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尾巨桉人工林土壤细菌群落结构和多样性的动态变化

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尾巨桉人工林土壤细菌群落结构和多样性的动态变化

作者：赵子麒中南林业科技大学

学位级别：硕士

桉树人工林单一树种多代连栽的炼山经营模式对土壤质量及其生态环境产生剧烈扰动,已引起社会的广泛关注,而采用免炼山造林这种模式是解决上述问题的重要措施之一;然而,在免炼山造林模式下,作为土壤生态环境重要组成部分的土壤微生物群... 详细信息

桉树人工林单一树种多代连栽的炼山经营模式对土壤质量及其生态环境产生剧烈扰动,已引起社会的广泛关注,而采用免炼山造林这种模式是解决上述问题的重要措施之一;然而,在免炼山造林模式下,作为土壤生态环境重要组成部分的土壤微生物群落如何响应,且这一响应在林地更新后不同种植年限中又会产生怎么样的动态变化,我们仍然知之甚少。本文以免炼山新造林模式为研究对象,分析不同采伐剩余物处理方式下桉树人工林土壤中细菌群落结构和功能在林地更新后,在四个不同种植年限中的动态变化。研究对象为四种不同采伐剩余物处理方式的随机区组试验:炼山、移除采伐剩余物、平铺采伐剩余物和将采伐剩余物带状堆放,并以采伐前的第三代桉树人工林及样地附近的针阔混交次生林作为对照,对土壤物理、化学和生物学性质指标进行研究,并基于16srna测序结果,进行土壤细菌群落结构和多样性动态变化的分析,并预测土壤细菌基因功能预测。主要结论如下:(1)使用高通量测序技术,确定了7358个OTU。通过方差分析的指数组间差异检验,揭示了不同采伐剩余物处理和采样时间之间的细菌群落α多样性指数和丰富度指数(Shannon多样性,Simpsion均匀度,Ace丰富度,Chao丰富度)。本研究发现在α多样性指数上,不同采伐剩余物管理方式之间最大的差异体现于,在Shannon多样性和Simpsion均匀度指数值的极值分别出现在采伐前和次生林的指数值上,炼山和移除处理在林地更新的早期,对于土壤细菌群落产生了相对更大的扰动。因为林地更新后,在第一年中,炼山和移除处理的shannon指数值同时小于采伐前和次生林;而在Simpsion均匀度指数值上,炼山和移除大于采伐前和次生林,且在Chao丰富度指数中,第一年的炼山和移除指数值均低于平铺、炼山、采伐前和次生林。此外在林地更新后不同种植年限指数值的对比发现,第一年与其他种植年限的在指数指数值上拥有最多显著差异。经过β多样性分析和PERMANOVA分析我们研究发现,在综合讨论多个种植年限时,采用不同采伐剩余物管理方式对于土壤细菌群落的变化影响有限,而种植年限作为时间因素,对于土壤细菌群落的变化有显著的影响(p土壤细菌群落的venn图的分析,我们进一步发现:林地更新会对土壤生态环境产生巨大扰动,而在不同采伐剩余物管理方式中,移除处理可能对土壤细菌群落产生了最大的扰动,因此导致移除处理有最多的独有OTU。而在林地更新后不同种植年限的土壤细菌群落VENN图的结果显示,我们发现土壤细菌群落并不能在受到扰动的第一年内恢复到相对稳定的状态。(4)土壤中的细菌群落的相对丰度在不同采伐剩余物处理方式和不同种植年限中,呈现动态变化,变形菌门Proteobacteria(相对丰度28.7%～40.5%),酸杆菌门Acidobacteria(20.9%～38%)和放线菌门Actinobacteria(6.8%～16.9%)能够在不同采伐剩余物管理方式和不同种植年限中成为相对丰度大于5%的优势菌群,而绿弯菌门Chloroflexi(4%～20.5%)和厚壁菌门Firmicutes(1.5%～6.2%)在某些情况下无法成为优势菌群。(5)土壤性质中,理化性质均在林地更新后两年内呈现波动后趋于稳定,在第四年,四种采伐剩余物处理方式之间的理化性质值没有显著差异,而生物化学性质中,蔗糖酶高值均出现在平铺处理,最低则倾向出现在炼山和移除处理中,脲酶高值倾向于出现在炼山处理中。(6)Heatmap分析结果表明土壤中化学性质对土壤平均相对群落占比大于2%的细菌群落影响,发现有机质,全钾,全磷,钙,镁和脲酶活性等环境因子与土壤细菌群落之间存在显著相关性,暗示这些土壤环境因子可能是土壤细菌群落结构变化的关键限制因子。(7)细菌群落功能预测发现在不同采伐剩余物处理方式之间的差异,主要存在于采伐前和次生林之间。其中采伐前处理表达较低的通路都属于在土壤环境不稳定的情况下才变得重要的功能基因。而在林地更新后不同种植年限之间,高表达量的通路均与细菌群落快速发展扩张有关,甚至某些细菌群落可能出现的演替也与这些功能基因的大量表达有关。

