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MALDI-TOF MS在鲍曼不动杆菌同源性分析中的临床应用评估

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中国感染控制杂志 2024年第1期23卷 104-111页

作者：郑恬周柯周磊杨玉琪陈潇白露刘家云空军军医大学第一附属医院检验科陕西西安710032

目的评估基质辅助激光解析电离飞行质谱(MALDI-TOF MS)分析鲍曼不动杆菌(AB)同源性的临床应用价值。方法剔除同一患者或环境多次送检标本中的重复菌株,收集某三甲综合医院2020年5月—2021年2月神经内科重症监护病房(ICU)住院患者痰标本... 详细信息

目的评估基质辅助激光解析电离飞行质谱(MALDI-TOF MS)分析鲍曼不动杆菌(AB)同源性的临床应用价值。方法剔除同一患者或环境多次送检标本中的重复菌株,收集某三甲综合医院2020年5月—2021年2月神经内科重症监护病房(ICU)住院患者痰标本及环境标本分离的46株AB,使用VITEK-MS质谱仪检测菌株,应用SARAMIS Premium软件进行聚类分析,并采用多位点序列分型(MLST)的方法进行验证。结果通过MALDI-TOF MS和MLST聚类分析和比较,46株AB中,39株为MALDI-TOF MS的MS-a型,其中,22株为MLST的MT-A簇,包括ST208型3株,ST540型3株,ST195型8株,ST369型5株,以及ST136、ST436、ST1893型各1株;16株为MT-B簇,包括ST381型4株、ST469型11株和ST938型1株;1株为MT-C簇(ST1821);MS-b型1株为ST381;MS-c型2株为ST369;MS-d型1株为ST195;MS-e型2株分别为ST540、ST369;MS-f型1株为STN1。结论作为AB同源性分析工具,MALDI-TOF MS具有一定的局限性,其菌株同源性分析结果与MLST结果一致性低,分辨特异性低,不可取代MLST技术。

关键词： MALDI-TOF MS 鲍曼不动杆菌 MLST 同源性

2021—2022年浙江省绍兴市市售畜禽肉中致泻性大肠埃希菌耐药性与同源性分析

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疾病监测 2024年

作者：何琴芬蒋卓婧唐诗洁周梁康张琴超绍兴市疾病预防控制中心

目的了解2021—2022年浙江省绍兴市市售畜肉和禽肉中致泻性大肠埃希菌（DEC）的耐药表型和同源性。方法2021年3月至2022年11月采集绍兴市所辖区内农贸市场、超市和餐饮店畜禽肉420份，对样本中的DEC进行分离鉴定。采用微量肉汤稀释法测... 详细信息

目的了解2021—2022年浙江省绍兴市市售畜肉和禽肉中致泻性大肠埃希菌（DEC）的耐药表型和同源性。方法2021年3月至2022年11月采集绍兴市所辖区内农贸市场、超市和餐饮店畜禽肉420份，对样本中的DEC进行分离鉴定。采用微量肉汤稀释法测定分离株对13种抗生素的耐药性，使用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对分离株进行分子分型并采用BioNumerics7.6软件进行聚类分析。结果420份畜禽肉样本（畜肉112份、禽肉308份）有72份阳性，总检出率为17.14%（72/420），其中畜肉DEC检出率为19.64%（22/112），禽肉DEC检出率为16.23%（50/308）。共分离到77株DEC，其中畜肉源24株，禽肉源53株，77株DEC共分为3种型别，其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）占92.21%（71/77），肠致病性大肠埃希菌（EPEC）占5.19%（4/77），产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）占2.60%（2/77）。77株DEC对四环素耐药率最高，为76.62%（59/77），对氨苄西林、氯霉素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑的耐药率分别为67.53%（52/77）、61.04%（47/77）、57.14%（44/77）。发现1株EAEC对碳青霉烯类药物（亚胺培南）耐药。77株DEC获得46种耐药谱，多重耐药菌株占70.13%（54/77）。禽肉源分离株对头孢唑林(χ2=9.403，P=0.002)、头孢噻肟(χ2=7.721，P=0.005)、庆大霉素(χ2=11.422，P性分布，亲缘关系较低。畜牧业应加强对抗生素的使用管理，加强DEC的耐药性监测，防控耐药菌的传播。

关键词：畜肉禽肉致泻性大肠埃希菌耐药性同源性

重症医学科耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因型和同源性分析

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海南医学院学报 2024年第8期30卷 582-590页

