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脆性组氨酸三联体基因异常转录与肝癌关系的研究

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中华肝脏病杂志 2003年第9期11卷 550-551页

作者：于永春孙奋勇李智卢少毅滕小洪同济大学附属铁路医院中心实验室上海200072 暨南大学生物工程研究所

目的研究脆性组氨酸二联体(FHIT)基因异常转录与肝细胞癌(HCC)的相关性。方法利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)技术检测24对肝癌及癌旁组织、4例正常肝组织中FHIT的转录和突变情况。结果 11例肝癌组织(46％)标本... 详细信息

目的研究脆性组氨酸二联体(FHIT)基因异常转录与肝细胞癌(HCC)的相关性。方法利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)技术检测24对肝癌及癌旁组织、4例正常肝组织中FHIT的转录和突变情况。结果 11例肝癌组织(46％)标本、2例(8％)癌旁正常组织检测到异常转录本,正常肝组织无异常转录。结论 FHIT基因异常转录可能是导致肝细胞癌形成的一个重要因素。

关键词：脆性组氨酸三联体基因异常转录肝癌基因表达聚合酶链反应单链构象多态性

结核病临床分离株及痰标本中embB基因型的快速测定

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中国抗生素杂志 2005年第2期30卷 100-102页

作者：张俊仙吴雪琼韩慧新李洪敏梁建琴陆阳解放军309医院北京100091

目的建立快速测定结核病耐乙胺丁醇(EMB)分离株和痰标本中结核分枝杆菌EMB耐药基因型的方法,以期为患者提供及时、有效地化验结果。方法应用16SrDNA聚合酶链反应(PCR)-单链构象多态性(SSCP)和PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)对11株耐EM... 详细信息

目的建立快速测定结核病耐乙胺丁醇(EMB)分离株和痰标本中结核分枝杆菌EMB耐药基因型的方法,以期为患者提供及时、有效地化验结果。方法应用16SrDNA聚合酶链反应(PCR)-单链构象多态性(SSCP)和PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)对11株耐EMB分离株和46例结核病痰标本进行分子菌种鉴定和embB基因突变的部位与性质分析。结果以结核分枝杆菌H37Rv标准株为对照,11株耐EMB分离株和46例临床痰标本经16SrDNAPCR-SSCP分析电泳图谱均与结核分枝杆菌标准株相同;限制性内切酶Nla消化embB基因扩增产物显示,11株耐EMB分离株中4株(36.4%)不被Nla消化;46例结核病痰标本中10例(21.7%)不被Nla消化。结论部分结核分枝杆菌耐EMB是由于embB基因突变所致,采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法可直接快速测定结核病耐EMB分离株和痰标本中结核分枝杆菌耐EMB基因型。

关键词：聚合酶链反应单链构象多态性限制性片段长度多态性乙胺丁醇结核分枝杆菌结核病

4种柑橘衰退病毒源单蚜传毒分离株CP基因的分子特征

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植物病理学报 2007年第1期37卷 25-30页

作者：徐小峰周常勇宋震王雪峰周彦西南大学植物保护学院重庆400716 中国农业科学院柑橘研究所重庆400712

对4种柑橘衰退病毒源及其31个单蚜传毒分离株的CP基因做了限制性片段长度多态性(RFLP)和单链构象多态性(SSCP)分析,并对其中8个单蚜传毒分离株的CP基因进行了序列分析。实验明确了所研究柑橘衰退病毒(Citrus triste-za virus,CTV)的CPG/... 详细信息

对4种柑橘衰退病毒源及其31个单蚜传毒分离株的CP基因做了限制性片段长度多态性(RFLP)和单链构象多态性(SSCP)分析,并对其中8个单蚜传毒分离株的CP基因进行了序列分析。实验明确了所研究柑橘衰退病毒(Citrus triste-za virus,CTV)的CPG/Hinf I RFLP组群和CPG/SSCP模式,二者能较好地对应并有效验证了单蚜传毒对CTV毒源的分离纯化作用;CP基因序列分析结果表明,相同CPG/Hinf I RFLP组群的单蚜传毒分离株间具有高度的序列相似性,而不同CPG/Hinf I RFLP组群单蚜传毒分离株间则存在较大差异;通过与已知生物学特性CTV分离株比较,初步建立了上述CP基因分子特征与病毒生物学特性之间的联系。

关键词：柑橘衰退病毒单蚜传毒 CP基因限制性片段长度多态性单链构象多态性

食管癌线粒体DNA微卫星不稳与核DNA微卫星不稳相关性探讨

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中国肿瘤临床 2004年第14期31卷 791-793页

