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珠海市海-陆交错带水环境原核生物多样性

应用生态学报 2010年第2期21卷 452-457页

作者：黄小兰陈建耀周世宁谢丽纯付丛生中山大学地理科学与规划学院广州510275 广西师范学院资源与环境科学学院南宁530001 中山大学生命科学学院广州510275

采用16S rRNA基因PCR-RFLP分析技术,对珠海市海-陆交错带的海水和地下水进行原核生物多样性分析,并将所得数据与国际基因数据库Genbank进行相似性比较及聚类分析.结果表明:海水细菌以变形菌居多,其次是古菌和芽单胞菌,以及Candidate div... 详细信息

采用16S rRNA基因PCR-RFLP分析技术,对珠海市海-陆交错带的海水和地下水进行原核生物多样性分析,并将所得数据与国际基因数据库Genbank进行相似性比较及聚类分析.结果表明:海水细菌以变形菌居多,其次是古菌和芽单胞菌,以及Candidate division OP3、OP8和浮霉菌等;海-陆交错带地下水细菌则以古菌居多,其次是变形菌和鞘脂杆菌,以及Candidate division OP3、放线菌和假单胞菌等.海-陆交错带地下水中大部分优势类群与源于海洋的不可培养细菌具有很高的相似性.地下水样中存在大量能降解有机质和具有净化水体潜力的细菌,说明在长期演化下,海-陆交错带兼备了海洋生态系统和陆地生态系统的特征.

关键词：原核生物多样性 16S rRNA基因水环境海陆交错带

生物砾间接触氧化反应器中原核生物多样性及其对剩余污泥减量化的贡献

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自然科学进展 2006年第10期16卷 1245-1250页

作者：林山杉金玉花付丽丽全成实东北师范大学城市与环境科学学院长春130024 吉林大学医学部病理生物学教育部重点实验室长春130061

采用分子生物学手段,通过构建16 S rRNA基因文库,对新型剩余污泥减量化处理技术——生物砾间接触氧化反应器(GCOR)中悬浮颗粒的原核生物多样性进行了系统发育分析,并讨论了多种原核生物共存对剩余污泥减量化的贡献．结果表明,颗粒的原... 详细信息

采用分子生物学手段,通过构建16 S rRNA基因文库,对新型剩余污泥减量化处理技术——生物砾间接触氧化反应器(GCOR)中悬浮颗粒的原核生物多样性进行了系统发育分析,并讨论了多种原核生物共存对剩余污泥减量化的贡献．结果表明,颗粒的原核生物可分为好氧呼吸菌群与厌氧水解发酵菌群两大类．其中,优势菌群分别是以呼吸代谢为主的假单胞菌属和以发酵为主要代谢方式的拟杆菌/噬纤维菌菌属,它们的16S rRNA序列各占文库的17%．此外,好氧菌群中还发育有α蛋白菌、β蛋白菌、γ蛋白菌、亚硝化螺菌属、土壤杆菌属、衣原体属、葡萄糖杆菌属及褐色高温单孢菌属细菌；厌氧菌群中则发育属于螺旋体属、δ蛋白菌、反硝化菌、乳杆菌属、真杆菌属的原核生物．反应系统中两大相反环境多种原核生物的共存,为在降解污水有机物的同时,达到剩余污泥减量化做出巨大贡献．

关键词：生物砾间接触氧化反应器悬浮颗粒原核生物多样性 16S rRNA基因文库假单胞菌属拟杆菌/噬纤维菌属

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杭州湾入海口沉积物原核生物多样性分析

生物学杂志 2018年第3期35卷 47-51页

作者：李双彤张秋芳周阳靖唐方园程军蕊郑琦宏徐继荣宁波大学建筑工程与环境学院宁波315211 泉州师范学院海洋与食品学院泉州362000 福建省海洋藻类活性物质制备与功能开发重点实验室泉州362000

为了解杭州湾入海口沉积物中原核生物多样性特征及其与环境因子的关系,应用Illumina Miseq测序平台对原核微生物16S rRNA基因V3-V4区序列进行了高通量测序,分析了杭州湾入海口13个点位的沉积物原核生物多样性特征。结果表明:1)共有原核... 详细信息

