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刺参养殖池塘患病区域沉积物菌群结构与功能特征

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生态学杂志 2023年第8期42卷 1936-1943页

作者：林志萍周叶青张靖婧王荦刘艳霞丁君常亚青大连海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室辽宁大连116023

为探究刺参养殖池塘患病区域沉积物菌群结构与功能特征,本文采用高通量测序技术开展同一刺参养殖池塘患病区域与正常区域沉积物菌群结构与功能共性及特异性研究。结果表明:与正常区域相比,患病区域刺参养殖池塘沉积物菌群多样性无显著差... 详细信息

为探究刺参养殖池塘患病区域沉积物菌群结构与功能特征,本文采用高通量测序技术开展同一刺参养殖池塘患病区域与正常区域沉积物菌群结构与功能共性及特异性研究。结果表明:与正常区域相比,患病区域刺参养殖池塘沉积物菌群多样性无显著差异,但丰富度显著下降(P刺参养殖池塘沉积物优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);患病区域沉积物特异性菌群则主要隶属于放线菌门(Actinobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria),以假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、弧菌属(Vibrio)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、Aliivibrio为代表;基于KEGG代谢通路注释,患病区域与正常区域刺参养殖池塘沉积物菌群代谢通路存在差异,其中有36条三级代谢通路呈现出显著性差异(P刺参养殖池塘沉积物菌群结构与功能存在显著性差异,其中弧菌、假交替单胞菌和葡萄球菌等条件致病菌的增殖加大了刺参患病的风险。

关键词：刺参养殖池塘沉积物菌群高通量测序

刺参TRAF7基因克隆及其响应高温胁迫下的表达特征分析

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渔业科学进展 2024年

作者：赵岩峰廖梅杰葛建龙王锦锦王印庚荣小军李彬谭颜廷青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室上海海洋大学水产与生命学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室

肿瘤坏死因子受体相关因子7 (tumor necrosis factor receptor associated factor7， TRAF7)作为一种细胞内蛋白，参与信号转导，并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用，本研究利用c... 详细信息

肿瘤坏死因子受体相关因子7 (tumor necrosis factor receptor associated factor7， TRAF7)作为一种细胞内蛋白，参与信号转导，并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用，本研究利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)，克隆了刺参TRAF7 (AjTRAF7)全长cDNA序列，分析了其结构特征和在基因组中的分布，并检测了该基因在刺参不同组织和高温胁迫过程中体壁组织中的表达变化情况。结果显示，AjTRAF7全长2 576 bp，开放阅读框(ORF)长1 770 bp，5′UTR长345 bp，3′UTR长461 bp，编码589个氨基酸，预测蛋白分子量为65.6 kDa，理论等电点(pI)为7.52。蛋白序列包含1个RING finger结构域、1个Coiled coil结构域和6个WD40结构域，N端包含1个螺旋区域。该基因预测蛋白包含41个丝氨酸磷酸化位点、20个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点，蛋白N端具有3个天冬酰胺糖基化位点。刺参基因组中比对到2个AjTRAF7基因拷贝，位于同一条染色体上，第一个拷贝包含18个外显子和15个内含子，第二拷贝包含17个外显子和14个内含子。系统进化学分析表明，刺参TRAF7氨基酸序列与蝠海星(Patiria miniata)和紫色球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)相似性较高，分别为40.58%和38.37%，刺参与蝠海星和紫色球海胆聚在一支。qRT-PCR结果显示，AjTRAF7在健康刺参各组织中均有表达，其在雌性性腺中表达量最高，体腔细胞中表达量次之，在呼吸树、体壁、肠道、雄性性腺和纵肌中表达量依次降低，各组织间表达量差异显著(P刺参应对高温胁迫的表达调控过程，相关结果将为解析刺参应对高温胁迫的分子机制提供科学依据。

关键词：刺参 TRAF7 高温胁迫基因克隆表达特征

刺参双通道自清洁循环水养殖系统构建与饲料中海泥比例确定

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广东海洋大学学报 2023年第3期43卷 82-88页

作者：李浩周红朱建新刘洋崔正国陈世波大连海洋大学水产与生命学院辽宁大连116023 中国水产科学研究院黄海水产研究所山东青岛266071 山东恒兴渔业发展有限公司山东潍坊262714 青岛卓越海洋集团有限公司山东青岛266408

