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盐析法快速提取口腔拭子DNA

第二军医大学学报 2011年第12期32卷 1370-1374页

作者：朱伟锋罗达亚涂硕张霞丽揭克敏万福生南昌大学医学院生物化学与分子生物学教研室南昌330006

目的建立盐析法快速从口腔拭子中提取基因组DNA的方法。方法首先以细胞裂解液和蛋白酶K消化口腔上皮细胞,然后用5 mol/L NaCl沉淀蛋白质,用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤得到的DNA并将其溶于TE(10mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH 8... 详细信息

目的建立盐析法快速从口腔拭子中提取基因组DNA的方法。方法首先以细胞裂解液和蛋白酶K消化口腔上皮细胞,然后用5 mol/L NaCl沉淀蛋白质,用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤得到的DNA并将其溶于TE(10mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH 8.0)中。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对TP53基因的rs1042522和CHRNA3基因的rs12910984位点进行分型。对不同基因型的样本测序验证。结果单支口腔拭子提取得到的DNA量在0.68～2.56μg之间,D260/D280比值在1.77～1.94之间。经PCR扩增和酶切消化,10个样本的两个单核苷酸多态性都得到了清楚分型。酶切结果与测序结果吻合。结论本实验所建立的盐析法可以快速、简便、经济地从口腔拭子得到高质量的基因组DNA。

关键词：盐析口腔拭子 DNA提取单核苷酸多态性

碱裂解法快速提取口腔拭子DNA对CHRNA3基因多态性的研究

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重庆医学 2012年第8期41卷 764-765,768,F0002页

作者：朱伟锋刘卓琦吴金兰余乐涵万福生南昌大学研究生院医学部江西南昌330006 南昌大学医学院生物化学与分子生物学教研室江西南昌330006 南昌大学实验动物科学部江西南昌330006

目的建立一种快速的从口腔拭子中提取DNA的方法,研究其在尼古丁乙酰胆碱受体α3(CHRNA3)基因多态性分析中的应用。方法以NaOH和乙二胺四乙酸(EDTA)配制碱裂解液,以三羟甲基氨基甲烷-EDTA(TE)为中和液,经加热裂解和中和两步提取口腔拭子... 详细信息

目的建立一种快速的从口腔拭子中提取DNA的方法,研究其在尼古丁乙酰胆碱受体α3(CHRNA3)基因多态性分析中的应用。方法以NaOH和乙二胺四乙酸(EDTA)配制碱裂解液,以三羟甲基氨基甲烷-EDTA(TE)为中和液,经加热裂解和中和两步提取口腔拭子DNA。以提取的DNA为模板,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析对CHRNA3基因的rs6495309进行分型。对不同基因型的样本测序验证。结果 PCR扩增和酶切的靶带清晰,无非特异性条带。酶切结果与测序结果吻合。结论碱裂解法提取口腔拭子DNA具有快速、简便、经济、可靠的特点,可以用于CHRNA3基因多态性的分析。

关键词：多态性,限制性片段长度序列分析,DNA 口腔拭子尼古丁乙酰胆碱受体α3 碱裂解

上海市造血干细胞捐献志愿者口腔拭子样本的分型成功率及其影响因素

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医学与社会 2021年第12期34卷 1-4页

作者：朱臻逸杜克明廖宽镇刘宝松张钢吕军复旦大学公共卫生学院上海200032 复旦大学中国残疾问题研究中心上海200032 上海荻硕贝肯医学检验所有限公司上海201318 上海市红十字会上海200040

目的:了解上海市造血干细胞捐献志愿者的口腔拭子样本分型成功率情况,分析其影响因素,为提高口腔拭子样本分型成功率提供参考。方法:利用2015-2018年上海市口腔拭子入库志愿者的8104条口腔拭子样本检测结果和造血干细胞资料库信息,对不... 详细信息

