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圆口铜鱼亲本与子代肝脏转录组特征及对比分析

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水生生物学报 2020年第4期44卷 774-780页

作者：李学梅吴兴兵龚进铃朱永久杨德国中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室武汉430223

通过Illumina Hiseq TM 2000测序平台首次开展了圆口铜鱼(Coreius guichenoti)亲本与子代肝脏转录组测序并对比分析其测序结果。对转录组进行拼接和组装,共获得80688个Unigene,Unigene的长度主要分布在401-600 bp,占总Unigene的43.56%。... 详细信息

通过Illumina Hiseq TM 2000测序平台首次开展了圆口铜鱼(Coreius guichenoti)亲本与子代肝脏转录组测序并对比分析其测序结果。对转录组进行拼接和组装,共获得80688个Unigene,Unigene的长度主要分布在401-600 bp,占总Unigene的43.56%。与Nr、GO、COG、KEGG等公共数据库比对并进行功能注释,经分析圆口铜鱼亲本与子代差异表达基因共2701个,其中上调1240个,下调1461个。差异基因表达模式聚类热图显示,同一样本不同重复基因表达相似。将差异基因映射到代谢通路KEGG数据库进行富集分析,并对37个KEGG显著富集的代谢通路(P圆口铜鱼子代中表达量均显著上调。该结果丰富了圆口铜鱼基因组数据,并首次从分子水平比较了圆口铜鱼亲本和子代的代谢差异,同时解释了在同一循环水系统中子代不易患病的现象。

关键词：圆口铜鱼肝脏转录组代谢通路网络

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圆口铜鱼颌须形态差异的多元分析

云南农业大学学报（自然科学版） 2017年第4期32卷 606-611页

作者：梁祥徐超群李光华冷云赵利刚云南省渔业科学研究院云南昆明650111 北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083 云南澜沧江实业有限公司龙开口分公司云南鹤庆671500

【目的】为研究以形态特征为主要依据的鱼类传统分类鉴定的有效性。【方法】本研究通过测定圆口铜鱼的颌须长、全长、体长、头长、口宽、眼径、吻长、吻端至胸鳍基部前端的距离;对所测形态参数进行相关性、主成分和回归分析。【结果】... 详细信息

【目的】为研究以形态特征为主要依据的鱼类传统分类鉴定的有效性。【方法】本研究通过测定圆口铜鱼的颌须长、全长、体长、头长、口宽、眼径、吻长、吻端至胸鳍基部前端的距离;对所测形态参数进行相关性、主成分和回归分析。【结果】相关性中除眼径外,其余7个形态指标之间,相关系数最小值为0.59,最大值达为0.99,表现出极强的相关性;主成分分析共提取3个主成分,第1个主成分对总方差的累计贡献率为77.42%,前2个主成分对总方差的累计贡献率为91.67%,全部3个主成分对总方差的累计贡献率为95.28%,颌须长的变异与除眼径外的其他测量性状均有较大的相关性,其中,吻长、全长、头长和口宽的主成分载荷值更高,表现出对颌须长变异近乎相近的特性;回归分析得到回归方程:Y=26.68+1.29X_1+0.010 X_2+2.05 X_3(R^2=0.54);对除颌须长的其余7个形态参数得到的主成分因子的散点图显示:绝大多数的圆口铜鱼个体分为一簇。【结论】在鱼类分类中,形态特征依然可作为群体分类的重要依据。

关键词：圆口铜鱼颌须形态差异多元分析

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圆口铜鱼人工繁殖及胚胎发育研究

水生态学杂志 2019年第3期40卷 115-119页

作者：董纯陈小娟万成炎曹恒源唐会元水利部中国科学院水工程生态研究所水利部水工程生态效应与生态修复重点实验室武汉430079

鉴于金沙江梯级电站开发运行后鱼类栖息地减少、洄游通道受阻、自然繁殖受到影响、早期资源量显著下降、种群生存面临危机的现状,为了保护鱼类种质资源,通过人工增殖放流是补充其资源量的主要补救措施。利用船体网箱原位活水驯养的圆口... 详细信息

