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变形菌门与哺乳动物结肠肠道菌群失调相关研究进展

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中国微生态学杂志 2022年第4期34卷 479-484页

作者：郭仕辉余永涛万佳宏毛彦妮张浩东张津慎田新岳赵清梅宁夏大学农学院宁夏银川750021 北方民族大学生物科学与工程学院国家民委发酵酿造工程生物技术重点实验室

随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道... 详细信息

随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道中一类适应性强、具有潜在致病性的常见菌,其丰度变化可直接对宿主健康产生影响。本文就哺乳动物结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度升高的微生物特征进行综述,旨在深入了解结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度变化的驱动因素,以期为哺乳动物肠道菌群失调相关疾病的诊治提供新思路。

关键词：变形菌门肠道菌群结肠上皮细胞肠道失调

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云南4处酸性热泉中的变形菌门细菌多样性

河南农业大学学报 2016年第3期50卷 376-382页

作者：宋兆齐王莉刘秀花梁峰商丘师范学院生命科学学院河南省高校生物质降解与气化工程技术研究中心河南商丘476000

选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉（pH：2．3—6．0，温度：47～96℃），通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析，详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列，可划分为... 详细信息

选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉（pH：2．3—6．0，温度：47～96℃），通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析，详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列，可划分为234个可操作分类单元（OTUs）。分类结果显示，热泉内涵盖了大量已知的目、科和属。而41％的OTUs可能代表了变形菌门的未知物种。系统发育分析显示，样点中存在着若干全新遗传类群，这些样点和美国黄石地区的热泉各自呈现不同的变形菌门遗传多样性。此外，本次调查的热泉彼此间存在着变形菌门群落结构的显著差异。

关键词：变形菌门多样性系统发育分析酸性热泉云南

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大气颗粒物暴露对肠道细菌丰度调节研究进展

环境与职业医学 2024年第4期41卷 451-456页

作者：王耀晗黄楠楠李彬陈汉清李晓波陈瑞首都医科大学公共卫生学院北京100069

大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者... 详细信息

大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者通过消化道直接进入人体。肠道菌群是定位于肠道上皮黏膜及肠腔的微生物群,数量庞大,功能丰富,其稳态对个体的肠道健康甚至是机体健康都起着重要的作用。肠道菌群可能介导环境因素诱导的健康效应,因此现有越来越多的研究关注大气颗粒物对肠道菌群的影响。因此,本综述检索并整理了多种大气颗粒物暴露对肠道菌群稳态的影响,以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门及疣微菌门这五大菌门为主,讨论了它们的主要功能及大气颗粒物对其稳态和丰度的影响。

关键词：颗粒物肠道菌群厚壁菌门拟杆菌门变形菌门放线菌门疣微菌门

城镇污水厂尾水排放对嘉陵江流域微生物群落的潜在影响

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西华师范大学学报（自然科学版） 2024年第1期45卷 1-8页

作者：李润秦明森李蕾王瑶唐贇西华师范大学生命科学学院四川南充637009 西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川南充637009

为了探究城镇污水排放对嘉陵江流域水体中微生物群落的潜在影响,于2021年12月下旬,采集嘉陵江(南充段)流域8个污水处理厂的进水、尾水以及附近水样品,测定了常规水质指标,并利用Illumina NovaSeq 6000平台对水体微生物群落进行测序分析... 详细信息

为了探究城镇污水排放对嘉陵江流域水体中微生物群落的潜在影响,于2021年12月下旬,采集嘉陵江(南充段)流域8个污水处理厂的进水、尾水以及附近水样品,测定了常规水质指标,并利用Illumina NovaSeq 6000平台对水体微生物群落进行测序分析。结果显示:pH为附近水>进水>尾水,TN、NH_(4)^(+)-N、TP为进水>尾水>附近水。尾水中的微生物多样性高于进水和附近水;所有水体中,微生物均以变形菌门(Proteobacteria)为主,但不同来源水体群落组成显著不同;相较于附近水,尾水中微生物具有更多的特有种。此外,相关性分析结果表明,附近水的微生物群落与水体理化因子相关性最大,且仅附近水的微生物多样性指数与理化因子相关。综合来看,嘉陵江南充段城镇污水厂尾水的微生物可作为生物源影响江水微生物,且尾水亦能通过提升水体营养间接影响江水微生物群落组成。城镇污水厂应该进一步改进净水工艺,降低尾水水体营养,同时提升杀菌强度,从两方面来避免沿岸城镇污水处理厂尾水对嘉陵江微生物群落的潜在影响。

