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我国蚊虫体内感染的Wolbachia的wsp基因序列测定与分析

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昆虫学报 2002年第5期45卷 571-577页

作者：宋社吾赵彤言董言德蒋书楠陆宝麟军事医学科学院微生物流行病研究所北京100071 西南农业大学植物保护系重庆400716

测定了我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊蚊虫体内感染的Wolbachia株的wsp基因序列。核苷酸和氨基酸的同源性及系统关系分析表明 ,我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊中Wolbachia株的wsp基因序列与Pip组其它株的核苷酸及氨基酸同源性分别为 98%～... 详细信息

测定了我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊蚊虫体内感染的Wolbachia株的wsp基因序列。核苷酸和氨基酸的同源性及系统关系分析表明 ,我国尖音库蚊复合组和白纹伊蚊中Wolbachia株的wsp基因序列与Pip组其它株的核苷酸及氨基酸同源性分别为 98%～ 10 0 %和 97%～ 10 0 % ,属B大组Wolbachia中的Pip组。

关键词：蚊虫体内感染 Wolbachia 基因序列测定尖音库蚊复合组白纹伊蚊昆虫共生微物

北京人类免疫缺陷病毒1型阳性吸毒者env基因序列测定和亚型分析

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中华预防医学杂志 2010年第6期44卷 572-573页

作者：李桂英贺雄叶景荣卢红艳汪宁北京市疾病预防控制中心性病艾滋病防治所 100013

人类免疫缺陷病毒1型（human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）高度变异既是病毒自身特点决定的,也是适应环境和免疫逃逸的结果[1].一般来说感染的途径不同,HIV-1病毒的变异情况也不同.北京于1993年发现首例静脉吸毒感染HIV的吸毒... 详细信息

人类免疫缺陷病毒1型（human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）高度变异既是病毒自身特点决定的,也是适应环境和免疫逃逸的结果[1].一般来说感染的途径不同,HIV-1病毒的变异情况也不同.北京于1993年发现首例静脉吸毒感染HIV的吸毒者,2000年开始对吸毒人群进行哨点监测,2006年首次对流动人口中的吸毒者HIV-1毒株亚型进行测定,但关于北京吸毒人群HIV-1的毒株亚型及其分布仍知之甚少.

关键词：人类免疫缺陷病毒1型基因序列测定亚型分析吸毒者 immunodeficiency 北京 HIV-1病毒 HIV-1毒株

人源性抗HBc单链抗体的筛选、鉴定及基因序列测定

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中国病理生理杂志 2003年第3期19卷 329-333页

作者：汤正好马会慧陈文思顾琳李刚姚集鲁中山大学附属第三医院传染病科广东广州510630

目的 :筛选人源性抗乙型肝炎病毒核心蛋白 (HBc)单链抗体 (ScFv)并在体外原核表达、鉴定和基因序列测定 ,为抗HBcScFv的进一步研究奠定基础。方法 :采用噬菌体表面展示技术 ,以乙肝病毒核心抗原为包被抗原 ,从人源性单链噬菌体抗体库中... 详细信息

目的 :筛选人源性抗乙型肝炎病毒核心蛋白 (HBc)单链抗体 (ScFv)并在体外原核表达、鉴定和基因序列测定 ,为抗HBcScFv的进一步研究奠定基础。方法 :采用噬菌体表面展示技术 ,以乙肝病毒核心抗原为包被抗原 ,从人源性单链噬菌体抗体库中经过 3轮“吸附 -感染 -扩增”的筛选过程 ,获得抗原结合活性较强的人源性抗HBc单链抗体阳性克隆 ,并在大肠杆菌HB2 15 1中进行ScFv可溶性表达 ,对其进行免疫学鉴定和序列测定。结果 :筛选出的ScFv具有抗HBc的特异性 ,并可在大肠杆菌中进行可溶性表达 ;基因序列测定表明 ,该ScFv的重链段基因与人类免疫球蛋白重链可变区相符 ,轻链段基因为人类免疫球蛋白κ轻链可变区。结论 :利用噬菌体抗体库技术。

关键词：人源性抗HBc单链抗体筛选鉴定基因序列测定乙型肝炎

浙江鼬獾狂犬病毒F01株P和M基因序列测定分析

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中华预防医学杂志 2009年第6期43卷 543-544页

作者：雷永良王晓光李浩陈秀英叶碧峰柳付明兰进权梅建华唐青浙江省丽水市疾病预防控制中心 323000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

狂犬病毒（rabiesvirus，RABV）广泛存在于多种哺乳动物体内，并在宿主动物之间相互传播。鼬獾又名白面鼬，野生小型貂科动物，杂食性，浙江全境均有分布。近几年浙江省人狂犬病疫情不仅仅局限于通过犬传播，鼬獾咬伤致人狂犬病的情况... 详细信息

