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两种配制胶对单链构象多态性筛查AKT2基因突变的影响

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汕头大学医学院学报 2007年第2期20卷 120-121,125页

作者：张庆英成文翔汕头大学医学院公共卫生与预防医学教研室广东汕头515041

目的:观察单链构象多态性(SSCP)筛查AKT2基因突变时凝胶配制的不同对筛查结果的影响。方法:采用PCR扩增AKT2基因第6外显子片段,分别采用添加体积分数5%的甘油和不加甘油的非变性聚丙烯酰胺胶进行电泳,银染后观察结果,选取阳性样本测序... 详细信息

目的:观察单链构象多态性(SSCP)筛查AKT2基因突变时凝胶配制的不同对筛查结果的影响。方法:采用PCR扩增AKT2基因第6外显子片段,分别采用添加体积分数5%的甘油和不加甘油的非变性聚丙烯酰胺胶进行电泳,银染后观察结果,选取阳性样本测序验证。结果:单链DNA在两种胶中呈现出不同的带型,经测序验证后突变检出率有差别。结论:加入甘油的聚丙烯酰胺胶降低了AKT2基因第6外显子的突变检出率。

关键词：单链构象多态性甘油 AKT2基因突变

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垂体腺瘤p16基因的单链构象多态性分析

河南实用神经疾病杂志 2001年第3期4卷 3-4页

作者：魏新亭罗世祺河南医科大学第一附属医院神经外科郑州450052 北京天坛医院神经外科北京100050

目的：筛选垂体腺瘤中ｐ１６基因的突变。方法：对无ｐ１６基因纯合性的肿瘤及其血标本进行单链构象多态性分析。结果：３０例标本中未见ｐ１６基因第一和第一外显子迁移率改变。结论：垂体腺瘤ｐ１６基因的表达缺失与基因突变无关。

关键词：垂体腺瘤 p16基因基因突变单链构象多态性

银染单链构象多态性技术检测人IL-3基因突变

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第三军医大学学报 2001年第11期23卷 1358-1359页

作者：毛琼国刘昕王燕梁红第三军医大学基础医学部分子遗传学教研室重庆400038

目的　对人白细胞介素 3(hIL 3)基因突变体进行分析和进一步鉴定 ,建立一种灵敏、快捷的检测基因突变和DNA多态性的方法即银染单链构象多态性技术 (Singlestrandconformationpolymorphism ,SSCP)。方法　将野生型和突变型的人白介素 ... 详细信息

目的　对人白细胞介素 3(hIL 3)基因突变体进行分析和进一步鉴定 ,建立一种灵敏、快捷的检测基因突变和DNA多态性的方法即银染单链构象多态性技术 (Singlestrandconformationpolymorphism ,SSCP)。方法　将野生型和突变型的人白介素 3(hIL 3)cDNA连接到PUC9和PUC19质粒载体上 ,转化入大肠杆菌 ,扩增质粒 ,用常规方法抽提 ,酶切 ,然后将酶切后的DNA片段进行PAGE胶电泳 ,银染检测野生型和突变型的异同。结果　以野生型hIL 3cDNA作为对照 ,连接到PUC9和PUC19上的电泳结果均为一致 ,突变型hIL 3cDNA的电泳带明显比野生型的电泳带靠后。结论　SSCP方法具有简便 ,快捷较灵敏的特点 ,对人白细胞介素 3(hIL 3)基因的点突变得到进一步的鉴定。

关键词：单链构象多态性人白细胞介素-3 基因突变基因诊断

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DNA单链构象多态性原理初探

基础医学与临床 1997年第2期17卷 142-146页

作者：戚豫唐炬黄丽英北京医科大学第一医院儿科

通过总结５年来的实验结果和１１０篇统计文献报道的结果，阐明了ＳＳＣＰ适用于能够引起ＤＮＡ单链中发夹结构改变的突变的检出，并据此提出ＳＳＣＰ实验原则。

关键词：单链构象多态性发夹结构 DNA突变检测方法

单链构象多态性分析K-ras和p16基因突变(英文)

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河南医科大学学报 2000年第3期35卷 194-196页

作者：吴逸明张振中史香林王新朝河南医科大学劳动卫生学与卫生毒理学教研室郑州450052 河南医科大学药学系郑州450052 美国职业安全卫生研究所病理生理学研究室

目的 :研究大鼠肺癌组织K ras和p16基因突变情况。方法 :运用聚合酶链反应单链构象多态性 (PCR SSCP)技术分析肺癌组织K ras和p16基因突变。结果 :未发现正常大鼠肺组织中K ras和p16基因突变 ,在肿瘤组织中K ras和p16均有 2例突变发生... 详细信息

目的 :研究大鼠肺癌组织K ras和p16基因突变情况。方法 :运用聚合酶链反应单链构象多态性 (PCR SSCP)技术分析肺癌组织K ras和p16基因突变。结果 :未发现正常大鼠肺组织中K ras和p16基因突变 ,在肿瘤组织中K ras和p16均有 2例突变发生。结论 :K ras和p16基因突变与肺癌发生存在一定的相关性 .

