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Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*) 376T等位基因高分辨熔解曲线检测方法的建立及分布频率研究

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中国输血杂志 2022年第7期35卷 690-693页

作者：王贞贾双双廖志坚莫春妍魏玲张润青罗广平姬艳丽广州血液中心广州市血液安全重点实验室广东广州510091

目的建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标... 详细信息

目的建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标本作为阳性对照,不携带该突变的野生型标本作为阴性对照,建立该等位基因的高分辨熔解曲线(HRM)检测方法。应用建立的方法对广州地区献血人群的DNA标本进行筛查,对筛查出携带ABCG2^(*)376T等位基因的标本进行测序确证,以验证HRM方法的准确性。结果成功建立可检测ABCG2^(*)376T等位基因,并可同时对纯合子及杂合子进行准确分型的HRM方法,在1 560例广州地区献血者中筛查出携带杂合型等位基因个体15例,尚未筛查出携带纯合型等位基因的个体。结论 HRM方法可用于准确筛查ABCG2^(*)376T等位基因并进行分型,该等位基因在中国人群的分布频率约为0.48%(15/3120)。

关键词： Jr(a-)血型 ABCG2^(*)376T等位基因高分辨熔解曲线分布频率

四川盆地稻瘟病菌无毒基因分布频率与变异分析

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四川盆地稻瘟病菌无毒基因分布频率与变异分析

中国东北地区汉族癫痫患者HLA-B*1502等位基因分布频率

中国植物病理学会2019年学术年会

作者：胡孜进李燕樊晶黄衍焱王文明四川农业大学水稻研究所

稻瘟病是水稻生产上的重大病害之一,每年都造成水稻产量的严重损失。四川盆地寡日照、小温差及高湿度的气候特点,使得稻瘟病常年多发,成为制约水稻安全生产的瓶颈问题。为明确四川盆地无毒基因的分布及变异情况,以采自四川盆地东北部营... 详细信息

稻瘟病是水稻生产上的重大病害之一,每年都造成水稻产量的严重损失。四川盆地寡日照、小温差及高湿度的气候特点,使得稻瘟病常年多发,成为制约水稻安全生产的瓶颈问题。为明确四川盆地无毒基因的分布及变异情况,以采自四川盆地东北部营山、通江和大竹地区的共238个稻瘟菌菌株的基因组DNA为模板,用5个无毒基因（AVR-Pik,AVR-Pi9,AVRPii,AVR-Pib,AVR-Pi54）的特异引物进行PCR检测及测序分析。结果表明,这5个基因的检出率分别为100%,98.32%,34.03%,100%和100%。其中通江和大竹菌株的AVR-Pik基因型均为含有AVR-Pik-A和AVR-Pik-D两个拷贝的混合型,而营山的菌株主要由AVR-Pik-E组成。对AVR-Pib基因PCR产物测序分析显示,有135个菌株在启动子区域存在转座子Pot3的插入;而检测出的AVR-Pii,AVR-Pi9和AVR-Pi54的PCR产物测序分析暂未发现插入、缺失及单碱基变异等。后续将对四川盆地其他地区的无毒基因分布及变异情况进行分析,从而对水稻抗病品种的合理布局提供参考。

关键词：稻瘟菌无毒基因分布频率基因变异品种布局

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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中国临床药理学杂志 2013年第2期29卷 98-99,103页

作者：何晓静汝继玲肇丽梅中国医科大学附属盛京医院药学部沈阳110004

目的研究中国东北地区汉族癫痫患者HLA-B*1502等位基因分布的频率。方法用聚合酶链反应DNA序列分析法,对125例中国东北地区汉族癫痫患者DNA标本进行HLA-B基因分型。结果 125例DNA标本中,共检测出34种不同的HLA-B等位基因。其中,2例患者... 详细信息

