检索结果-南通市图书馆

红松和蒙古栎菌根系变形菌门细菌的群落多样性

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吉林农业大学学报 2023年

作者：刘进冀瑞卿李冠霖高婷婷司滟汲李彬琦吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心

外生菌根对森林生态系统的稳定起重要作用，在外生菌根系内除外生菌根真菌和植物根系外，还存在着各种各样的其他微生物，构成菌根微生态。变形菌门(Proteobacteria)是植物根系中最丰富细菌门之一，其下包含根瘤菌等大量的对植物生长有... 详细信息

外生菌根对森林生态系统的稳定起重要作用，在外生菌根系内除外生菌根真菌和植物根系外，还存在着各种各样的其他微生物，构成菌根微生态。变形菌门(Proteobacteria)是植物根系中最丰富细菌门之一，其下包含根瘤菌等大量的对植物生长有益的类群，目前对其在菌根系的群落结构及其对植物的功能了解甚微。本研究立足于东北地区主要树种红松与蒙古栎，对菌根系样品的细菌 16S rDNA进行了高通量测序并与根围土壤进行比较分析。结果显示：变形菌门细菌在菌根系中的相对丰度基本为最高，相对丰度介于30.35%-93.81%之间。尽管两树种土壤样品变形菌门细菌丰度差异较小，但在菌根系样品中差异却较大。为了解变形菌门细菌在菌根系的群落结构及其与栖息地的关系，将测序结果中的变形菌门细菌进行单独分析。在蒙古栎菌根系A、蒙古栎根围土壤A、蒙古栎菌根系B、蒙古栎根围土壤B、红松菌根系C、红松根围土壤C、红松菌根系D和红松根围土壤D样品得到变形菌门OTUs分别为550、656、554、622、493、710、527和737个。根围土壤的变形菌门的α多样性指数均显著高于菌根系（P变形菌门多样性差异较小（P>0.05）；红松菌根系的变形菌门的α多样性指数显著低于蒙古栎（P菌根系内有90%以上的变形菌门OTUs与根围土壤共有，其主要来源于根围土壤。基于Silva数据库，两树种根围土壤样品中Alpha变形菌纲相对丰度最高，其中，红游动菌属Rhodoplanes是相对丰度最高的优势属。红松菌根系样品表现为Gamma变形菌纲均最丰富，而蒙古栎菌根系Gamma变形菌纲和Alpha变形菌纲为优势纲；假单胞菌属Pseudomonas是两树种菌根系相对丰度最大的优势属，同时红松与蒙古栎菌根系存在特有优势属。菌根系内变形菌门物种的差异证明不同植物菌根招募的变形菌门群落不同，可能受根系分泌物等因素的影响。

关键词：菌根微生态变形菌门红松蒙古栎菌根系

变形菌门与哺乳动物结肠肠道菌群失调相关研究进展

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中国微生态学杂志 2022年第4期34卷 479-484页

作者：郭仕辉余永涛万佳宏毛彦妮张浩东张津慎田新岳赵清梅宁夏大学农学院宁夏银川750021 北方民族大学生物科学与工程学院国家民委发酵酿造工程生物技术重点实验室

随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道... 详细信息

随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道中一类适应性强、具有潜在致病性的常见菌,其丰度变化可直接对宿主健康产生影响。本文就哺乳动物结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度升高的微生物特征进行综述,旨在深入了解结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度变化的驱动因素,以期为哺乳动物肠道菌群失调相关疾病的诊治提供新思路。

关键词：变形菌门肠道菌群结肠上皮细胞肠道失调

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湿地变形菌门甲烷氧化菌群的缺氧能量代谢

土壤学报 2020年第4期57卷 1008-1016页

作者：汪欢郑越杨烨怡陈向南杨帆吴雪娥杨朝晖赵峰湖南大学环境科学与工程学院环境生物与控制教育部重点实验室长沙410082 中国科学院城市环境研究所中国科学院城市污染物转化重点实验室厦门361021 厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系厦门361021 中国科学院大学北京100049

甲烷氧化菌以甲烷作为碳源和能源,在全球甲烷平衡和温室效应控制中扮演着重要角色。甲烷生物氧化过程跨越不同氧化还原生态位,近年来的研究表明,在湿地缺氧生态位下变形菌门甲烷氧化菌具有代谢潜力,但其能量代谢机制尚不清楚。本研究基... 详细信息

甲烷氧化菌以甲烷作为碳源和能源,在全球甲烷平衡和温室效应控制中扮演着重要角色。甲烷生物氧化过程跨越不同氧化还原生态位,近年来的研究表明,在湿地缺氧生态位下变形菌门甲烷氧化菌具有代谢潜力,但其能量代谢机制尚不清楚。本研究基于生物电化学技术、矿物学实验及微生物组学方法,结果表明变形菌门甲烷氧化菌主导的菌群具有直接和间接胞外电子传递潜力;在氧气耗尽时,甲烷氧化菌群可利用水铁矿作为电子受体完成能量代谢过程,缺氧体系中γ-Proteobacteria纲的甲烷氧化菌和非甲烷氧化微生物共同驱动铁矿还原。本研究探讨了变形菌门甲烷氧化菌主导菌群的缺氧能量代谢过程,拓展了反硝化厌氧甲烷氧化菌及厌氧甲烷氧化古菌主导的缺氧甲烷氧化理论,为甲烷生物控制提供了理论支持。

