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拉萨岩蜥与吴氏岩蜥种群遗传学及谱系地理学研究

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拉萨岩蜥与吴氏岩蜥种群遗传学及谱系地理学研究

作者：张勇西藏大学

学位级别：硕士

岩蜥属Laudakia（Gray,1845）隶属鬣蜥科（Agamidae）蜥蜴亚目,因为岩蜥属分布于高原上,在高原上开展科学考察和研究相对困难等原因。我国分布有7种,分布于西藏自治区、新疆维吾尔自治区及甘肃省。本属的研究系统学及种群遗传学研究较... 详细信息

岩蜥属Laudakia（Gray,1845）隶属鬣蜥科（Agamidae）蜥蜴亚目,因为岩蜥属分布于高原上,在高原上开展科学考察和研究相对困难等原因。我国分布有7种,分布于西藏自治区、新疆维吾尔自治区及甘肃省。本属的研究系统学及种群遗传学研究较少。基于前人的研究基础,拉萨岩蜥和吴氏岩蜥存在过度类型,本研究采取零假设,姑且认为是一个物种。采用“长杆活套”法（黄松首创）沿雅鲁藏布江及其支流对拉萨岩蜥和吴氏岩蜥进行广泛、连续而密集的采样。2019年,在拉萨市叶巴村采集4只拉萨岩蜥怀孕个体进行观察记录了拉萨岩蜥的卵生繁殖方式。补充了拉萨岩蜥的卵生繁殖的基础生物学资料。与同属其他物种的繁殖观察研究对比,讨论需要进一步的野外考察了解岩蜥产卵季节的洞穴温度和湿度,以此提高孵化率,为岩蜥提供更为精确的繁殖生物学数据。同时在野外考察过程中发现吴氏岩蜥8月下旬仍有怀卵个体,低海拔的吴氏岩蜥繁殖季节是否推后,还是一年像其他蜥蜴类物种一年产卵多次,在接下来的研究中需要侧重的去观察研究。2016至2019年,共获得23个地点的48号典型样本,经过对形态测量、线粒体基因组及基因富集的方法,仔细研究了拉萨岩蜥和吴氏岩蜥的系统关系。形态上测量上与前人的研究结果一致,拉萨岩蜥尾背3环每节,尾腹4环每节。从线粒体基因组的角度,用拉萨岩蜥与吴氏岩蜥线粒体全序列结合12条近缘属物种构建系统发育树,及遗传距离分析。拉萨岩蜥与吴氏岩蜥亲缘关系较近（线粒体遗传距离约2.7%）,两个物种是成立的,但是分化时间并不久远。基于跨物种靶基因富集9271个基因位点进行系统发育基因组学分析,并不支持拉萨岩蜥和吴氏岩蜥之间存在过度的隐存种。吴氏岩蜥分布于墨脱背崩乡北上到波密倾多乡,拉萨岩蜥分布自里龙乡沿雅鲁藏布江向西至拉萨市尼木县附近,很好的反映了物种的进化历史。同时基于系统发育分析解析了吴氏岩蜥和拉萨岩蜥由南向北再向西沿雅鲁藏布江扩散。南迦巴瓦峰和加拉白垒峰起到了地理隔离的作用。支持了前人提出的岩蜥属从可能的起源中心绕着跨喜马拉雅山脉。在“阴雨”的条件下,出现了可接受的干旱地区的扩散假说。未来需要加强多方面的合作,尤其是与中亚岩蜥属分布的国家科研团队进行合作,以便尝试解决整个岩蜥属的系统发育关系。