关键词：土壤化学性质土壤细菌群落土壤细菌多样性 16srna测序土壤细菌功能预测

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轮作方式对黄瓜根际细菌多样性及产量的影响

轮作方式对黄瓜根际细菌多样性及产量的影响

作者：于慧颖东北农业大学

学位级别：硕士

作物间的间、混、轮、套栽培方式是我国传统农业的精华,连作有害,轮作有利早已被人们所认识,但其机理尚不十分清楚。土壤微生物的群落结构组成及其变化在一定程度上反映了土壤的生态环境及土壤质量,本试验以设施内连作问题突出的黄瓜为... 详细信息

作物间的间、混、轮、套栽培方式是我国传统农业的精华,连作有害,轮作有利早已被人们所认识,但其机理尚不十分清楚。土壤微生物的群落结构组成及其变化在一定程度上反映了土壤的生态环境及土壤质量,本试验以设施内连作问题突出的黄瓜为研究对象,利用PCR-DGGE技术研究4种不同蔬菜的7种轮作方式对黄瓜根际土壤细菌群落结构多样性的影响,并通过黄瓜病害及产量的调查结果对不同蔬菜轮作的效果进行验证,目的在于弄清轮作控制病害提高产量的土壤微生物学机理,为改善黄瓜根际土壤微生态环境,建立较好的黄瓜轮作方式提供理论依据。本试验得出以下结论: 1.设施轮作对土壤细菌群落结构有一定影响。轮作能够提高土壤微生物多样性,本试验所研究轮作方式中,菜豆-芹菜-黄瓜轮作,番茄-芹菜-黄瓜轮作和番茄-菜豆-黄瓜轮作方式,对于黄瓜根际土壤细菌群落结构多样性和均匀度有较好的促进作用,是较理想的黄瓜轮作方式。 2.设施轮作对黄瓜病害有一定影响。不同蔬菜轮作能够减轻黄瓜病害,其中菜豆-芹菜-黄瓜轮作有效的减轻黄瓜白粉、霜霉和角斑三种病害发生,是理想的轮作方式。番茄-菜豆-黄瓜和番茄-芹菜-黄瓜轮作分别对于减轻黄瓜霜霉和角斑病害的发生有较好的作用,也是较好的轮作方式。 3.设施轮作对土壤理化性状有一定影响。不同蔬菜轮作能够均衡土壤养分降低土壤盐分。番茄-菜豆-黄瓜轮作能够显著的降低土壤氮含量(p土壤盐度。菜豆-芹菜-黄瓜轮作也能较好的提高土壤有机质含量,降低土壤盐度。 4.设施轮作对黄瓜产量有一定影响。各轮作处理黄瓜产量均显著高于对照黄瓜产量(p番茄-芹菜-黄瓜轮作>番茄-菜豆-黄瓜轮作>黄瓜-芹菜-黄瓜轮作>菜豆-番茄-黄瓜轮作>黄瓜-番茄-黄瓜轮作>黄瓜-菜豆-黄瓜轮作。 5土壤细菌群落结构多样性指数和均匀度指数与黄瓜病情指数具有一定的相关性。土壤细菌群落结构多样性指数与黄瓜霜霉病病情指数呈极显著负相关,与白粉病和角斑病病情指数呈显著负相关。均匀度指数与黄瓜白粉病和角斑病病情指数呈显著负相关。综合以上结论,轮作可以提高土壤细菌多样性,降低黄瓜病害,均衡土壤养分。其中菜豆-芹菜-黄瓜轮作、番茄-芹菜-黄瓜轮作和番茄-菜豆-黄瓜轮作方式可以为黄瓜生长创造一个良好的生态环境,显著提高黄瓜产量。