作者：颜坤王明荣房殿春罗元辉第三军医大学附属西南医院胸心外科重庆市400038 第三军医大学附属西南医院消化专科中心重庆市400038

目的:探讨食管癌线粒体DNA微卫星不稳与核DNA微卫星不稳的关系。方法:采用PCR单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测食管癌及正常组织细胞mtMSI与nMSI。结果:45例食管癌检出mtMSI9例(20.0%),检出nMSI10例(22.2%)。mtMSI主要发生于D-loop区。... 详细信息

目的:探讨食管癌线粒体DNA微卫星不稳与核DNA微卫星不稳的关系。方法:采用PCR单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测食管癌及正常组织细胞mtMSI与nMSI。结果:45例食管癌检出mtMSI9例(20.0%),检出nMSI10例(22.2%)。mtMSI主要发生于D-loop区。mtMSI与nMSI两者的发生有相关性(P<0.05)。结论:食管癌组织中存在mtMSI,mtMSI的发生可能通过nMSI参与了食管癌的发生过程。

关键词：食管癌线粒体微卫星不稳定核微卫星不稳定单链构象多态性

微流控芯片电泳激光诱导荧光检测p53外显子上的突变点

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分析试验室 2010年第12期29卷 1-4页

作者：李钢葛淑丽王清江何品刚方禹之华东师范大学化学系上海200062

利用单链构象多态性(SSCP),建立微流控芯片电泳(ME)联合激光诱导荧光检测(LIF)技术,检测人类p53基因点突变的方法。设计不同碱基长度的p53单链序列,针对易突变的外显子7,8,9进行SSCP分析,分离野生与突变的单链DNA序列;研究了筛分介质聚... 详细信息

利用单链构象多态性(SSCP),建立微流控芯片电泳(ME)联合激光诱导荧光检测(LIF)技术,检测人类p53基因点突变的方法。设计不同碱基长度的p53单链序列,针对易突变的外显子7,8,9进行SSCP分析,分离野生与突变的单链DNA序列;研究了筛分介质聚乙烯基氧化物(PEO)的浓度,场强对芯片电泳行为的影响。在PEO质量分数为0.5%,分离场强为260V/cm时,100 s之内就可以实现样品p53外显子7,8,9的野生型与突变型碱基的分离检测。

关键词：微流控芯片电泳激光诱导荧光检测单链构象多态性 p53

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中国人散发性大肠癌APC基因突变的研究

中华实验外科杂志 2005年第11期22卷 1357-1359页

作者：唐卫中高枫李卫唐宗江广西医科大学第一附属医院大肠肛门病外科南宁530021 广西医科大学医学实验中心

目的观察中国人大肠癌APC基因突变情况,并结合临床病理资料加以分析.方法应用常规酚、氯仿法提取48例散发性大肠癌组织及相应正常黏膜组织的DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增、单链构象多态性(SSCP)电泳和DNA直接测序,检测APC基因第15外显子MC... 详细信息

目的观察中国人大肠癌APC基因突变情况,并结合临床病理资料加以分析.方法应用常规酚、氯仿法提取48例散发性大肠癌组织及相应正常黏膜组织的DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增、单链构象多态性(SSCP)电泳和DNA直接测序,检测APC基因第15外显子MCR区段的突变情况.结果 APC基因突变率为37.5%(18/48),APC基因第15外显子MCR区段突变发生在codon1306～codon1442之间,突变类型有点突变(A→G、G→T、C→A、C→T、G→A)、移码突变(-A、-C、-G、-AG、+T、+A、+AACG).结论中国人大肠癌APC基因突变率为37.5%(18/48),以体细胞的错义突变为主,codon1309∽codon1356是大肠癌APC基因突变热区,而codon1356(CCT→TCT)是突变热点.散发性大肠癌APC基因突变与患者的年龄、性别、肿瘤的位置、浸润深度、组织类型、分化程度、远处转移、Dukes'分期和5年生存无关.