【目的】构建刺参(Apostichopus japonicus)高效清洁的循环水养殖系统,并探究不同料泥质量比对刺参生长的影响,为刺参工厂化循环水养殖提供新的工艺实验数据。【方法】通过测定养殖水体中的亚硝氮和氨氮浓度、刺参生长指标、肠道消化酶... 详细信息

【目的】构建刺参(Apostichopus japonicus)高效清洁的循环水养殖系统,并探究不同料泥质量比对刺参生长的影响,为刺参工厂化循环水养殖提供新的工艺实验数据。【方法】通过测定养殖水体中的亚硝氮和氨氮浓度、刺参生长指标、肠道消化酶活性指标等的变化,分析确定刺参循环水养殖系统中饵料适宜的料泥质量比。【结果与结论】在120 d的养殖过程中,所构建的循环水养殖系统自清洁效果明显,养殖水质良好,NH_(4)^(+)-N(≤0.289 mg/L)与NO_(2)^(-)-N(≤0.025 mg/L)质量浓度均在适合刺参生长的安全浓度范围内,刺参的平均增重率达43.70%。实验初期,随饲料中料泥质量比增加,刺参生长速率降低,但60 d后,料泥质量比1∶3和1∶2的实验组刺参保持快速生长,而料泥质量比1∶4和1∶1的刺参生长相对缓慢。实验结束时,料泥质量比1∶3和1∶2组的刺参肠道淀粉酶、脂肪酶、胰蛋白酶活力均显著高于其他两组(P刺参工厂化循环水养殖具有可行性,且最优料泥质量比为1∶3,此时刺参肠道内的消化酶活性较高、生长速率最快。

关键词：刺参自清洁附着基循环水养殖系统料泥质量比消化酶

刺参germ cell-less基因表达分析及转录因子预测

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渔业科学进展 2023年第6期44卷 203-213页

作者：黄孝枭刘炳正孙志惠丛晶晶苏唯一魏金亮大连海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室辽宁大连116023

不同性别的刺参(Apostichopus japonicus)在生长速度、免疫能力等方面具有显著差异,解析其性别决定和性别分化机制具有重要的理论和经济价值。目前,刺参的性腺发育机制尚不清晰,挖掘性腺发育相关基因是解析其发育机制的重要途径。研究表... 详细信息

不同性别的刺参(Apostichopus japonicus)在生长速度、免疫能力等方面具有显著差异,解析其性别决定和性别分化机制具有重要的理论和经济价值。目前,刺参的性腺发育机制尚不清晰,挖掘性腺发育相关基因是解析其发育机制的重要途径。研究表明,germ cell-less基因在哺乳动物性腺发生中起重要作用,但无脊椎动物中关于germ cell-less基因的研究较少。本研究从刺参基因组中鉴定了germ cell-less (Ajgcl)基因片段,随后通过c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE)获得其全长c DNA序列。通过荧光定量PCR (real-time quantitative PCR,RT-q PCR)揭示了Ajgcl在成体组织中呈现泛表达状态,性腺中表达量最高,且雌性性腺中的表达量是雄性性腺中表达量的2.25倍。随着卵子的发生,Ajgcl的表达量呈现先上升后下降的动态表达变化,而在精子发生的过程中其表达量变化不大,意味着其可能在卵子发生过程中发挥重要作用。在整个胚胎发育过程中均能检测到Ajgcl转录本,意味着Ajgcl作为母源因子可能与原始生殖细胞的形成有关。此外,Ajgcl基因启动子中具有Oct-1、FOXD3、PAX-6、CRP、c-Myb和NF-1等转录因子的结合位点。本研究为深入解析germ cell-less基因在刺参等无脊椎动物性腺发育中发挥的功能奠定了基础。

关键词：刺参 germ cell-less 生殖细胞母源因子

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刺参不同酶解产物的抗氧化活性分析

现代食品科技 2023年第7期39卷 53-59页

作者：倪明龙闫瑞峰王永丽李威广东食品药品职业学院实验实训中心广东广州510520 苏州中西医结合医院心血管内科江苏苏州215000 广东食品药品职业学院化妆品与艺术设计学院广东广州510520 广东食品药品职业学院中药学院广东广州510520

