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我国辽宁省赫坎按蚊种团的分子鉴别研究

寄生虫与医学昆虫学报 2009年第4期16卷 224-227页

作者：马颖马雅军孟祥梅张稷博梁刚陕西师范大学生命科学学院西安710062 第二军医大学病原生物学教研室上海200433 辽宁省疾病预防控制中心沈阳110005

为更新和补充辽宁省按蚊多样性的本底资料，笔者对2008年在辽宁省5个地点采集的按蚊进行形态和PCR分子鉴别，并随机抽取已鉴别的和未获鉴别的样本，进行rDNA—ITS2序列测定和分析。本研究共鉴别了168个个体，均为赫坎按蚊种团成员种，... 详细信息

为更新和补充辽宁省按蚊多样性的本底资料，笔者对2008年在辽宁省5个地点采集的按蚊进行形态和PCR分子鉴别，并随机抽取已鉴别的和未获鉴别的样本，进行rDNA—ITS2序列测定和分析。本研究共鉴别了168个个体，均为赫坎按蚊种团成员种，分别是中华按蚊（n=14）、雷氏按蚊（n=4）、八代按蚊（n=113）、比伦按蚊（n=2）和克莱按蚊（n=35）。

关键词：赫坎按蚊分子鉴别 rDNA-ITS2 辽宁

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美花石斛种质资源的RAPD分子鉴别

美花石斛种质资源的RAPD分子鉴别

2006海峡两岸暨CSNR全国第七届天然药物资源学术研...

作者：白音王文全孙志蓉包英华武孔媛北京中医药大学中药学院韶关学院英东生物工程学院

美花石斛Dendrobium loddigesii Rolfe为兰科(Orchidaceae)石斛属多年生草本植物,又称环草石斛、粉花石斛或耳环石斛等,主要分布于贵州、广西、云南和广东等省区。利用美花石斛加工生产的药材,是我国常用名贵中药材,具有滋阴清热、益胃... 详细信息

美花石斛Dendrobium loddigesii Rolfe为兰科(Orchidaceae)石斛属多年生草本植物,又称环草石斛、粉花石斛或耳环石斛等,主要分布于贵州、广西、云南和广东等省区。利用美花石斛加工生产的药材,是我国常用名贵中药材,具有滋阴清热、益胃生津和润肺止咳等功效,主要含有多糖、生物碱和Stilbenoids类等化学成分。

关键词：野生药用植物美花石斛种质资源分子鉴别

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24份番茄育种材料的分子鉴别及遗传分析

24份番茄育种材料的分子鉴别及遗传分析

中国园艺学会2011年学术年会

作者：孙兆法黄婷婷刘炳禄黄胜雄闫留华刘淑芹李平张永志青岛市农业科学研究院中国科学院遗传与发育生物学研究所

利用SSR和CAPS分子标记技术研究了24份番茄(Solanum lycopersicum L.)育种材料的遗传多样性。2009年8月播种,出苗后用C1AB小量法提取基因组DNA。利用1对SSR和10对CAPS引物进行分子标记。用NTSYS软件分析计算出材料间的相似系数和遗传距... 详细信息

利用SSR和CAPS分子标记技术研究了24份番茄(Solanum lycopersicum L.)育种材料的遗传多样性。2009年8月播种,出苗后用C1AB小量法提取基因组DNA。利用1对SSR和10对CAPS引物进行分子标记。用NTSYS软件分析计算出材料间的相似系数和遗传距离并做出分子标记聚类图。生长表型以历年调查数据为准,分别调查植株生长类型、果形、果色、果实大小、苗期叶色、茎毛多少、长势、果实耐贮性等8个性状。

关键词：番茄分子鉴别分子聚类性状聚类遗传距离

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沙苑子与其混伪品的ITS序列分子鉴别研究

中国现代中药 2015年第7期17卷 668-672,682页

作者：张乐朱虹韦坤华张春红李旻辉内蒙古科技大学包头医学院内蒙古包头014060 内蒙古自治区特色药用植物培育与保护工程技术研究中心内蒙古包头014060 广西壮族自治区药用植物园广西药用资源保护与遗传改良重点实验室广西南宁530023