目的研究中国东北地区汉族癫痫患者HLA-B*1502等位基因分布的频率。方法用聚合酶链反应DNA序列分析法,对125例中国东北地区汉族癫痫患者DNA标本进行HLA-B基因分型。结果 125例DNA标本中,共检测出34种不同的HLA-B等位基因。其中,2例患者携带HLA-B*1502等位基因。HLA-B*1502等位基因在中国东北地区癫痫患者中的分布频率为1.6%。其他分布频率较高的等位基因分别为HLA-B*4001、B*4601、B*4801、B*1302和B*4002。结论东北地区癫痫患者中HLA-B*1502等位基因分布频率(1.6%)与其在北京地区健康汉族人群中的分布频率近似(1.5%);但远低于其在中国中部、西部及南部地区的分布频率。

关键词： HLA-B＊1502 分布频率汉族癫痫患者

糖尿病视网膜病变中医证型分布频率的Meta分析

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湖南中医药大学学报 2021年第3期41卷 439-446页

作者：肖莉匡文轩刘晓清彭俊彭清华晏峻峰湖南中医药大学湖南长沙410208 中医药防治眼耳鼻喉疾病湖南省重点实验室湖南长沙410007 湖南省中医药防治眼耳鼻咽喉疾病与视功能保护工程技术研究中心湖南长沙410007 湖南中医药大学第一附属医院湖南长沙410007

目的系统客观定量地分析糖尿病视网膜病变中医证型分布频率,为其先验概率分布情况提供循证医学依据。方法通过中国知网、维普、万方、CBM、PubMed、Embase等数据库检索关于糖尿病视网膜病变中医证型的相关文献,检索时限设定为建库至2020... 详细信息

目的系统客观定量地分析糖尿病视网膜病变中医证型分布频率,为其先验概率分布情况提供循证医学依据。方法通过中国知网、维普、万方、CBM、PubMed、Embase等数据库检索关于糖尿病视网膜病变中医证型的相关文献,检索时限设定为建库至2020年6月4日,采用双人双机独立检索并交叉核对,并采用Rev Man 5.3软件进行Meta分析。结果共纳入文献25篇,研究对象3350例。Meta分析结果显示:气阴两虚、脉络瘀阻证的分布频率为0.45[95%CI(0.33,0.58)];气阴两虚证的分布频率为0.44[95%CI(0.35,0.53)];瘀血阻滞证的分布频率为0.31[95%CI(0.17,0.49)];湿浊中阻证的分布频率为0.24[95%CI(0.01,0.47)];阴津不足、燥热内生证的分布频率为0.23[95%CI(0.04,0.42)];阴阳两虚证的分布频率为0.19[95%CI(0.15,0.23)];肝肾亏虚证的分布频率为0.17[95%CI(0.11,0.25)];阴阳两虚、血瘀痰凝证的分布频率为0.12[95%CI(0.07,0.19)];阴虚内热证的分布频率为0.05[95%CI(0.01,0.20)]。亚组分析结果显示:气阴两虚证在不同区域的分布情况的差异有统计学意义(P分布情况的差异有统计学意义(P分布频率最高;气阴两虚证的分布情况存在地域差异;肝肾亏虚证、阴阳两虚证的分布频率与病程有关。

关键词：糖尿病视网膜病变中医证型 Meta分析分布频率

西南地区稻瘟病菌群体遗传多样性分析及其毒性相关基因分布频率初步预测

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西南地区稻瘟病菌群体遗传多样性分析及其毒性相关基因分布频率初...

