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四倍体杂交冰草AFLP遗传连锁图谱的构建

麦类作物学报 2015年第4期35卷 457-463页

作者：姜志艳于肖夏于卓刘志华郝治满李小雷内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019 内蒙古科技大学数理与生物工程学院内蒙古包头014010

为给冰草抗性及产量等重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定基础,以四倍体杂交冰草的347个F2代单株及其亲本为材料,利用AFLP分子标记技术构建四倍体冰草的分子遗传连锁图。结果表明,本研究首次成功构建出1张密度较高的四倍体杂... 详细信息

为给冰草抗性及产量等重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定基础,以四倍体杂交冰草的347个F2代单株及其亲本为材料,利用AFLP分子标记技术构建四倍体冰草的分子遗传连锁图。结果表明,本研究首次成功构建出1张密度较高的四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,该图谱包含14个连锁群,572个标记,各连锁群长度范围为129.75~214.90cM,覆盖基因组总长度2 266.59cM,标记间平均间距4.13cM。

关键词：四倍体杂交冰草 AFLP标记遗传连锁图谱

四倍体杂交冰草SRAP和SSR分子标记遗传连锁图谱构建

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麦类作物学报 2018年第8期38卷 941-948页

作者：杨东升于卓于肖夏李晓宇吴国芳石悦张明飞内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019

为了给后期冰草抗旱耐寒基因筛选及QTL图位克隆搭建平台,并为产量及相关性状QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础,以航道冰草和蒙古冰草为亲本,杂交加倍后随机选取180个F2分离单株为作图群体,利用SRAP和SSR分子标记进行四倍体杂交冰草遗... 详细信息

为了给后期冰草抗旱耐寒基因筛选及QTL图位克隆搭建平台,并为产量及相关性状QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础,以航道冰草和蒙古冰草为亲本,杂交加倍后随机选取180个F2分离单株为作图群体,利用SRAP和SSR分子标记进行四倍体杂交冰草遗传连锁图谱的构建。结果表明,构建的图谱包含475个标记(240个SRAP标记和235个SSR标记),分布于14个连锁群,图谱全长为1 592.7cM,标记间平均间距为3.35cM,各连锁群长度范围为67.6~145.2cM。该图谱密度较高、标记位点分布均匀且连锁群更加饱满。

关键词：四倍体杂交冰草 SRAP SSR 遗传连锁图谱

四倍体杂交冰草11个重要性状的QTL定位分析

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中国草地学报 2015年第4期37卷 7-14页

作者：姜志艳于肖夏于卓姜超石悦内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019 内蒙古科技大学数理与生物工程学院内蒙古包头014010

为了定位四倍体杂交冰草重要农艺性状的QTL和深入开展冰草的分子标记辅助育种、重要性状基因的图位克隆及其功能分析等提供理论依据,试验以其F2群体为材料,在已构建出的四倍体杂交冰草高密度分子连锁遗传图谱上,采用多MQM模型法对株高... 详细信息

为了定位四倍体杂交冰草重要农艺性状的QTL和深入开展冰草的分子标记辅助育种、重要性状基因的图位克隆及其功能分析等提供理论依据,试验以其F2群体为材料,在已构建出的四倍体杂交冰草高密度分子连锁遗传图谱上,采用多MQM模型法对株高、茎粗、叶片数、叶长、叶宽、茎叶比、穗长、穗宽、单株干重、单株干重、分蘖数共11个农艺性状进行了QTL定位分析.结果表明：各性状两年一点的测量值呈正态分布,均适用于QTL分析;在LOD＞3.0条件下,11个性状共定位了59个QTL,分布在14个连锁群上,其遗传贡献率变幅为6.7％～37.6％;在这59个QTL中,控制叶片数7个、分蘖数6个、单株鲜重4个、单株干重5个、茎粗5个、叶长4个、叶宽10个、穗长6个、穗宽5个、茎叶比4个、株高3个.

关键词：四倍体杂交冰草杂种F2群体重要农艺性状 QTL定位

四倍体杂交冰草SSR分子遗传图谱构建及主要性状QTL定位

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四倍体杂交冰草SSR分子遗传图谱构建及主要性状QTL定位

作者：张志成内蒙古农业大学

学位级别：硕士

冰草是禾本科小麦族多年生植物,具有适应性广、抗逆性强、高产优质等特性,是麦类作物品种改良的重要基因资源。本论文以四倍体杂交冰草F2代的200个分离单株为作图群体,构建四倍体冰草的SSR分子遗传连锁图谱,并对其株高、茎叶比、单株干... 详细信息