关键词：拉萨岩蜥吴氏岩蜥繁殖线粒体基因组基因富集单拷贝直系同源基因谱系地理学

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樱实叶蜂属物种界定及系统发育研究

樱实叶蜂属物种界定及系统发育研究

作者：吴朵江西师范大学

学位级别：硕士

樱实叶蜂属Analcellicampa Wei,2019隶属于昆虫纲(Insecta)膜翅目(Hymenoptera)、叶蜂亚目(Tenthredinomorpha)、叶蜂科(Tenthredinidae)、实叶蜂亚科(Hoplocampinae)。本属专性取食蔷薇科(Rosacoae)樱属(Cerasus)幼果。该属种类个体色斑复杂多样,种间界限模糊,地理分布差异较大,成为利用基因组研究演化关系和物种形成的好材料。本研究采用高通量测序方法,获得了73条樱实叶蜂属线粒体基因组,并提取了单拷贝直系同源基因。分析了樱实叶蜂属线粒体基因组特征,使用多种数据集探究了樱实叶蜂属关于物种界定的问题,并推断其系统发育关系和分歧时间,主要结果如下:樱实叶蜂属线粒体基因组长度范围为15071～15520 bp,包含典型的37个基因,碱基组成有明显的AT偏向性。属内所有样本基因顺序与祖先昆虫相比,均发生CR-trn I-trn Q-trn M到trn M-trn Q-CR-trn I(CR为control region)的重排。13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子,除nad4以T终止,其余均以TAN为终止密码子。属内密码子使用具有相似性。属内的d N/d S均小于1,表明受到了选择压力,推测其处在演化选择的正选择之中。其中atp8受到的自然选择压力相对较小。使用多种方法对樱实叶蜂属进行物种界定。ABGD、Vsearch和单倍型网络图的结果均支持樱实叶蜂属被划分为5个种,而b PTP结果显示该属被划分为9个种。结合形态学,推测b PTP存在过度划分的可能性。综上,樱实叶蜂属应分为5个有效种。本研究构建的12棵系统发育树均支持实叶蜂属位于实叶蜂亚科的基部,单室叶蜂属(Monocellicampa)与樱实叶蜂属构成姊妹群,并支持樱实叶蜂属是单系群。在樱实叶蜂属内部,基于单拷贝直系同源基因系统发育关系如下:(Analcellicampa maculidorsata+(Analcellicampa acutiserrula+(Analcellicampa wui+(Analcellicampa danfengensis+Analcellicampa xanthosoma))))。分别使用线粒体基因组和单拷贝直系同源基因估算分歧时间。选用了棒蜂科(242～237 Mya)和叶蜂总科(183～182 Mya)进行化石标定。基于线粒体基因组的结果显示樱实叶蜂属在约37.581 Mya开始出现分化;而基于单拷贝直系同源基因的结果为11.855 Mya。通过文献知樱实叶蜂属寄主樱属出现的时间约为35.9Mya。综上,认为基于单拷贝直系同源基因进行分歧时间估算的结果更为可靠。樱实叶蜂属在约11.855 Mya开始出现分化,首先分化出***,在约9.89 Mya时分化出***,随后在约7.608 Mya分化出***,最后在约6.67 Mya,***和***出现了分化。

关键词：樱实叶蜂属线粒体基因组单拷贝直系同源基因系统发育分歧时间

管蚜蝇族（双翅目：蚜蝇科）昆虫分子系统学研究

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管蚜蝇族（双翅目：蚜蝇科）昆虫分子系统学研究

作者：刘含悦陕西理工大学

学位级别：硕士

管蚜蝇族(Eristalini)隶属于双翅目(Diptera)蚜蝇科(Syrphidae)管蚜蝇亚科(Eristalinae),已知种类成虫访花;幼虫大部分为腐食性,水生,体末端有较长的呼吸管,被称为鼠尾蛆。管蚜蝇族物种多样性和特异性极为丰富,目前全世界已知约42余属1... 详细信息

