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嗜酸氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化酶基因分子多态性研究

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遗传 2005年第5期27卷 787-791页

作者：杨宇彭宏孙斌王杰伟胡岳华中南大学资源加工与生物工程学院长沙410083

嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,A.f)属于化能自养、革兰氏阴性细菌,好氧嗜酸,以氧化亚铁离子或还原态硫化物(S0&S2-)获得能量生长.在其Fe2+氧化系统中,亚铁氧化酶起重要作用.对不同硫化矿区分离得到的5株A.f进行... 详细信息

嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,A.f)属于化能自养、革兰氏阴性细菌,好氧嗜酸,以氧化亚铁离子或还原态硫化物(S0&S2-)获得能量生长.在其Fe2+氧化系统中,亚铁氧化酶起重要作用.对不同硫化矿区分离得到的5株A.f进行生长动力学和对亚铁氧化活性的对比研究,结果显示不同菌株之间存在表型差异.提取A.f菌株的基因组DNA,设计引物,对亚铁氧化酶基因进行PCR扩增,同时对扩增产物直接进行测序,并同GenBank的参考序列进行比对分析,发现序列相似性在99%～97%之间,分析编码区域发现在第187～195位可能存在一个高变异区:在第187～189位,菌株YTW编码的氨基酸Thr→Pro ;而在第193～195位,菌株TK是Met→Asn;菌株BY则是Met→Ile.另外在位点第219位,所有菌株都是T→C,但编码的氨基酸未发生变化,属于同义密码子.对于编码区上游序列,比对后没有差异;而对于编码区下游序列,经比对发现存在一些差异位点.

关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化酶基因分子多态性

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不同地理种源杉木的分子多态性分析

热带亚热带植物学报 2009年第2期17卷 183-189页

作者：杨玉玲马祥庆张木清宁德师范高等专科学校福建宁德352100 福建农林大学林学院福建杉木研究中心福州350002 农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室福州350002

利用ISSR分子标记技术和筛选出的22条ISSR引物,对24个不同地理种源杉木的DNA进行扩增,共扩增出188条谱带,其中多态条带173条,占总数的92.0%。经计算,平均位点的有效等位基因是1.3408,Nei’s基因多样性指数是0.2154,Shannon多态性信息指... 详细信息

利用ISSR分子标记技术和筛选出的22条ISSR引物,对24个不同地理种源杉木的DNA进行扩增,共扩增出188条谱带,其中多态条带173条,占总数的92.0%。经计算,平均位点的有效等位基因是1.3408,Nei’s基因多样性指数是0.2154,Shannon多态性信息指数为0.3458,表明不同杉木种源间具有较高的遗传多样性。通过UPGMA法聚类分析,可把24个种源杉木分为五个类群:中带东区生态型、中带东南区生态型、中带中区生态型、南带生态型和北带生态型,表明杉木地理种源遗传距离聚类呈现出一定的地域性分布规律。

关键词：杉木 ISSR 分子多态性地理种源

转pMThGH基因红鲤F_4代鱼体内转植基因存在的分子多态性

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科学通报 2000年第18期45卷 1957-1962页

作者：曾志强朱作言中国科学院水生生物研究所淡水生态及生物技术国家重点实验室武汉430072

从一尾转ｐＭＴｈＧＨ基因红鲤Ｆ４代仔鱼基因组内回收并克隆了５０个转植基因（ｔｒａｎｓｇｅｎｅ），对其中３３个进行了分析．根据双酶切结果，可将这些回收基因分为４种类型．用５种内切酶构建了这４种类型回收基因的限制性内切... 详细信息

从一尾转ｐＭＴｈＧＨ基因红鲤Ｆ４代仔鱼基因组内回收并克隆了５０个转植基因（ｔｒａｎｓｇｅｎｅ），对其中３３个进行了分析．根据双酶切结果，可将这些回收基因分为４种类型．用５种内切酶构建了这４种类型回收基因的限制性内切酶图谱，第１种类型（６个，占１８％）与建立原代转基因鱼所用的外源基因相同，而其他３种类型回收基因的分子量大小、酶切位点的种类、数量、位置都迥异于转移前的结构，意味着大多数转植基因顺序发生了缺失和重排．Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交进一步证明了这一结果．对回收基因侧翼进行顺序分析，鉴别了两个相关的整合位点，即鲤鱼β－ａｃｔｉｎ基因的启动子或５’ ＵＴＲ位点，以及与小鼠ＲＴＫｍＲＮＡ同源的鲤鱼基因顺序位点。

