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古细菌在牙周病患者龈下菌斑中的定性和定量分析

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中华口腔医学杂志 2008年第10期43卷 589-591页

作者：李超伦姜云涛张明珠梁景平上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔内科 200011

目的探讨古细菌与牙周疾病的关系，为深入研究古细菌与人类疾病的相关性和古细菌的可能致病机制奠定基础。方法收集侵袭性牙周炎23例、慢性牙周炎29例、慢性龈炎35例及牙周健康者38人的龈下菌斑，进行古细菌的定性和定量检测。结果古细... 详细信息

目的探讨古细菌与牙周疾病的关系，为深入研究古细菌与人类疾病的相关性和古细菌的可能致病机制奠定基础。方法收集侵袭性牙周炎23例、慢性牙周炎29例、慢性龈炎35例及牙周健康者38人的龈下菌斑，进行古细菌的定性和定量检测。结果古细菌在龈下菌斑中的检出率：侵袭性牙周炎组65％，慢性牙周炎组72％，慢性龈炎组26％，健康对照组未检出。每微克湿重菌斑中的古细菌16SrRNA基因平均拷贝数：侵袭性牙周炎组6．66×10^6，慢性牙周炎组4．47×10^6，慢性龈炎组1．78×10^6.龈下菌斑中牙周炎组古细菌的检出率、古细菌16SrRNA基因平均拷贝数均高于龈炎组，差异有统计学意义（P〈0．05）。结论古细菌可能为牙周炎的致病因素之一。

关键词：牙周病学牙菌斑古细菌

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牙周治疗对龈下菌斑中古细菌定植的影响

上海交通大学学报（医学版） 2011年第7期31卷 1047-1049页

作者：李超伦刘大力钱洁蕾周彦玢束蓉上海交通大学医学院附属第九人民医院牙周科上海市口腔医学重点实验室上海200011

目的研究牙周治疗对龈下菌斑中古细菌定植的影响。方法对49例中重度牙周炎患者的牙周治疗进程进行跟踪,分别于龈上菌斑刮除后(基线)、牙周基础治疗后4周和牙周翻瓣术后12周,采集龈下菌斑标本抽提DNA,利用古细菌16S rRNA基因通用引物进行... 详细信息

目的研究牙周治疗对龈下菌斑中古细菌定植的影响。方法对49例中重度牙周炎患者的牙周治疗进程进行跟踪,分别于龈上菌斑刮除后(基线)、牙周基础治疗后4周和牙周翻瓣术后12周,采集龈下菌斑标本抽提DNA,利用古细菌16S rRNA基因通用引物进行PCR,对各菌斑标本古细菌16S rRNA表达进行定性检测,确定阳性标本并计算古细菌检出率。采用Real-Tim e PCR技术对阳性标本中总细菌和古细菌16S rRNA基因进行定量检测,计算古细菌相对丰度。结果牙周翻瓣术后12周时龈下菌斑标本中的古细菌检出率和古细菌相对丰度分别为17.6%和0.58%,显著低于基线时的69.4%和2.32%及牙周基础治疗后4周时的57.1%和2.30%,差异均有统计学意义(P古细菌的定植情况伴随牙周治疗的进程而迅速降低,提示菌斑厌氧环境的改变是影响古细菌定植的关键因素。

关键词：牙周炎古细菌定植龈下菌斑

填埋场古细菌垂直分布格局及其与垃圾降解程度响应特征

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环境科学学报 2021年第3期41卷 1040-1049页

作者：开颜王亚楠孙英杰王华伟徐榕卞荣星李卫华宫渤海青岛理工大学环境与市政工程学院青岛266033 青岛市固体废物污染控制与资源化工程研究中心青岛266033 青岛市市政公用科学技术研究院青岛266033

研究了青岛市小涧西垃圾填埋场表层(3~12 m)、中上层(15~24 m)、中下层(27~36 m)和底层(39~45 m)古细菌的多样性、群落组成与垂直分布特征,以及垃圾降解程度与古细菌群落结构演替变化的响应关系.结果表明:垃圾有机质和凯氏氮含量随填埋... 详细信息

研究了青岛市小涧西垃圾填埋场表层(3~12 m)、中上层(15~24 m)、中下层(27~36 m)和底层(39~45 m)古细菌的多样性、群落组成与垂直分布特征,以及垃圾降解程度与古细菌群落结构演替变化的响应关系.结果表明:垃圾有机质和凯氏氮含量随填埋深度增加呈降低趋势,而pH呈微弱升高趋势.填埋场中下层的古细菌群落多样性和丰度显著高于其他填埋层.在填埋层各深度上,广古菌门(Euryarcharota)为优势菌门,相对丰度达到90%以上,甲烷微菌纲(Methanomicrobia)和热源体纲(Thermoplasmata)为优势菌纲,二者相对丰度之和达84.69%~99.67%.属水平上,甲烷囊菌属(Methanoculleus)的占比在38.16%~64.46%之间变化,且与有机质相关性不显著,表明该类氢营养型产甲烷菌在垃圾中分布广泛,受垃圾降解程度影响较小.马赛球菌属(Methanomassiliicoccus)的相对丰度自表层的50%降至底层的20%,且与有机质呈显著正相关(r=0.95,p<0.05),表明该类甲基营养型产甲烷菌的分布受有机质降解程度影响较大.以乙酸裂解产甲烷的甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)和甲烷丝菌属(Methanothrix)在填埋场中也占有重要地位,但二者相对丰度整体低于Methanoculleus.Methanosarcina自表层至底层所占比重逐渐升高,与有机质呈显著负相关(r=-0.96,p<0.05);而Methanothrix仅在中下层有较高的丰度,与有机质相关性不显著,主要与两种菌属对乙酸亲和性的差异有关.不同填埋深度上产甲烷菌群落结构的演替变化反映了不同类型产甲烷菌对垃圾降解产物与稳定化程度的响应.