目的：研究沙苑子与其混伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法：采集不同产地的沙苑子药材10份，基原植物2份，达乌里黄芪3份，蒙古黄芪4份，直立黄芪3份，混伪品猪屎豆和凹叶野百合各1份，所有样品进行总DNA的提取，PCR扩增，并对扩增产物... 详细信息

目的：研究沙苑子与其混伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法：采集不同产地的沙苑子药材10份，基原植物2份，达乌里黄芪3份，蒙古黄芪4份，直立黄芪3份，混伪品猪屎豆和凹叶野百合各1份，所有样品进行总DNA的提取，PCR扩增，并对扩增产物进行测序得到相应的序列，用MEGA计算其种间的K-2-P距离，最后利用ITS序列构建其系统发育树。结果：测得了24份样品的ITS序列全长，分别为沙苑子644～688bp，蒙古黄芪为646～673bp；直立黄芪685—687bp；达乌里黄芪为676～688bp；猪屎豆为785bp；凹叶野百合为837bp。通过以ITS序列重建系统进化树进行的聚类分析可以将沙苑子与其混伪品有效的区分开。用MEGA软件基于ITS序列构建的沙苑子与其混伪品间的遗传距离分析得到了沙苑子与达乌里黄芪的种间K-2-P距离0．0802；蒙古黄芪为0．0812，与直立黄芪之间的遗传距离为0．0824，凹叶野百合和猪屎豆与沙苑子的遗传距离稍大，达到0．2362和0．2299。用MEGA软件测定沙苑子种内遗传距离为0．0010。此外，对通过测定种间的遗传距离发现，蒙古黄芪与直立黄芪种间的遗传距离最小为0．0009，与猪屎豆种问的遗传距离最大为0．2362。结论：ITS序列能够成功鉴定沙苑子及其混伪品，可以作为沙苑子与其混伪品的分子鉴别方法。

关键词：沙苑子 ITS序列分子鉴别

我国杂鳞库蚊复组（Culex vishnui Complex）的分子鉴别——核糖体DNA第二内转录间隔区序列及三带喙库蚊地理株遗传多态性分析

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我国杂鳞库蚊复组（Culex vishnui Complex）的分子鉴别——核糖...

中国昆虫学会2002年学术年会

作者：杨明陈汉彬贵阳医学院生物学教研室贵阳医学院生物学教研室

＜正＞杂鳞库蚊复组（Culex vishnui Complex）由数种近缘种组成,其中三带喙库蚊（Cx.tritaeniorhynchus）被证实为乙型脑炎病毒的主要传播媒介。该复组成员在形态学上难以区分,分类学上尚有争议,亟待从分子水平上予以解决。1998-2002... 详细信息

＜正＞杂鳞库蚊复组（Culex vishnui Complex）由数种近缘种组成,其中三带喙库蚊（Cx.tritaeniorhynchus）被证实为乙型脑炎病毒的主要传播媒介。该复组成员在形态学上难以区分,分类学上尚有争议,亟待从分子水平上予以解决。1998-2002年用PCR、DNA直接测序和RAPD—PCR等分子生物学方法对杂鳞库蚊复组分类上有争论的一些问题进行了探讨,建立了三带喙库蚊、环带库蚊（Cx.annulus）

关键词：杂鳞库蚊复组分子鉴别 PCR方法

PCR扩增rDNA-28S等位基因以分子鉴别溪流按蚊复合体成员种

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国外医学（寄生虫病分册） 2005年第3期32卷 140-141页

作者：王冬

溪流按蚊(广义)是印度最主要的传疟媒介，依据细胞学分类，即2号多线染色体臂内固定倒位，可分为S、T和U等独立的3种，以上3种在分布地、刺叮偏好和疟疾传播中存在明显差异。溪流按蚊S种是高山和森林地区主要嗜人血按蚊(密度约占90％)... 详细信息

溪流按蚊(广义)是印度最主要的传疟媒介，依据细胞学分类，即2号多线染色体臂内固定倒位，可分为S、T和U等独立的3种，以上3种在分布地、刺叮偏好和疟疾传播中存在明显差异。溪流按蚊S种是高山和森林地区主要嗜人血按蚊(密度约占90％)和高效的传疟媒介，自然群体中具较高的子孢子感染率，其余2种均偏嗜动物血，被认为其媒介能力低或为非媒介。