管蚜蝇族(Eristalini)隶属于双翅目(Diptera)蚜蝇科(Syrphidae)管蚜蝇亚科(Eristalinae),已知种类成虫访花;幼虫大部分为腐食性,水生,体末端有较长的呼吸管,被称为鼠尾蛆。管蚜蝇族物种多样性和特异性极为丰富,目前全世界已知约42余属1000余种,我国记载14余属100余种,因其复杂的形态学变化使其在蚜蝇科内的系统发育地位,以及其族下部分属级,甚至亚族的划分一直存在较大争议。本研究联合单拷贝直系同源基因、线粒体基因组以及cox1基因数据集重建了管蚜蝇族种水平系统发育树,对管蚜蝇族的单系性,其下各亚族的划分,以及各属种的分类地位等系统发育关系进行了初步分析,为进一步探究管蚜蝇族及其下各分类阶元的系统演化提供新的分子证据,同时也对后续开展蚜蝇科这一重要昆虫资源的生物学、生态学、资源利用等方面的研究具重要意义。本研究主要结果如下:(1)基于二代基因组测序平台,本研究新测了12种管蚜蝇族昆虫低覆盖度基因组数据,结合NCBI数据库已公开的4种管蚜蝇族基因组数据,以近缘的巴蚜蝇族(Bacchini)、蚜蝇族(Syrphini)和鼻颜蚜蝇族(Rhingiini)的代表物种为外群,利用579个单拷贝直系同源基因构建的数据集重建了16种管蚜蝇族昆虫系统发育树;随后,结合33种线粒体基因组数据(12种为本研究新测数据),以上述单拷贝直系同源基因构建的系统树为骨架,对管蚜蝇族系统树进行扩充;最后,以线粒体基因组树为骨架,基于cox1基因重建了包含2亚族14属157种的管蚜蝇族种水平系统树。(2)基于二代基因组测序平台,本研究完成了12种管蚜蝇族昆虫的线粒体基因组组装和注释工作,在此基础上,对管蚜蝇族昆虫的线粒体基因组的基本结构、碱基组成、密码子使用频率、RNA二级结构等特征注释进行了分析,结果表明:(1)与大多数后生动物线粒体基因组相似,目前已测得的管蚜蝇族昆虫线粒体基因组均为环状的双链DNA分子,长度14 429 bp～16 375 bp之间,除个别物种,均包含13个蛋白质编码基因(protein coding genes,PCGs)、2个核糖体RNA基因(ribosomal RNA genes,r RNAs)、22个转运RNA基因(transfer RNA genes,t RNAs)和1个控制区(D-loop),线粒体基因组基因排列与亚库巴果蝇(Drosophila yakuba)的线粒体基因组方式排列一致,无基因重排现象;(2)已测管蚜蝇族昆虫的线粒体基因组具有明显的AT偏向性,在碱基的使用中表现出轻微A偏向和C偏向;(3)已测管蚜蝇族昆虫线粒体基因组中蛋白质编码基因的起始密码子多为标准的三联密码子ATN(ATA、ATT、ATC、ATG),终止密码子除典型的三联密码子TAA或TAG,还包括不完整的终止密码子(TA或T)。(3)本研究构建的管蚜蝇族昆虫种水平系统进化关系,支持管蚜蝇族的单系性以及管蚜蝇亚族(Eristalina)的单系性,但不支持条胸蚜蝇亚族(Helophilina)的单系性。(4)管蚜蝇亚族具有单系性,位于整个系统树的端部,其下Senaspis属、管蚜蝇属(Eristalis)具单系性;支持将斑目蚜蝇属(Lathyrophthalmus)(除绿黑斑目蚜蝇Lathyrophthalmus viridis)、离眼管蚜蝇属(Eristalinus)、条眼蚜蝇属(Eristalodes)做为亚属归入离眼管蚜蝇属中。(5)条胸蚜蝇亚族位于整个系统树的基部,仅恢复了其下拟条胸蚜蝇属(Parhelophilus)、墨管蚜蝇属(Mesembrius)的单系性;条胸蚜蝇亚族分为两大支,其中拟条胸蚜蝇属(Parhelophilus)、条胸蚜蝇属(Helophilus)、平管蚜蝇属(Lejops)构成了基部的分支,作为管蚜蝇族(Eristalini)剩余属的姐妹类群;靠近端部的一大支中,墨管蚜蝇属、毛管蚜蝇属、毛眼管蚜蝇属(Myathropa)、叉茎管蚜蝇属(Tigridemyia)与传统形态学分类中的管蚜蝇亚族(Eristalina)亲缘关系更近,聚为一支。

关键词：管蚜蝇族单拷贝直系同源基因线粒体基因组 cox1基因系统发育

齿腿蚜蝇族（双翅目：蚜蝇科）昆虫分子系统学研究

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齿腿蚜蝇族（双翅目：蚜蝇科）昆虫分子系统学研究

作者：贺屹成陕西理工大学

学位级别：硕士

齿腿蚜蝇族Merondontini隶属于双翅目Diptera蚜蝇科Syrphidae管蚜蝇亚科Eristalinae,该族物种多样性和特异性极为丰富,目前全世界已知11属520余种,因其复杂的形态学变化,该族在蚜蝇科内的系统发育地位,以及该族下部分属级,甚至种的划分... 详细信息

