检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

贵州省浮萍形态学鉴定与遗传多样性分析

水生生物学报 2022年第7期46卷 974-982页

作者：冯丹谭艾娟吕世明郑萌盟杨贵利贵州大学生命科学学院山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心贵阳550025 贵州大学动物科学学院贵阳550025 中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室贵阳550025

为调查贵州省浮萍种间亲缘关系及变异情况,研究在贵州省辖9个地级行政区的多处水环境中共采集到41份浮萍种质,通过形态鉴定这些种质中33个属于绿萍属(Lemna),6个属于紫萍属(Spirodela),2个属于斑萍属/兰氏萍属(Landoltia)。利用叶绿体at... 详细信息

为调查贵州省浮萍种间亲缘关系及变异情况,研究在贵州省辖9个地级行政区的多处水环境中共采集到41份浮萍种质,通过形态鉴定这些种质中33个属于绿萍属(Lemna),6个属于紫萍属(Spirodela),2个属于斑萍属/兰氏萍属(Landoltia)。利用叶绿体atpF-atpH间隔序列和rpS16内含子序列进行分子生物学分析和鉴定,41份浮萍种质聚类到Lemna aequinoctialis、Lemna minor、Spirodela polyrhiza和Landoltia punctata 4个种。atpF-atpH间隔序列和rpS16内含子序列的单倍型多样性分别为0.98700和0.64700,群体突变率分别为0.15380和0.14334,平均每kb核苷酸差异数为47.20000和61.72200,核苷酸多态性分别为0.08725和0.09158。研究讨论了中国亚热带温润季风地区浮萍的遗传多样性,为浮萍亲缘关系分析提供了依据,也为亚热带湿润季风气候地区植物的种属鉴定及资源化利用奠定了基础。

关键词：形态学鉴定分子生物学鉴定遗传多样性发育树浮萍

基于SLAF-seq技术的石斛兰SNP标记开发及亲缘关系分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物技术通报 2023年第6期39卷 141-148页

作者：崔学强黄昌艳邓杰玲李先民李秀玲张自斌广西壮族自治区农业科学院花卉研究所南宁530007

利用SNP标记技术对收集的石斛兰种质资源进行亲缘关系分析,为新品种选育亲本选择提供理论依据。以60份石斛兰种质资源为对象,用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对种质进行SNP标记开发及亲缘关系分析。通过对各样品的测序数据进行... 详细信息

利用SNP标记技术对收集的石斛兰种质资源进行亲缘关系分析,为新品种选育亲本选择提供理论依据。以60份石斛兰种质资源为对象,用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对种质进行SNP标记开发及亲缘关系分析。通过对各样品的测序数据进行统计,共获得157.34 Mb Clean Reads数据,各样本Reads数据在576 195-5 359 710之间。样本平均测序质量值Q30为93.85%,平均GC含量为40.16%。通过测序数据分析,共获得1 337 217个SLAF标签,标签的平均测序深度为9.63×,其中具多态性的SLAF标签有1 049 638个。共开发得到11 248 186个群体SNP标记,每个样品的SNP标记数目介于694 015-6 367 379之间,SNP标记完整度为2.71%-24.89%,杂合率为1.13%-5.74%。对群体SNP过滤,共获得31 499个高度一致性的有效SNP标记。利用筛选获得的SNP标记构建系统发育树,60份石斛兰种质资源被分为3个亚群,这3个亚群分别包含材料为Q1:3份,Q2:21份,Q3:36份。种质聚类结果与形态学分类结果基本一致。利用SLAF-seq技术能高效、精确地开发出适用于石斛兰种质遗传分析的SNP标记,开发的SNP标记可为石斛兰育种、遗传图谱构建、品种鉴定以及农艺性状的关联分析等研究提供分子基础。

关键词：石斛兰 SLAF-seq SLAF标签 SNP标记群体结构发育树亲缘关系遗传分析

0℃冷藏下三文鱼片菌相变化规律及特定腐败菌的分离鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

现代食品科技 2015年第4期31卷 36-41页

作者：李婷婷丁婷邹朝阳周凯仪淑敏励建荣大连民族学院生命科学学院辽宁大连116600 西南大学食品科学学院重庆400715 渤海大学食品科学研究院辽宁省食品安全重点实验室辽宁锦州121013