鉴于金沙江梯级电站开发运行后鱼类栖息地减少、洄游通道受阻、自然繁殖受到影响、早期资源量显著下降、种群生存面临危机的现状,为了保护鱼类种质资源,通过人工增殖放流是补充其资源量的主要补救措施。利用船体网箱原位活水驯养的圆口铜鱼(Coreius guichenoti)亲鱼,开展亲鱼驯养、人工催产和胚胎发育研究。结果表明,圆口铜鱼亲鱼在船体网箱活水驯养条件下,性腺发育成熟,可用于人工催产。2017年6月17-30日,采用二次注射法人工催产3批次,共产卵约12万粒,在水温20.5～21.9℃条件下,针距8～10 h,效应时间18～19 h,平均受精率69.3%,出苗约5万尾。圆口铜鱼卵径1.9～2.2 mm,卵膜径6.4～7.2 mm,胚胎发育过程分为受精卵、卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、器官形成期和出膜期7个阶段,在水温20.5～22.5℃,溶氧7 mg/L以上条件下,历时48～62 h出膜。研究结果为圆口铜鱼人工繁殖技术提供了参考,为其规模化人工增殖放流提供了保障。

关键词：圆口铜鱼原位驯养人工繁殖胚胎发育

高投饲率对圆口铜鱼幼鱼肝脏抗氧化、免疫功能和脂质代谢的影响

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动物营养学报 2023年第9期35卷 5870-5885页

作者：陈沛赵煜杨元金杨菁曲焕韬中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所宜昌443100 三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室宜昌443100

本试验通过研究高投饲率对圆口铜鱼(Coreius guichenoti)幼鱼肝脏抗氧化、免疫功能和脂质代谢的影响,来探究高投饲率导致圆口铜鱼脂肪肝形成的原因。设置2%(对照组)和5%(高投饲率组)2个投饲率,每组设3个重复,每个重复投放30尾圆口铜鱼,... 详细信息

本试验通过研究高投饲率对圆口铜鱼(Coreius guichenoti)幼鱼肝脏抗氧化、免疫功能和脂质代谢的影响,来探究高投饲率导致圆口铜鱼脂肪肝形成的原因。设置2%(对照组)和5%(高投饲率组)2个投饲率,每组设3个重复,每个重复投放30尾圆口铜鱼,养殖期为8周。结果显示:与对照组相比,高投饲率显著提高圆口铜鱼幼鱼肝脏甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、游离脂肪酸(NEFA)、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(AKP)和总胆汁酸(TBA)含量/活性(P圆口铜鱼幼鱼肝脏活性氧(ROS)、还原性谷胱甘肽(GSH)和丙二醛(MDA)含量以及总抗氧化能力(T-AOC)(P圆口铜鱼幼鱼肝脏脂肪合成的增加、脂肪分解的降低,从而导致肝脏脂肪蓄积,最终诱导脂肪肝的形成,并引发氧化应激和炎症反应,加剧肝脏的损伤。

关键词：圆口铜鱼脂肪肝脂质代谢转录组转录因子

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圆口铜鱼幼鱼鱼体的化学组成及能量密度

西南大学学报（自然科学版） 2008年第10期30卷 62-67页

作者：吴斌罗毅平谢小军西南大学生命科学学院重庆400715

2007年8月于长江木洞江段（重庆市巴南区）采集到体长（L）为40.2~79.1 mm,体质量为1.12~8.43 g的圆口铜鱼（Coreius guichenoti）幼鱼224尾.测定了鱼体化学组成,估算了其能量密度.结果表明：圆口铜鱼幼鱼含水量（WAT）、蛋白质含量（PR... 详细信息

