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用RAPD分子标记鉴别黑木耳菌种的研究

菌物研究 2006年第4期4卷 54-56页

作者：张介驰马庆芳张丕奇韩增华孔祥辉戴肖东黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江哈尔滨150010

运用RAPD技术,选用20个寡核苷酸引物对我所供应的8个黑木耳生产菌株进行了分子鉴别。结果表明:在选用的20个随机引物中,有10个引物能对8个供试黑木耳菌株扩增出清晰、稳定的DNA谱带。用NTSYS软件进行聚类分析,在相似水平为0．70阈值时,... 详细信息

运用RAPD技术,选用20个寡核苷酸引物对我所供应的8个黑木耳生产菌株进行了分子鉴别。结果表明:在选用的20个随机引物中,有10个引物能对8个供试黑木耳菌株扩增出清晰、稳定的DNA谱带。用NTSYS软件进行聚类分析,在相似水平为0．70阈值时,可将供试的8个黑木耳菌株归为3个组群。

关键词： RAPD技术黑木耳分子鉴别聚类分析

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15个代料栽培香菇菌株的分子鉴别

食用菌学报 2002年第3期9卷 5-8页

作者：黄志龙谢宝贵谢福泉付瑞洲福建省食用菌菌种站福州350003 福建农林大学生命科学学院福州350002

以福建省已认定的 15个代料栽培香菇菌株为材料 ,用 5 0个随机引物对其进行RAPD分析。结果表明 ,5 0个随机引物中 ,S11、S2 2、S2 3、S2 9、S31、S33、S4 2、S4 3、S4 5和S4 7可以获得重复性好、具有多态性的理想图谱。以S4 2作为引物... 详细信息

以福建省已认定的 15个代料栽培香菇菌株为材料 ,用 5 0个随机引物对其进行RAPD分析。结果表明 ,5 0个随机引物中 ,S11、S2 2、S2 3、S2 9、S31、S33、S4 2、S4 3、S4 5和S4 7可以获得重复性好、具有多态性的理想图谱。以S4 2作为引物进行扩增 ,产生的多态性DNA片段作为分子标记 ,可以有效地鉴别

关键词：代料栽培香菇菌株分子鉴别 RAPD

用ISSR分子标记鉴别黑木耳生产菌株的研究

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用ISSR分子标记鉴别黑木耳生产菌株的研究

首届全国食用菌中青年专家学术交流会

作者：马庆芳张介驰张丕奇戴肖东孔祥辉韩增华王玉文黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所黑龙江省科学院应用微生物研究所

利用ISSR分子标记对黑木耳生产菌株进行了分子鉴别,研究结果表明:在选用的20个UBC-ISSR引物中,有10 个引物能对供试的27个黑木耳菌株基因组DNA进行扩增,获得的指纹图谱清晰稳定、多态性强。用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平在0．75时,... 详细信息

利用ISSR分子标记对黑木耳生产菌株进行了分子鉴别,研究结果表明:在选用的20个UBC-ISSR引物中,有10 个引物能对供试的27个黑木耳菌株基因组DNA进行扩增,获得的指纹图谱清晰稳定、多态性强。用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平在0．75时,可将27个供试黑木耳菌株分为3个组群。研究结果说明ISSR分子标记,可以有效地用于黑木耳生产菌株快速准确的鉴别,是黑木耳指纹图谱分析的理想手段。

关键词： ISSR 黑木耳生产菌株分子鉴别聚类分析

来源： cnki会议评论

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中药半夏的DNA分子与分子鉴别

中药半夏的DNA分子与分子鉴别

作者：曹晖刘玉萍毕培曦邵鹏柱香港中文大学生物系及中医中药研究所

目的:分析半夏[Pinellia ternata(Thunb.)Breit.]的核基因组18SrRNA基因核苷酸序列,以中药半夏正品基原进行分子鉴别。方法:采用PCR直接测序技术测定半夏及其伪品的18S rRNA基因序列并作DNA序列变异分析。结果:半夏和伪品虎掌的18S rRN... 详细信息