关键词：转基因鱼转植基因分子多态性 F4代红鲤鱼

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稻秸对土壤细菌群落分子多态性的影响

土壤学报 2005年第2期42卷 270-277页

作者：卜元卿黄为一南京农业大学生命科学学院微生物学系农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

模拟稻秸原位还田条件,分别在水稻土和红壤中添加水稻秸秆培养70d ,第0、5、2 5、4 5、70天采集土样。采用非机械破壁法直接提取水稻土和红壤细菌总DNA ,水稻土细菌总DNA经过二次纯化;红壤细菌总DNA经过一次纯化后,PCR扩增其16SrDNAV3... 详细信息

模拟稻秸原位还田条件,分别在水稻土和红壤中添加水稻秸秆培养70d ,第0、5、2 5、4 5、70天采集土样。采用非机械破壁法直接提取水稻土和红壤细菌总DNA ,水稻土细菌总DNA经过二次纯化;红壤细菌总DNA经过一次纯化后,PCR扩增其16SrDNAV3可变区,均可获得清晰的目的条带,对扩增产物进行DGGE分析,结果显示:水稻土和红壤样品的DGGE条带增加,说明稻秸能够增加土壤细菌群落分子多态性的丰富度,随着培养期的延长,施有稻秸的处理中土壤细菌群落多态性的变化远远复杂于空白对照土壤中的细菌群落变化;

关键词：土壤细菌水稻土红壤群落总DNA 分子多态性还田 DGGE 细菌群纯化

杀配子染色体特异RAPD标记及山羊草属与普通小麦间分子多态性的研究

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植物研究 2001年第3期21卷 432-436页

作者：郭长虹石锐王同昌李集临哈尔滨师范大学生物系哈尔滨150080

以普通小麦“中国春”、三个“中国春”具杀配子染色体的二体异附加系及作为三个杀配子基因种源的三种山羊草为材料 ,用 46个 1 0nt随机引物对基因组DNA进行扩增 ,以筛选杀配子染色体特有的RAPD标记 ,并检测普通小麦与三种山羊草之间的R... 详细信息

以普通小麦“中国春”、三个“中国春”具杀配子染色体的二体异附加系及作为三个杀配子基因种源的三种山羊草为材料 ,用 46个 1 0nt随机引物对基因组DNA进行扩增 ,以筛选杀配子染色体特有的RAPD标记 ,并检测普通小麦与三种山羊草之间的RAPD多态性。结果表明 :46个引物中有 3 5个扩增出比较稳定的RAPD产物。其中引物OPF 1 4和OPQ 0 9分别在普通小麦“中国春” 山羊草附加系间扩增出多态性产物 ;因而认定OPF - 1 41 30 0 与OPQ - 0 980 0 、OPF - 1 41 1 60 与OPQ - 0 9770 、OPF - 1 41 2 80 分别为三个杀配子染色体 3C、Gcl和 2C的特异性RAPD标记 ,可以用于快速跟踪鉴定 3C、Gcl、2C杀配子染色体。对三种山羊草与普通小麦“中国春”进行了基因组DNA多态性分析 ,结果表明 ,3 5个引物在“中国春”中共扩增出 1 6 2个产物 ,在离果山羊草、拟斯卑尔脱山羊草、柱穗山羊草中分别扩增出 1 40、1 5 4和 1 5 5个产物 ;三种山羊草与“中国春”之间的共有扩增产物分别为 6 9、87、96个 ,占总扩增产物的 2 9.6 1 %、3 7.70 %和 43 .44%。上述结果。

关键词：杀配子染色体小麦山羊草属 RAPD标记分子多态性

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吉林省烟草野火病菌群体分子多态性分析

吉林农业大学学报 2014年第5期36卷 524-529页

作者：夏纬跃卢宝慧杨丽娜南楠刘燕妮陈长卿高洁吉林农业大学农学院长春130118

为研究烟草野火病菌的群体遗传多样性，采用正交试验方法，对5个多态性引物（ REP，ERIC，BOX， J3，IS1112）的Rep－PCR反应体系分别进行了优化，同时优化了体系中的Mg2＋、dNTP、rTaq 酶等几个因素，并在此基础上对来源于吉林省不同... 详细信息