关键词：轮作土壤细菌多样性 PCR-DGGE 病害产量

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土壤多功能性对微生物多样性降低的响应

环境科学 2022年第11期43卷 5274-5285页

作者：陈桂鲜吴传发葛体达陈剑平邓扬悟江西理工大学资源与环境工程学院赣州341000 宁波大学植物病毒学研究所省部共建农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室宁波315211

土壤微生物群落在驱动多种生态系统功能和生态过程中发挥着重要作用,是维持生物地球化学循环的主要驱动力.鉴于全球背景下观察到土壤微生物多样性随着土地利用集约化、气候变化而降低的现象,对土壤微生物多样性的减少是否会对土壤多功... 详细信息

土壤微生物群落在驱动多种生态系统功能和生态过程中发挥着重要作用,是维持生物地球化学循环的主要驱动力.鉴于全球背景下观察到土壤微生物多样性随着土地利用集约化、气候变化而降低的现象,对土壤微生物多样性的减少是否会对土壤多功能性产生影响进行调查显得尤为重要.利用稀释灭绝法构建土壤微生物多样性梯度,结合高通量测序等技术手段,探究细菌、真菌和原生生物多样性降低对土壤多功能性的影响.结果表明,与未灭菌土壤相比,稀释处理土壤微生物α多样性(丰富度指数和香农指数)显著降低.主坐标分析(PCoA)表明,未灭菌土壤微生物群落结构与稀释处理土壤存在显著分异,而且细菌和真菌群落对稀释处理的响应高于原生生物.回归模型显示,土壤多功能性与微生物多样性指标呈显著的负线性关系,表明土壤微生物群落变化是调节土壤多功能性的关键因素.其次,通过集成推进树(ABT)和回归模型预测分析发现,一些特定的微生物类群如真菌短柄菌属(Solicoccozyma)、瓦湖胶珊瑚菌(Holtermanniella)和细菌属Rudaea相对丰度与土壤多功能性显著负相关,说明关键微生物类群在生物过程中发挥了指示性作用.进一步通过结构方程模型揭示,细菌、真菌和原生生物多样性都对土壤多功能性存在直接或间接影响,其中细菌是驱动土壤多功能性变化的关键生物因子.研究为土壤微生物多样性对土壤多功能性的影响提供了试验证据,并认为在单一农业生态系统中维持一定的土壤微生物群落多样性,特别是关键微生物类群的多样性对未来生态系统功能的可持续发展具有重要意义.

关键词：土壤细菌多样性土壤真菌多样性土壤原生生物多样性土壤多功能性小麦生物量

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黄腐酸生物有机肥贮藏性评价及其施用对土壤细菌和理化性质的影响

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黄腐酸生物有机肥贮藏性评价及其施用对土壤细菌和理化性质的影响

作者：陈代红山东农业大学

学位级别：硕士

近年来,黄腐酸生物有机肥成为肥料行业里比较热门的新型肥料,在应用上有很好的表现,其含有非常丰富的有机质和特定功能的有益微生物。但是黄腐酸生物有机肥货架期短一直是困扰行业健康发展的关键问题,而且其对于土壤养分的释放和土壤微... 详细信息