关键词：污水处理厂嘉陵江水体营养微生物群落变形菌门南充市

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湿地变形菌门甲烷氧化菌群的缺氧能量代谢

土壤学报 2020年第4期57卷 1008-1016页

作者：汪欢郑越杨烨怡陈向南杨帆吴雪娥杨朝晖赵峰湖南大学环境科学与工程学院环境生物与控制教育部重点实验室长沙410082 中国科学院城市环境研究所中国科学院城市污染物转化重点实验室厦门361021 厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系厦门361021 中国科学院大学北京100049

甲烷氧化菌以甲烷作为碳源和能源,在全球甲烷平衡和温室效应控制中扮演着重要角色。甲烷生物氧化过程跨越不同氧化还原生态位,近年来的研究表明,在湿地缺氧生态位下变形菌门甲烷氧化菌具有代谢潜力,但其能量代谢机制尚不清楚。本研究基... 详细信息

甲烷氧化菌以甲烷作为碳源和能源,在全球甲烷平衡和温室效应控制中扮演着重要角色。甲烷生物氧化过程跨越不同氧化还原生态位,近年来的研究表明,在湿地缺氧生态位下变形菌门甲烷氧化菌具有代谢潜力,但其能量代谢机制尚不清楚。本研究基于生物电化学技术、矿物学实验及微生物组学方法,结果表明变形菌门甲烷氧化菌主导的菌群具有直接和间接胞外电子传递潜力;在氧气耗尽时,甲烷氧化菌群可利用水铁矿作为电子受体完成能量代谢过程,缺氧体系中γ-Proteobacteria纲的甲烷氧化菌和非甲烷氧化微生物共同驱动铁矿还原。本研究探讨了变形菌门甲烷氧化菌主导菌群的缺氧能量代谢过程,拓展了反硝化厌氧甲烷氧化菌及厌氧甲烷氧化古菌主导的缺氧甲烷氧化理论,为甲烷生物控制提供了理论支持。

关键词：甲烷氧化菌变形菌门胞外电子传递缺氧生态位微生物组学

基于16S rRNA基因分析异育银鲫肠道微生物多样性

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水产科学 2022年第2期41卷 266-272页

作者：陈鹏孙启睿张宏华王帅王嘉伟徐阳张明明乔帼李强大连海洋大学水产与生命学院辽宁大连116023 盐城工学院海洋与生物工程学院江苏盐城224051 建湖县上冈镇农业中心江苏盐城224731

异育银鲫是我国主要淡水养殖鱼类之一。结合Illumina高通量测序技术和传统分离培养技术探究异育银鲫肠道菌群组成特点,以期为异育银鲫人工养殖环境的微生态调控技术开发提供指导。高通量测序分析结果表明,不投喂任何饵料的野生组和投喂... 详细信息

异育银鲫是我国主要淡水养殖鱼类之一。结合Illumina高通量测序技术和传统分离培养技术探究异育银鲫肠道菌群组成特点,以期为异育银鲫人工养殖环境的微生态调控技术开发提供指导。高通量测序分析结果表明,不投喂任何饵料的野生组和投喂商品化饲料的养殖组异育银鲫肠道微生物丰度及多样性水平差异不显著,但两组肠道菌群结构差异显著。在门水平上,养殖组厚壁菌门的相对丰度显著高于野生组,而变形菌门显著低于野生组(P菌属、假单胞菌属和消化链球菌属的相对丰度均显著高于野生组(P菌属的相对丰度显著低于野生组(P菌分离鉴定结果表明,两组异育银鲫肠道中可分离培养细菌均以葡萄球菌属为主,其次为微球菌属;同时,从两组中均分离到芽孢杆菌属;野生组异育银鲫肠道经分离培养所得细菌种类多于养殖组。本试验结果将为异育银鲫健康养殖业的发展提供理论基础。