齿腿蚜蝇族Merondontini隶属于双翅目Diptera蚜蝇科Syrphidae管蚜蝇亚科Eristalinae,该族物种多样性和特异性极为丰富,目前全世界已知11属520余种,因其复杂的形态学变化,该族在蚜蝇科内的系统发育地位,以及该族下部分属级,甚至种的划分一直存在较大争议。本研究在联合单拷贝同源基因、线粒体基因组和条形码数据集构建了稳健的蚜蝇科系统发育关系的基础上,深入探讨齿腿蚜蝇族的单系性,以及该族和其下各属、种在蚜蝇科中的分类地位提供了新的分子证据,同时为更好地开展齿腿蚜蝇族昆虫的生物学、生态学及资源利用等方面的研究奠定基础。主要结果如下:(1)本研究新测4属6种齿腿蚜蝇族昆虫的基因组、线粒体基因组和cox1条形码序列。结合已公开数据,共收集2亚科9族37属60种蚜蝇科昆虫基因组数据;4亚科14族44属72种蚜蝇科昆虫线粒体基因组数据;4亚科15族51属208种蚜蝇科昆虫cox1条形码数据,涵盖了蚜蝇科所有的亚科和绝大多数族(仅丝蚜蝇族未涉及),齿腿蚜蝇族70%以上的属。(2)本研究以近缘的鼓翅蝇科Sepsidae、头蝇科Pipunculidae和扁足蝇科Platypezidae的代表物种为外群,基于248个单拷贝直系同源基因重建了60种蚜蝇科高级分类阶元(亚科和族)的系统发育框架;随后,以上述单拷贝直系同源基因构建的系统树为骨架,结合72种线粒体基因组数据,将蚜蝇科系统树细化至亚族和属级别,再以此为骨架,使用208种cox1条形码数据填补和完善了蚜蝇科属内种间的系统发育关系,这一策略有效整合了不同类型的遗传信息,在覆盖尽可能多的物种的同时保留系统发育树的准确性和分辨率。(3)本研究构建系统发育树的拓扑结果显示,蚜蝇科呈单系并与头蝇科昆虫构成姐妹群,蚜蝇亚科Syrphinae、缩颜蚜蝇亚科Pipizinae和巢穴蚜蝇亚科Microdontinae为单系,但不支持管蚜蝇亚科Eristalinae的单系性;齿腿蚜蝇族Merodontini和迷蚜蝇族Milesiini不具单系性,其余13个族均具单系性。(4)齿腿蚜蝇族的11个属中,仅Cepa属、Austrocheilosia属和Lyneborgimyia属在分析中缺失,其余属的拓扑结构显示齿腿蚜蝇族为多系,并分为4个分支。(5)齿腿蚜蝇族的第一个分支包括平颜蚜蝇属Eumerus、直腿蚜蝇属Azpeytia、齿腿蚜蝇属Merodon、Megatrigon属和Platynochaetus属,其中仅直腿蚜蝇属具单系性并独立位于该分支的基部;而其余4个属之间的系统发育关系复杂,属内的物种彼此相互嵌合,需要使用更高级的系统发育分析方法,或对相关物种的形态学特征进行更细致的研究从而进行分类学修订,例如重新界定属的界限,或创建新的分类群以更准确地反映物种之间的亲缘关系。考虑到该分支的独特位置(位于蚜蝇科系统树的最基部,且与剩余的蚜蝇科昆虫互为姐妹群)和包含的属种形态及幼虫食性的特征,建议将该分支提升为齿腿蚜蝇亚科Merodontinae。(6)齿腿蚜蝇族的第二个分支仅包含凸唇蚜蝇属Psilota,该属与丽角蚜蝇族Callicerini聚为一支,和部分迷蚜蝇族互为姐妹群,但与齿腿蚜蝇族的其他成员关系较远,结合形态学数据,建议将凸唇蚜蝇属从齿腿蚜蝇亚科中排除,但由于迷蚜蝇族不具单系性,凸唇蚜蝇属在管蚜蝇亚科内的确切地位仍不确定。(7)齿腿蚜蝇族剩余的两个分支分别包含Alipumilo属和Nausigaser属,Alipumilio属和Nausigaster属系统发育地位靠近树的基部,与巢穴蚜蝇亚科、平颜蚜蝇属、齿腿蚜蝇属、直腿蚜蝇属、Megatrigon属、Platynochaetus属聚为一支,但均与齿腿蚜蝇族的其他成员成为并系,根据这些属与其他蚜蝇科成员的系统发育距离,建议将这两个属从齿腿蚜蝇族中排除;结合之前形态学的研究,建议将Nausigaser属归入巢穴蚜蝇族中,但Alipumilo属的分类学地位,后续需补充更多的代表类群,以获得更全面的系统发育和分类信息。

关键词：齿腿蚜蝇族单拷贝直系同源基因线粒体基因 cox1条形码系统发育

基于比较转录组研究太行菊属物种的适应性分化

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基于比较转录组研究太行菊属物种的适应性分化

作者：叶航山西师范大学

学位级别：硕士

物种分化是产生生物多样性的基础和前提,是进化生物学的核心议题与研究热点。太行菊属（Opisthopappus Shih）,为中国太行山所特有,属下包括长裂太行菊（Opisthopappus longilobus）与太行菊（Opisthopappus taihangensi）两种。太行山... 详细信息