近年来,黄腐酸生物有机肥成为肥料行业里比较热门的新型肥料,在应用上有很好的表现,其含有非常丰富的有机质和特定功能的有益微生物。但是黄腐酸生物有机肥货架期短一直是困扰行业健康发展的关键问题,而且其对于土壤养分的释放和土壤微生物群落结构的影响研究较少。本试验通过自制黄腐酸生物有机肥(FMO),模拟肥料保存试验,探讨黄腐酸生物有机肥在货架期内其p H、有效活菌数及其养分变化规律,为延长货架期提供依据;另一方面,通过土壤施肥试验探索肥料施入土壤后对土壤理化性质和细菌群落结构的影响,为黄腐酸生物有机肥的使用提供理论依据。主要研究结果如下。通过扫描电镜观察FMO结构表明:黄腐酸呈球形,内部为多孔性结构,菌粉能吸附在黄腐酸的孔隙和表面,制成FMO后,菌体散开吸附在腐熟物表面和缝隙;模拟保存试验研究结果表明:20℃、28℃和35℃恒温保存的FMO在货架期内都呈下降趋势,20℃下保存FMO有效活菌数大约在135天之后出现显著性差异(P性增加(P性下降(P土壤施肥试验的有效活菌数变化结果表明:15℃和20℃环境能显著增加土壤中有效活菌数的生物量(P土壤养分所测结果表明:FMO、FO和MO的施加均能显著提升土壤全氮(STN)、土壤有效磷(SAP)、土壤速效钾(SAK)、土壤有机质(SOM)和土壤黄腐酸(SFA)含量(P土壤的p H。10℃、15℃、20℃处理的土壤SOM、STN和SFA含量变化较大,SAP和SAK在3个月内无显著变化。FA的施用能减少土壤中氮素的流失,增强土壤的保肥能力;水稳性土壤团聚体结果表明:施加FMO和FO的土壤能显著增加土壤中>0.25 mm的水稳性土壤团聚体的百分比(P土壤团粒结构;土壤细菌群落结构分析结果表明:施加FMO、FO和MO的细菌群落与CK对比存在差异,肥料种类对土壤细菌群落影响大于温度对其影响。FO的土壤细菌丰富度高于MO高于FMO。施加FMO和MO主要会降低放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteriota)、迷踪菌门(Elusimicrobiota)、Dependentiae的相对丰度,提高芽单胞杆菌门(Gemmatimonadetes)和厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度。施加FO主要会增加芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteriota)的相对丰度,降低变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)和厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度。FA和解淀粉芽孢杆菌F1都能增加土壤中假单胞菌属的相对丰度,降低Massilia的相对丰度。

关键词：黄腐酸生物有机肥有效活菌数土壤养分土壤细菌多样性

不同生草模式对关中地区有机猕猴桃园土壤理化性质及细菌群落的影响

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不同生草模式对关中地区有机猕猴桃园土壤理化性质及细菌群落的影...

作者：靳旭妹西北农林科技大学

学位级别：硕士

果园生草是近年来研究的热点领域之一,它兼具控制杂草、提高土壤肥力、调节土壤微生物多样性及改善果实品质等多种功能,生草模式已成为安全有效、可持续的果园土壤管理新模式。目前,国内的果园生草大多集中在传统果园生草较清耕的区别,... 详细信息