以冰鲜的三文鱼片为研究对象,利用形态学观察和16S r DNA序列分析法探究其在0℃冷藏过程中腐败菌的变化规律,并结合VITEK2微生物自动鉴定系统对其特定腐败菌进行分离和鉴定。结果表明:0℃冷藏三文鱼片在贮藏初期(第0 d)的腐败菌主要为... 详细信息

以冰鲜的三文鱼片为研究对象,利用形态学观察和16S r DNA序列分析法探究其在0℃冷藏过程中腐败菌的变化规律,并结合VITEK2微生物自动鉴定系统对其特定腐败菌进行分离和鉴定。结果表明:0℃冷藏三文鱼片在贮藏初期(第0 d)的腐败菌主要为葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、片球菌属(Pediococcus sp.)、微球菌属(Micrococcus sp.)、气单胞菌属(Aeromonas sp.)、肉食杆菌属(Carnobacterium sp.)及部分鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas sp.)。随贮藏时间的延长,腐败菌菌相逐渐单一,葡萄球菌属、片球菌属、微球菌属呈明显的下降趋势;气单胞菌属及鞘氨醇单胞菌属完全消失;肉食杆菌属变化较小,而假单胞菌属呈上升趋势且到贮存后期数量占绝对优势。腐败菌的PCR产物经测序后通过NCBI数据库比对,并经MEGA5.05软件构建系统发育树分析及微生物自动鉴定仪共同鉴定,确定荧光假单胞菌(Ps.Fluorescens)为冷藏三文鱼片的优势腐败菌。

关键词：三文鱼片腐败菌 16S rDNA 发育树荧光假单胞菌

鱿鱼丝加工中真菌菌相变化规律及优势真菌的分离鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

现代食品科技 2016年第5期32卷 98-103,111页

作者：黄鹏晓吴祖芳沈飚翁佩芳刘茜宁波大学海洋学院应用海洋生物技术教育部重点实验室浙江宁波315211

为减少鱿鱼丝加工过程中真菌污染,提高鱿鱼丝产品的质量,将传统的微生物鉴定技术与5.8S r DNA-ITS序列分析法相结合,并通过系统发育树分析,探索鱿鱼丝加工过程中真菌菌相变化规律及优势菌株。结果表明,在鱿鱼丝加工过程中,不同阶段样品... 详细信息

为减少鱿鱼丝加工过程中真菌污染,提高鱿鱼丝产品的质量,将传统的微生物鉴定技术与5.8S r DNA-ITS序列分析法相结合,并通过系统发育树分析,探索鱿鱼丝加工过程中真菌菌相变化规律及优势菌株。结果表明,在鱿鱼丝加工过程中,不同阶段样品中真菌数量差异显著(p<0.05),在加工终点(即烘干包装后)时真菌数量高达2.61 log cfu/g,其中调味和烘干包装阶段是真菌污染的主要环节。加工终点的鱿鱼丝中分离出6种酵母菌和4种霉菌,经测序并通过National Center for Biotechnology Information(NCBI)数据库比对,确定它们分别属于假丝酵母属(Candida sp.)、隐球酵母属(Cryptococcus sp.)、座囊菌属(Dothideomycetes sp.)、胶红酵母属(Rhodotorula sp.)、丝孢酵母属(Trichosporon sp.)、茎点霉属(Phoma sp.)、青霉属(Penicillium sp.)、曲霉属(Aspergillus sp.)、枝孢霉属(Cladosporium sp.)。其中,青霉菌(M-03)和假丝酵母菌(Y-04)为鱿鱼丝加工过程中的优势菌,在加工终点时的数量分别为1.85 log cfu/g和2.15 log cfu/g。

关键词：鱿鱼丝真菌发育树 5.8S rDNA-ITS 聚合酶链式反应(PCR)

冷海水保藏下鲐鱼(Pneumatophorus japonicus)菌相变化规律及优势腐败菌的分离鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

现代食品科技 2016年第4期32卷 81-86页

作者：郑振霄周聃冯俊丽金仁耀戴志远浙江工商大学海洋食品研究院浙江杭州310012 浙江省水产品加工联合重点实验室浙江杭州310012

以冷海水保鲜的鲐鱼为研究对象,通过选择性培养基和16S r DNA序列分析法探究其在冷海水保鲜过程中的菌相变化,确定了鲐鱼在冷海水保鲜条件下的优势腐败菌,并通过MEGA5.2软件构建了贮藏末期代表菌株的系统发育树。结果表明:冷海水保鲜鲐... 详细信息

