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白及不同地理群体的分子遗传学评价

北方园艺 2024年第10期 105-111页

作者：桂腾琴张思平武忠亮李春艳韦燕苗贵东兴义民族师范学院生物与化学学院贵州兴义562400 贵州省民族药用生物资源研究与开发重点实验室贵州兴义562400

以采自6个不同地理区域33份白及资源为试材,利用SRAP标记技术对白及资源进行分子遗传学评价研究,以期为白及品种资源的综合利用、野生资源的就地保护和迁地保护提供参考依据。结果表明:白及资源在物种水平遗传多样性比较丰富,白及居群... 详细信息

以采自6个不同地理区域33份白及资源为试材,利用SRAP标记技术对白及资源进行分子遗传学评价研究,以期为白及品种资源的综合利用、野生资源的就地保护和迁地保护提供参考依据。结果表明:白及资源在物种水平遗传多样性比较丰富,白及居群的遗传多样性指数分别为Ht=0.3267,Hs=0.2356,Gst=0.2506,Nm=1.4952,说明白及居群间存在少量的基因交流,而且遗传变异主要发生在居群内。6个野生居群根据UPGMA聚类,可分为2个支系。居群结构分析结果表明,K=2时,样品分类效果最佳。Mantel test检测表明,白及居群间遗传距离越大居群之间地理距离就越远,呈显著正相关性(r=0.6246;P<0.001)。

关键词：白及地理群体遗传多样性遗传结构 SRAP

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多鳞四指马鲅5个地理群体的形态差异

水产学报 2022年第8期46卷 1334-1344页

作者：章翊涵王咏雪梁海来洪运水柏年台州市污染防治工程技术中心浙江海洋大学水产学院台州市海洋环境监测中心

为探讨不同地理群体多鳞四指马鲅形态差异，实验基于2018—2019年采自海门、如东、舟山、三门、珠海5个地理群体的133尾多鳞四指马鲅个体进行35个可量性状和8个可数性状测定，并拍摄保存样本照片用于几何形态学分析。多鳞四指马鲅的传... 详细信息

为探讨不同地理群体多鳞四指马鲅形态差异，实验基于2018—2019年采自海门、如东、舟山、三门、珠海5个地理群体的133尾多鳞四指马鲅个体进行35个可量性状和8个可数性状测定，并拍摄保存样本照片用于几何形态学分析。多鳞四指马鲅的传统形态学和几何形态学分析结果显示，5个地理群体的多鳞四指马鲅形态特征存在一定程度的差异，且和地理距离成正相关，但尚未达到种群分化的程度。这可能是更新世冰期时，海平面下降导致南海和东黄海之间形成地理隔离所致；但随更新世末期海平面上升，因多鳞四指马鲅极强的洄游习性，仍有部分群体可以在黄海和南海之间进行长距离洄游，以及鱼卵和仔稚鱼存在随洋流扩散从而群体间存在不同程度的基因交流，导致不同地理群体间虽存在着较大的形态特征差异，但形态和遗传分化仍未能达到种群分化水平。综上，鉴于不同地理群体的多鳞四指马鲅在不同海域繁殖、索饵出现的时段差异，建议对这5个地理群体中的三门群体和舟山群体划为2个管理单元，如东群体和海门群体划为1个管理单元，珠海群体划为另1个独立的管理单元。针对5个地理群体按4个管理单元进一步制定特别管理政策，以期既保护渔业资源可持续发展又保障广大渔民的生计。

关键词：多鳞四指马鲅地理群体传统形态学分析几何形态学分析生产管理

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脊尾白虾6个地理群体的形态差异分析

西北农林科技大学学报(自然科学版) 2023年第11期51卷 13-21,36页

作者：张年国周裕华于飞上海市水产研究所上海市水产技术推广站上海200433 连云港市海洋与渔业发展促进中心江苏连云港222003

【目的】研究6个地理群体脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)的形态差异,为脊尾白虾的种质资源保护及其良种选育提供参考依据。【方法】采用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析及判别分析等多元分析方法,以体质量和外部形态性状(全... 详细信息