狂犬病毒（rabiesvirus，RABV）广泛存在于多种哺乳动物体内，并在宿主动物之间相互传播。鼬獾又名白面鼬，野生小型貂科动物，杂食性，浙江全境均有分布。近几年浙江省人狂犬病疫情不仅仅局限于通过犬传播，鼬獾咬伤致人狂犬病的情况已有报道。为了解野生动物狂犬病毒街毒流行株的分子特征，笔者对检测获得的鼬獾F01株狂犬病毒的P、M基闽序列进行扩增并测序，将其与中国人、犬毒株以及目前使用的疫苗株进行比较分析，现报道如下。

关键词：狂犬病毒街毒基因序列测定浙江省动物体内人狂犬病野生动物宿主动物分子特征

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猪瘟病毒新疆分离株E2基因序列测定及分析

畜牧与兽医 2015年第5期47卷 158-159页

作者：汪萍陆桂丽成进王文沙依兰.卡依扎彭晓玲夏俊新疆畜牧科学院兽医研究所新疆乌鲁木齐830000 新疆维吾尔自治区动物卫生监督所乌鲁木齐830063

猪瘟病毒（classical swine fever virus,CSFV） E2蛋白是诱导产生保护性中和抗体的主要抗原结构蛋白,是瘟病毒主要的免疫相关基因.本文选择E2蛋白作为目的基因,用于猪瘟病毒新疆分离株的遗传进化分析.通过基因分型,我们能很好地阐明猪... 详细信息

猪瘟病毒（classical swine fever virus,CSFV） E2蛋白是诱导产生保护性中和抗体的主要抗原结构蛋白,是瘟病毒主要的免疫相关基因.本文选择E2蛋白作为目的基因,用于猪瘟病毒新疆分离株的遗传进化分析.通过基因分型,我们能很好地阐明猪瘟病毒不同毒株间的遗传演化关系,为追溯病毒的传播来源和预测预警流行趋势奠定基础.

关键词：猪瘟病毒 E2蛋白基因序列测定分离株新疆免疫相关基因遗传进化 virus

辽宁省HIV-1株的基因序列测定和亚型分析

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中国公共卫生 2003年第11期19卷 1312-1313页

作者：韩晓旭卢春明周立平姜凤霞姜拥军王亚男张子宁文小宁尚红中国医科大学附属第一医院艾滋病研究室沈阳110001 辽宁省疾病预防控制中心

目的　通过DNA序列分析 ,确定辽宁省HIV -1流行毒株的亚型。方法　从辽宁省HIV -1抗体阳性者中选择 16例 ,其中经性接触感染者 8例 ,经静脉吸毒和血液途径感染者 7例 ,垂直传播者 1例 ,采集全血提取DNA作为PCR扩增的模板 ,套式引物扩增H... 详细信息

目的　通过DNA序列分析 ,确定辽宁省HIV -1流行毒株的亚型。方法　从辽宁省HIV -1抗体阳性者中选择 16例 ,其中经性接触感染者 8例 ,经静脉吸毒和血液途径感染者 7例 ,垂直传播者 1例 ,采集全血提取DNA作为PCR扩增的模板 ,套式引物扩增HIV -1前病毒DNA的C2～V 3区用于测序。所测序列与国际标准株及国内外参考序列进行比较 ,确定被检标本的亚型。结果　辽宁省流行的HIV -1病毒分属A、B、C、G4种亚型 ,其中经性途径传播者 8例分别为B′亚型和A亚型 ,静脉吸毒者 4皆为C亚型 ,经血途径感染者分别属B′和G亚型 ,垂直传播者为A亚型。亚型内基因离散率分别为 :A亚型 (7 5± 1 0 ) % ,B′亚型 (8 5± 0 9) % ,C亚型 (5 4± 0 9) % ,G亚型 (13 5±2 1) %。结论　辽宁省目前HIV -1的流行株亚型较为复杂 ,不同传播途径感染HIV毒株亚型有所不同 ,C亚型毒株只见于静脉吸毒者 ,经性途径和血途径感染主要为B′亚型 ,而A亚型和G亚型只见于非洲劳务输出人员及其配偶子女。

关键词： HIV-1 DNA序列分析聚合酶链反应基因序列测定基因亚型分析

广西流行的猪瘟病毒株E2基因序列测定及分析

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中国生物制品学杂志 2005年第3期18卷 196-199页

作者：廖素环罗廷荣吴显实刘芳陆芹章黄伟坚温荣辉秦爱珍余克伦广西大学动物科学技术学院南宁530005

目的对广西流行的猪瘟病毒E2基因进行序列测定及分析。方法应用PCR对15株猪瘟病毒E2基因进行扩增、克隆及测序,利用DNAstar分析软件对所测定的15株毒株与兔化弱毒(HCLV)、石门(Shimen)毒株的相应基因片段进行同源性分析。结果得到长度为... 详细信息

