检索结果-南通市图书馆

病毒学报 2024年第1期40卷 115-124页

作者：童桂香谭红连杨明伟陈福艳吴铁军黄婷李莉萍雷爱莹韦信贤广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室南宁530021 广西水产畜牧学校南宁530021

为了解广西地区对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus, WSSV)分子变异特征,选取2010-2019年采自广西沿海地区的120份WSSV阳性凡纳滨对虾(Litopenarus vannamei)样品,进行同源重复区ORF75、ORF94和ORF125基因的扩增和测序,并比... 详细信息

为了解广西地区对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus, WSSV)分子变异特征,选取2010-2019年采自广西沿海地区的120份WSSV阳性凡纳滨对虾(Litopenarus vannamei)样品,进行同源重复区ORF75、ORF94和ORF125基因的扩增和测序,并比较分析其重复单元变化差异(Variable number of tandem repeats, VNTR)及单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs)。结果显示,ORF75的重复单元(Repeat units, RUs)是45bp(RUs-45 bp)和102 bp(RUs-102 bp),RUs数目存在3、4、6、7、8、9类型,最多的是6 RUs型;ORF94的RUs是54bp(RUs-54 bp),RUs数目有0、1、2、3、4、6、8、9、11、12类型,最多的是2 RUs型;ORF125的RUs前两个是72 bp(RUs-72 bp),第3个之后的RUs为69 bp(RUs-69 bp),RUs有3、5、6、8、9类型,最多的是6 RUs型。SNPs分析结果表明,ORF75的RUs-45 bp的第3、15、30、42、44位存在多态性,RUs-102 bp的第83位存在多态性;ORF94的RUs-54 bp的第48位具有多态性,为G、T或C;ORF125的RUs-72 bp不存在多态性,RUs-69 bp(从第1个到倒数第2个)的第2、12、19、22、37、40、48、53、60、63位具有多态性,第2位为T/C,12和22位为G/T,19位为G/A,37、40、48、53和63位为A/G,60位为C/T,出现较多的位点是第12、22、37、60、63位,其中第60、63位多态性最为普遍。结果表明,WSSV广西株同源重复区存在较大变异,序列的RUs数目和SNP存在多样性。

关键词：凡纳滨对虾白斑综合征病毒同源重复区基因序列分析

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