以冷海水保鲜的鲐鱼为研究对象,通过选择性培养基和16S r DNA序列分析法探究其在冷海水保鲜过程中的菌相变化,确定了鲐鱼在冷海水保鲜条件下的优势腐败菌,并通过MEGA5.2软件构建了贮藏末期代表菌株的系统发育树。结果表明:冷海水保鲜鲐鱼样品在贮藏初期(第0 d)的微生物比较复杂,优势种群是假单胞菌属(Pseudomonas sp.)和嗜冷菌属(Psychrobacter sp.),还有少量的类芽孢杆菌属(Paenibacillus sp.)、希瓦氏菌属(Shewanella sp.)、蜡状芽孢杆菌(Bacillus anthracis)、枯草芽孢杆菌属(Brevibacterium sp.);随着贮藏时间的延长,鲐鱼样品中的菌相逐渐变的单一,假单胞菌属迅速下降,希瓦氏菌属迅速增加;贮藏末期希瓦氏菌属和肠杆菌属(Enterobacter sp.)的比例迅速增加,其中希瓦氏菌属呈上升趋势且到贮藏后期数量占绝对优势,被确定为鲐鱼冷海水保鲜条件下的优势腐败菌。

关键词：鲐鱼 16S rDNA 腐败菌发育树

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

猪塞内卡病毒全基因组分析及系统进化树构建

现代畜牧兽医 2021年第10期 5-10页

作者：崔慧绮赵司淼冉旭华闻晓波海南大学动物科技学院海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室海南海口570228

研究对目前发现的典型A型塞内卡病毒(SVA)毒株进行遗传进化分析,旨在了解该病毒的进化路线,为相关疫苗开发和疾病防控提供参考。研究从NCBI网站中选取220株SVA全基因组序列作为分析对象,使用RDP5软件剔除重组病毒,利用MEGA7和MrBayes软... 详细信息

研究对目前发现的典型A型塞内卡病毒(SVA)毒株进行遗传进化分析,旨在了解该病毒的进化路线,为相关疫苗开发和疾病防控提供参考。研究从NCBI网站中选取220株SVA全基因组序列作为分析对象,使用RDP5软件剔除重组病毒,利用MEGA7和MrBayes软件将符合要求的184条全基因组序列构建进化树。结果显示,SVA遗传进化历程以时间跨度分为3个进化支。随着时间推移,每个进化分支中的毒株数量逐渐增加,流行扩大化。研究表明,SVA的进化树体现了地域上的屏障,每个国家的SVA分离株大多聚类在一起;该病毒由美国始发,向加拿大、巴西、哥伦比亚、中国、泰国等地扩散,并有向其他国家流行的趋势。

关键词：塞内卡病毒全基因组遗传进化分析发育树

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

盐度对细菌菌株降解苯酚的影响

环境科学与技术 2010年第11期33卷 33-38页

作者：温洪宇杨柳韩宝平平文娟陈艳红马小琛中国矿业大学环境与测绘学院江苏徐州221008 徐州师范大学生命科学学院江苏徐州221116

从处理苯酚废水活性污泥中筛选分离到四株苯酚降解优势细菌菌株JHCFS1,JHCFS2,JHCFS3与JHCFS4,通过四株细菌在不同盐度条件下的苯酚降解率表明,随着盐浓度的逐渐升高,抑制作用逐渐增大,当NaCl,KCl浓度为4%时,四株细菌降解苯酚均受到显... 详细信息