目的对广西流行的猪瘟病毒E2基因进行序列测定及分析。方法应用PCR对15株猪瘟病毒E2基因进行扩增、克隆及测序,利用DNAstar分析软件对所测定的15株毒株与兔化弱毒(HCLV)、石门(Shimen)毒株的相应基因片段进行同源性分析。结果得到长度为1092nt猪瘟病毒E2基因,编码364个氨基酸残基的目的基因片段。广西株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为81.5%～82.8%和82.8%～84.3%,推导的氨基酸同源性分别为87.1%～88.8%和88.5%～89.9%,广西毒株之间核苷酸与推导的氨基酸同源性分别为92.3%～99.9%和94.8%～100%。广西15株猪瘟病毒E2蛋白上的全部半胱氨酸(Cys)位点均未改变,推测其E2蛋白的抗原结构保持很高的稳定性。但广西毒株中与特定单克隆抗体结合的724、725、729、734和738位的氨基酸发生了变异,这些变异可能导致不完全免疫保护。把所测定的广西15株与国内外已发表的19株病毒相应序列进行比较,建立系统发育树,所比较的34株猪瘟病毒被分为两个群,广西毒株皆属于基因群Ⅱ。结论成功进行了广西流行猪瘟病毒E2基因序列分析,为进一步探讨猪瘟病毒E2蛋白的抗原结构提供了依据。

关键词：基因序列测定流行病毒株氨基酸同源性猪瘟病毒 E2基因核苷酸同源性 E2蛋白基因序列分析基因片段抗原结构同源性分析氨基酸残基单克隆抗体系统发育树方法应用兔化弱毒分析软件 HCLV 半胱氨酸免疫保护 PCR

福建省HIV-l流行毒株的基因序列测定和亚型分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2000年第5期20卷 458-461页

作者：严延生陈舸邵一鸣邢辉郑兆双福建省流行病防治研究所中国预防医学科学院病毒学研究所

目的　通过DNA序列分析 ,确定福建省HIV 1流行毒株的亚型。方法　从福建省HIV 1抗体阳性者中选择 9例经性接触感染HIV 1者 ,采集其全血分离周围血淋巴细胞 (PBMCs)提取DNA作为PCR扩增的模板 ,设计合成 3对套式引物扩增HIV 1前病毒DNA的C... 详细信息

目的　通过DNA序列分析 ,确定福建省HIV 1流行毒株的亚型。方法　从福建省HIV 1抗体阳性者中选择 9例经性接触感染HIV 1者 ,采集其全血分离周围血淋巴细胞 (PBMCs)提取DNA作为PCR扩增的模板 ,设计合成 3对套式引物扩增HIV 1前病毒DNA的C2～V3区用于测序。所测序列与HIV 1中的 6个亚型的 10个国际标准或参考序列进行比较 ,确定被检标本的型别。结果使用PCR技术对 9份福建HIV 1阳性感染者PBMC样品进行扩增 ,获得HIV 1膜蛋白 (env)基因的核酸片段 ,并对其约 2 47bp核苷酸序列进行了分析、比较 ,证实 9份样品中 7份为E亚型 ,其余 2份分别为B和C亚型毒株。E亚型各株间序列存在一定差异 ,组内基因离散率为 6 2 8± 2 40。结论　福建省目前HIV 1的流行株主要为E亚型 ,流行株的来源较为复杂 ,株间序列差异不仅与感染时间有关 ,也和感染地点不同等因素有关 ,这些特点不同于我国其他一些省份发现的经血传播的HIV 1B或C亚型 ,其流行时间不长。

关键词：艾滋病毒流行毒株基因序列测定亚型分析福建

mtDNA 12S rRNA基因序列测定在腐烂动物肌肉样本鉴定中的应用

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刑事技术 2005年第4期30卷 10-11页

作者：黄娅琳国家林业局野生动植物刑事物证鉴定中心南京210046

目的利用mtDNA12SrRNA基因序列测定法对宁波森林公安局查获的一例腐烂动物肌肉样本进行种属鉴定,并探讨该方法在腐烂动物肌肉样本鉴定中的应用价值。方法用酚/氯仿法从腐烂动物肌肉样本中提取出基因组总DNA,再用一通用引物通过PCR技术扩... 详细信息

目的利用mtDNA12SrRNA基因序列测定法对宁波森林公安局查获的一例腐烂动物肌肉样本进行种属鉴定,并探讨该方法在腐烂动物肌肉样本鉴定中的应用价值。方法用酚/氯仿法从腐烂动物肌肉样本中提取出基因组总DNA,再用一通用引物通过PCR技术扩增mtDNA上12SrRNA基因的部分片段并进行序列测定。测序结果在GenBank上进行BLAST搜索,再利用DNAMAN软件进行同源性分析。结果扩增产物序列与东北虎的线粒体DNA的12SrRNA基因序列的部分片段的同源性高达99.9%。结论该动物样本为东北虎,本研究所用方法在野生动物案件的样本鉴定中有极高的应用价值。

关键词：野生动物线粒体DNA 12S rRNA 鉴定 12SrRNA基因 rRNA基因序列基因序列测定 mtDNA 动物肌肉