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基于主成分与分子标记鉴定的樱桃番茄新组合综合评价

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安徽农业科学 2023年第18期51卷 51-54,58页

作者：赵云霞颜秀娟王学梅杨冬艳宁夏农林科学院园艺研究所宁夏银川750002

以28份樱桃番茄组合为试材,通过对15个果实数量性状的主成分分析及对其抗病性的分子标记鉴定进行综合评价,以期为樱桃番茄新品种的选育提供理论参考。结果表明,28份樱桃番茄杂交组合之间均存在明显的遗传差异;通过主成分分析,以方差贡... 详细信息

以28份樱桃番茄组合为试材,通过对15个果实数量性状的主成分分析及对其抗病性的分子标记鉴定进行综合评价,以期为樱桃番茄新品种的选育提供理论参考。结果表明,28份樱桃番茄杂交组合之间均存在明显的遗传差异;通过主成分分析,以方差贡献率大于79%为标准,提取5个主成分累计方差贡献率达79.64%,对主成分因子进行未旋转因子得分,计算各樱桃番茄的综合得分并对其进行排序,以综合得分大于0.9为标准,有A6、A1、A8、A28、A7综合得分位居前5,且通过抗病性分子标记鉴定表明这5个组合均含有10个抗病位点基因,因此这5个组合的综合品质和抗病性均表现较好,适合进一步试种推广。

关键词：樱桃番茄主成分分析分子标记鉴定综合评价

皮球桃黄肉芽变的ISSR和SRAP分子标记鉴定

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基因组学与应用生物学 2020年第11期39卷 5180-5185页

作者：文露王永清邓群仙何珊珊黄艳石丝洪敏张卉四川农业大学园艺学院成都611130

本研究采用ISSR和SRAP两种分子标记方法对皮球桃(Prunus persica)及其黄肉芽变进行分子鉴定,从DNA水平揭示两者的遗传差异。结果显示,39条ISSR引物共扩增出176个位点,多态性比率为9.7%,遗传系数为0.95;224对SRAP引物组合共扩增出444个位... 详细信息

本研究采用ISSR和SRAP两种分子标记方法对皮球桃(Prunus persica)及其黄肉芽变进行分子鉴定,从DNA水平揭示两者的遗传差异。结果显示,39条ISSR引物共扩增出176个位点,多态性比率为9.7%,遗传系数为0.95;224对SRAP引物组合共扩增出444个位点,多态性比率为5.0%,遗传系数为0.97,表明两者的亲缘关系非常相近,遗传背景基本一致。经过反复筛选与多轮PCR鉴定,引物UBC827、UBC848、组合Me4-Em1在皮球桃与黄肉突变体的基因组中稳定扩增出差异条带,说明两者在DNA分子水平确实存在较小程度的差异,遗传物质发生了微小的变异,证明该黄肉突变体桃的确为皮球桃的芽变。

关键词：皮球桃(Prunus persica) 芽变分子标记鉴定 ISSR SRAP

基于EST-SSR标记的金线莲叶色突变体分子身份分析

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东南园艺 2023年第4期11卷 281-285页

作者：樊荣辉陈艺荃钟淮钦叶秀仙福建省农业科学院作物研究所/福建省特色花卉工程技术研究中心福建福州350013 福建省农业科学院农业工程技术研究所福建福州350003

【目的】为金线莲(Anoectochilus roxburghii)从DNA分子水平上探索叶色突变体的遗传差异。【方法】采用EST-SSR分子标记技术对金线莲及其2个叶色突变体进行分子鉴定。【结果】20对SSR引物共扩增出78条谱带,其中3对引物(JXL-6、JXL-14和J... 详细信息

【目的】为金线莲(Anoectochilus roxburghii)从DNA分子水平上探索叶色突变体的遗传差异。【方法】采用EST-SSR分子标记技术对金线莲及其2个叶色突变体进行分子鉴定。【结果】20对SSR引物共扩增出78条谱带,其中3对引物(JXL-6、JXL-14和JXL-16)能稳定扩增出差异条带,多态性条带9条,多态性比率11.54%。【结论】获得的2个叶色突变体为金线莲突变体,叶色突变体与亲本在DNA分子水平差异较小。