物种分化是产生生物多样性的基础和前提,是进化生物学的核心议题与研究热点。太行菊属（Opisthopappus Shih）,为中国太行山所特有,属下包括长裂太行菊（Opisthopappus longilobus）与太行菊（Opisthopappus taihangensi）两种。太行山独特的生态环境使其成为研究局域尺度下物种适应性分化的理想材料。本文中,通过比较转录组分析以及环境影响分析,鉴定了两物种间的差异表达基因与正选择直系同源基因,同时筛选出对太行菊属植物适应性分化可能存在重要作用的关键气候因子。长裂太行菊与太行菊转录组组装后分别产生5.35E+05条和2.64E+05条Unigene,这些Unigene注释在NR（长裂太行菊:37.48%;太行菊:35.19%）、GO（长裂太行菊:18.65%;太行菊:12.25%）、KEGG（长裂太行菊:1.22%;太行菊:2.38%）、egg NOG（长裂太行菊:34.24%;太行菊:37.66%）、Swiss-Prot（长裂太行菊:46.36%;太行菊:48.47%）数据库。在太行菊属植物中共鉴定出3410个差异表达基因,其中,长裂太行菊相对于太行菊,1925个基因显著上调表达,1485个基因显著下调表达。差异表达基因被显著富集在代谢过程、能量传递、信号转导、环境适应等GO term与KEGG pathway。长裂太行菊样本与太行菊样本中鉴定出59753对单拷贝直系同源基因,其中有5832对直系同源基因受到正向选择。正选择直系同源基因被显著富集在转录调节、结合细胞物质或成分、光合作用、多糖合成等生物学途径。表达量变化最显著的前十个差异表达基因中,Unigene c286931＿g1＿i1在太行菊中上调表达,在长裂太行菊中下调表达,且被显著富集在光合作用、碳水化合物代谢、内源刺激响应、化学物质响应4个GO term以及碳水化合物代谢和磷酸戊糖途径两个KEGG pathway中。单拷贝直系同源基因对GR37042受到正向选择,且同时被显著富集在6个GO term（DNA结合、转录活性调节、DNA结合转录活性调节、细胞核、含核酸复合物代谢过程）以及1个KEGG pathway（转录因子）中。根据比对结果,前者是果糖-1,6-二磷酸酶而后者是CCAAT盒结合因子。推测这两类基因对太行菊属植物的生态适应性分化可能具有关键作用,并将其视为候选基因。环境影响分析结果表明,当地的环境异质性影响了太行菊属物种间的遗传分化。Mantel检验,MMRR分析,以及db RDA分析均显示,遗传距离与地理、环境距离显著相关,环境变量对遗传变异的解释率达到60%以上。解释变量的前向选择结果表明,bio6（最冷月份的最低温度）与bio14（最干燥月份的降水量）是影响太行菊属植物遗传分化的重要气候因子。

关键词：太行菊属转录组差异表达基因单拷贝直系同源基因适应性分化气候因子

基于转录组数据的巴山松成种机制与适应性研究

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基于转录组数据的巴山松成种机制与适应性研究

作者：韩洁西北大学

学位级别：硕士

巴山松（Pinus henryi Mast.）,为我国特有珍稀亚热带针叶松,是1902年Master根据Henry在湖北房县采集的6909号标本命名的。主要分布于湖北西部、四川东北部及陕西南部之大巴山区,因此得名巴山松。本文基于高通量测序技术,从转录组水平... 详细信息