关键词：溪流按蚊 Singh PCR扩增 Nanda 分子鉴别等位基因成员种复合体 Med OP Am 传疟媒介细胞学分类多线染色体疟疾传播森林地区内固定感染率子孢子动物血

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三种细茎类石斛药材的分子生物学鉴别

遵义医科大学学报 2020年第4期43卷 452-456页

作者：陆安静曾瑶杜艺玫秦琳鲁艳柳张倩茹谭道鹏何芋岐遵义医科大学国家级药学实验教学示范中心药学实验室贵州遵义563099 遵义医科大学基础药理教育部重点实验室暨特色民族药教育部国际合作联合实验室贵州遵义563099

目的针对目前细茎类石斛的植物分类较为困难,商品药材来源鉴别难度大,建立3种常用细茎类石斛的分子生物学鉴别方法。方法采用PCR扩增的方法对3种细茎类石斛样品进行ITS序列的扩增并经单向测序,进行聚类、亲缘关系分析。结果9个石斛样本... 详细信息

目的针对目前细茎类石斛的植物分类较为困难,商品药材来源鉴别难度大,建立3种常用细茎类石斛的分子生物学鉴别方法。方法采用PCR扩增的方法对3种细茎类石斛样品进行ITS序列的扩增并经单向测序,进行聚类、亲缘关系分析。结果9个石斛样本明显分为三类,罗河石斛(1、2、3)聚为一类,铁皮石斛(4、5、6)聚为一类,细茎石斛(7、8、9)聚为一类。细茎石斛与铁皮石斛的亲缘关系较近,与罗河石斛的亲缘关系较远,罗河石斛与铁皮石斛的亲缘关系最远。结论以ITS序列为DNA条形码可以快速准确地鉴别3种细茎类石斛来源,为解决细茎类石斛的分类异议提供参考,并保障石斛药材的来源准确。

关键词：石斛 ITS序列 DNA条形码分子鉴别

紫苏属药用植物的rDNA ITS区SNP分子标记与位点特异性PCR鉴别

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紫苏属药用植物的rDNA ITS区SNP分子标记与位点特异性PCR鉴别

第六届全国药用植物和植物药学术研讨会

作者：罗玉明张卫明丁小余沈洁保曙琳褚必海毛善国南京师范大学生命科学学院中华供销合作总社南京野生植物综合利用研究院

目的分析单种属——紫苏属各变种间rDNA ITS区的序列以及存在的单核苷酸多态性(SNP)现象, 设计出位点特异性PCR引物,用于紫苏属各变种间的分子标记鉴别。方法对紫苏属各变种多个体的rDNA ITS 区全序列进行了准确测定,运用Clustral X 1．... 详细信息

目的分析单种属——紫苏属各变种间rDNA ITS区的序列以及存在的单核苷酸多态性(SNP)现象, 设计出位点特异性PCR引物,用于紫苏属各变种间的分子标记鉴别。方法对紫苏属各变种多个体的rDNA ITS 区全序列进行了准确测定,运用Clustral X 1．8、MEGA 3．0进行排序并进行SNP分析,从而设计出鉴别各变种的等位基因位点特异性PCR鉴别引物。结果紫苏属各变种(紫苏、白苏、鸡冠苏、耳齿紫苏等)的rDNA ITS区全序列共有615—618bp的长度,ITS1为233—235bp,5．8S为179bp,ITS2为203—204bp,GC含量为61．5％-61．9％。从rDNA ITS区碱基变异的整体情况来看,紫苏属各变种间不仅在非编码的转录间隔区 ITS1、ITS2内存在非编码区单核苷酸多态性(ncSNP),而且在保守的5．8S编码区内也存在3个位点的单核苷酸多态性,即编码区SNP(cSNP),所有的SNP均只具2等位多态性。5．8S区cSNP的出现与产生该变异的变种出现的显著形态差异关联。本文还利用这些SNP位点设计出了鉴别紫苏属各变种的位点特异性PCR引物, 无需测序即可对紫苏属的原植物及“苏子”、“苏叶”等药材及商品进行有效准确的分子鉴别。结论紫苏属植物rDNA ITS区存在的SNP可用作紫苏属各变种鉴别的分子标记。