关键词：异育银鲫肠道菌群厚壁菌门变形菌门气单胞菌属

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贵州省部分地区蜱及其携带细菌调查

中国媒介生物学及控制杂志 2022年第1期33卷 148-152页

作者：向昱龙周敬祝刘英刘平涛胡勇梁文琴贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州省疾病预防控制中心实验中心贵州贵阳550004 修文县疾病预防控制中心贵州贵阳550299

目的对贵州省部分地区开展蜱及其携带细菌调查,为深入了解贵州省蜱及蜱传病原体情况和蜱传疾病的防控提供科学依据。方法2017年4月和2019年4月在贵州省修文县、晴隆县、兴义市、兴仁市、望谟县、江口县的牛、羊、鼠体表捕捉寄生蜱,进行... 详细信息

目的对贵州省部分地区开展蜱及其携带细菌调查,为深入了解贵州省蜱及蜱传病原体情况和蜱传疾病的防控提供科学依据。方法2017年4月和2019年4月在贵州省修文县、晴隆县、兴义市、兴仁市、望谟县、江口县的牛、羊、鼠体表捕捉寄生蜱,进行形态学鉴定;选取部分蜱,采用血平板和脑心浸液培养基(BHI)平板进行细菌培养,挑选不同菌落形态的细菌进行传代纯化,经PCR扩增16S rDNA全长序列,测序鉴定菌种。结果共采集动物体表蜱3属6种742只,其中长角血蜱为优势蜱种,占捕获总数的69.81%;其次是微小扇头蜱,占比为23.05%;其余蜱种较少,占7.14%。共培养出细菌188株,隶属3门28属,其中变形菌门为优势菌门,其次是厚壁菌门和放线菌门。结论贵州省调查地区蜱种丰富,蜱体内携带细菌种类繁多,含多种人兽共患病菌。为防止蜱侵害人及家畜,应加强蜱及蜱传病原体的调查、监测与防控。

关键词：蜱细菌培养化脓性感染长角血蜱变形菌门

肠道菌群高通量测序在新生儿坏死性小肠结肠炎诊疗中的价值

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肠道菌群高通量测序在新生儿坏死性小肠结肠炎诊疗中的价值

作者：王英豪安徽医科大学

学位级别：硕士

目的:坏死性小肠结肠炎（necrotizing enterocolitis,NEC）是影响早产儿肠道的最常见疾病,常见于早产儿,病死率高,约20-30%。存活NEC患儿也会有诸多并发症如短肠综合征,肠外营养相关的胆汁淤积和肝功能障碍、营养不良、代谢性骨病等。... 详细信息