果园生草是近年来研究的热点领域之一,它兼具控制杂草、提高土壤肥力、调节土壤微生物多样性及改善果实品质等多种功能,生草模式已成为安全有效、可持续的果园土壤管理新模式。目前,国内的果园生草大多集中在传统果园生草较清耕的区别,本研究通过在有机果园开展果园生草,结合不同生草处理的植物生长表现以及生草还田对有机猕猴桃园00 cm土壤理化性质及细菌群落的影响,以期为我国猕猴桃产业可持续发展提供理论依据及技术支撑。陕西猕猴桃的种植面积和产量位居中国首位,目前,陕西省猕猴桃园以清耕为主,导致土壤结构破坏,生物多样性降低等一系列土壤质量下降的问题。本研究分2020年秋播和2021年春播两个阶段,以当季自然生草为对照(CK),四种秋播人工生草模式分别为:多年生黑麦草+毛苕子(Mode 1)、多年生黑麦草+草木樨(Mode 2)、多年生黑麦草+白三叶(Mode 3)及鼠茅草(Mode4);春播人工生草为一年生黑麦草+毛苕子(Mode 5)、一年生黑麦草+紫云英(Mode6)及一年生黑麦草+秣食豆(Mode 7)。通过研究不同生草处理的植物生长表现以及生草还田对有机猕猴桃园00 cm土壤理化性质及细菌群落的影响,初步探索一套关中地区有机猕猴桃园的生草还田模式,为我国猕猴桃产业发展提供理论依据及技术支撑。主要研究结果如下:(1)生草可有效控制果园杂草。对生草越冬率、地上部生物量进行比较发现,鼠茅草适应性强、耐寒,其越冬成活率显著高于白三叶、多年生黑麦草、毛苕子和草木樨(P土壤含水量较自然生草均增加,但无显著性差异(P>0.05)。Mode 1在0 cm、50 cm、105 cm和150 cm土层,土壤含水量较自然生草分别增加22.44%、7.57%、6.60%和12.87%,Mode 2处理00 cm土壤含水量平均值低于其他人工生草处理;春播各生草处理土壤含水量变化各不相同,与对照相比,150 cm土层,3个人工生草处理土壤含水量较自然生草均增加,但差异不显著(P>0.05)。(3)秋播人工生草处理组中Mode 4降低果园土壤p H,春播各人工生草处理提高了土壤p H;绿肥还田后,秋播各人工生草处理较自然生草p H均提高,春播Mode 7处理的土壤p H降低。各生草、还田处理有机质含量均增加,秋播生草Mode 1较自然生草有机质增加38.63%,还田后以Mode 4处理增加效果最为显著(P土壤脲酶、蔗糖酶、碱性磷酸酶和过氧化氢酶活性,其中,Mode 1提高土壤脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性最为显著(P土壤脲酶、碱性磷酸酶和过氧化氢酶活性效果显著(P土壤脲酶、碱性磷酸酶和过氧化氢酶活性均提高,Mode 6降低了土壤蔗糖酶活性;绿肥还田后人工生草处理组较自然生草还田后土壤脲酶、蔗糖酶、碱性磷酸酶和过氧化氢酶活性均提高,其中,Mode 5提高效果显著(P土壤细菌物种丰富度最高,绿肥还田后Mode 2土壤细菌物种丰富度和多样性最高,但较自然生草差异不显著。秋播生草、还田各处理土壤细菌群落分布较为集中,且各处理间未明显分开。生草处理下,变形菌门、酸杆菌门和浮霉菌门为优势类群;还田后变形菌门、酸杆菌门和放线菌门为优势类群;春播人工生草处理组Mode 6对细菌群落的影响最大,Mode 5次之,还田后,Mode 5物种丰富度和多样性最高,Chao1指数为2946.49,Shannon指数为10.63,与自然生草相比差异不显著。人工生草处理组土壤细菌群落结构比较相似,各处理间未明显分开,但与自然生草处理细菌群落结构差异明显,还田后各处理土壤细菌群落结构有明显差异。生草处理下,变形菌门、酸杆菌门和放线菌门为优势类群,还田后土壤细菌优势门类为变形菌门、酸杆菌门和浮霉菌门。秋播鼠茅草覆盖后土壤p H下降,有利于酸杆菌生存。春播一年生黑麦草+毛苕子生草、还田可明显提高芽单胞菌门丰度。在关中平原猕猴桃园种植绿肥及还田生产措施中,建议

关键词：生草绿肥还田土壤理化性质土壤细菌多样性有机果园

兴安落叶松林土壤细菌和酶活性与理化性质的动态分析

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兴安落叶松林土壤细菌和酶活性与理化性质的动态分析

作者：党乾顺东北林业大学

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以黑龙江中央站黑嘴松鸡自然保护区的4种不同兴安落叶松林为研究对象,探讨不同兴安落叶松林中土壤理化性质、土壤酶活性和土壤细菌群落结构和多样性的变化规律。选取4种不同兴安落叶松林型(白桦-兴安落叶松林、杜鹃-兴安落叶松林、兴安... 详细信息