作者：颜学海四川农业大学

学位级别：硕士

由稻瘟病菌（Magnapothe oryzae）引起的稻瘟病是世界水稻生产中三大毁灭性病害之一,也是西南地区一季稻常见的流行性病害之一。该病害在贵州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地发生率非常高。因此,致力于稻瘟病菌群体遗传结构及其... 详细信息

由稻瘟病菌（Magnapothe oryzae）引起的稻瘟病是世界水稻生产中三大毁灭性病害之一,也是西南地区一季稻常见的流行性病害之一。该病害在贵州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地发生率非常高。因此,致力于稻瘟病菌群体遗传结构及其多样性的研究、掌握其毒性相关基因的出现频率,对于品种选育、合理布局和延长抗病品种的使用寿命等方面都具有重要的意义。本研究通过对西南地区8个县（市）所采集到的穗颈瘟标样进行病菌分离,选用13对SSR引物和16对毒性相关基因特异性引物对病原菌基因组DNA进行PCR扩增。根据反应的结果,建立基于SSR序列和毒性相关基因序列的0-1数据库,通过一系列软件对病原菌群体遗传结构及遗传多样性进行分析,并根据扩增结果初步预测毒性相关基因的分布频率,得到如下结论：1、通过分离得到200个单孢分离菌株。其中四川雅安52株,温江37株,南充33株,自贡6株;重庆永川25株,垫江24株,梁平15株;贵州湄潭8株。2、8对SSR引物都能扩增出特异性条带,扩增频率较高,大部分在95.00%以上;16对毒性相关基因特异性引物均能扩增出目的条带,扩增频率差异较大。3、西南地区稻瘟病菌群体遗传结构复杂,层次丰富。200个供试菌株可以归为90个不同的单元型,包括1个绝对优势单元型,22个次要单元型,67个稀有单元型。在0.90遗传相似水平下划分为24个遗传宗谱,包括1个绝对优势宗谱、5个亚优势宗谱、7个次要宗谱和11个小宗谱。8个区域稻瘟病菌的单元型和遗传宗谱都非常丰富。相同来源的菌株能够构成不同的单元型和遗传宗谱,同一单元型和遗传宗谱的菌株来源也不尽相同,各区域内的菌株在群体遗传结构上反映出一定的特异性和明显的多样性。4、通过遗传参数分析显示西南地区稻瘟病菌的遗传多样性比较丰富。在群体平均水平上,有效等位基因数目（Ne）为1.4466,Nei’s基因多样性指数（H）为0.2753,Shannon信息指数（I）为0.4291,多态性位点数（NP）为28个,多态位点百分率（P）为96.50%。不同区域之间,各群体的遗传多样性水平具有一定差异。来源于南充的稻瘟病菌群体具有较高的遗传多样性,其次是自贡、永川、雅安相对较高,而温江和垫江相对较低,梁平和湄潭区域最低。5、西南地区稻瘟病菌群体存在一定的遗传分化,群体内多样性大于群体间多样性,且总遗传变异的40.14%存在于群体间,59.86%存在于群体内（Gst=0.4014）。6、Nei（1972）无偏倚遗传距离范围为0.0357～0.6173,遗传相似度范围为0.5394-0.9649,8个群体间的平均遗传距离为0.1901,平均遗传相似度为0.8383。8个区域稻瘟病菌群体亲缘关系由近到远依次为雅安、南充、垫江、梁平、湄潭、温江、永川和自贡。7、各致病基因特异性引物在群体间和群体内的扩增频率差异都较大,大部分无毒基因特异性引物在群体间和群体内的扩增频率差异较大,据此初步预测各毒性相关基因在群体中的分布频率,为聚合育种、品种布局、延长抗病品种的使用寿命提供一定的参考。

关键词：稻瘟病菌遗传多样性微卫星标记致病基因无毒基因分布频率

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云南地区肾移植受者HLA基因分布频率分析

检验医学与临床 2021年第19期18卷 2841-2844页

作者：蒲丹潘永圣汪佳婕许小靓徐宏忍赵云平尹利民昆明市第一人民医院检验科云南昆明650011

目的探讨云南地区肾移植受者人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率。方法收集2017年6月至2020年11月该院1251例肾移植受者HLA基因检测结果,分析HLA-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率。结果HLA-A位点检出等位... 详细信息