关键词：甲烷氧化菌变形菌门胞外电子传递缺氧生态位微生物组学

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大气颗粒物暴露对肠道细菌丰度调节研究进展

环境与职业医学 2024年第4期41卷 451-456页

作者：王耀晗黄楠楠李彬陈汉清李晓波陈瑞首都医科大学公共卫生学院北京100069

大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者... 详细信息

大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者通过消化道直接进入人体。肠道菌群是定位于肠道上皮黏膜及肠腔的微生物群,数量庞大,功能丰富,其稳态对个体的肠道健康甚至是机体健康都起着重要的作用。肠道菌群可能介导环境因素诱导的健康效应,因此现有越来越多的研究关注大气颗粒物对肠道菌群的影响。因此,本综述检索并整理了多种大气颗粒物暴露对肠道菌群稳态的影响,以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门及疣微菌门这五大菌门为主,讨论了它们的主要功能及大气颗粒物对其稳态和丰度的影响。

关键词：颗粒物肠道菌群厚壁菌门拟杆菌门变形菌门放线菌门疣微菌门

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杭州市西湖景区春季空气细菌多样性特征

生态学报 2019年第8期39卷 2946-2953页

作者：楼秀芹郭卫俊姚文冲方治国杭州市疾病预防控制中心微生物检验科杭州310021 浙江工商大学环境科学与工程学院杭州310018

选取了杭州市西湖景区4个典型样点,利用高通量测序方法研究了其空气细菌多样性特征。结果表明,在细菌门水平上,各样点优势细菌为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),... 详细信息

选取了杭州市西湖景区4个典型样点,利用高通量测序方法研究了其空气细菌多样性特征。结果表明,在细菌门水平上,各样点优势细菌为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其总相对含量在断桥残雪(MSBB)、柳浪闻莺(OSW)、宝石流霞(PSHFRC)和三潭印月(TPMM)分别为88.31%、86.03%、85.06%和89.28%,且不同样点优势菌群存在一定的差异,OSW和TPMM厚壁菌门分别占9.65%和11.6%,拟杆菌门分别占6.86%和5.55%,MSBB和PSHFRC拟杆菌门分别占7.31%和7.86%,厚壁菌门分别占7.09%和5.32%。在细菌属水平上,各样点优势菌属及含量差异显著,MSBB、TPMM、OSW和PSHFRC相对含量最高的菌属分别为马赛菌属(Massilia)、两面神菌属(Janibacter)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和甲基杆菌属(Methylobacterium),分别占6.22%、6.45%、6.05%和11.5%,各样点相对含量高于2%的细菌属有鞘氨醇单胞菌属、甲基杆菌属、薄层菌属(Hymenobacter)和异常球菌属(Deinococcus),这些菌属是西湖景区各样点共有的优势菌群;通过空气细菌OTU及多样性分析可知,MSBB空气细菌丰富度较高,均匀度较低,而PSHFRC丰富度较低,均匀度较高。杭州西湖景区不同样点空气细菌群落特征差异显著,且其丰富度和均匀度明显不同。

关键词：生物气溶胶西湖景区变形菌门细菌丰富度多样性指数

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黄海北部不同站位海洋细菌群落分布特征

微生物学报 2009年第3期49卷 343-350页

作者：白洁李海艳赵阳国中国海洋大学环境科学与工程学院青岛266100

【目的】为揭示北黄海不同海域中真细菌群落分布的差异,【方法】采用16SrRNA基因文库和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,对远海和近海两个站位的沉积物和水体中细菌群落特征进行了解析和评价。【结果】文库分析揭示海水及沉积物中微生物种... 详细信息

【目的】为揭示北黄海不同海域中真细菌群落分布的差异,【方法】采用16SrRNA基因文库和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,对远海和近海两个站位的沉积物和水体中细菌群落特征进行了解析和评价。【结果】文库分析揭示海水及沉积物中微生物种类丰富,存在大量未被认知的类群。各站位中主要为变形菌门(Proteobacteria),沉积物中γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria亚门占优势,水中则以α-Proteobacteria亚门占优势,但各亚门微生物在两个站位中存在明显系统发育学分歧。DGGE图谱聚类分析显示,近海沉积物和海水中细菌群落优势类群相似性很高,而远海沉积物和海水中则相似性很低。【结论】研究结果表明,微生物种类在不同地理位置和生存介质中存在明显差异,环境因素对微生物的分布起主导作用。

关键词：北黄海 16S rRNA 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 变形菌门

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岩画和壁画类文物微生物病害研究进展

生态学报 2014年第6期34卷 1371-1378页

作者：李强葛琴雅潘晓轩王宇朱旭东郭宏潘皎南开大学生命科学学院微生物系分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071 中国文化遗产研究院北京100029