2007年8月于长江木洞江段（重庆市巴南区）采集到体长（L）为40.2~79.1 mm,体质量为1.12~8.43 g的圆口铜鱼（Coreius guichenoti）幼鱼224尾.测定了鱼体化学组成,估算了其能量密度.结果表明：圆口铜鱼幼鱼含水量（WAT）、蛋白质含量（PRO）、脂肪含量（FAT）、灰分含量（ASH）和能量密度（E）的范围分别为71.74%~76.33%,13.90%~14.69%,7.11%~10.96%,2.39%~2.43%和6.09~7.80 kJ/g.随体长增加,蛋白质含量、脂肪含量和能量密度均呈增加而含水量呈下降趋势,其灰分含量变化无明显规律.统计分析表明含水量与蛋白质含量、脂肪含量、能量密度均呈显著的负线性关系,分别为：PRO=24.34-0.14 WAT（r=-0.53,p〈0.05）,FAT=70.00-0.83 WAT（r=-0.95,p〈0.05）和E=33.42-0.36 WAT（r=-0.97,p〈0.05）;体长与蛋白质含量、脂肪含量、能量密度均呈显著的正线性关系,分别为：PRO=12.52＋0.03 L（r=0.49,p〈0.05）,FAT=-0.61＋0.16 L（r=0.78,p〈0.05）和E=2.71＋0.07 L（r=0.80,p〈0.05）.圆口铜鱼幼鱼脂肪含量高于文献报道的大多数鱼类.讨论认为,该种鱼在生长中其鱼体较高的脂肪含量及其快速积累可为其长距离繁殖洄游提供必要的能量储备.

关键词：圆口铜鱼能量密度化学组成脂肪含量

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圆口铜鱼早期卵母细胞发生的超微结构

西南师范大学学报（自然科学版） 2006年第1期31卷 119-124页

作者：张贤芳张耀光甘光明王志坚西南大学水产科学重庆市市级重点实验室三峡库区生态环境教育部重点实验室重庆400715

用透射电镜观察了圆口铜鱼早期卵母细胞超微结构，发现：第1时相，卵原细胞呈圆形，细胞核较大，核仁1个，由纤维中心、致密纤维组分、颗粒组分组成；核内异染色质少，常染色质多；细胞质中有1～2个核仁样体，线粒体数量少，其基质电子... 详细信息

用透射电镜观察了圆口铜鱼早期卵母细胞超微结构，发现：第1时相，卵原细胞呈圆形，细胞核较大，核仁1个，由纤维中心、致密纤维组分、颗粒组分组成；核内异染色质少，常染色质多；细胞质中有1～2个核仁样体，线粒体数量少，其基质电子密度低，嵴不发达．第2时相，卵母细胞体积增大，核仁数目增多，形态上出现大小区别．早期细胞质中核仁样体增多，靠近核膜，不被线粒体包围；光面内质网较多，糖原颗粒均匀分布；线粒体出现聚集现象；中期线粒体包围核仁样体．晚期核仁样体由大变小，逐渐消失，细胞膜边缘开始形成胞质突起．第3时相，早期卵母细胞的细胞质形成大量突起，且越来越明显；中期放射带开始形成，滤泡细胞出现颗粒细胞和鞘膜细胞的分化，两种细胞的超微结构有显著差异；晚期卵母细胞周围胶原纤维发达，呈束状，鞘膜细胞扁平状，卵母细胞质中有丰富的细胞器．讨论了圆口铜鱼早期卵子发生的特点，并与铜鱼的卵子发生做了比较．

关键词：圆口铜鱼卵巢发育卵子发生超微结构

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圆口铜鱼维氏气单孢菌的分离鉴定及药敏试验

水生态学杂志 2016年第4期37卷 95-100页

作者：曹恒源乔晔陈小娟潘磊谢建军董纯安苗王小明杨少荣贵州大学动物科学学院贵阳550025 水利部中国科学院水工程生态研究所水利部水工程生态效应与生态修复重点试验室武汉430079 中国三峡建设管理有限公司成都610041

从濒死圆口铜鱼的脾和肾病灶部位分离优势菌,进行纯化分离并开展生理生化鉴定、16S r DNA序列分析以及常用抗生素药物的药敏性筛选,以期丰富圆口铜鱼病害防治的基础资料。分离出的1株优势菌在BHI固体培养基上长出表面光滑的灰白色圆形菌... 详细信息

从濒死圆口铜鱼的脾和肾病灶部位分离优势菌,进行纯化分离并开展生理生化鉴定、16S r DNA序列分析以及常用抗生素药物的药敏性筛选,以期丰富圆口铜鱼病害防治的基础资料。分离出的1株优势菌在BHI固体培养基上长出表面光滑的灰白色圆形菌落,边缘整齐、不透明、稍隆起;序列长度为1 399 bp,与维氏气单孢菌的同源性为100%,与维氏气单孢菌(KT964297.1;KJ650080.1;KM362731.1)聚为一支,置信度99。结合菌落形态特征和生理生化特征,鉴定菌株为维氏气单孢菌。该菌株对氟苯尼考等7种药物敏感,对利福平中度敏感,对新霉素等9种药物耐药。