目的探讨云南地区肾移植受者人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率。方法收集2017年6月至2020年11月该院1251例肾移植受者HLA基因检测结果,分析HLA-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率。结果HLA-A位点检出等位基因17种,其中A*11、A*02和A*24分布频率较高,分别为0.3145、0.2802和0.1930。HLA-B位点检出等位基因31种,其中B*15、B*40和B*46分布频率较高,分别为0.1926、0.1199和0.1199。HLA-DRB1位点检出等位基因14种,其中DRB1*12、DRB1*04、DRB1*09分布频率较高,分别为0.2178、0.1399和0.1171。HLA-DQB1位点检出等位基因7种,其中DQB10301、DQB1*05和DQB1*06分布频率较高,分别为0.2866、0.2010和0.1671。结论云南地区肾移植受者HLA-A、B、DRB1和DQB1位点中,A*11、B*15、DRB1*12和DQB10301分别为分布频率最高的等位基因,符合南方汉族人群HLA基因多态性的分布特征。

关键词：肾移植受者人类白细胞抗原等位基因分布频率

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慢性咳嗽病因的构成及其分布频率的季节差异

慢性咳嗽病因的构成及其分布频率的季节差异

作者：李院玲延安大学

学位级别：硕士

目的：探讨慢性咳嗽的病因构成及各病因分布频率的季节差异性，为慢性咳嗽的诊断与治疗提供经验。方法：收集延安大学附属医院2012年3月到2013年2月呼吸内科门诊诊治的慢性咳嗽患者91例，所有患者均符合：咳嗽时间≥8周且以咳嗽为主要... 详细信息

目的：探讨慢性咳嗽的病因构成及各病因分布频率的季节差异性，为慢性咳嗽的诊断与治疗提供经验。方法：收集延安大学附属医院2012年3月到2013年2月呼吸内科门诊诊治的慢性咳嗽患者91例，所有患者均符合：咳嗽时间≥8周且以咳嗽为主要或唯一症状;胸部X线检查未见明显异常;年龄13岁80岁;非吸烟者。且排除：孕期或哺乳期女性;存在慢性阻塞性肺疾病、肺结核、肺炎等已经明确病因的慢性咳嗽疾病病史;伴严重心、肝、肾功能不全者。以我国2009年版“咳嗽的诊断与治疗指南”中慢性咳嗽的诊断流程为指导，结合本院实际情况对91例慢性咳嗽患者进行病因诊断，并行针对病因的特异性治疗。病因确立后再按4个季节进行分组，分析比较各季节慢性咳嗽病因分布频率的季节差异。结果：本研究符合病例入选与排除标准、能够配合完成本研究慢性咳嗽病因诊断流程，且资料完整者91例，其中男性41例，女性50例，年龄1669岁，平均年龄（4012）岁，咳嗽时间中位数6（2120个月）。最终能够确定病因诊断者87例（95.6%），病因明确者中，单一病因者78例（89.7%），双重病因者7例（8.0%），三重病因者2例（3.3%），4例患者病因未明（4.4%），包括复合病因在内，总计慢性咳嗽病因102例次，各病因中以上气道咳嗽综合症（UACS，又称鼻后滴流综合症，PNDS）、咳嗽变异性哮喘（CVA）、感染后咳嗽（PIC）、嗜酸粒细胞性支气管炎（EB）多见。2012年3月到2013年2月慢性咳嗽病因分布UACS以冬季最多见，其次为春季，秋季低于春季，夏季分布频率最低（2=9.302，P=0.026）;CVA以春季最多见，秋季次之，夏季和冬季无差异（2=8.206， P=0.042），UACS和CVA分布频率存在季节差异（P0.05），其它病因分布频率无显著季节差异。结论：1.慢性咳嗽的病因繁多复杂，且涉及面广，UACS、CVA、PIC、EB、ACEI类药物诱发的咳嗽是引起慢性咳嗽的主要病因，上述病因（包括单一和复合病因）占慢性咳嗽总病因的85.3%。2.2012年3月到2013年2月延安大学附属医院呼吸内科就诊的102例次慢性咳嗽病因中，UACS和CVA的分布频率随季节而不同，了解这一变化规律，可能有助于慢性咳嗽的诊断和防治。

