检索结果-南通市图书馆

中国科学：化学 2015年第4期45卷 419-426页

作者：边玉坤赵南蓉四川大学原子与分子物理研究所成都610064 四川大学化学学院成都610064

单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了拉断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象.本文立足一维广义朗之万方程,描述在拉伸力作用下大分子体系构象态转变动力学,结合分数高斯噪声和幂律摩擦记忆内... 详细信息

单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了拉断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象.本文立足一维广义朗之万方程,描述在拉伸力作用下大分子体系构象态转变动力学,结合分数高斯噪声和幂律摩擦记忆内核,引入构型涨落的亚扩散特征;借助Kramers速率理论,推导含时反应速率k(t,F)、非单指数衰减残存概率分布S(t,F)以及恒速拉伸力作用下的拉断力分布p(F)等,揭示动力学无序效应;将理论应用于DNA解链的单分子拉伸力实验研究,采用漏斗势能模型,拟合不同恒速拉伸力作用下的拉断力分布曲线,估算体系的本征反应速率和势能面特征参数;与Bell公式,以及基于马尔可夫近似的介观统计理论进行系统比较.结果表明,本文建立的动力学无序理论能很好地拟合实验结果,解释单分子拉伸力作用下DNA解链拉断力分布的宽尾特征,揭示了该动力学无序效应与DNA构型慢涨落亚扩散机制的内在关联.

关键词：单分子拉伸力实验 DNA解链动力学无序广义郎之万方程构型涨落亚扩散

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

动力学无序理论在单分子拉伸力实验中的应用

动力学无序理论在单分子拉伸力实验中的应用

引用

中国化学会第29届学术年会

作者：赵南蓉边玉坤董运红四川大学化学学院

单分子拉伸力实验常用于探测大分子反应,如蛋白质解折叠等的本征速率及本征活化能信息。大分子反应动力学过程同时伴随着大分子构型的慢变化,导致速率含时涨落,即动力学无序现象。我们基于广义朗之万方程,引入分数高斯噪声及幂律摩擦内... 详细信息

单分子拉伸力实验常用于探测大分子反应,如蛋白质解折叠等的本征速率及本征活化能信息。大分子反应动力学过程同时伴随着大分子构型的慢变化,导致速率含时涨落,即动力学无序现象。我们基于广义朗之万方程,引入分数高斯噪声及幂律摩擦内核,描述在恒力和恒速拉伸力作用下蛋白质解折叠动力学过程。采用Kramers速率理论,计算了含时速率,等候时间分布,折叠态的残存概率分布,拉断力分布以及平均拉断力等,揭示了解折叠过程的非单指数动力学特征,并计算了动力学无序带来的偏离。进一步,我们将动力学无序理论应用于泛素蛋白解折叠动力学的单分子拉伸力实验研究。结合构型涨落的亚扩散特征,拟合等候时间分布及残存概率分布的非单指数衰减。结果表明,动力学无序理论能够在合理的参数条件下很好地拟合实验数据。同时,通过比对不同拉伸力作用下的残存概率分布,我们估算了体系的本征能垒高度以及过渡态与折叠态之间的距离,与分子动力学模拟的结果基本吻合。研究结果表明动力学无序效应是正确分析单分子拉伸力实验的重要因素。

关键词：单分子拉伸力实验动力学无序构型涨落亚扩散广义郎之万方程 Kramers速率理论

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

DNA逃逸α-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究

DNA逃逸α-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究

引用

中国化学会第30届学术年会-第十九分会：化学中的量子与...

作者：边玉坤赵南蓉四川大学原子与分子物理研究所四川大学化学学院

DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳米孔涨落的半... 详细信息

DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳米孔涨落的半径决定归因于纳米孔构象在多个亚态之间的跃迁。运用一维广义朗之万方程,结合高斯分数噪声和幂律摩擦内核引入构象亚扩散描述瓶颈半径的随机演化。计算与实验结果可以直接比较的非单指数的平均残存概率、逃逸时间分布以及平均逃逸时间。将建立的理论应用于DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验研究,拟合DNA逃逸过程中的非单指数衰减的残存概率。结果表明,我们的理论能够在整个时间区域很好地拟合实验,估算了合理的本征动力学参数。涨落模型对DNA穿越纳米孔的非单指数动力学提供了更深层次的理解,并为类似受限空间中的俘获和逃逸问题提供了新的思路和视角。

关键词：动力学无序涨落瓶颈模型广义朗之万方程构象涨落亚扩散

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

单分子拉伸力作用下DNA解链动力学无序的涨落瓶颈模型研究

单分子拉伸力作用下DNA解链动力学无序的涨落瓶颈模型研究

引用

中国化学会第29届学术年会

作者：边玉坤李昊赵南蓉四川大学原子与分子物理研究所四川大学化学学院

单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了剪断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象。基于Zwanzig涨落瓶颈模型（fluctuating bottleneck model）,假设解链过程的速率与DNA构型开—合态密切相关,正... 详细信息

单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了剪断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象。基于Zwanzig涨落瓶颈模型（fluctuating bottleneck model）,假设解链过程的速率与DNA构型开—合态密切相关,正比与沿反应通道的瓶颈面积。采用一维广义朗之万方程描述瓶颈半径的随机涨落,受到与构型慢涨落密切相关的分数高斯噪声的影响。采用随机泛函分析方法,求解得到恒速拉伸力作用下的剪断力分布。拟合不同恒速拉伸力实验数据,确定本征动力学参数。结果发现,涨落瓶颈模型能很好地解释单分子拉伸力作用下DNA解链动力学的剪断力分布的宽尾特征,揭示了该动力学无序效应与DNA构型涨落亚扩散机制的内在关联。

关键词：单分子拉伸力实验 DNA解链动力学无序广义朗之万方程涨落瓶颈模型

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

大分子反应中的动力学无序效应与单分子力检测

大分子反应中的动力学无序效应与单分子力检测

引用

中国化学会第28届学术年会

作者：赵南蓉郑跃赖鑫昱李平四川大学化学学院

＜正＞大分子反应过程常常伴随着动力学无序现象,即跃迁速率在测量的时间标尺内发生大尺度的涨落,体现为速率常数随时间发生变化。另外,通过单分子力实验分析[1],可以得到反应的本征速率和活化能垒的动力学信息[2-5]。为纳入动力学无序... 详细信息

＜正＞大分子反应过程常常伴随着动力学无序现象,即跃迁速率在测量的时间标尺内发生大尺度的涨落,体现为速率常数随时间发生变化。另外,通过单分子力实验分析[1],可以得到反应的本征速率和活化能垒的动力学信息[2-5]。为纳入动力学无序对速率的影响,我们

关键词：单分子力实验大分子反应动力学动力学无序 Kramers速率理论

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：