目的:了解上海市造血干细胞捐献志愿者的口腔拭子样本分型成功率情况,分析其影响因素,为提高口腔拭子样本分型成功率提供参考。方法:利用2015-2018年上海市口腔拭子入库志愿者的8104条口腔拭子样本检测结果和造血干细胞资料库信息,对不同年份、不同采样方式获得的样本分型成功率进行卡方分析,并对口腔拭子样本分型结果的影响因素进行回归分析。结果:2015-2018年,造血干细胞入库志愿者的口腔拭子样本分型成功率逐年上升(P口腔拭子样本与静脉血样本在分型成功率上无差异(P>0.05);logistic回归分析显示,样本分型的有效性在户籍、献血经历与采集检测的时间间隔上差异有统计学意义(P口腔拭子样本具有更高的分型成功率。结论:口腔拭子样本的分型成功率较为理想;志愿者户籍、献血经历和采集检测时间间隔是影响口腔拭子样本分型结果的主要因素,需要优化关键环节来保障口腔拭子技术的有效应用。

关键词：造血干细胞口腔拭子 DNA分型上海

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口腔拭子DNA检验的实时定量研究

刑事技术 2007年第4期32卷 23-25页

作者：杨电李越刘超陈玲广东广州市刑事科学技术研究所 510030 南方医科大学法医教研室广东广州510515

目的寻求提高口腔拭子的DNA检验效率的方法。方法对来源于不同个体或同一个体不同擦拭次数的口腔拭子用Chelex-100或磁珠法提取的DNA用实时定量PCR技术进行定量,同时用Identifiler复合扩增系统在ABI3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行ST... 详细信息

目的寻求提高口腔拭子的DNA检验效率的方法。方法对来源于不同个体或同一个体不同擦拭次数的口腔拭子用Chelex-100或磁珠法提取的DNA用实时定量PCR技术进行定量,同时用Identifiler复合扩增系统在ABI3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型。结果在建立的Identifiler系统8μl扩增体系中,3个月内的口腔拭子用Chelex-100法提取的DNA模板1μl量较3μl量扩增效果好,磁珠法提取的DNA模板用量大小对复合扩增检测影响较小。结论用棉签擦拭颊粘膜5次制备口腔拭子,取其头部的约1/4用200μlChelex-100法提取DNA,然后用1μl模板进行复合扩增,是提高口腔拭子的DNA检验效率的简便可行的方法,但陈旧口腔拭子用磁珠法提取更能保证复合扩增分型成功。

关键词：口腔拭子实时定量PCR技术 DNA定量 STR复合扩增

口腔鳞癌组织和口腔拭子中Dickkopf-1基因甲基化状态与疾病进展的相关性研究

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实用临床医药杂志 2022年第8期26卷 27-31,43页

作者：申庸凡李志军达云萌尹克任贵云河北省眼科医院口腔科河北邢台054000 河北医科大学附属医院口腔科河北邢台054000 河北省口腔医院口腔科河北石家庄050000

目的研究口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织和口腔拭子(OS)中Dickkopf-1(DKK-1)基因甲基化状态与疾病进展的关系及其临床意义。方法选取诊断为OSCC的67例患者作为OSCC组,收集病变同侧和对侧OS标本及手术组织标本。另选择30例阻生智齿患者的健康... 详细信息

目的研究口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织和口腔拭子(OS)中Dickkopf-1(DKK-1)基因甲基化状态与疾病进展的关系及其临床意义。方法选取诊断为OSCC的67例患者作为OSCC组,收集病变同侧和对侧OS标本及手术组织标本。另选择30例阻生智齿患者的健康口腔黏膜组织作为健康对照组,30例口腔黏膜下纤维病变(OSF)患者作为癌前病变组。采用免疫组化法检测组织DKK-1蛋白表达;采用重亚硫酸盐转化和定量甲基化特异性聚合酶链反应(qMSP)法检测DKK-1基因甲基化水平。结果癌前病变组(66.67%,20/30)和OSCC组(20.90%,14/67)DKK-1蛋白阳性表达率低于健康对照组(93.33%,28/30),且OSCC组低于癌前病变组,差异有统计学意义(P<0.001)。OSCC组肿瘤组织和OS标本中DKK-1基因甲基化水平高于癌前病变组和健康对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。Spearman相关系数分析显示,组织标本与OS病变同侧标本中DKK-1基因甲基化水平呈正相关性(r_(s)=0.672,P<0.001)。组织和OS病变同侧标本中DKK-1基因甲基化水平用于鉴别诊断OSCC和癌前病变的曲线下面积(AUC)分别为0.799(95%CI:0.713~0.884)、0.843(95%CI:0.762~0.924)。OS样本中DKK-1甲基化在早期(Z=2.354,P=0.021)和高分化肿瘤患者中更显著(Z=3.731,P<0.001)。结论从病变部位采集的OS标本中DKK-1基因高甲基化可用于OSF癌变监测以及OSCC的早期诊断。