作者：张立荣江滟贵州医科大学检验学院微免教研室贵州贵阳550025 贵州省黔东南州从江县人民医院检验科贵州从江557400 贵州医科大学附属医院临床检验中心微免科贵州贵阳550004

目的:了解贵州省从江县人民医院重症医学科下呼吸道感染患者金黄色葡萄球菌耐药变迁情况,掌握耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的主要耐药基因和耐消毒剂基因,并对部分菌株作同源性分析。方法:回顾性分析贵州省从江县人民医院重症医学科下呼吸... 详细信息

目的:了解贵州省从江县人民医院重症医学科下呼吸道感染患者金黄色葡萄球菌耐药变迁情况,掌握耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的主要耐药基因和耐消毒剂基因,并对部分菌株作同源性分析。方法:回顾性分析贵州省从江县人民医院重症医学科下呼吸道感染患者2018~2021年金黄色葡萄球菌耐药情况变迁情况,以相关性分析(pearson)统计学方法探讨细菌耐药性与抗菌药物用药频度(defined daily dose system,DDDs)二者的关系。以四年间重症医学科下呼吸道感染患者送检标本分离获得的40株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌为研究对象,采用仪器法对试验菌株作鉴定及药敏,通过PCR技术作耐药基因(mecA、SCCmec、femB)和耐消毒剂基因(qacA/B)检测。应用多位点序列分型(MLST)法分析40株试验菌的同源性。结果:金黄色葡萄球菌每年的平均耐药率显示青霉素耐药率一直高于92%以上。四环素、克林霉素、复方新诺明耐药率在2019年有所下降后却又再次持续升高。红霉素、苯唑西林、左氧氟沙星、奎奴普丁/达福普丁的耐药率呈现逐年增长趋势。未发现对利奈唑胺、万古霉素和替加环素的耐药菌株。相关性分析提示青霉素耐药率与苯唑西林DDDs存在明显正相关(r=0.99,P性无统计学意义。基因检测发现40株耐MRSA中mecA检出率为97.5%,SCCmec和femB基因未检出,qacA/B基因检出率为15%。MLST分型结果显示共分为7个序列型,其中以ST59型占比最高,为优势型别,占比42.5%,其次为ST45型,占25%,ST239型、ST28型、ST188型、ST1型和ST630型分别占12.5%、7.5%和5%、5%、2.5%。结论:重症医学科下呼吸道感染金黄色葡萄球菌耐药率逐年增加,可选择的抗生素有限。细菌耐药性的产生与药物使用频率有一定关系,携带mecA和qacA/B基因是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌产生耐药的主要原因。MLST结果表明ICU病房存在科内克隆菌株。

关键词：金黄色葡萄球菌敏感性耐药性耐药基因同源性

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黏菌素耐药肺炎克雷伯菌耐药性及同源性

中华医院感染学杂志 2024年第1期34卷 1-6页

作者：萧晨路韩立中杨之涛徐玉敏倪语星石大可上海交通大学医学院附属瑞金医院临床微生物科上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院急诊科上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院医院感染管理科上海200025

目的了解黏菌素耐药的肺炎克雷伯菌耐药特点、临床分布、耐药性表型及基因型,并对菌株进行同源性分析。方法收集2021年1月-2021年12月上海交通大学医学院附属瑞金医院临床分离的黏菌素耐药肺炎克雷伯菌共17株,使用微生物质谱检测系统(MO... 详细信息

目的了解黏菌素耐药的肺炎克雷伯菌耐药特点、临床分布、耐药性表型及基因型,并对菌株进行同源性分析。方法收集2021年1月-2021年12月上海交通大学医学院附属瑞金医院临床分离的黏菌素耐药肺炎克雷伯菌共17株,使用微生物质谱检测系统(MOLDI-TOF MS)进行菌株鉴定,Vitek-2 Compact全自动微生物分析仪进行药敏试验,肉汤稀释法确认黏菌素敏感性,对菌株携带的耐药基因型进行PCR扩增和序列分析,分析菌株之间的同源性。结果17株黏菌素耐药的肺炎克雷伯菌菌株中,血液中分离率最高(4株占23.5%),科室分布以ICU为主(11株占64.7%);黏菌素耐药的肺炎克雷伯菌对β-内酰胺酶抑制剂复合制剂、头孢吡肟、环丙沙星、左氧氟沙星耐药率达100%;均携带bla_(SHV)和bla_(TEM),未检出mcr基因;其中16株(94.1%)多位点序列分型(MLST)为ST-11型;17例分离出黏菌素耐药肺炎克雷伯菌患者均合并多种基础疾病,13例(76.5%)为男性,年龄(37~96)岁,住院天数(33~146)天,9例(52.9%)死亡,4例(23.5%)检出前未接受任何黏菌素相关治疗;系统进化树显示不同部位分离的15株黏菌素耐药肺炎克雷伯菌在进化关系上具有同源性。结论黏菌素耐药肺炎克雷伯菌为广泛耐药菌株,大多携带多种耐药基因,治疗难度大,需引起临床重视,加强耐药菌株防控,合理选用抗菌药物。