为了探究刺参不同酶解产物的抗氧化活性,外源添加了3种蛋白酶(碱性蛋白酶、中性蛋白酶、木瓜蛋白酶)酶解鲜活刺参。测定了不同蛋白酶组的水解度、分子量分布、3种自由基(DPPH·、O_(2)^(-)·、·OH)的清除率。结果表明:空白组水解度随... 详细信息

为了探究刺参不同酶解产物的抗氧化活性,外源添加了3种蛋白酶(碱性蛋白酶、中性蛋白酶、木瓜蛋白酶)酶解鲜活刺参。测定了不同蛋白酶组的水解度、分子量分布、3种自由基(DPPH·、O_(2)^(-)·、·OH)的清除率。结果表明:空白组水解度随着酶解时间的延长没有明显差异,蛋白酶组的水解度与酶解时间呈正相关关系,不同蛋白酶组水解度高低顺序为,中性蛋白酶>碱性蛋白酶>木瓜蛋白酶,中性蛋白酶组最高为19.4%,木瓜蛋白酶组最低为16.1%;酶解后大分子量片段减少,刺参蛋白利用率的有效方式。

关键词：刺参酶解产物抗氧化活性

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刺参对生境的选择性及其行为生理响应

水生生物学报 2022年第6期46卷 847-855页

作者：姜玉山宋亚彩方玲吕菲张沛东中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室青岛266003

在室内模拟环境条件下,研究了刺参(Apostichopus japonicus)对鳗草(Zostera marina)、裸沙和石块生境的选择性和偏好性,比较分析了刺参在不同生境的平均聚集率、行为特征(爬行、摄食与排泄行为)和生理状态(刺参肌肉ATP含量、体腔液多巴... 详细信息

在室内模拟环境条件下,研究了刺参(Apostichopus japonicus)对鳗草(Zostera marina)、裸沙和石块生境的选择性和偏好性,比较分析了刺参在不同生境的平均聚集率、行为特征(爬行、摄食与排泄行为)和生理状态(刺参肌肉ATP含量、体腔液多巴胺、肾上腺素、去甲肾上腺素和皮质醇含量)。结果显示:(1)刺参对鳗草生境的选择和偏好显著高于裸沙生境与石块生境,其在鳗草生境的平均聚集率达到64%,是裸沙生境的4.5倍;(2)刺参在鳗草生境的行为活动显著高于石块生境与裸沙生境,其爬行行为和摄食行为的出现频率是石块生境的2倍,排泄行为明显,刺参粪便的长度和厚度分别是裸沙生境的1.9倍和2.5倍;(3)刺参在鳗草生境的肌肉ATP含量是裸沙生境和石块生境的2倍。结果表明,刺参对鳗草生境具有明显的选择性,其在鳗草生境行为活跃,免疫功能提高,说明鳗草草床是刺参绿色生态牧场构建的优良生境。

关键词：平均聚集率行为特征生理状态儿茶酚胺类激素鳗草刺参

刺参响应灿烂弧菌侵染差异microRNAs鉴定及靶基因分析

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渔业科学进展 2023年第2期44卷 107-117页

作者：畅孟阳李彬荣小军王锦锦于永翔王印庚廖梅杰张正范瑞用刘清兵上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266071 青岛瑞滋集团有限公司山东青岛266409

microRNA参与基因的转录后调控,在真核生物的生长发育、细胞分化和免疫防御等过程中发挥重要作用。刺参(Apostichopusjaponicus)病害问题已成为产业发展的主要限制因素之一,而其病害发生的分子机制尚待进一步完善。本研究以刺参重大疾... 详细信息