关键词：金线莲自然突变分子标记鉴定 SSR

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工业大麻种子及苗期性别鉴定方法的研究

甘肃农业大学学报 2023年第1期58卷 130-136页

作者：孙玉婷丁美云王璐瑶于梦迪李珊珊金忠民张东向刘丽杰齐齐哈尔大学生命科学与农林学院黑龙江齐齐哈尔161006

【目的】探究工业大麻在生产实践中减少雄株比例,提高雌株比例的方法。【方法】通过形态学观察法、生理代谢差异比较、化学物质鉴定法及DNA分子标记鉴定法对工业大麻的种子及未进行性别分化的苗期叶片进行性别鉴定。【结果】通过测定雌... 详细信息

【目的】探究工业大麻在生产实践中减少雄株比例,提高雌株比例的方法。【方法】通过形态学观察法、生理代谢差异比较、化学物质鉴定法及DNA分子标记鉴定法对工业大麻的种子及未进行性别分化的苗期叶片进行性别鉴定。【结果】通过测定雌雄工业大麻叶片中的NADH和TTCH含量发现,雌雄性工业大麻叶片的NADH和TTCH含量差异明显。通过显色反应发现,甲基红染色20 h后,雄麻变为紫红色,雌麻变为黄褐色。溴麝香草酚蓝染色12 h后,雌麻变为草绿色,雄麻变为天蓝色。快蓝B盐染色20 h后,雌叶表层纤毛变成淡红色,雄叶纤毛仍为无色透明态。通过特异性序列OPV-08和SCAR1可鉴定工业大麻种子及苗期的雌雄性。【结论】形态学观察法、生理代谢差异比较、化学物质鉴定法及DNA分子标记鉴定法(特异性序列OPV-08和SCAR1)可用于工业大麻的性别鉴定。

关键词：工业大麻雌雄鉴定形态学观察代谢差异化学物质鉴定分子标记鉴定

蛇胆、鹿类中药材分子标记鉴别及鹿亚科动物的系统学研究

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蛇胆、鹿类中药材分子标记鉴别及鹿亚科动物的系统学研究

作者：刘向华南京师范大学

学位级别：硕士

蛇胆为传统中药，本研究综述了其化学成分、药理研究及鉴定研究进展。并分别从药材蛇胆的胆衣和胆汁中提取DNA，经PCR扩增得到约400bp的12S rRNA基因片段，并测序。结果表明：DNA分子标记技术可用于中药材蛇胆和胆汁的鉴定，提示该技术... 详细信息

蛇胆为传统中药，本研究综述了其化学成分、药理研究及鉴定研究进展。并分别从药材蛇胆的胆衣和胆汁中提取DNA，经PCR扩增得到约400bp的12S rRNA基因片段，并测序。结果表明：DNA分子标记技术可用于中药材蛇胆和胆汁的鉴定，提示该技术也可用于其它动物分泌物类型药材的鉴别。在鹿类中药材研究中，概述了化学成分、药理研究及鉴定研究进展。为建立简便、准确的鹿类中药材的DNA分子标记鉴定方法，在对正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物Cyt b基因全序列分析的基础上，设计了一对用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性引物。用该对引物对鹿类中药材正、混伪品原动物及鹿茸、鹿鞭、鹿筋药材进行PCR鉴定。结果表明：市售鹿类商品药材需加强质量监督和管理。所设计的鉴定引物对梅花鹿和马鹿有很高的特异性，可用于以其为原动物的鹿类中药材的鉴定。最后，根据Cyt b基因的序列分析，探讨了鹿亚科及中国鹿属、马鹿亚种的分子系统进化关系。分析表明：1．斑鹿属并非是单系发生，支持将豚鹿并入鹿属;麋鹿属与鹿属有较近的进化关系，支持将其并入鹿属;鲇鹿属的进化地位有待于进一步研究。2．中国鹿属为单系发生。3．中国马鹿从梅花鹿中分化出来，在系统发生上是一单系群。

关键词：蛇胆鹿类中药材分子标记鉴定鹿亚科系统发生

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中国主要茸鹿分子鉴别及分子系统学的研究

中国主要茸鹿分子鉴别及分子系统学的研究

作者：张敏东北农业大学

学位级别：硕士

鹿与人类生活自古以来就有密切关系。鹿浑身是宝，给人们提供了极为丰富的产品，其中最贵重的产品是鹿茸，是传统名贵的中药材，能治疗多种疾病，上百种中成药皆有鹿茸配伍。我国是世界上养鹿最早的国家，也是驯养茸鹿历史最悠久的国家... 详细信息