目的:分析半夏[Pinellia ternata(Thunb.)Breit.]的核基因组18SrRNA基因核苷酸序列,以中药半夏正品基原进行分子鉴别。方法:采用PCR直接测序技术测定半夏及其伪品的18S rRNA基因序列并作DNA序列变异分析。结果:半夏和伪品虎掌的18S rRNA序列长度均为1805bp,两者存在4个变异位点,而且在半夏18SrRNA序列中有一个限制性内切酶AseⅠ识别位点,通过PCR-RFLP图谱分析可以区别两者。结论:通过DNA序列和PCR-RFLP图谱差异分析,可对半夏正品基原进行准确而有效的分子鉴别。

关键词：半夏 18S rRNA基因 DNA分析分子鉴别

来源： cnki会议评论

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马铃薯疮痂病菌不同致病种的分子鉴别

马铃薯疮痂病菌不同致病种的分子鉴别

中国植物病理学会2017年学术年会

作者：杨德洁邱雪迎关欢欢赵伟全刘大群河北农业大学植物保护学院河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心

马铃薯疮痂病(Potato common scab)是由植物病原链霉菌引起的一种重要经济性病害,不但影响马铃薯的外观和品质,而且会降低薯块的商品价值。马铃薯疮痂病的病原菌较为复杂,目前国内外已报道十多种疮痂病原链霉菌可引起马铃薯疮痂病,对这... 详细信息

马铃薯疮痂病(Potato common scab)是由植物病原链霉菌引起的一种重要经济性病害,不但影响马铃薯的外观和品质,而且会降低薯块的商品价值。马铃薯疮痂病的病原菌较为复杂,目前国内外已报道十多种疮痂病原链霉菌可引起马铃薯疮痂病,对这些病原菌目前还缺乏有效的分子鉴别方法。笔者在前期工作中从我国不同地区已经采集并纯化到大量不同的病原菌菌株,本研究对4个不同致病种的分子区别方法进行了探索。根据NCBI的GenBank数据库中已登记的疮痂病菌特有毒素合成基因簇中的基因及16S rRNA序列及16S3S ITS区域序列设计不同致病种的特异性引物,对选择的致病种Streptomyces scabies(典型菌株CPS-1)、Streptomyces diastatochromogeness(典型菌株Sd-2)、Streptomyces turgidiscabies(典型菌株St-2)、Streptomyces acidiscabies(典型菌株CPS-3)等4个典型菌株的基因组进行扩增。挑选Tm值相近且扩增产物长度不同,特异性和稳定性较高的的引物,经温度梯度筛选和优化反应体系后,获得了4对不同致病种的检测引物D1/D2、T1/T2、A1/A2、S3/S4,扩增产物大小分别为1 280bp、723bp、468bp、252bp。利用4对引物和引物组合可以对以上4种致病菌进行快速分子鉴定。为验证检测方法的实用性,本研究分别对含有马铃薯疮痂病菌S.scabies、S.turgidiscabies及S.acidiscabies的3个发病地块的土壤样品进行了检测,经土壤DNA小量提取试剂盒提取土壤总基因组DNA,同时用所得4对引物扩增检测,扩增产物的电泳结果表明:3个土壤样品均获得了相应的特异性条带,说明建立的鉴别方法可以对疮痂病菌不同致病种的土壤样品进行有效区分。本研究建立了一种马铃薯疮痂病菌不同致病种快速鉴别的方法,该方法可对疮痂病田土壤进行快速病原定种检测,有助于提高生产中疮痂病菌种类鉴定的检测效率,也为马铃薯疮痂病的病原检测和预测预报提供了新的途径。

关键词：马铃薯疮痂病菌致病种分子鉴别

来源： cnki会议评论

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基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

中国现代中药 2020年第2期22卷 207-212,218页

作者：李珍珍郑司浩尚兴朴邓庭伟王继永赵润怀江西中医药大学江西南昌330004 中国中药有限公司北京100195

目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力。方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系... 详细信息

目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力。方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率。结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析。各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psbA-trnH、ITS、ITS2、rbcL。ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小。Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小。NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开。结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合。本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据。