关键词：紫苏属 rDNA ITS区单核苷酸多态性（SNP）位点特异性PCR 分子鉴别

赣南油茶EST-SSR分子标记的开发及遗传多样性分析

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赣南油茶EST-SSR分子标记的开发及遗传多样性分析

作者：廖初琴广州大学

学位级别：硕士

油茶(Camellia oleifera Abel.)是多年生常绿灌木或乔木,原产于中国,具有悠久的栽植历史和广泛的种植面积,是重要的木本油料经济作物。我国已成功选育了一些优良无性系,如江西省赣州市林科所的“赣州油系列”,但选育的优良无性系之间遗... 详细信息

油茶(Camellia oleifera Abel.)是多年生常绿灌木或乔木,原产于中国,具有悠久的栽植历史和广泛的种植面积,是重要的木本油料经济作物。我国已成功选育了一些优良无性系,如江西省赣州市林科所的“赣州油系列”,但选育的优良无性系之间遗传背景较狭窄,幼苗及种子等离体材料难以根据形态特征进行辨别,严重影响到赣南油茶系列产品的推广以及我国油茶良种化进程。本研究通过对赣南油茶进行转录组测序,开发具有多态性的SSR分子标记,并对其SSR-PCR反应体系进行了优化,对赣南油茶19个品系进行了遗传多样性分析,并构建了指纹图谱进行分子鉴别。主要结果如下:对GLS赣州油4号、赣州油9号、赣州油23号、单籽油茶、攸县油茶、越南油茶进行转录组测序,共获得38.43 Gb数据,总长度、平均长度、N50以及GC含量分别为115 860 769 bp、963 bp、1 569 bp和42.10%;共获得120 202个Unigenes,在Nr、Nt、Swiss Prot、KEGG、KOG、Pfam、GO数据库中进行Blast比对,分别比对到89 522、91 640、59 200、63 239、61 777、57 869、66 370个Unigenes;检测出64 399个CDS,利用MISA软件共检测到了50 519个SSR位点分布于34 550个Unigenes,SSR的出现频率为42.03%,平均距离为2.29 kb,基序类型丰富,以二核苷酸重复为主。采用正交实验设计对赣南油茶SSR-PCR反应体系进行了优化,得到最优反应体系总体系为20μL:2×Taq PCR Master mix 9μL、dd HO 7μL、正反引物各1.5μL、DNA模板1μL。根据SSR位点利用Premier 3设计了29 122对引物,筛选获得201对引物,经琼脂糖凝胶电泳初筛发现有86对SSR引物能稳定扩增,毛细管电泳复筛得到21对引物扩增结果较稳定、多态性较好。利用开发的21对EST-SSR分子标记对19个赣南油茶群体共265份种质进行了遗传多样性、遗传分化、遗传结构分析及DNA指纹图谱的构建。从整体上的分析看赣南油茶群体的遗传多样性较丰富,绝大部分品系间存在中等程度的遗传分化,部分品系间的亲缘关系较近。通过AMOVA分析发现赣南油茶的遗传变异多发生在群体内。基于贝叶斯模型的Structure遗传结构分析将19个赣南油茶品系分为3类,并没有完全按品系进行划分且赣南油茶品系间杂合程度较高。UPGMA聚类分析发现在遗传距离0.12附近时,可分为赣州油16号(S16)和其它赣南油茶品系两类。利用引物组合法构建了赣南油茶品系的指纹图谱,可将19个赣南油茶品系区分开。综上,本研究开发了21对EST-SSR分子标记,为今后相关研究提供了丰富的标记来源,利用EST-SSR分子标记对赣南油茶有效地进行了遗传多样性等分析,并构建了相应的指纹图谱,为准确快速地鉴别赣南油茶提供了分子依据,有助于加快赣南油茶分子标记辅助育种工作进程及对其进一步的开发利用。

关键词：赣南油茶 SSR分子标记遗传多样性分子鉴别