冰草是禾本科小麦族多年生植物,具有适应性广、抗逆性强、高产优质等特性,是麦类作物品种改良的重要基因资源。本论文以四倍体杂交冰草F2代的200个分离单株为作图群体,构建四倍体冰草的SSR分子遗传连锁图谱,并对其株高、茎叶比、单株干重等11个主要性状进行QTL定位,为进一步开展冰草重要性状基因克隆、功能分析及分子标记辅助育种奠定基础。主要结果如下： 1.利用四倍体杂交冰草F2作图群体其中一个单株和其亲本蒙古冰草、航道冰草的基因组DNA进行SSR引物筛选,从238对引物中选出32对适宜引物,对F2代200个单株PCR扩增获得180个多态性位点,平均每对引物扩增出5.63个位点。 2.在180个多态性标记中,偏离孟德尔分离比例的标记有30个,占总标记数的13.9%,偏分离标记数少,符合遗传连锁图谱的构建要求。 3.构建出一张包含161个SSR标记、7个连锁群的四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱。各连锁群的标记位点数在11-41之间,长度范围在52.7-184.2cM之间,图谱长度为707.4cM,标记间平均距离4.39cM,图谱密度较高。7个连锁群中,第1连锁群最长,第5连锁群最短。 4.四倍体杂交冰草F2作图群体单株的株高、茎叶比、单株干重、分蘖数等11个农艺性状均呈正态分布,且各性状间存在着一定的相关性。 5.对四倍体冰草的11个主要农艺性状QTL定位,在5个连锁群中共检测到19个QTLs,其遗传贡献率在5.7%～11.1%之间。在第1连锁群中,含有茎粗和茎叶比的QTL各1个、单株干重QTL2个;在第2连锁群中,含有叶片数、叶宽和穗长的QTL各1个,分蘖数QTL2个;在第3连锁群中有株高QTL1个;在第6连锁群中,有单株鲜重QTL3个;在第7连锁群中,有穗长QTL1个、穗宽QTL2个,叶长QTL3个。而连锁群4和连锁群5无QTL分布。

关键词：四倍体杂交冰草 SSR标记分子遗传图谱重要性状 QTL定位

基于GBS技术构建四倍体杂交冰草超高密度遗传连锁图谱

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麦类作物学报 2021年第10期41卷 1197-1210页

作者：杨东升于卓于肖夏李佳奇李景伟吴国芳卢倩倩内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019

冰草是优良的牧草,也是小麦等麦类作物抗逆遗传改良的重要基因库。构建冰草超高密度遗传连锁图谱,有利于冰草的标记辅助育种和遗传分析。本研究利用基因分型测序(GBS)技术,对四倍体杂交冰草F_(2)分离群体的115个单株及其亲本蒙古冰草和... 详细信息

冰草是优良的牧草,也是小麦等麦类作物抗逆遗传改良的重要基因库。构建冰草超高密度遗传连锁图谱,有利于冰草的标记辅助育种和遗传分析。本研究利用基因分型测序(GBS)技术,对四倍体杂交冰草F_(2)分离群体的115个单株及其亲本蒙古冰草和航道冰草进行高通量SNP基因分型,经测序获得了超过584 Gb的数据,SNP鉴定以及完整度和偏分离过滤后,最终得到了5035个高质量的SNP标记;采用Join Map 4.0作图软件构建四倍体冰草超高密度遗传连锁图谱,该遗传图谱包括14个连锁群,各连锁群的长度范围在68.959~280.309 cM之间,平均长度为153.473 cM,覆盖的基因组总长度为2148.621 cM,标记间的平均距离为0.427 cM。该图谱是目前冰草中分子标记数目最多、密度最高的遗传连锁图谱,为进一步开展冰草品质、抗性等重要性状的QTL定位、图位克隆及分子标记辅助育种研究等奠定了基础。

关键词：四倍体杂交冰草 F_(2)群体 SNP标记开发超高密度遗传图谱

冰草可溶性碳水化合物含量等重要品质性状的QTL定位

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麦类作物学报 2020年第5期40卷 568-576页

作者：李佳奇于卓于肖夏张胜杨东升卢倩倩吴国芳牛亚青青内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019

冰草是小麦的重要优质基因源,为更好地利用冰草资源进行小麦育种,以四倍体杂交冰草F2群体的246个分离单株无性系及其亲本为材料,在课题组前期已构建的冰草高密度分子遗传连锁图谱上,利用区间作图法对两年一地环境条件下测定的冰草WSC、... 详细信息

冰草是小麦的重要优质基因源,为更好地利用冰草资源进行小麦育种,以四倍体杂交冰草F2群体的246个分离单株无性系及其亲本为材料,在课题组前期已构建的冰草高密度分子遗传连锁图谱上,利用区间作图法对两年一地环境条件下测定的冰草WSC、淀粉和粗纤维含量的QTL进行了定位分析。结果发现,在LOD>2.5的条件下,共检测到85个QTLs位点;在两年一地不同环境条件下均能检测到的稳定QTLs有11个,分布在冰草LG1、LG3、LG8、LG9、LG10和LG14连锁群上,遗传贡献率范围在10.1%~41.4%之间。贡献率>20%的主效QTLs有6个,分别是qwsc1-1(2)-1、qwsc10-1(2)-2、qwsc14-1(2)-3、qst3-1(2)-5、qcf1-1(2)-3和qcf8-1(2)-2。本研究明确了各稳定QTLs的分子标记位点和遗传效应,为深入开展冰草3个品质性状QTL的精细定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。

关键词：四倍体杂交冰草品质性状分子标记 QTL定位