应用技术,使用PHP技术进行计算机网页平台的设计开发应用,不仅具有较快的开发设计与构建速度,并且在进行计算机网页设计构建的过程中操作也比较简单,具有较大的应用优势。本文主要结合生物基因数据库的特... 详细信息

PHP技术是计算机网页设计的重要应用技术,使用PHP技术进行计算机网页平台的设计开发应用,不仅具有较快的开发设计与构建速度,并且在进行计算机网页设计构建的过程中操作也比较简单,具有较大的应用优势。本文主要结合生物基因数据库的特点,以及PHP技术进行计算机网页平台构建设计的应用优势等,从PHP技术支持的计算机生物基因数据库网页平台的软件配置、系统流程设计、基因数据库网络实用技术等方面,对于PHP技术支持的基因数据库Web平台构建过程进行分析论述。

关键词： PHP技术基因数据库 Web服务平台设计构建实现分析

Expasy数据库与基因数据库交联比对法初步分析SELDI蛋白质荷峰

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中国中医药现代远程教育 2009年第10期7卷 7-8页

作者：赖梅生南方医科大学中医药学院中医外科教研室

目的探索确定SELDI识别出的蛋白质荷峰性质的方法。方法应用基因数据库与Expasy等蛋白数据库交联比对分析方法来初步分析SELDI得到系统性红斑狼疮淋巴细胞候选质荷峰的蛋白性质。结果应用基因数据库与Expasy等蛋白数据库交联比对分析方... 详细信息

目的探索确定SELDI识别出的蛋白质荷峰性质的方法。方法应用基因数据库与Expasy等蛋白数据库交联比对分析方法来初步分析SELDI得到系统性红斑狼疮淋巴细胞候选质荷峰的蛋白性质。结果应用基因数据库与Expasy等蛋白数据库交联比对分析方法可以初步明确SELDI法建立的蛋白质荷峰的蛋白可能属性的较小范围，为进一步确定蛋白质荷峰的性质提供更加明确的方向，为进一步研究打下基础，该方法有待进一步完善与验证。

关键词： SELDI 蛋白鉴定基因数据库

国际遗传,基因数据库的比较分析及其检索途径

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高校文献信息研究 1999年第1期6卷 38-40页

作者：张颖雷燕中山大学图书馆