【目的】研究6个地理群体脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)的形态差异,为脊尾白虾的种质资源保护及其良种选育提供参考依据。【方法】采用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析及判别分析等多元分析方法,以体质量和外部形态性状(全长、体长、头胸甲长、头胸甲宽、头胸甲高、第一腹节高、第一腹节宽、额剑长、尾节长、腹部长)为指标,对分别采自中国沿海赣榆、大丰、如东、启东、奉贤、宁海6个地理群体的脊尾白虾进行比较分析。【结果】(1)脊尾白虾群体的形态性状差异明显,其中宁海群体与其他群体差异最明显,大丰群体与赣榆、奉贤群体最为相近。(2)聚类分析发现,赣榆群体与大丰群体欧氏距离最短,形态最为接近,宁海群体趋异程度最大。(3)贡献最大的3个主成分的方差贡献率分别为27.490%,23.819%和18.039%,累积方差贡献率高达69.348%,其中主成分1中负荷值最大的为头胸甲宽/体长(0.749)。(4)得到6个地理群体脊尾白虾的判别函数,判别准确率P_1为48.30%~75.00%,P_2为50.00%~93.75%,综合判别率为60.60%,6个群体间各性状比例的差异系数均地理群体脊尾白虾存在一定程度的外部形态差异,但这种形态差异尚未达到亚种水平。

关键词：脊尾白虾地理群体形态差异判别分析

不同地理群体织锦巴非蛤表型性状的相关性及通径分析

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南方农业学报 2023年第6期54卷 1868-1875页

作者：尹聪邱焗维刁宏山赖胜琪栗志民刘志刚广东海洋大学水产学院广东湛江524000

【目的】分析北部湾海域不同地理野生群体的织锦巴非蛤的表型性状与软体质量的关系,为织锦巴非蛤人工育苗育种和经济选择提供依据。【方法】随机选取广西东兴、广西北海和广东湛江草潭群体的织锦巴非蛤,分别测量其壳长、壳高、壳宽、前... 详细信息

【目的】分析北部湾海域不同地理野生群体的织锦巴非蛤的表型性状与软体质量的关系,为织锦巴非蛤人工育苗育种和经济选择提供依据。【方法】随机选取广西东兴、广西北海和广东湛江草潭群体的织锦巴非蛤,分别测量其壳长、壳高、壳宽、前缘长、后缘长、外韧带长和外韧带槽宽等6个性状形态指标并称量活体质量和软体质量,采用相关性与通径分析法研究各形态性状对软体质量的影响效果。【结果】织锦巴非蛤各性状指标在不同地理群体中变异系数范围为4.880%~25.148%,鲜出肉率的范围在21.400%~24.400%,且各性状间的相关性大多呈极显著水平(P群体中,对软体质量直接影响作用最大的分别是壳宽和外韧带长,间接作用影响最大的是壳宽与壳高,对应的决定系数总和为0.541;在广西北海群体中,对软体质量直接影响作用最大的是壳高,间接作用影响最大的是壳高与外韧带长,对应的决定系数总和为0.469;在广东湛江草潭群体中,对软体质量直接影响作用最大的分别是前缘长和外韧带长,间接作用影响最大的是壳宽与前缘长,对应的决定系数总和为0.509。剔除对软体质量不显著的形态性状后,分别构建不同地理群体织锦巴非蛤软体质量的最优回归方程,F和P检验所得结果表明回归关系均达极显著水平。【结论】影响3个地理群体织锦巴非蛤软体质量的决定性壳形态性状存在差异,广西东兴群体应首选壳宽和外韧带长,广西北海群体应选择壳高,而广东湛江草潭群体的前缘长和外韧带长是重要性状。

关键词：织锦巴非蛤地理群体表型性状通径分析

华南沿海长鳍篮子鱼不同地理群体的遗传多样性分析

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水生态学杂志 2022年第5期43卷 127-133页

作者：彭敏肖珊洪传远潘传燕冯鹏霏李旻曾地刚杨春玲蒋伟明陈秀荔广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室广西南宁530021 广西壮族自治区水产引育种中心广西南宁530031