古代岩画和壁画是人类文明发展历史进程的重要记录,具有极高的历史价值、艺术价值及科学价值,但他们无时无刻不受到环境因素引起的物理、化学及生物的劣化作用。近年,有关微生物对古代岩/壁画的危害逐渐受到关注。阐述了世界一些著名的... 详细信息

古代岩画和壁画是人类文明发展历史进程的重要记录,具有极高的历史价值、艺术价值及科学价值,但他们无时无刻不受到环境因素引起的物理、化学及生物的劣化作用。近年,有关微生物对古代岩/壁画的危害逐渐受到关注。阐述了世界一些著名的岩/壁画文物的微生物的研究进展,如法国拉斯科洞穴岩画(Lascaux Cave)、西班牙阿尔塔米拉洞穴岩画(Altamira Cave)、敦煌石窟壁画、嘉峪关魏晋墓壁画以及我国东北地区公元5世纪的墓葬壁画等。通过对以上所述岩画和壁画微生物群落的分析比较,发现主要的细菌群落是变形菌门和放线菌门,放线菌门以假诺卡氏菌为主。真菌群落主要以虫生真菌为主。进一步分析了岩画和壁画微生物病害的共性和区别,揭示了洞穴、墓室等特殊环境下的微生物群落特点,为防治古代岩/壁画微生物病害提供了以下借鉴。

关键词：岩画和壁画群落分析变形菌门假诺卡氏菌虫生真菌藻类

基于MiSeq测序技术分析红鳍东方鲀养殖环境菌群多样性

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生态学杂志 2015年第10期34卷 2965-2970页

作者：赵晓伟丁君窦妍王梦鸽常亚青大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁大连116023

养殖环境中的微生物在物质循环及能量流动中发挥着重要的作用。对养殖环境中微生物多样性研究，不仅可以为养殖过程中病害防治提供基础，还可以发现新的微生物资源。本文利用MiSeq测序技术分析了大连某养殖公司红鳍东方鲍养殖环境中室... 详细信息

养殖环境中的微生物在物质循环及能量流动中发挥着重要的作用。对养殖环境中微生物多样性研究，不仅可以为养殖过程中病害防治提供基础，还可以发现新的微生物资源。本文利用MiSeq测序技术分析了大连某养殖公司红鳍东方鲍养殖环境中室内养殖环境水、室外入水口水和底泥中菌群结构特征，从室内养殖环境水、室外入水口水和室外入水口底泥样品中分别获得27164、41146和30474条有效序列。结果表明：红鳍东方鲍养殖环境中具有较高的菌群多样性，其中室外入水口底泥中菌群多样性较其相应养殖水环境中菌群多样性高；3个样品中的细菌可归为33个门类，除常见报道的绿弯菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、蓝藻门、酸杆菌门、变形菌门、梭杆菌门、疣微菌门、厚壁菌门和放线菌门外，还有23个鲜见报道的门类的菌群被检测到；各样品中菌群组成虽有差异，但变形菌门和拟杆菌门为优势菌，约占68．33％～93．37％。本文揭示了大连某养殖公司红鳍东方鲍池塘养殖环境中的菌群多样性和丰度，比较了其菌群结构及差异，为红鳍东方鲍健康养殖提供参考。

关键词：优势类群变形菌门拟杆菌门

城市富营养化湖泊沉积物微生物多样性季节变化

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应用与环境生物学报 2015年第6期21卷 1012-1018页

作者：彭磊赵建伟张钰华玉妹朱端卫刘广龙农业部长江中下游耕地保育重点实验室武汉430070 华中农业大学生态与环境工程研究室武汉430070

分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研究沉积物中微生物多样性及其季节变化.结果显示,城市湖泊沉积... 详细信息

分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研究沉积物中微生物多样性及其季节变化.结果显示,城市湖泊沉积物中微生物多样性十分丰富,冬季两个湖泊沉积物的DGGE条带总数为287条,夏季为317条.冬季和夏季,东湖的平均丰度分别为27.4和31.0,Shannon-Wiener指数分别为2.32和2.78;南湖的平均丰度分别为30.0和32.2,Shannon-Winner指数分别为2.83和2.86.两个湖泊的夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季;同一湖泊各样点之间的相似性更强,说明湖泊内部形成了自身特有的微生物群落结构.克隆测序的结果表明东湖、南湖微生物主要归属于3个细菌类群,其中,变形菌门占有优势地位,其次为拟杆菌门和厚壁菌门,分别占序列总数的77%、17%和6%.变形菌门中,β-变形菌纲和γ-变形菌纲为优势菌种,占序列总数的35%和31%.综上,东湖和南湖沉积物夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季,季节性变化影响了沉积物微生物群落的丰度和结构;本研究结果丰富了对城市富营养化湖泊沉积物微生物多样性的认识.

关键词：湖泊沉积物季节性变化微生物多样性 PCR-DGGE 变形菌门