关键词： K-ras p16基因肺肿瘤单链构象多态性

半重退火（Semireannealing）单链构象多态性（SSCP）分析：一种诊断T—细胞克隆形成能力的有效工具

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中国医师杂志 2002年第9期4卷 1037-1037页

p53单链构象多态性变化与食管鳞癌患者术后生存期的关系

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河南医科大学学报 2000年第6期35卷 512-514页

作者：阎明曹巍常扶保章茜河南医科大学生理学教研室郑州450052 新乡医学院病理学教研室新乡453003 林州市食管癌医院林州456500

目的 :探讨p5 3基因单链构象多态性变化与食管鳞癌患者术后生存期的关系。方法 :采用聚合酶链反应单链构象多态性 (PCR SSCP)结合银染技术 ,对 47例河南林县食管鳞癌患者癌组织及癌旁正常组织中p5 3基因第 5～ 8外显子进行比较。结果 :... 详细信息

目的 :探讨p5 3基因单链构象多态性变化与食管鳞癌患者术后生存期的关系。方法 :采用聚合酶链反应单链构象多态性 (PCR SSCP)结合银染技术 ,对 47例河南林县食管鳞癌患者癌组织及癌旁正常组织中p5 3基因第 5～ 8外显子进行比较。结果 :p5 3基因第 5～ 8外显子出现异常电泳条带者 2 0例 (4 2 6 % ) ;生存期大于 5a组与生存期小于 5a组 ,p5 3基因单链构象多态性变化发生率分别为 32 1% (9/ 2 8)和 5 7 9(11/ 19) ,2组比较 ,差异无显著性(χ2 =3 0 71,P >0 0 5 )。结论 :食管鳞癌组织p5 3基因第 5～

关键词： p53基因生存期食管鳞癌单链构象多态性

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北京市模拟给水管网管壁微生物膜群落分析

环境科学 2008年第5期29卷 1170-1174页

作者：刘小琳刘文君金丽燕顾军农清华大学环境科学与工程系北京100084 北京市自来水集团水质监测中心北京100031

以北京市模拟给水管网管壁微生物膜为研究对象,采用HPC(异养菌平板计数)和PCR-SSCP(单链构象多态性)方法,分析模拟给水管网管壁微生物膜异养菌数目和微生物群落结构.结果表明,在相同流速条件下,镀锌钢管的管壁微生物数量约为PVC管的5倍... 详细信息

以北京市模拟给水管网管壁微生物膜为研究对象,采用HPC(异养菌平板计数)和PCR-SSCP(单链构象多态性)方法,分析模拟给水管网管壁微生物膜异养菌数目和微生物群落结构.结果表明,在相同流速条件下,镀锌钢管的管壁微生物数量约为PVC管的5倍.在相同材质的镀锌钢管内,死水区的HPC计数量约为0.6 m.s-1,是流速区的1/5.计数结果的差异可能与不同材质表面的光滑度及流速造成微生物生长所需的氧气和营养基质不同有关.而不同材质和不同流速区微生物群落的SSCP电泳图谱则显示为一样,均在相同位置出现同样条带.测序结果显示,SSCP电泳图中的3条带与蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus,GenBank登录号为AB190077)、假单胞菌(Peudomonas sp. yged143,GenBank登录号为EF419342)和未分类细菌(Bacterium UASWS0134,GenBank登录号为DQ190347)的同源性分别为100%、99%和94%.测序结果的一致性可能与取样点为同一模拟管网,距离比较接近,不同微生物容易在其中流动和转移有关.而潜在致病菌蜡状芽孢杆菌和假单胞菌的存在则提示应该更加重视饮用水的微生物安全性.

关键词：模拟给水管网微生物膜异养菌平板计数单链构象多态性

SSCP技术解析硫酸盐还原反应器中微生物群落结构

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环境科学 2005年第4期26卷 171-176页

作者：赵阳国任南琪王爱杰刘广民赵秋实商淮湘哈尔滨工业大学市政环境工程学院哈尔滨150090

采用改进的单链构象多态性(SSCP)技术,以16SrRNA基因的V3区为靶对象,分析完全混合式硫酸盐还原反应器中微生物的群落结构以及硫酸盐还原菌(SRBs)与产酸菌(ABs)的种间关系.共得到13个可辨晰的SSCP条带,对其中的6条带(A1,A3,A4,A5,A9,A10... 详细信息

采用改进的单链构象多态性(SSCP)技术,以16SrRNA基因的V3区为靶对象,分析完全混合式硫酸盐还原反应器中微生物的群落结构以及硫酸盐还原菌(SRBs)与产酸菌(ABs)的种间关系.共得到13个可辨晰的SSCP条带,对其中的6条带(A1,A3,A4,A5,A9,A10)进行了测序分析,分别同嗜柠檬酸明串球菌(GenBank登录号:AY453065,下同)、未培养细菌(AJ318147,AF227834,AJ576427)、产乙醇杆菌(AY434722)、梭杆菌(AB084627)等相似性较大.为检测系统中的SRBs,以SRBs富集培养基,对反应器中的活性污泥进行选择性富集,培养的混合菌群同样采用SSCP分析,带型与前者相差较大,其中有2条带与Bacteroidetes(AB074606)和脱硫弧菌(Y12254,U42221)最为相似.分析表明,SRBs在总DNA中的含量可能不到1·5%,但是它们与大量的ABs形成很好的种间协作关系,从而维持工艺系统较高的硫酸盐去除率和运行稳定性.

关键词：微生物群落群落结构单链构象多态性硫酸盐还原菌产酸菌