目的:坏死性小肠结肠炎（necrotizing enterocolitis,NEC）是影响早产儿肠道的最常见疾病,常见于早产儿,病死率高,约20-30%。存活NEC患儿也会有诸多并发症如短肠综合征,肠外营养相关的胆汁淤积和肝功能障碍、营养不良、代谢性骨病等。目前关于NEC发病机制仍未完全了解。本研究旨在通过对新生儿坏死性小肠结肠炎患儿肠道菌群进行高通量测序,了解其变化特点为NEC诊疗提供理论依据。方法:以2020.年1月到2021年7月在安徽医科大学附属省儿童医院住院的早产儿（胎龄＜37周）为研究对象,分为非NEC组（对照组）和NEC组（实验组）,后者根据治疗前后分为两个亚组:NEC组（治疗前）和NEC组（治疗后）。实验组（治疗前）在诊断NEC后24小时内采集粪便标本,同时采集对照组粪便标本,实验组（治疗后）在临床症状明显好转,达全量喂养时采集粪便标本。通过高通量测序技术对患儿粪便进行基因测序,分析粪便标本的菌群多样性以及明确细菌种类。结果:实验组患儿治疗前后及对照组各收集1份粪便样本,最终共收集66份粪便样本,其中实验组44份,对照组22份。实验组患儿平均出生胎龄（35±2）w,剖宫产率41%（9/22）,母乳喂养率36%（8/22）,男婴45%（10/22）,女婴56%（12/22）,出生体重（2274±236）g;对照组患儿平均出生胎龄（35±3）w,剖宫产率41%（9/22）,母乳喂养率36%（8/22）,男婴45%（10/22）,女婴56%（12/22）,出生体重（2358±227）g。实验组（治疗前）和对照组肠道菌群多样性指数:Shannon指数分别为0.93±0.50及1.10±0.34;Sobs指数分别为19.36±7.08及21.96±4.76;Simpson指数分别为0.51±0.26及0.46±0.16;Chao值分别为22.16±7.62及25.44±6.97;提示实验组（治疗前）和对照组肠道菌群丰富度及均匀度无统计学差异（p＞0.05）。实验组治疗前后肠道菌群多样性指数:Shannon指数分别为0.93±0.50及0.91±0.51;Sobs指数分别为19.36±7.08及21.23±6.43;Simpson指数分别为0.51±0.26及0.58±0.25;Chao值分别为22.16±7.62及24.25±7.10;提示实验组治疗前后肠道菌群丰富度及均匀度无统计学差异（p＞0.05）。实验组（治疗前）和对照组肠道菌群种类构成方面具有明显差异:实验组以肠球菌（占40%）,厚壁菌门（占21%）,变形菌门（占23%）,双歧杆菌（占10%）为主;对照组以大肠杆菌（占42%）,肠球菌（占25%）,双歧杆菌（30%）,厚壁菌门（占2%）为主。实验组治疗前后肠道菌群种类构成方面具有明显差异:实验组（治疗前）以肠球菌（占40%）,厚壁菌门（占21%）,变形杆门（占23%）,双歧杆菌（占10%）为主;实验组（治疗后）以大肠杆菌（占28%）,肠球菌（占21%）,双歧杆菌（占28%）,厚壁菌门（占8%）为主,变形菌门（约占5%）,两组之间克雷伯杆菌所占比例无明显差异。结论:本研究结果表明实验组（治疗前）和对照组、实验组治疗前后肠道菌群种类有显著差异,表明NEC患儿发病时肠道菌群中厚壁菌门及变形菌门丰度增加,且双歧杆菌丰度降低。

关键词：坏死性小肠结肠炎高通量测序厚壁菌门变形菌门双歧杆菌

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多囊卵巢综合征大鼠肠道菌群多样性研究

中国医学前沿杂志（电子版） 2022年第11期14卷 34-42页

作者：颜芳刘艳霞张偲范琼尹苏泽琦王停北京中医药大学北京100029 北京中医药大学东方医院妇科北京100078 北京中医药大学北京中医药研究院北京100029

目的采用16S rRNA测序技术对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)大鼠及正常大鼠肠道菌群进行检测,比较正常及PCOS大鼠的肠道菌群多样性。方法选取无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级雌性SD大鼠12只,对照组和模型... 详细信息

目的采用16S rRNA测序技术对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)大鼠及正常大鼠肠道菌群进行检测,比较正常及PCOS大鼠的肠道菌群多样性。方法选取无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级雌性SD大鼠12只,对照组和模型组各6只;对照组给予大鼠维持饲料,模型组给予高脂饲料联合来曲唑灌胃;观察大鼠阴道涂片及卵巢组织学变化。采用16S rRNA高通量基因测序技术检测两组大鼠肠道菌群多样性。结果与对照组相比,模型组在多个水平上表现出有益菌丰度减少,有害菌丰度增加。LEfSe分析发现,Negativicutes菌纲下的多个水平菌群在对照组富集;变形杆菌门下的多个水平菌群在模型组富集。结论与正常大鼠相比,高脂饲料联合来曲唑构建的PCOS大鼠肠道菌群失调,主要表现为有益菌群丰度减少,有害菌群丰度增加。并且Negativicutes菌多个水平菌群在对照组富集;变形杆菌门多个水平在模型组富集。

关键词：多囊卵巢综合征肠道菌群 16S rRNA 拟杆菌门厚壁杆菌门变形菌门