从处理苯酚废水活性污泥中筛选分离到四株苯酚降解优势细菌菌株JHCFS1,JHCFS2,JHCFS3与JHCFS4,通过四株细菌在不同盐度条件下的苯酚降解率表明,随着盐浓度的逐渐升高,抑制作用逐渐增大,当NaCl,KCl浓度为4%时,四株细菌降解苯酚均受到显著抑制。苯酚浓度为1000mg/L,NaCl浓度为3%时,JHCFS2的降解率最高为83%,JHCFS4的降解率最低为47.20%;KCl浓度为3%时,JHCFS2的降解率最高为99%,JHCFS4的降解率最低为48%,表明四株菌在盐浓度(NaCl,KCl)低于3%的条件下可正常降解苯酚。通过对四株菌的16S rRNA基因克隆与序列分析,在NCBI进行BLAST获得同源性序列,利用Clustalx1.8软件和MEGA4.0软件进行同源性比较和系统发育学分析,结合生理生化特性将菌株JHCFS1,JHCFS2,JHCFS3与JHCFS4(GenBank收录号:FJ455076,FJ455077,FJ458437与FJ458438)分别归为Bacillus simplex,Bacillus cereus,Bacillus pumilus与Bacillus cibi,为降解苯酚提供了微生物物种资源。

关键词：苯酚盐度 16SrRNA 发育树基因

芽孢杆菌B3的鉴定及其对常见污染真菌的拮抗作用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2013年第1期32卷 58-64页

作者：黄福常刘斌覃培升黎金锋吴浩广西大学应用微生物研究所南宁530005

从平菇废弃培养料中分离获得一株细菌B3,通过对其进行形态学、培养特征比较研究和16SrDNA序列分析,鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。在与常见的三种食用菌污染真菌脉孢菌(Neurospora sp.)、木霉(Trichoderma sp.)及... 详细信息

从平菇废弃培养料中分离获得一株细菌B3,通过对其进行形态学、培养特征比较研究和16SrDNA序列分析,鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。在与常见的三种食用菌污染真菌脉孢菌(Neurospora sp.)、木霉(Trichoderma sp.)及鬼伞(Coprinus sp.)分别进行对峙培养时,都有明显的抑菌作用,形成的抑菌带分别为0.38cm、0.57cm及0.56cm,而与平菇(Pleurotus ostreatus)、鸡腿菇(Coprinus comatus)及草菇(Volvariella volvacea)分别进行对峙培养时,除对草菇有明显的抑制作用外,对平菇和鸡腿菇的抑制作用很小。在混接B3菌株麸皮菌剂栽培料培养基上,B3菌株对三种污染真菌的抑制作用都很明显;可抑制木霉分生孢子形成、脉孢菌分生孢子萌发及鬼伞菌丝扩展;但不抑制平菇菌丝的生长。

关键词： B3菌株 16S rDNA 发育树污染真菌抑制作用

福建水生植物浮萍的形态学和分子系统学鉴定及遗传多样性研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

热带作物学报 2017年第4期38卷 682-688页

作者：叶松建韩冰莹张家明海南大学热带农林学院海南海口570228 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南省热带生物能源工程技术研究中心海南海口571101

在福建53个市县(区)收集获得119份浮萍种质。通过叶片大小、根系和叶脉数等形态性状初步鉴定为4个属:少根紫萍属(Landoltia)、多根紫萍属(Spirodela)、无根萍属(Wolffia)、浮萍属(Lemna)。利用叶绿体atp F-atp H间隔序列和rp S16内含子... 详细信息

在福建53个市县(区)收集获得119份浮萍种质。通过叶片大小、根系和叶脉数等形态性状初步鉴定为4个属:少根紫萍属(Landoltia)、多根紫萍属(Spirodela)、无根萍属(Wolffia)、浮萍属(Lemna)。利用叶绿体atp F-atp H间隔序列和rp S16内含子序列进行系统发育分析。结果表明,119份浮萍种质分别属于4个种Landoltia punctata,Spirodela polyrhiza,Wolffia globosa,Lemna aequinoctialis。利用DnaSP 5.10.01软件分析结果显示,福建浮萍种质存在丰富的遗传多样性,且rpS16比atp F-atpH多样性大,两者的核苷酸多态性指数分别为0.051 23和0.031 53,每kb平均核苷酸差异数为44.675和20.374,群体突变率分别为0.051 64和0.036 40,单倍型多态性指数分别为0.617和0.577。稀脉萍、无根萍和多根紫萍基于atpF-atpH和rp S16序列的单倍型数为4、2、2。另外,闽南地区浮萍遗传多样性高于闽北地区,其核苷酸多态性指数、每kb核苷酸变异数以及群体突变率分别是闽北地区的2倍以上。

关键词：浮萍形态学分子系统学遗传多样性发育树