鹿与人类生活自古以来就有密切关系。鹿浑身是宝，给人们提供了极为丰富的产品，其中最贵重的产品是鹿茸，是传统名贵的中药材，能治疗多种疾病，上百种中成药皆有鹿茸配伍。我国是世界上养鹿最早的国家，也是驯养茸鹿历史最悠久的国家，其中我国驯养梅花鹿已有300多年的历史，我国在2000年版《中华人民共和国药典》只规定了梅花鹿鹿茸、马鹿鹿茸为正品药材。由于鹿茸及产品资源锐减而需求量激增，使得伪品、混淆品和代用品不断涌现。从国内市场来看存在着严重的以假充真以次充好的问题，很大程度上制约了中医药的安全有效及其向现代化、标准化和国际化的发展，其品种鉴定与质量评价工作越来越棘手其鉴定具有重要的现实意义。传统生药鉴定主要包括基源鉴定、性状鉴定、显微鉴定、理化鉴定、生物鉴定等。至今仍是生药学研究的重要内容和手段。在本研究中采用分子生物学的鉴定的方法，对四种茸鹿的SRY基因进行扩增，从扩增的图象可以看到我们采用的引物准确的对这四种鹿茸进行区别。在相同条件下用这种引物扩增这四种鹿都可以扩增出明显的条带且条带数目存在差异。而且阴性对照没有出现任何条带证明结果真实可靠!这样我们计划用引物2，TAQ酶，dNTP,PCR反应缓冲液组成这四种药材鹿茸鉴定的试剂盒用以上扩增的图象做为标准，可以有效的检出鹿茸的种类，因为目前还没有对鹿的种内群体的差异和分歧进行的报道，该试剂盒的开发，可以有效制止同源性假冒药材的泛滥，维护人们的经济效益，随着该技术再实践中的不断应用和日臻完美，可以建立名贵同类鹿茸药材检测技术。在脊椎动物的分子系统需的研究中，随着mtDNA序列的大量积累，人们越来越迫切的想得到核DNA的信息，来对mtDNA的资料进行补充，以便在系统学研究中对所言及的对象有一个更为全面准确地认识。由于rDNA的碱基顺序可作为研究生物系统进化和分类的可靠参照物，本研究通过18SrDNA片断来探讨鹿科动物的遗传分化关系，分子系统学进化关系。在实验中对中国四种茸鹿的核糖体的18SrDNA进行了克隆和测序，发送到GeneBank上(序列号分别是：AY225108 AY223903 AY145527)对其物种间同源性进行比较研究，并采用DNASTAR软件包中的MegAlign软件按Clustal排序，用Mega 2.1软件的UPGMA法建树。采用UPGMA法，Bootstrap检验，其结果和Mega 2.1软件的NJ法构建进化树是一致的。得出马鹿则最后从梅花鹿中分化出来．他们的同源性最高。与Wang& Du(1982)等研究结果一致。

关键词：茸鹿分子标记鉴定分子系统学

基于形态与分子标记区分人肉孢子虫与猪人肉孢子虫

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基于形态与分子标记区分人肉孢子虫与猪人肉孢子虫

作者：潘静云南大学

学位级别：硕士

人肉孢子虫（Sarcocystis hominis）和猪人肉孢子虫（Sarcocystis suihominis）是人肠道肉孢子虫病病原,能引起人体腹泻、腹痛等临床症状,其中间宿主分别是黄牛和猪。目前人肉孢子虫病患者的确诊主要依靠镜检其排泄物中的肉孢子虫卵囊... 详细信息