关键词：黏菌素耐药肺炎克雷伯菌基因组学耐药基因同源性

某医院重症监护病房耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌耐药性及同源性分析

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中华医院感染学杂志 2024年 2580-2583页

作者：杨丽芳刘卫平内蒙古医科大学内蒙古自治区人民医院医院感染控制科

目的了解某医院重症监护病房(ICU)耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌(CRAB)临床标本及环境标本中CRAB分布、耐药性及同源性。方法对2020年1月—2022年12月内蒙古自治区人民医院ICU患者及同期环境分离的CRAB进行耐药性分析及脉冲凝胶电泳(PFGE... 详细信息

目的了解某医院重症监护病房(ICU)耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌(CRAB)临床标本及环境标本中CRAB分布、耐药性及同源性。方法对2020年1月—2022年12月内蒙古自治区人民医院ICU患者及同期环境分离的CRAB进行耐药性分析及脉冲凝胶电泳(PFGE)分型。结果共分离CRAB 846株,主要来自痰标本,占所有标本75.30%;主要分布在神外重症(34.16%)、呼吸重症(24.35%)和综合重症(18.68%);CRAB仅对磺胺类、左氧氟沙星、环丙沙星耐药率稍低,在80%～90%左右;对其他常见抗菌药物耐药率均在95%以上;34株CRAB PFGE聚类分析共得到A-J 7个类型,以C聚类为主(11株占32.35%),其次为E聚类(7株20.59%)。结论医院CRAB临床标本神经外科ICU和呼吸与危重症医学科ICU检出率较高,耐药较为严重,且存在患者间、患者与环境间交叉传播,应加强院内环境和医疗仪器表面消毒,强化医务人员手卫生意识,防止院内感染的暴发。

关键词：重症监护病房耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌耐药性同源性脉冲凝胶电泳

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鲍曼不动杆菌抗生素耐药及同源性分析

标记免疫分析与临床 2024年第3期31卷 427-431,437页

作者：耿荣华崔兰卿张佳蔡珍何宗辉李鹏博石莹莹航空总医院北京 100020 北京大学第一医院临床药理研究所北京 100034

目的了解我院住院患者及环境中鲍曼不动杆菌临床感染特点、耐药性及同源性,为临床有效治疗及感控预防提供参考.方法收集我院部分科室及环境中2018年11月至2021年6月分离的824株鲍曼不动杆菌中重点科室怀疑存在交叉感染的47株鲍曼不动... 详细信息

目的了解我院住院患者及环境中鲍曼不动杆菌临床感染特点、耐药性及同源性,为临床有效治疗及感控预防提供参考.方法收集我院部分科室及环境中2018年11月至2021年6月分离的824株鲍曼不动杆菌中重点科室怀疑存在交叉感染的47株鲍曼不动杆菌,采用Vitek-Ⅱ compact全自动微生物分析系统对菌株进行鉴定和药敏试验,采用多位点序列分型和基质辅助激光解析电离时间质谱(MALDI-TOF MS)对菌株进行同源性分析.结果 47株鲍曼不动杆菌对粘菌素表现为全部敏感,对替加环素、氨苄西林/舒巴坦、头孢哌酮/舒巴坦敏感率分别为89.5％、80.0％和56.6％,36株表现为3类以上抗生素耐药,MDRAB检出率为76.6％,多位点序列分型(MLST)得到8种序列型,以ST2型占优势(38株,占80.8％),其次为ST10型(2株,占4.3％)及ST132型(2株,占4.3％).分布特点以呼吸与危重症医学科、重症监护医学科和神经外科病房为主.结论我院鲍曼不动杆菌耐药率较高,多个克隆株在院内广泛分布,部分科室存在较近的亲缘关系,提示院感防控需进一步加强.