为探明华南沿海长鳍篮子鱼(Siganus canaliculatus)不同地理群体遗传多样性与遗传分化状况,采用线粒体控制区(D-loop)基因序列分析华南沿海厦门(XM)、汕尾(SW)、阳江(YJ)、海口(HK)、三亚(SY)、北海(BH)、钦州(QZ)、防城港(FC)以及越南... 详细信息

为探明华南沿海长鳍篮子鱼(Siganus canaliculatus)不同地理群体遗传多样性与遗传分化状况,采用线粒体控制区(D-loop)基因序列分析华南沿海厦门(XM)、汕尾(SW)、阳江(YJ)、海口(HK)、三亚(SY)、北海(BH)、钦州(QZ)、防城港(FC)以及越南清化(TH)9个地理位置长鳍篮子鱼群体的遗传多样性及群体遗传结构。结果显示,长鳍篮子鱼群体DNA D-loop序列共计484条,序列长度约828 bp,包含57个变异位点,92个单倍型;所有群体总的单倍型多样性指数(H_(d))为0.80798,核苷酸多样性指数(π)为0.00405;群体内遗传距离为0.00386~0.00532,群体间遗传距离为0.00383~0.00482,群体间分化指数为-0.01935~0.00759,各种分组的AMOVA分析均显示遗传变异全部来自群体内;Fu’s Fs检验值为显著负值(-25.53678,P地理群体间不存在显著的地理结构和谱系结构,可划归一个管理单元进行种质资源保护。

关键词：长鳍篮子鱼遗传多样性地理群体线粒体控制区华南沿海

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山东沿海不同地理群体中国蛤蜊形态差异分析

海洋渔业 2023年第1期45卷 95-104页

作者：荆圆圆胡凡光刘广斌吴海一孙铭陈群张天文山东省海洋科学研究院山东青岛266104

为研究山东沿海不同地理群体中国蛤蜊(Mactra chinensis)形态差异和地理分化特点,运用多变量形态度量学方法,通过方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析对日照东港(DG)、烟台海阳(HY)、青岛黄岛(HD)、威海文登(WD)和东营垦利(KL)5... 详细信息

为研究山东沿海不同地理群体中国蛤蜊(Mactra chinensis)形态差异和地理分化特点,运用多变量形态度量学方法,通过方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析对日照东港(DG)、烟台海阳(HY)、青岛黄岛(HD)、威海文登(WD)和东营垦利(KL)5个中国蛤蜊野生群体形态数据进行比较分析。生长指标指数显示,文登群体贝壳最厚,黄岛群体贝壳最薄、肥满度最低,海阳群体软体部最肥;5个群体间最大差异系数为0.515~1.245,均小于1.28,尚未达到亚种水平;主成分分析共提取3个主成分,主成分1贡献率为33.71%,主成分2贡献率为27.16%,主成分3贡献率为14.42%,累计贡献率达75.29%;聚类分析结果表明,5个中国蛤蜊群体聚为2类,海阳群体、文登群体和垦利群体聚为一类,东港群体和黄岛群体分别聚为一类;通过判别分析,共建立了4个判别函数,判别准确率为70.0%~94.0%,综合判别率为80.0%。研究结果可为中国蛤蜊的地理群体识别、种质资源保护与利用提供重要依据。

关键词：中国蛤蜊地理群体形态差异分析

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褐菖鲉不同地理群体的形态学比较研究

水生态学杂志 2023年第2期44卷 81-88页

作者：刘璐周永东高天翔山东交通学院船舶与港口工程学院山东威海264209 浙江省海洋水产研究所浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室浙江舟山316021 浙江海洋大学水产学院浙江舟山316021

褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)常见于西北太平洋近海的暖温水域底层,是我国重要的广布型海洋经济鱼类。研究褐菖鲉群体间形态差异及其与生境的关系,能够为我国近海鱼类多样性保护提供基础资料。鉴于生物多元统计需要尽量缩小不同鱼类... 详细信息

褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)常见于西北太平洋近海的暖温水域底层,是我国重要的广布型海洋经济鱼类。研究褐菖鲉群体间形态差异及其与生境的关系,能够为我国近海鱼类多样性保护提供基础资料。鉴于生物多元统计需要尽量缩小不同鱼类群体大小和规格差异为前提,通过传统形态测定和多变量框架量度相结合的方法,采用主成分分析、判别分析、聚类分析和单因素方差分析多元统计方法,对采集自浙江舟山、福建厦门、广东汕头及广西北海附近海域的4个褐菖鲉群体共112尾个体的8个分节特征和15个量度特征开展研究。结果显示,不同群体间可数性状特征差异不明显,难以作为有效区分4个褐菖鲉群体的依据;结合框架法和传统形态学进行研判,4个群体的综合判别正确率在81.5%~96.7%。主成分分析表明,前4个主成分累积贡献率为51.74%,北海群体和舟山群体的形态特征指标分别与其他2个群体存在一定程度的分化。相比于北海群体,厦门群体的尾柄更长、头部更小。生境差异以及褐菖鲉生活范围相对稳定,使得被隔绝于相对独立生活环境的群体产生了形态特征上的适应性分化。由于东海海域和南海海域之间的联通性,不同海域的褐菖鲉群体之间因摄食、繁殖等出现的短距离迁徙和短暂的基因交流,在一定程度上削弱了形态特征的分化。

关键词：褐菖鲉地理群体形态特征适应性分化

我国近海龟足3个地理群体比较转录组及环境适应性研究

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动物学杂志 2023年第4期58卷 563-578页

作者：毛宁蔡月凤张宇姬南京申欣江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室连云港222005 江苏省海洋生物产业技术协同创新中心连云港222005

龟足(Capitulum mitella)隶属于节肢动物门(Arthropoda)指茗荷科(Pollicipedidae)龟足属,广泛分布于亚热带及热带近海沿岸中高潮地带。由于龟足生存环境复杂多变,可能导致其不同地理群体形成与其生境相适应的特征。本研究基于高通量测... 详细信息

龟足(Capitulum mitella)隶属于节肢动物门(Arthropoda)指茗荷科(Pollicipedidae)龟足属,广泛分布于亚热带及热带近海沿岸中高潮地带。由于龟足生存环境复杂多变,可能导致其不同地理群体形成与其生境相适应的特征。本研究基于高通量测序技术对浙江舟山、福建宁德和广东珠海3个典型海域的龟足进行比较转录组分析,并利用生物信息学方法探究3个地理群体对环境的适应机制。结果表明,3个地理群体间存在651个(广东珠海和福建宁德群体间)至3738个(浙江舟山和福建宁德群体间)数量不等的差异表达基因(DEGs),主要涉及核糖体合成、抗原加工与递呈、分子伴侣代谢通路。基因序列的非同义替换率(K_(a))和同义替换率(K_(s))之间的比例K_(a)/K_(s),如果其超过1,则认为有正选择压力作用于该基因,基因正在快速进化。3个地理群体间龟足直系同源基因正选择压力分析结果显示,254个直系同源基因中有7个基因受到正选择压力,包括D-天冬氨酸酶基因(K_(a)/K_(s)=2.076)、GTP结合核蛋白基因(K_(a)/K_(s)=1.001)、凋亡抑制蛋白基因(K_(a)/K_(s)=1.008)、真核起始因子2B基因(K_(a)/K_(s)=1.001)、RNA聚合酶介体II基因(K_(a)/K_(s)=2.867)、吡咯啉-5-羧酸还原酶基因(K_(a)/K_(s)=1.131)和组蛋白去乙酰化酶基因(K_(a)/K_(s)=1.145),它们是参与龟足免疫系统调节、生长发育等生物过程的关键基因。本研究的开展有助于初步了解龟足对外界多重环境的适应机制,为研究龟足这3个地理群体的遗传多样性、种质资源保护和开发利用提供了基础数据。

关键词：龟足地理群体比较转录组环境适应性

半叶马尾藻中国变种四个地理群体分布特征调查及其对高温和低温环境胁迫的响应

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半叶马尾藻中国变种四个地理群体分布特征调查及其对高温和低温环...