关键词：大肠癌基因突变 APC基因突变散发性大肠癌中国 DNA直接测序单链构象多态性基因突变率临床病理资料

用PCR－SSCP分析区分不同来源的幽门螺杆菌

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中华消化杂志 1995年第S1期15卷 9-12页

作者：王蔚虹胡伏莲贾博琦瞿峰朱立煌北京医科大学第一医院胃肠科中国科学院遗传研究所

以幽门螺杆菌（Ｈｐ）特异引物（ＣＡＭ－２／ＣＡＭ－４），用聚合酶链反应及单链构象多态性分析，将来自９７名病人的Ｈｐ分成６组；同一病人相隔８个月分离的Ｈｐ单链构象不变；４个病人不同培养部位的Ｈｐ菌株分别具有相同的单链构... 详细信息

以幽门螺杆菌（Ｈｐ）特异引物（ＣＡＭ－２／ＣＡＭ－４），用聚合酶链反应及单链构象多态性分析，将来自９７名病人的Ｈｐ分成６组；同一病人相隔８个月分离的Ｈｐ单链构象不变；４个病人不同培养部位的Ｈｐ菌株分别具有相同的单链构象；未发现Ｈｐ分组与疾病诊断有相关性。１０例抗生素治疗前后病人的菌株中，９例治疗前后的菌株相同，１例治疗前后的菌株不同。该方法重复性好，有助于Ｈｐ感染的流行病学研究及治疗后菌株复发和再感染的鉴别。

关键词：幽门螺杆菌聚合酶链反应单链构象多态性菌株鉴定

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绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在大鼠体内的表达

动物医学进展 2012年第7期33卷 7-11页

作者：李靖瓦西力周艳喜么宏强于立新敖威华马学恩内蒙古农业大学兽医学院呼和浩特010018 内蒙古出入境检验检疫局技术中心呼和浩特010020

为探讨绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白(OPAV-Env)引起肺泡Ⅱ型上皮恶变的机理,将真核表达质粒pcDNA3.1-env用体内转染试剂经尾静脉转染到幼龄大鼠体内,用RT-PCR及免疫组化法检测绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在大鼠体内的表达,并采用SSCP法及基因克... 详细信息

为探讨绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白(OPAV-Env)引起肺泡Ⅱ型上皮恶变的机理,将真核表达质粒pcDNA3.1-env用体内转染试剂经尾静脉转染到幼龄大鼠体内,用RT-PCR及免疫组化法检测绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在大鼠体内的表达,并采用SSCP法及基因克隆法结合序列分析检测H-ras基因是否发生突变。结果显示,绵羊肺腺瘤病毒囊膜蛋白在大鼠肺脏组织存在表达,但转染21d后和正常大鼠比较,未发现大鼠H-ras基因发生突变。

关键词：绵羊肺腺瘤病毒 ras基因免疫组化单链构象多态性

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焦炉工人痰细胞p53基因外显子突变检测

中国公共卫生 2011年第9期27卷 1173-1175页

作者：张萍郑金平孙建娅山西医科大学公共卫生学院山西太原030001 太钢(集团)有限公司疾病预防控制中心

目的探讨焦炉工人痰细胞p53基因突变与焦炉暴露关系。方法选取某焦化厂125名焦炉作业工人（炉底38人,炉侧45人,炉顶42人）作为暴露组,同时选取同厂37名材料管理工人作为对照组;个体采样法对作业环境进行监测;高渗盐水超声雾化法诱导取痰... 详细信息

目的探讨焦炉工人痰细胞p53基因突变与焦炉暴露关系。方法选取某焦化厂125名焦炉作业工人（炉底38人,炉侧45人,炉顶42人）作为暴露组,同时选取同厂37名材料管理工人作为对照组;个体采样法对作业环境进行监测;高渗盐水超声雾化法诱导取痰,分离痰细胞;高效液相色谱法检测环境空气样本B〔a〕P和尿中1-羟基芘的水平;聚合酶链式反应-单链构象多态性方法（PCR-SSCP）检测痰细胞p53基因突变的情况。结果暴露组中炉顶工人组痰细胞p53基因6、7外显子和p53基因5、6、7外显子总突变率分别为14.3%,21.4%,33.3%,明显高于对照组（0%,5.4%,5.4%）,差异有统计学意义（P〈0.05）,且总突变率有随外暴露水平升高而升高的趋势（χ^2=7.457,P〈0.01）;经多元Logistic回归分析,焦炉暴露、炉顶暴露、炉底暴露和年龄的调整OR值（95%CI）分别为25.278（3.461-184.625）、7.359（1.017-53.267）、22.228（3.146-157.082）、1.106（1.011-1.211）,是焦炉工人痰细胞p53基因突变率升高的主要危险因素。结论焦炉逸散物可诱发焦炉工人的痰细胞p53基因突变率升高,且与暴露水平有关。

关键词：焦炉工人诱导痰 p53基因单链构象多态性突变率