关键词：口腔鳞状细胞癌 Dickkopf-1 基因甲基化口腔黏膜下纤维病变口腔拭子

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一种新型口腔拭子在法医学上的应用

中国刑警学院学报 2011年第1期 59-60页

作者：潘永峰牛青山高鹤铭沈阳市公安局刑事警察支队辽宁沈阳110002 中国刑警学院辽宁沈阳110035

一种采集人体口腔颊粘膜细胞的新型口腔拭子，适用于法医DNA的样本提取，该拭子具有无损伤、无痛苦、操作简便成本低廉的特点。

关键词：口腔拭子 DNA 检验 DNA数据库

维普期刊数据库评论

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维普期刊数据库

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50份口腔拭子常规细菌鉴定结果的报告

临床口腔医学杂志 1993年第2期9卷 91-92页

作者：郝世雄丁利北京口腔医院检验科 100050

正常人体口腔中存有大量多种类的细菌。口腔部位的正常菌群对保持宿主的正常健康和正常功能起一定的作用。但正常菌群中的某些细菌在宿主的一般抵抗力及局部免疫力低的情况下,也能引起疾病。为探讨口腔病患者口腔内菌群分布状况,我们对... 详细信息

正常人体口腔中存有大量多种类的细菌。口腔部位的正常菌群对保持宿主的正常健康和正常功能起一定的作用。但正常菌群中的某些细菌在宿主的一般抵抗力及局部免疫力低的情况下,也能引起疾病。为探讨口腔病患者口腔内菌群分布状况,我们对采自口腔病患者的50份口腔拭子进行了常规细菌学鉴定。现将结果作如下报告: 材料与方法 1.培养基来源:自制血平板、麦康凯平板、半固体、三糖铁、硝酸盐、尿素、枸椽酸盐等培养基,采用上海生研所产系列微量发酵管,包括鉴定细菌常用的21种生化反应,另采用开封市医学生物研究所产E—15—B快速生化鉴定系统。(肠杆菌科用)包括16种生化反应。

关键词：口腔细菌学口腔拭子

用口腔拭子和PCR验证新生鼠早期获得卡氏肺孢子虫感染

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国外医学（寄生虫病分册） 2003年第6期30卷 284-284页

作者：王振宇

纳米磁珠法与试剂盒法分析载脂蛋白E基因的多态性

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中国组织工程研究 2013年第38期17卷 6804-6810页

作者：吴婷易黎黄莹吴军北京大学深圳医院神经内科广东省深圳市518036

背景:相对于血液标本,口腔拭子标本更利于大规模载脂蛋白E基因多态性分析的研究,但目前对口腔拭子标本基因组DNA的提取尚无统一方法。目的:探索合适的口腔拭子标本基因组提取方法以分析载脂蛋白E基因的多态性。方法:收集50例散发性阿尔... 详细信息

背景:相对于血液标本,口腔拭子标本更利于大规模载脂蛋白E基因多态性分析的研究,但目前对口腔拭子标本基因组DNA的提取尚无统一方法。目的:探索合适的口腔拭子标本基因组提取方法以分析载脂蛋白E基因的多态性。方法:收集50例散发性阿尔茨海默病患者口腔拭子标本,每份标本分别应用纳米磁珠法与PicoDNA微量核酸提取试剂盒法提取基因组DNA,对比分析两种方法获得的基因组DNA纯度和浓度,后续进行PCR反应,应用DNA电泳确认有无成功扩增出目的条带,通过DNA测序方法分析载脂蛋白E基因的多态性。结果与结论:两种方法提取的基因组DNA纯度均较好,纳米磁珠法提取的基因组DNA浓度要高于PcioDNA微量核酸提取试剂盒法所得浓度(P口腔拭子标本基因组DNA更适合用于大样本载脂蛋白E基因多态性的研究。

关键词：生物材料纳米生物材料载脂蛋白E基因散发性阿尔茨海默病基因组DNA 纳米磁珠口腔拭子基因型 DNA测序