为了解杭州湾入海口沉积物中原核生物多样性特征及其与环境因子的关系,应用Illumina Miseq测序平台对原核微生物16S rRNA基因V3-V4区序列进行了高通量测序,分析了杭州湾入海口13个点位的沉积物原核生物多样性特征。结果表明:1)共有原核生物65个门、210个纲、419个目、688个科和1118个属,Shannon-Wiener指数平均值达9.72;主要优势菌有变形菌(Proteobacteria)、绿弯菌(Choloroflexi)和拟杆菌(Bacteroidetes)等,其中变形菌相对丰度最大;2)杭州湾南岸沉积物中厚壁菌(Firmicutes)的丰度比北岸高,对比上虞工业区和金山工业区排污口的样品可以发现,前者β变形菌相对丰度较高,而后者γ变形菌的相对丰度较高;3)绿菌(Chlorobi)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌和β变形菌(β-Proteobacteria)等相对丰度与总有机碳(TOC)显著相关;拟杆菌、放线菌和酸杆菌(Acidobacteria)等相对丰度与p H值显著相关;Fe和As皆与α变形菌、GN04和绿菌丰度具有显著相关性,Mn和Cu也分别与GN04和螺旋体(Spirochaetes)显著相关。因此,应用高通量测序方法可用于杭州湾入海口原核生物群落多样性特征分析,进而了解该区域原核生物分布与环境之间的相关关系。

关键词：沉积物原核生物多样性 16S rRNA基因高通量测序杭州湾入海口

云南热带和亚热带户用沼气池的原核微生物多样性比较研究

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云南热带和亚热带户用沼气池的原核微生物多样性比较研究

作者：李秋敏云南师范大学

学位级别：硕士

目前，人们对不同地理区域及气候条件下的沼气发酵系统中的微生物群落结构、组成与动态，以及其与环境生物与非生物因子的相关性认识有限，即对沼气发酵系统的生态学基本问题认识不够全面。为此针对上述问题，结合云南沼气发酵应用的独... 详细信息

目前，人们对不同地理区域及气候条件下的沼气发酵系统中的微生物群落结构、组成与动态，以及其与环境生物与非生物因子的相关性认识有限，即对沼气发酵系统的生态学基本问题认识不够全面。为此针对上述问题，结合云南沼气发酵应用的独特地理、气候优势与特征，以及良好的前期工作基础，本文采用免培养的微生物分子生态学方法与技术（PCR-DGGE技术和16S rRNA基因克隆文库技术），系统地比较分析了云南热带、亚热带代表性气候区域的农村户用沼气池中的原核生物群落结构、组成与动态，并分析了其与环境生物与非生物因子的相关性，进而探讨了影响不同沼气池中原核生物群落时空动态的主要因素，以及不同沼气池中微生物类群存在差异的原因。具体研究内容、研究结果如下：⑴DGGE初步分析户用沼气池原核微生物多样性：采用DGGE对云南热带（景洪）和亚热带（建水）的户用沼气池活性污泥进行了原核微生物多样性的初步分析，分析结果显示：细菌比古菌具有更丰富的多样性，同一气候区域的沼气池古菌多样性差异小于细菌，亚热带（建水）的沼气池细菌多样性差异和古菌多样性差异均小于热带（景洪）;不同气候区域的沼气池细菌和古菌的多样性因取样沼气池发酵状态、原料、进料情况、启用时间等的不同而呈现不同的聚类情况，细菌多样性的差异可能主要与发酵原料、启用时间、池温等因素有关，而古菌多样性差异受发酵参数影响较小。此外发酵液中仅COD含量与沼气池中古菌的多样性呈负相关，其他理化因子对细菌古菌多样性影响较小。⑵16S rRNA基因克隆文库技术分析农村户用沼气池原核微生物多样性：采用16S rRNA基因克隆文库技术对云南（北）热带和（南）亚热带代表性沼气池样品的细菌和古菌多样性进行了深入的研究，结果表明：两个气候区域的农村户用沼气池均具有丰富的古菌和细菌多样性，且细菌的多样性明显高于古菌;经分析统计两个气候区域的沼气发酵系统中大部分细菌均为未培养细菌，优势细菌类群是拟杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门和变形菌门;古菌主要的优势类群是甲烷八叠球菌目的鬃毛甲烷菌属;此外，还检测到少量未培养的泉古菌门细菌;沼气池细菌和古菌的多样性因发酵原料、启用时间、COD含量等因素的影响而存在差异。⑶不同季节不同发酵状态的户用沼气池原核微生物多样性初步分析：①采用显微镜直接计数法对不同季节（冬季和夏季）下不同气候区域（景洪和建水）不同发酵状态（发酵正常和不正常）的农村户用沼气池中的微生物进行了计数和形态的观察，结果显示：不正常发酵样品的微生物数量明显多于正常发酵样品，夏季样品的微生物数量多于冬季样品;②采用DGGE对其细菌和古菌的多样性变化进行了初步监测和比较，结果显示：不同气候区域、不同季节（冬季和夏季）、发酵正常与不正常的的样品之间存在一定的差异和联系，影响沼气池是否发酵正常的可能主要是细菌，而非古菌。以上实验结果一方面为云南各代表性区域高效沼气发酵系统的设计与建立提供理论指导，另一方面为云南沼气发酵相关微生物资源的收集、保藏、研究与利用奠定基础。