以黑龙江中央站黑嘴松鸡自然保护区的4种不同兴安落叶松林为研究对象,探讨不同兴安落叶松林中土壤理化性质、土壤酶活性和土壤细菌群落结构和多样性的变化规律。选取4种不同兴安落叶松林型(白桦-兴安落叶松林、杜鹃-兴安落叶松林、兴安落叶松纯林和兴安落叶松人工林),按季节划分进行采样,测定不同季节的土壤理化性质和酶活性(过氧化氢酶、酸性磷酸酶、脲酶、蔗糖酶和纤维素酶),同时分析不同兴安落叶松林土壤细菌群落结构和多样性的变化,探究土壤理化和酶活性季节的变化动态及其与土壤细菌群落结构和多样性的关系。结果表明:土壤理化性质和酶活性在不同林型和季节有着显著差异,而且变化趋势也有一定的不同,这与林下凋落物的积累和植被类型的差异有关;土壤酸性磷酸酶受到土壤全磷、全氮以及速效钾的影响较大;土壤过氧化氢酶与全氮、速效氮、速效钾和速效磷均呈显著正相关;土壤蔗糖酶主要受速效磷和速效氮的显著影响;土壤脲酶和纤维素酶则受土壤有机碳含量影响最大。主成分分析(PCA)表明,4种兴安落叶松林土壤酶活性与土壤理化性质差异显著,主成分1均可解释方差变量的50%以上,并且影响不同兴安落叶松林型的因素各不相同。采用高通量测序的方法对4种不同兴安落叶松林型的土壤微生物进行测定,通过分析土壤细菌群落组成和多样性的变化规律,来探讨土壤微生物多样性与土壤环境因子之间的内在联系,结果表明:土壤细菌Ace和Chao多样性指数在各林型的土壤间无显著差异,土壤细菌总数和菌群丰度在兴安落叶松人工林中最高,在兴安落叶松纯林中最低;Shannon指数与Simpson指数分析得出兴安落叶松人工林土壤细菌群落的多样性最大,而白桦-兴安落叶松林土壤细菌群落的多样性最小,且差异显著;相关性分析显示Chao指数与土壤速效磷呈显著正相关,Evenness指数与土壤全磷呈显著正相关;典型性相关分析显示,4种林型间差异显著,土壤细菌群结构与土壤理化性质之间存在不同程度地相关性,由此可见土壤环境因子是影响不同兴安落叶松林土壤细菌多样性的重要因素。采用Bradford法对4种兴安落叶松林的土壤球囊霉素相关蛋白含量进行测定,分析不同兴安落叶松林型下土壤球囊霉素相关蛋白含量的变化规律,进而分析与土壤理化性质、土壤酶活性之间的关系,结果表明:总球囊霉素相关蛋白(T-GRSP)含量范围在11.91 mg/g8.05 mg/g之间,易提取球囊霉素相关蛋白(EE-GRSP)含量在5.7mg/g.03 mg/g之间,EE-GRSP/T-GRSP在19%3%之间。球囊霉素相关蛋白含量与土壤理化性质之间存在显著的相关性,影响T-GRSP含量的主要因素有碳氮比、全氮以及速效氮,影响EE-GRSP含量的主要因素为有效磷、速效钾以及全钾,另外,不同林型的土壤其球囊霉素相关蛋白含量也大不相同。土壤蔗糖酶活性极显著影响球囊霉素相关蛋白含量,其它酶活性也在不同程度上对球囊霉素相关蛋白含量有所影响。本研究显示,球囊霉素相关蛋白含量在不同林型之间存在显著的空间差异性,并且与土壤的各理化性质之间存在不同程度的相关性,因此可见土壤理化因子是调节球囊霉素相关蛋白含量的重要因素,这证实了之前的研究并且为当地的土壤质量评价提供参考依据。

关键词：兴安落叶松林土壤养分酶活性季节动态土壤细菌多样性球囊霉素相关蛋白

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三明水稻-烟草轮作土壤细菌群落多样性比较

中国农学通报 2017年第24期33卷 85-90页

作者：张书泰陈献勇杨秋明刘肖萍陈璐李利君倪辉集美大学食品与生物工程学院福建厦门361021 福建省烟草公司福州350003

为了比较福建三明地区不同水稻-烟草轮作土壤细菌多样性及群落结构,认识三明水稻-烟草轮作土壤微生物资源多样性,对不同土壤样品中细菌类群进行分析。通过构建细菌16S r DNA克隆文库,对将乐砂壤土、将乐壤土、宁化砂壤土和宁化壤土细菌... 详细信息