作者：向玉哲汕头大学

学位级别：硕士

半叶马尾藻中国变种（Sargassum hemiphyllum var.chinese）是我国南方沿海常见的大型褐藻,具有生物量大、生长速度快、富含活性物质等特性,是南方海藻场的主要组成种类,具有重要的经济和生态价值。近年来由于海岸环境受到人为破坏,全... 详细信息

半叶马尾藻中国变种（Sargassum hemiphyllum var.chinese）是我国南方沿海常见的大型褐藻,具有生物量大、生长速度快、富含活性物质等特性,是南方海藻场的主要组成种类,具有重要的经济和生态价值。近年来由于海岸环境受到人为破坏,全球气候变化等诸多因素导致半叶马尾藻中国变种的自然资源锐减,需要开展半叶马尾藻的养护和海藻场人工构建工作。由于其生长环境条件的差异,半叶马尾藻中国变种不同地理群体具有不同的自然分布特征和环境适应性,也影响其海藻场的种群结构变化。本文于2020年12月到2021年10月期间调查了福建省漳浦县六鳌镇、广东省南澳县深澳镇、广东省惠来县靖海镇、广东省深圳市大鹏4个地区半叶马尾藻中国变种的生物量、单位密度和藻体长度、鲜重等生态分布特征的季节变化情况,并比较不同地理群体苗种在人工浮筏栽培条件下的生长特征,同时在实验室条件下,探究4个地理群体在高温和低温胁迫下的生理响应,分析半叶马尾藻中国变种不同地理群体的生态分布特征、生长特性和环境适应性的差异,为开展半叶马尾藻人工养护和海藻场构建工作提供技术依据。主要研究结果如下:（1）半叶马尾藻中国变种4个地理群体的生物量随海水温度变化发生变化,深圳大鹏群体和南澳深澳群体的生物量变化具有明显季节特征,在冬季期间生物量开始增加,在春季期间生物量达到最大值,在春季繁殖期结束后,由于藻株腐烂,生物量大大下降,夏、秋两季都处于生长停滞期,而惠来靖海群体和漳浦六鳌群体的周年生物量都处于较低水平,夏季较少观察到繁殖现象。（2）在南澳海区进行半叶马尾藻中国变种4个地理群体的浮筏栽培试验,结果显示,南澳深澳群体和深圳大鹏群体的藻体长势良好,在84 d内藻体的相对生长速率和藻体长度平均增长速率都较高,在84 d以后藻体出现衰败现象,藻体重量和长度均出现下降,而漳浦六鳌群体和惠来靖海群体的生长较慢,在98 d养殖周期内个体长度和重量增幅显著小于深圳大鹏群体和南澳深澳群体。（3）在28℃和32℃高温胁迫下,半叶马尾藻中国变种藻体的光合色素含量显著下降,漳浦六鳌群体和惠来靖海群体下降幅度较大;4个地理群体的藻体中丙二醛含量均显著上升,其中漳浦六鳌群体和惠来靖海群体的丙二醛含量最高;可溶性蛋白和可溶性糖含量呈现先升后降的趋势,深圳大鹏群体和南澳深澳群体在7 d达到最高;同时高温诱导藻体的超氧化物歧化酶活性显著升高,其中深圳大鹏群体和南澳深澳群体的增幅较大。（4）在8℃和12℃低温胁迫下,半叶马尾藻中国变种藻体光合色素含量显著下降,其中漳浦六鳌群体和惠来靖海群体下降幅度最小,而超氧化物歧化酶活性、可溶性蛋白、可溶性糖和丙二醛含量显著上升,其中漳浦六鳌群体和惠来靖海群体细胞内SOD活性、可溶性蛋白和可溶性糖含量增幅最大,而深圳大鹏群体和南澳深澳群体藻体重丙二醛含量有较大的增幅。研究结果表明半叶马尾藻中国变种不同地理群体具有不同的生态分布特征,具有季节变化规律,在南澳海区的筏式栽培具有不同的生长特征,其中深圳大鹏和群体和南澳深澳群体的生长较好。并在高温和低温胁迫下,4个地理群体具有不同的生理生化响应,其中深圳大鹏群体和南澳深澳群体的耐受高温能力较强,漳浦六鳌群体和惠来靖海群体耐受低温胁迫的能力较好。

关键词：半叶马尾藻中国变种地理群体高温胁迫低温胁迫