关键词：圆口铜鱼维氏气单胞菌生化鉴定 16S rDNA序列药敏试验

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圆口铜鱼资源变化及物种保护研究进展

人民长江 2023年第3期54卷 63-71页

作者：熊美华邵科李伟涛朱滨水利部中国科学院水工程生态研究所水利部水工程生态效应与生态修复重点实验室湖北武汉430079 湖北省水生态保护与修复工程技术研究中心湖北武汉430079

圆口铜鱼(Coreius guichenoti(Sauvage et Dabry))是国家二级重点保护野生动物和长江上游特有鱼类,为中国典型的淡水洄游性鱼类,研究梯级电站建设背景下圆口铜鱼资源变化对保护圆口铜鱼具有重要意义。综合文献调研及野外监测结果,发现... 详细信息

圆口铜鱼(Coreius guichenoti(Sauvage et Dabry))是国家二级重点保护野生动物和长江上游特有鱼类,为中国典型的淡水洄游性鱼类,研究梯级电站建设背景下圆口铜鱼资源变化对保护圆口铜鱼具有重要意义。综合文献调研及野外监测结果,发现圆口铜鱼资源量呈下降趋势,分布范围随着电站蓄水不断缩减并呈现出片段化,大坝建成运行几年后,库区不再有圆口铜鱼分布,坝下流水江段仍有圆口铜鱼分布;圆口铜鱼繁殖群体分布范围愈来愈窄,目前金沙江下游仅乌东德水电站坝下流水江段东川渡口能监测到亲鱼;攀枝花断面和巧家、皎平渡断面所监测到的圆口铜鱼产卵规模显著下降。通过对圆口铜鱼资源变化等研究进展的梳理,提出圆口铜鱼保护建议:加强栖息地和产卵场保护,构建人工产卵场;对圆口铜鱼人工种群应开展相应的遗传管理,并进行放流效果评估研究;修建过鱼设施,使圆口铜鱼能顺利通过大坝完成生殖洄游,保护其种群延续。

关键词：圆口铜鱼物种保护梯级电站长江上游

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基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术

水生生物学报 2019年第6期43卷 1216-1223页

作者：何勇凤朱永久吴兴兵龚进玲杨德国中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室

为快速有效地鉴别不同的圆口铜鱼家系及来源,研究从已发表的40个微卫星标记中筛选出20个多态性较高且稳定扩增的微卫星位点,通过对8个圆口铜鱼家系339尾个体进行微卫星基因分型检测,建立了圆口铜鱼荧光微卫星标记与多重毛细管电泳相结... 详细信息

为快速有效地鉴别不同的圆口铜鱼家系及来源,研究从已发表的40个微卫星标记中筛选出20个多态性较高且稳定扩增的微卫星位点,通过对8个圆口铜鱼家系339尾个体进行微卫星基因分型检测,建立了圆口铜鱼荧光微卫星标记与多重毛细管电泳相结合的亲子鉴定技术。遗传多样性分析结果显示,圆口铜鱼8个家系群体的平均等位基因数(Na)为9个,平均多态信息含量(PIC)为0.616,平均期望杂合度(He)为0.659,平均观测杂合度(Ho)为0.691,其中子一代群体的遗传多样性水平明显低于亲本群体。亲子鉴定分析结果显示,当双亲基因型未知时其单亲累积排除概率(CE-1P)为0.99954473,当单亲基因型已知时其累积排除概率(CE-2P)为0.99999825,当双亲基因型未知时其双亲累积排除概率(CE-PP)为1.00000000,当使用20个微卫星位点进行亲子鉴定时,297尾子一代均能正确找到其父母本,亲子鉴定准确率为100%。由此可见,研究建立的圆口铜鱼亲子鉴定技术是可靠的,能为圆口铜鱼的家系管理、种群遗传管理和增殖放流效果评估提供科学依据.

关键词：圆口铜鱼微卫星亲子鉴定