关键词：热带和亚热带户用沼气池原核生物多样性 PCR-DGGE 16S rRNA基因克隆文库技术

砾石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及主要功能

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砾石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及主要功能

作者：金玉花东北师范大学

学位级别：硕士

剩余污泥的处理与处置是目前生物法处理生活污水和工业废水的主要难题,新型剩余污泥减量化处理技术—生物砾间接触氧化反应工艺可在高效处理废水的同时达到无剩余污泥排出。本文通过对碎石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及其主... 详细信息

剩余污泥的处理与处置是目前生物法处理生活污水和工业废水的主要难题,新型剩余污泥减量化处理技术—生物砾间接触氧化反应工艺可在高效处理废水的同时达到无剩余污泥排出。本文通过对碎石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及其主要功能的研究,从微观分析生物碎石球工艺的污泥减量机理。实验首先使反应器启动、挂膜、正常运行,经过长时间的稳定运行,结果证明反应器在5个月的连续运行期间无剩余污泥排出且处理效果良好,出水各项指标均达标(污水综合排放标准一级,GB 8987-1996)。在反应器的稳定运行期间,还对反应器内的生物膜及沉淀污泥进行了显微镜镜检,发现在反应器内有丰富的原生动物和微小后生动物。这些微型动物使系统内食物链增长、变复杂,增加了能量在食物连内的损失,减少了用于合成生物体的能量,进而降低污泥的产量,同时微型动物对细菌和有机颗粒的大量吞噬也为系统的污泥减量做出了贡献。实验采用分子生物学手段,对反应器(GCOR)中原核生物多样性建立了16SrRNA基因文库,进行了系统发育分析,并讨论了多种原核生物共存对剩余污泥减量化的贡献.结果表明,系统内的原核生物可分为好氧呼吸菌群与厌氧水解发酵菌群两大类。其中,优势菌群分别是以呼吸代谢为主的假单胞菌属和以发酵为主要代谢方式的拟杆菌/噬纤维菌菌属,它们的16SrRNA序列各占文库的17%。此外,好氧菌群中还发育有α蛋白菌、β蛋白菌、γ蛋白菌、硝化螺菌属、土壤杆菌属、衣原体属、葡萄糖杆菌属及褐色高温单孢菌属细菌;厌氧菌群中则发育属于螺旋体属、δ蛋白菌、反硝化菌、乳杆菌属、真杆菌属的原核生物。反应系统中两大相反环境多种原核生物的共存,为在降解污水有机物的同时,达到剩余污泥减量化做出巨大贡献。

关键词：生物砾间接触氧化反应器原核生物多样性 16SrRNA基因文库系统发育分析