人肉孢子虫（Sarcocystis hominis）和猪人肉孢子虫（Sarcocystis suihominis）是人肠道肉孢子虫病病原,能引起人体腹泻、腹痛等临床症状,其中间宿主分别是黄牛和猪。目前人肉孢子虫病患者的确诊主要依靠镜检其排泄物中的肉孢子虫卵囊或孢子囊,该方法敏感性较低,且由于2种病原的卵囊/孢子囊大小重叠、形态相似而无法鉴定到种类,从而无法追溯感染源头。因此,本实验在对昆明等地农贸市场黄牛肉和猪肉中的人肉孢子虫及猪人肉孢子虫自然感染调查的基础上,以其包囊为材料,对其各种分子标记（核糖体的18S r DNA基因、ITS-1基因、线粒体的COX1基因、COX3基因、顶质体的CLPC基因）进行了测序和分析并建立了特异性的诊断方法,结果如下:（1）黄牛肉样品中人肉孢子虫（S.hominis）的感染率为25.7%（9/35）,光镜下包囊梭形、乳白色,大小为131.27×2024.5μm（n=6）,包囊壁有平均长度为5.17μm（n=18）的直立指状突起。其18S r DNA基因、COX1基因、COX3基因、ITS-1基因和CLPC基因不同克隆之间的平均相似度分别为99.3%（n=2）、98.9%（n=7）、98.9%（n=18）、95.5%（n=6）、99.6%（n=5）。（2）猪肉样品中猪人肉孢子虫（S.suihominis）的感染率为14.7%（5/34）,其包囊大小均值为142.33×1998.6μm（n=6）,包囊壁有浓密毛状突起,突起长度均值为6.44μm（n=18）。其18S r DNA基因、COX1基因、COX3基因、ITS-1基因和CLPC基因不同克隆之间的平均相似度为99.5%（n=3）、99.5%（n=9）、99.4%（n=12）、94.8%（n=8）、99.6%（n=6）。（3）人肉孢子虫（S.hominis）与猪人肉孢子虫（S.suihominis）的18S r DNA基因、COX1基因、COX3基因、ITS-1基因和CLPC基因的种间平均相似度为92.0%、75.4%、91.2%、57.5%、93.4%。（4）根据人肉孢子虫（S.hominis）与猪人肉孢子虫（S.suihominis）的18S r DNA基因遗传标记序列设计2对引物,F1/Sh R5能将人肉孢子虫的18S r DNA基因扩增出323bp的片段;F1/ZR1能将猪人肉孢子虫18S r DNA基因扩增出403bp的片段,使用这两对引物能将两种肉孢子虫区分。结果表明上述5种分子标记都能把人肉孢子虫和猪人肉孢子虫区分开,其中ITS-1基因和COX1基因的区分度优于18S r DNA基因、COX3基因和CLPC基因。本次实验是首次对人肉孢子虫的线粒体COX3基因、ITS-1基因和CLPC基因进行测序分析,首次对猪人肉孢子虫的COX3基因、CLPC基因进行测序分析。

关键词：肉孢子虫病人肉孢子虫猪人肉孢子虫形态分析分子标记鉴定

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莪术种质资源的RAPD-PCR分析

中草药 2016年第17期47卷 3098-3102页

作者：刘双利王晓慧姜程曦袁玮张金华吉林农业大学中药材学院吉林长春130118 温州医科大学药学院浙江温州325035 吉林省农业科学院农业资源与环境研究所吉林长春130033 大理药业股份有限公司云南大理671000

目的探讨不同品种莪术的亲缘关系和遗传多样性,对其进行分子标记鉴定。方法采用RAPD-PCR标记方法研究来源于不同地域的4个种42个样本的莪术种质资源。采用POPGEN32分析其遗传相似系数和遗传距离,UPGMA方法聚类。结果 90个随机引物中筛选... 详细信息

目的探讨不同品种莪术的亲缘关系和遗传多样性,对其进行分子标记鉴定。方法采用RAPD-PCR标记方法研究来源于不同地域的4个种42个样本的莪术种质资源。采用POPGEN32分析其遗传相似系数和遗传距离,UPGMA方法聚类。结果 90个随机引物中筛选出10个引物,共扩增出83个位点,其中多样性位点64个,占77.5%,遗传距离变化范围0.22-0.58,获得清晰的RAPD-PCR图谱,建立了不同种莪术亲缘关系的树状结构图。结论莪术群体中存在较丰富的遗传多样性,具有明显的遗传分化,这些遗传分化是莪术种质资源筛选的关键,是莪术高效育种和生物技术开发的基础。

关键词：莪术种质资源 RAPD PCR 分子标记鉴定

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辽宁省农业科学院高粱研究所

辽宁农业科学 2022年第6期 F0002-F0002,F0003,F0004页

辽宁省农业科学院高粱研究始于1956年,由院属作物研究所高粱研究室承担。1984年由国家农业部和辽宁省政府共同投资组建辽宁省农业科学院高粱研究所;1999年,与院作物研究所合署办公;2000年经国家农业部批准,依托高粱研究所组建国家高粱... 详细信息

辽宁省农业科学院高粱研究始于1956年,由院属作物研究所高粱研究室承担。1984年由国家农业部和辽宁省政府共同投资组建辽宁省农业科学院高粱研究所;1999年,与院作物研究所合署办公;2000年经国家农业部批准,依托高粱研究所组建国家高粱改良中心;2011年从作物研究所独立出来,以高粱研究所为基础成立院创新中心,2018年恢复辽宁省农业科学院高粱研究所。研究涵盖高粱资源收集、创新与利用、重要农艺性状基因挖掘和分子标记鉴定、育种技术研发、专用新品种选育、栽培技术与生理研究等领域。

关键词：作物研究所改良中心重要农艺性状栽培技术分子标记鉴定高粱辽宁省农业科学院育种技术