为研究烟草野火病菌的群体遗传多样性，采用正交试验方法，对5个多态性引物（ REP，ERIC，BOX， J3，IS1112）的Rep－PCR反应体系分别进行了优化，同时优化了体系中的Mg2＋、dNTP、rTaq 酶等几个因素，并在此基础上对来源于吉林省不同地区的70株烟草野火病菌进行了分子多态性分析。结果表明：优化的PCR反应体系电泳图谱清晰，多态性丰富，重复性好，适合烟草野火病菌群体分子标记研究。通过聚类分析发现，吉林省烟草野火病菌群体存在分子多态性，在遗传相似系数为0？9时，70个菌株被聚为4个类群（ G1～G4），其中G1类群最大（39个菌株，占55？71％），而G3类群最小，仅包括2个菌株。 G1和G2类群分别包含了5个和3个亚群。不同类群和亚群的菌株地理来源存在多样性。

关键词：烟草野火病菌 Rep-PCR体系优化分子多态性

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不同地理种源无患子的分子多态性分析

浙江农林大学学报 2014年第1期31卷 151-155页

作者：刘宝范辉华彭珠清刘燕陈存及福建农林大学林学院福建福州350002 福建省林业科学研究院福建福州350012

利用筛选出的18对相关序列扩增多态性(SRAP)引物对12个来自印度和中国不同种源的无患子进行SRAP扩增,计算Dice遗传相似系数后用非加权组平均法(UPGMA)法进行聚类,分析其亲缘关系,以便为今后无患子Sapindus mukorossi优质种质资源的保存... 详细信息

利用筛选出的18对相关序列扩增多态性(SRAP)引物对12个来自印度和中国不同种源的无患子进行SRAP扩增,计算Dice遗传相似系数后用非加权组平均法(UPGMA)法进行聚类,分析其亲缘关系,以便为今后无患子Sapindus mukorossi优质种质资源的保存、选育和后续研究提供参考。试验结果表明:12个样本共扩增出253个带型,其中191条为多态性条带,多态性百分率为75.16%,样本的平均遗传相似系数为0.739,显示出无患子种内的相似度较高,遗传分化不明显。聚类分析表明:印度南的种源与其他种源产生较大的遗传分异,而印度北的种源由于地理纬度与中国国内种源较为相近,因此,和中国国内种源的遗传距离没有印度南种源相差那么大,各种源间的遗传距离与地理距离基本服从正相关的关系。

关键词：植物学无患子地理种源相关序列扩增多态性(SRAP) 亲缘关系分子多态性

水稻秸秆还田对河南沿黄稻区土壤细菌群落分子多态性影响

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河南农业大学学报 2008年第1期42卷 90-94页

作者：李自刚李兴道蒋媛媛边传周介晓磊赵跃进郑州牧业工程高等专科学校生物工程系河南郑州450011 河南农业大学河南郑州450002 河南省农业微生物工程技术研究中心河南三门峡472143

模拟河南省沿黄稻区水稻秸秆还田生态条件,分别在种植过水稻的潮土和没有种植过水稻的潮土中添加水稻秸秆培养70 d,在第0,5,25,45,70 d时采集土样.直接提取土样细菌总DNA,对细菌总DNA经PCR扩增后,对其产物进行DGGE分析.结果表明,施有水... 详细信息

模拟河南省沿黄稻区水稻秸秆还田生态条件,分别在种植过水稻的潮土和没有种植过水稻的潮土中添加水稻秸秆培养70 d,在第0,5,25,45,70 d时采集土样.直接提取土样细菌总DNA,对细菌总DNA经PCR扩增后,对其产物进行DGGE分析.结果表明,施有水稻秸秆处理的土壤细菌群落多态性的变化远远复杂于空白对照土壤中的细菌群落变化,说明水稻秸秆还田能够增加土壤细菌群落分子多态性的丰富度;并且水稻秸秆刺激作用下不同土壤细菌群落分子多态性高峰出现时间不同.

关键词：分子多态性变性梯度凝胶电泳水稻秸秆土壤细菌沿黄稻区潮土

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家禽MHC分子多态性与抗病育种

湖北农业科学 2011年第17期50卷 3480-3483页

作者：赵淑娟周虚庞有志路文东王波吉林大学畜牧兽医学院长春130062 河南科技大学动物科技学院河南洛阳471003

主要就家禽的组织相容性复合体(MHC)基因结构与多态性、与疾病的相关性以及抗病育种等方面进行了阐述,并提出了存在的问题和今后的研究方向。

关键词：家禽 MHC 分子多态性抗病育种