关键词：鲍曼不动杆菌流行病学耐药性同源性耐药基因基因重组测序技术

重症医学科产KPC-2肺炎克雷伯菌的耐药情况分析及同源性研究

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系统医学 2024年第4期9卷 48-51页

作者：戚丽敏陈建军睢宁县人民医院检验科江苏徐州221200 徐州市第一人民医院检验科江苏徐州221002

目的探究重症医学科产碳青霉烯酶-2(Klebsiella Pneumoniae Carbapenemase,KPC-2)肺炎克雷伯菌的耐药状况并分析其同源性情况。方法回顾性选取2020年10月—2022年9月睢宁县人民医院收治的46例重症医学科患者的临床资料,从中提取46株... 详细信息

目的探究重症医学科产碳青霉烯酶-2(Klebsiella Pneumoniae Carbapenemase,KPC-2)肺炎克雷伯菌的耐药状况并分析其同源性情况。方法回顾性选取2020年10月—2022年9月睢宁县人民医院收治的46例重症医学科患者的临床资料,从中提取46株耐青霉烯类肺炎克雷伯菌菌株,进行药敏性试验、mCIM及eCIM联合试验,并采用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增法检测待测菌的耐药基因,实施序列检测,使用脉冲场凝胶电泳(Pulsed field Gel Electrophoresis,PFGE)实施同源性分析。结果待测菌对替加环素、复方新诺明、阿米卡星、妥布霉素及庆大霉素有敏感性;mCIM及eCIM试验结果显示46株耐青霉烯类肺炎克雷伯菌均产丝氨酸碳青霉烯酶;待测菌株携带肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶基因阳性率达100.00%。结论产丝氨酸碳青霉烯酶是造成ICU分离耐青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制,酶基因为KPC-2型,且本院重症医学科存在耐青霉烯类肺炎克雷伯的克隆传播。

关键词：重症医学科肺炎克雷伯菌同源性耐药性

能谱CT多参数成像在肝脏肿瘤同源性鉴别诊断及术前分期的应用价值

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2024年第9期 0016-0019页

作者：罗露露资阳市中心医院四川资阳641300

探究为肝脏肿瘤同源性鉴别诊断及术前分期应用能谱CT多参数成像干预的临床意义。方法对95例存在疑似肝脏肿瘤症状的患者的资料进行收集(时间:2022年1月至2022年12月),均为其提供能谱CT多参数成像干预,以病理诊断结果作为金标准,分析该... 详细信息

探究为肝脏肿瘤同源性鉴别诊断及术前分期应用能谱CT多参数成像干预的临床意义。方法对95例存在疑似肝脏肿瘤症状的患者的资料进行收集(时间:2022年1月至2022年12月),均为其提供能谱CT多参数成像干预,以病理诊断结果作为金标准,分析该技术的效果。结果恶性者与良性者的能谱CT多参数成像干预各参数的对比存在差异,且对良恶性患者的鉴别效能、对肝癌术前分期的诊断价值等明确(p同源性鉴别诊断及术前分期应用能谱CT多参数成像干预的临床效果确切。

关键词：能谱CT多参数成像肝脏肿瘤同源性鉴别诊断术前分期

基于全基因组测序的耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药基因、毒力因子及同源性分析

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中国抗生素杂志 2022年第9期47卷 939-945页

作者：胡小骞王琴安徽医科大学第二附属医院合肥230601

目的通过应用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法收集该院2020年1月至3月重症... 详细信息

目的通过应用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法收集该院2020年1月至3月重症监护病房(Intensive care unit,ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株,通过二代测序平台进行全基因组测序,应用基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology,CGE)ResFinder 4.0软件分析其耐药基因型,并应用MORPHEUS在线制作热图,应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria,VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子,应用MLST软件检测菌株的ST型,应用Kaptive软件检测荚膜型,应用CSI Phylogeny 1.4软件及FigTree v1.4.4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree,MLT)以分析其同源性。结果11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药,而对阿米卡星、左氧氟沙星耐药的菌株株数较少。11株CRAB共检测出18种耐药基因,11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因bla_(OXA-23)和bla_(OXA-66),β-内酰胺酶耐药基因以bla_(TEM-1D)和bla_(ADC-25)为主,大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因。11株CRAB均携带多种毒力因子,包括外膜孔蛋白、脂多糖、生物膜、外排泵、磷脂酶和效应蛋白等,如OmpA、Lps、Csu、Pga、Ade、Plc、Bas、Bau、Ent、Hem、Aba、Bfm、Pbp和Kat等。11株CRAB均为ST2-K22型,同源性分析结果显示C组内同源性关系相近,存在院内传播的可能。结论该院CRAB的耐药性、毒力特征复杂多样,同源性分析显示该院存在1种优势克隆株,该克隆株有医院内传播的风险。

关键词：耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌全基因组测序耐药基因毒力因子同源性