关键词：垃圾填埋场古细菌产甲烷菌垃圾降解垂直分布

降解2，4-二氯酚的厌氧颗粒污泥-悬浮载体生物膜反应器中古细菌的种群结构

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应用与环境生物学报 2008年第3期14卷 422-426页

作者：黄爱群陈玲计军平戴亚蕾张文同济大学污染控制与资源化研究国家重点实验室上海200092 同济大学医学院免疫实验室上海200092

采用古细菌特异性引物ARC21F/ARC958R对污泥样品的总DNA进行聚合酶链式反应(PCR)、克隆、序列分析等,研究了降解2,4-二氯酚(2,4-dichloropheno,l2,4-DCP)的厌氧颗粒污泥-悬浮载体生物膜反应器(Anaerobic granu-lar sludge-suspended carrier biofilm reactor,ASBR)中古细菌的种群分布.结果表明,接种污泥和ASBR各层污泥中存在共有的古细菌:Methanothrix soehngenii和Uncultured archaeon等,M.soehngenii、uncultured archaeonTA05和unculturedarchaeon TA04在接种污泥和ASBR各层污泥中的分布为:接种污泥的丰度上层的丰度>中层的丰度>下层的丰度.经2,4-DCP驯化后,ASBR上层悬浮填料区出现特有的古细菌unidentified crenarchaeote等,下层厌氧颗粒污泥区特有的古细菌为uncultured archaeon ZAR106等.接种污泥特有的6种古细菌Methanosaeta concilii等经2,4-DCP驯化后消亡,污泥中古细菌多样性减少,以下层颗粒污泥中古细菌种群丰度的变化最为明显.

关键词： 2 4-二氯酚厌氧颗粒污泥-悬浮载体生物膜反应器克隆古细菌

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采油废水缺氧处理体系细菌和古细菌丰度对比

应用与环境生物学报 2009年第4期15卷 519-522页

作者：王振宇余韬张昱杨敏陈威河南师范大学生命科学学院新乡453007 中国科学院生态环境研究中心北京100085

建立缺氧的模拟生物处理体系经过物化预处理的采油废水,利用荧光原位杂交技术(FISH)跟踪了废水处理系统启动和稳定过程中真细菌和古细菌相对丰度的变化.结果表明,系统稳定后的COD去除率在40%左右.细菌和古细菌在采油废水生物处理系统中... 详细信息

建立缺氧的模拟生物处理体系经过物化预处理的采油废水,利用荧光原位杂交技术(FISH)跟踪了废水处理系统启动和稳定过程中真细菌和古细菌相对丰度的变化.结果表明,系统稳定后的COD去除率在40%左右.细菌和古细菌在采油废水生物处理系统中都有很高的比例,并呈现不同的变化趋势.细菌丰度在启动和稳定后维持在15%左右;而古细菌在系统稳定过程中呈现逐渐增加的趋势,比例上升到21%.表明古细菌可以在活性污泥系统中稳定存在并发挥作用,说明古细菌在特定污水处理上具有一定的研究和应用价值.

关键词：采油废水古细菌荧光原位杂交污水处理

Ni^(2+)对降解2-氯酚厌氧系统古细菌种群结构的影响

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环境科学研究 2007年第6期20卷 94-100页

作者：黄爱群陈皓陈玲戴亚蕾同济大学环境科学与工程学院污染控制与资源化研究国家重点实验室上海200092 同济大学医学院免疫实验室上海200092

提取降解2-氯酚(2-chlorophenol,2-CP)的厌氧颗粒污泥在Ni2+冲击前后样品的总DNA,用古细菌特异性引物ARC21F/ARC958R进行16S rDNA的聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)、克隆、测序及序列分析等,研究了Ni2+冲击及恢复性驯化对2-CP驯化后厌氧颗粒污泥中古细菌种群多样性的影响.结果表明:Ni2+冲击对古细菌种群结构影响较大,冲击前后厌氧颗粒污泥中存在共有的古细菌菌种(Methanothrix soehngenii,Methanosaeta concilii及Uncultured archaeon等).冲击后厌氧污泥中新出现的古细菌有Toluene-degrading Methanogenic consortium archaeon M1及Candidatus Methanoregula booneistrain6A8等.经过10 d的恢复性驯化后,厌氧污泥中又出现了新的古细菌Methanobacterium subterraneum及Methanobacterium palustre等.2-CP厌氧降解系统经过Ni2+冲击后,古细菌种群多样性显著增加,系统能较快恢复对2-CP的降解能力.

关键词： 2-氯酚 Ni2+冲击厌氧颗粒污泥克隆古细菌