为了比较福建三明地区不同水稻-烟草轮作土壤细菌多样性及群落结构,认识三明水稻-烟草轮作土壤微生物资源多样性,对不同土壤样品中细菌类群进行分析。通过构建细菌16S r DNA克隆文库,对将乐砂壤土、将乐壤土、宁化砂壤土和宁化壤土细菌多样性和群落结构进行分析和比较。结果表明:4个土壤样品中的细菌类群包括厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)等11个类群,将乐2个土壤样品中厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)是优势类群;宁化2个土壤样品中变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)为主要优势菌门。香农-维纳指数(H′)和辛普森指数(D)表明,壤土细菌多样性高于砂壤土。通过构建细菌16S r DNA克隆文库揭示了三明水稻-烟草轮作土壤中细菌多样性十分丰富,这为初步掌握三明水稻-烟草轮作土壤中细菌种类和组成状况提供了一定的参考依据,也为进一步开发利用该地区水稻-烟草轮作土壤微生物资源提供科学的依据。

关键词： 16S rDNA克隆文库土壤细菌多样性细菌群落结构

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贝莱斯芽孢杆菌D61-A对水稻根际土壤细菌群落结构的影响

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长江大学学报（自然科学版） 2023年第2期20卷 113-120页

作者：孙正祥曹帅王蓝琴刘艳华秦群英陈冰冰长江大学农学院湖北省农林病虫害预警与调控工程技术研究中心(长江大学)湖北荆州434025

为探究贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)D61-A对水稻促生长作用及对根际细菌群落结构的影响,通过菌悬液灌根处理,并于水稻苗期采集水稻样品,测定株高、根长、鲜重及干重,分蘖期采集根际土壤样品,提取土壤中的总DNA并使用高通量测序(... 详细信息

为探究贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)D61-A对水稻促生长作用及对根际细菌群落结构的影响,通过菌悬液灌根处理,并于水稻苗期采集水稻样品,测定株高、根长、鲜重及干重,分蘖期采集根际土壤样品,提取土壤中的总DNA并使用高通量测序(Illumina MiSeq)技术对水稻根际细菌群落结构进行分析。结果显示:D61-A对水稻有促生长作用,D61-A处理组茎长和鲜重显著大于对照组,分别增加了23.19%和15.02%;经D61-A处理的水稻根际土壤细菌Sobs指数、Chao指数、Shannon指数和Coverage指数均高于对照组,且Sobs指数和Chao指数显著高于对照组,表明D61-A处理后水稻根际细菌群落多样性更丰富;PCoA分析结果显示处理组和对照组的细菌群落组成存在明显差异;土壤细菌群落结构分析和多物种差异性检验显示,经D61-A处理后细菌数目显著增加,丰富了根际土壤细菌的群落结构,其中绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteriota)、变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteriota)为水稻根际土壤的主要优势菌群。结果表明贝莱斯芽孢杆菌D61-A具有较大的生防潜力。

关键词：贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis) 促生长土壤细菌多样性高通量测序

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转基因大豆对根际固氮细菌群落多样性的影响

生态学杂志 2010年第9期29卷 1736-1742页

作者：赖欣张永生赵帅李刚杨殿林农业部环境保护科研监测所农业部转基因生物生态环境安全监督检验测试中心天津300191

为了研究种植转基因大豆在土壤生态系统中对固氮细菌的影响,应用PCR-DGGE技术分析种植不同大豆处理下土壤细菌固氮酶nifH基因的分子多样性。结果表明:低GC含量的厚壁菌门出现在DGGE图谱的上部,而且受生育时期影响比较明显;绿菌门相对保... 详细信息

为了研究种植转基因大豆在土壤生态系统中对固氮细菌的影响,应用PCR-DGGE技术分析种植不同大豆处理下土壤细菌固氮酶nifH基因的分子多样性。结果表明:低GC含量的厚壁菌门出现在DGGE图谱的上部,而且受生育时期影响比较明显;绿菌门相对保守,不受生育时期和种植品种的影响;在测序得到的46个结果中,共计28个属于变形菌门,占60.8%,广泛分布于DGGE胶的各个部位,大部分较稳定,不受种植品种或者采样时间的影响。相对于不同生育时期对根际土壤固氮细菌的影响,种植转基因大豆、亲本非转基因大豆和普通大豆之间的差异并不明显,表明种植转基因大豆对土壤固氮细菌没有明显的影响。

关键词：转基因大豆土壤细菌多样性固氮细菌 nifH DGGE

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