巴山松（Pinus henryi Mast.）,为我国特有珍稀亚热带针叶松,是1902年Master根据Henry在湖北房县采集的6909号标本命名的。主要分布于湖北西部、四川东北部及陕西南部之大巴山区,因此得名巴山松。本文基于高通量测序技术,从转录组水平对巴山松及其近缘种进行分析,为巴山松的成种机制和生态适应性研究提供更多的理论依据。主要研究内容和结果如下:巴山松、马尾松和油松转录本去冗余后,分别得到16814,18458,18553条Unigene。这些Unigene与NR、GO、COG、Swiss-Prot、KEGG、Egg NOG等库进行比对,分别有33904、23179、14889、24699、14975和32516条Unigene得到注释。获得注释信息的Unigene共计34078条,占总数的63.31%,注释效果较好。共获得5,822,246个SNP标记,用于巴山松分类地位和成种机制分析。结果显示基于SNPs的主成分分析将这三种松树区分开来;Admixture分析结果证明了巴山松有来自油松和马尾松组分的混入,但依然独立的分类学地位;系统发育树等分析结果同样证明了巴山松独立种的分类地位。f3杂交检测结果说明了巴山松个体形成来源于杂交,双亲分别为油松和马尾松。Treemix和D、Nm基因流模型结果也证实了油松、巴山松和马尾松之间存在大量的基因交流,巴山松可能是两者的杂交产物。使用DESeq来鉴别差异表达基因,巴山松作为实验组,油松为对照组,共检测到1528个差异表达的基因,包括756个上调基因和772个下调基因。这些基因被显著富集在防御反应、代谢过程、信号转导、转录调控等GO term与KEGG pathway。确定了油松和巴山松之间共有438个候选单拷贝直系同源基因,其中72对受到正向选择,选取部分正向选择基因进行GO注释,结果显示正向选择基因主要参与的是代谢过程、酶活性、转录调控和结合功能。通过Pcadapt、Bayenv2以及Lfmm分析,分别找到了1920个,982个和1143个受选择位点。对所有筛选出来的位点取交集,得到共同识别位点44个,其中26个SNP位点能够注释到具体功能,这些位点有位于与适应性相关的功能基因上,包括转运蛋白、转录因子和转移酶家族的成员。最后筛选出对巴山松适应性分化可能有重要作用的气候因子,同时利用多变量冗余性分析影响遗传分化的自然选择和中性因素。结果显示最暖季度降水量（Precipitation of Warmest Quarter,Bio18）是对巴山松影响最大的气候因子。另外,迁移因素IBC协同地理因素IBD是遗传变异分布格局产生的主要驱动力,就IBD与IBC之间而言,IBC的作用更强些。

关键词：巴山松转录组差异表达基因单拷贝直系同源基因适应性分化

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口蘑科的系统学及我国该科的属种多样性研究

口蘑科的系统学及我国该科的属种多样性研究

拟口蘑属的系统发育位置、属下分类和物种多样性（蘑菇目）

中国菌物学会2023年学术年会

作者：崔杨洋丁晓霞徐鑫杨祝良中国科学院昆明植物研究所

口蘑科Tricholomataceae是一个世界广布且分类较为困难的大科,该科真菌具有重要的生态、经济和科研价值。多数该科物种为树木生长必需的外生菌根菌,松茸***等不少物种又是著名的食用菌,豹斑口蘑***等物种误食会导致中毒或危及生命。该... 详细信息

口蘑科Tricholomataceae是一个世界广布且分类较为困难的大科,该科真菌具有重要的生态、经济和科研价值。多数该科物种为树木生长必需的外生菌根菌,松茸***等不少物种又是著名的食用菌,豹斑口蘑***等物种误食会导致中毒或危及生命。该科曾是个包罗万象的大科,基于形态和分子曾开展了大量研究,但其下各个分支之间的系统发育亲缘关系仍不清晰,其中物种丰富的口蘑属的属下分类和物种划分仍然存在较大争议,我国对该科的属种多样性的认识就更加欠缺。本研究对采自全国各地的1100余份标本进行了详尽研究,1)利用多基因分子系统学和形态学证据,发现口蘑科是个自然的单系,其下共有11个属级支系,我国分布有5个属,分别为口蘑属Tricholoma、白桩菇属Leucopaxillus、假口蘑属Pseudotricholoma、白口蘑属Albomagister和假小孢伞属Pseudobaeospora,其中口蘑属为该科最大的属。2)基于浅层基因组测序筛选了600个单拷贝直系同源基因构建了口蘑属高度解析的系统发育框架,综合形态解剖、生态、地理分布等特征,首次明确了口蘑属的共衍征,提出了该属下分4亚属11组的新分类系统,确定了属下分亚属和组的关键形态性状。3)利用"形态-分子-生态"标准,界定和描述了我国口蘑科82个物种,明确了我国该科的食毒菌种类和各物种的地理分布规律。本研究对明确口蘑科的范围、解析口蘑属的系统关系及认识我国该科的属种多样性具有重要科学意义,对食用菌资源保护利用和毒菌预防具有重要应用价值。

关键词：单拷贝直系同源基因高度解析系统发育框架属种多样性精准分类

来源： cnki会议评论

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拟口蘑属的系统发育位置、属下分类和物种多样性（蘑菇目）