关键词：甘草属 DNA条形码分子鉴别内转录间隔区

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3个石榴良种的ISSR分子鉴别

贵州农业科学 2019年第1期47卷 94-100页

作者：王庆军罗华毕润霞赵丽娜郝兆祥枣庄市石榴研究中心/枣庄市峄城区果树中心山东枣庄277300

为石榴良种的推广栽植和分子标记辅助选择育种奠定理论基础,采用ISSR分子技术方法,从ISSR随机引物中筛选出8条多态性好、谱带清晰、扩增稳定的引物(UBC834、UBC841、UBC811、UBC835、UBC827、UBC861、UBC840、UBC810)对秋艳、青丽和桔艳... 详细信息

为石榴良种的推广栽植和分子标记辅助选择育种奠定理论基础,采用ISSR分子技术方法,从ISSR随机引物中筛选出8条多态性好、谱带清晰、扩增稳定的引物(UBC834、UBC841、UBC811、UBC835、UBC827、UBC861、UBC840、UBC810)对秋艳、青丽和桔艳3个石榴良种进行ISSR-PCR扩增分析鉴别。结果表明:秋艳良种获得的2条特异性分子标记引物为UBC811和UBC834;青丽、桔艳良种获得的2条特异性分子标记引物为UBC835和UBC840,同时获得了3个石榴良种各自的特征图谱,初步建立了分子鉴别体系。

关键词：石榴良种 ISSR 分子鉴别

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切花月季芽变品种的分子标记与鉴别研究

江苏林业科技 2001年第1期28卷 1-9页

作者：王国良上田善弘巫水钦江苏省林业科学研究院江苏南京211153 日本国立千叶大学园艺学部

现代月季的基因型高度杂合 ,目的基因的定位如同大海捞针 ,形态指标模棱两可的描述比比皆是。为此 ,特别收集了组别 17个 ,品种 45个及相对应的芽变品种进行随机增扩多态DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA ,RAPD)基因分析。结果表明 :1... 详细信息

现代月季的基因型高度杂合 ,目的基因的定位如同大海捞针 ,形态指标模棱两可的描述比比皆是。为此 ,特别收集了组别 17个 ,品种 45个及相对应的芽变品种进行随机增扩多态DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA ,RAPD)基因分析。结果表明 :11个经筛选的人工合成随机引物 ( 10 base)共增扩出基因位点 143个 ,其中多态性位点 93个 ,平均多型性比率高达 6 6 .0 % ;切花月季品种与品种之间 ,特异性RAPD图带清晰稳定 ,极易识别 ;由同一品种变异而来的芽变品种之间 ,特异性位点极少 ,相似性遗传距离非常接近 ,最小为 0 .86 0 7,最大为 1;幼叶DNA双步CTAB提取法有助于提高基因指纹图谱的重现性。这为表型性状较为相近的切花月季芽变品种的分子鉴别提供了可靠的技术手段。

关键词：切花月季 RAPD 分子标记基因指纹图谱芽变品种分子鉴别亲缘关系

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云南主要核桃品种的ISSR分子鉴别

经济林研究 2006年第4期24卷 41-45页

作者：陈少瑜杨恩习学良范志远张雨云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 西南林学院资源学院云南昆明650224 云南省林业科学院经济林研究所云南昆明650204

以核桃当年萌发的新叶为材料,在建立了良好的反应体系基础上,筛选出8条引物对云南省11个主要栽培和推广的核桃品种进行了ISSR分子标记研究。结果表明:8个ISSR引物共检测出位点102个,其中多态性位点62个,占60.78%,参试样品具有较高的多... 详细信息

以核桃当年萌发的新叶为材料,在建立了良好的反应体系基础上,筛选出8条引物对云南省11个主要栽培和推广的核桃品种进行了ISSR分子标记研究。结果表明:8个ISSR引物共检测出位点102个,其中多态性位点62个,占60.78%,参试样品具有较高的多态比率;用其中的两条引物建立了11个品种的指纹图谱,并可用之鉴别参试品种;POPGENE 32软件的计算结果有效等位基因数、基因的多样性和Shannon信息指数分别为1.370 7,0.214 3和0.321 6,供试的云南核桃品种在分子水平上存在比较丰富的遗传变异。

关键词：漾濞核桃品种分子鉴别 ISSR