关键词：慢性咳嗽病因构成分布频率季节差异

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单中心肾移植受者HLA抗原分布频率分析

中华移植杂志（电子版） 2019年第1期13卷 50-53页

作者：马锡慧肖漓韩永孙玉洁傅凌云刘培霞石炳毅中国人民解放军总医院第八医学中心全军器官移植研究所移植研究室北京市器官移植与免疫调节重点实验室北京100091

目的分析肾移植受者HLA-A、B、DR和DQ抗原分布频率。方法收集2017年1月至2018年6月在解放军总医院第八医学中心接受肾移植的791例受者HLA抗原检测数据,分析HLA-A、B、DR和DQ抗原种类和分布频率。结果 HLA-A抗原共出现18种,其中A2、A11和... 详细信息

目的分析肾移植受者HLA-A、B、DR和DQ抗原分布频率。方法收集2017年1月至2018年6月在解放军总医院第八医学中心接受肾移植的791例受者HLA抗原检测数据,分析HLA-A、B、DR和DQ抗原种类和分布频率。结果 HLA-A抗原共出现18种,其中A2、A11和A24(9)抗原分布频率较高,分别为30.59%、17.83%和15.68%;A2403、A34(10)和A66(10)抗原分布频率最低,均为0.06%。HLA-B抗原共出现42种,其中分布频率最高的是B13(12.64%),分布频率最低的是B44、B41和40∶40(均为0.06%)。HLA-DR抗原共出现16种,其中DR15(2)、DR4和DR12(5)分布频率较高,分别为14.60%、13.65%和13.40%;DR6分布频率最低(0.19%);DR15(2)与DQ6(1)具有强连锁反应(90.48%)。HLA-DQ抗原共出现7种,DQ7(3)抗原分布频率最高(24.91%),DQ8(3)分布频率最低(5.50%)。结论肾移植受者HLA-A、B、DR和DQ抗原中,A2、B13、DR15(2)和DQ7(3)分别为分布频率最高的抗原。分析HLA抗原分布频率有利于寻找HLA匹配的供者。

关键词：肾移植 HLA抗原分布频率等位基因基因多态性

龟纹瓢虫不同斑型在寄主作物的分布频率及捕食反应

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昆虫知识 2010年第4期47卷 705-709页

作者：潘悦周兴苗陈华爽雷朝亮湖北省昆虫资源利用与害虫可持续治理重点实验室武汉430070

本研究调查了龟纹瓢虫Propylea japonica(Thunberg)色斑变型在蚕豆、小麦和玉米田的分布频率,并对其捕食反应进行测定。结果表明,在3种作物中,龟纹瓢虫斑型种类有锚斑变型ancora、双二变型dionea、肩斑变型feliciae、鼎斑变型tessellat... 详细信息

本研究调查了龟纹瓢虫Propylea japonica(Thunberg)色斑变型在蚕豆、小麦和玉米田的分布频率,并对其捕食反应进行测定。结果表明,在3种作物中,龟纹瓢虫斑型种类有锚斑变型ancora、双二变型dionea、肩斑变型feliciae、鼎斑变型tessellate和黄缘变型marginata。其中,锚斑变型在3种作物中所占比率均为最大,约占采集总数的44.87%,而黄缘变型最少,仅占0.60%。不同作物中4种主要斑型的雌虫比率在30.47%～60.71%之间,锚斑变型的雌虫比率均小于50%。不同色斑型的龟纹瓢虫取食相同食物后,各斑型的雌虫食蚜数、日增重和摄食效率高于雄虫。锚斑变型的雄虫比肩斑变型的雄虫捕食蚜虫多,肩斑变型的雌虫摄食效率高于双二变型的雌虫。

关键词：龟纹瓢虫色斑变型寄主作物分布频率捕食反应