microRNA参与基因的转录后调控,在真核生物的生长发育、细胞分化和免疫防御等过程中发挥重要作用。刺参(Apostichopusjaponicus)病害问题已成为产业发展的主要限制因素之一,而其病害发生的分子机制尚待进一步完善。本研究以刺参重大疾病“腐皮综合征”的重要致病原灿烂弧菌(Vibriossplendidus)为侵染菌株,通过人工侵染实验制备患病刺参样本,采用miRNA-seq技术对侵染组(PT16S)和对照组(PT10H)各3头刺参的体壁组织进行miRNA测序,通过相关生物信息学软件对miRNAs进行鉴定和分析,筛选差异表达miRNAs (DEmiRNAs)并预测其靶基因,构建关键调控途径的miRNA-mRNA调控网络。结果显示,PT10H组平均得到5 902 588条有效序列,194个已知miRNA和19个新的miRNA;PT16S组平均得到5 053 529条有效序列,182个已知miRNA和42个新的miRNA。对2组鉴定到的miRNA进行差异表达分析,共筛选到2个上调和11个下调的具有显著差异的DEmiRNAs(P≤0.05),上调的DEmiRNAs靶基因预测结合到3010个靶基因,注释到585个GO terms及24条信号通路(P≤0.05),下调的DEmiRNAs靶基因预测到19 072个靶基因,注释到514个GOterms以及22条信号通路(P≤0.05)。对筛选到的DEmiRNAs进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)验证,显示miRNA-seq与qRT-PCR的一致率达到70%。根据KEGG分析结果构建泛素介导的蛋白水解途径和Notch信号通路的miRNA-mRNA调控网络,结果显示,13个DEmiRNAs分别靶向结合134个与泛素介导的蛋白水解相关的m RNAs和109个与Notch信号通路相关的m RNAs,Aja-miR-184、Aja-miR-2478和Aja-miR-9277p等DEmiRNAs可能参与对Notch信号通路和对泛素介导的蛋白水解的调控。相关研究结果将为刺参疾病发生调控网络建立和机制解析提供依据。

关键词：刺参 microRNA 灿烂弧菌胁迫应答靶基因 miRNA-mRNA调控网络

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刺参肠道组织结构及消化酶活性研究

大连海洋大学学报 2022年

作者：王涵王浩娜赵业烟台大学海洋学院

为了探索刺参肠道组织结构与功能之间的关系，采用常规石蜡组织切片、苏木素-伊红(H.E)染色法、阿利新蓝-过碘酸雪夫（AB-PAS）染色法及酶学方法研究了刺参肠道不同部位的组织结构、黏液细胞分布和消化酶活性。结果表明：刺参肠道由黏... 详细信息

为了探索刺参肠道组织结构与功能之间的关系，采用常规石蜡组织切片、苏木素-伊红(H.E)染色法、阿利新蓝-过碘酸雪夫（AB-PAS）染色法及酶学方法研究了刺参肠道不同部位的组织结构、黏液细胞分布和消化酶活性。结果表明：刺参肠道由黏膜层、黏膜下层、肌层和浆膜层组成，其中前肠黏膜层和肌层厚度显著高于中肠和后肠（P刺参肠道不同部位均包含Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型黏液细胞，且以Ⅲ型和Ⅳ型黏液细胞为主，总黏液细胞数量从前肠至后肠呈递减趋势，前肠四种类型黏液细胞数量均显著高于后肠（P刺参前肠消化吸收能力最强，中肠较弱。后肠分泌能力较强，具有一定的黏膜免疫保护功能。

关键词：刺参肠道组织学消化酶活性

刺参3个盐度相关microRNA及预测靶基因的表达模式分析

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大连海洋大学学报 2022年第2期37卷 212-220页

作者：王研高思祺匡倩瑶刘怡宁田燚大连海洋大学水产与生命学院辽宁大连116023

为研究低盐胁迫对刺参Apostichopus japonicus(16.38 g±1.27 g)体内离子浓度及钠钾ATP酶活力的影响,以及低盐胁迫与miRNA间的调控关系,试验取低盐度(18)胁迫0(对照)、6、24、48 h时的刺参体腔液,测定其钠、氯、钾离子浓度及钠钾ATP酶... 详细信息

为研究低盐胁迫对刺参Apostichopus japonicus(16.38 g±1.27 g)体内离子浓度及钠钾ATP酶活力的影响,以及低盐胁迫与miRNA间的调控关系,试验取低盐度(18)胁迫0(对照)、6、24、48 h时的刺参体腔液,测定其钠、氯、钾离子浓度及钠钾ATP酶活力。结果表明:低盐胁迫后,刺参体腔液中钠离子浓度在6 h时显著升高(P刺参miR-124、miR-2011和miR-20103个盐度相关的miRNAs序列相对保守,且在盐度胁迫后均能够被诱导表达,从而参与刺参盐度胁迫的响应过程。

关键词：刺参盐度胁迫 miRNA序列分析 miRNA基因表达