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薄荷内生细菌X7的分离鉴定及其对番茄黄萎病的防效

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中国瓜菜 2023年第2期36卷 29-34页

作者：张庆琛刘应敏朱晓琴韩霜黄梦晴裴冬丽商丘师范学院生物与食品学院·河南省特色微生物资源开发与应用工程研究中心河南商丘476000 商丘师范学院化学化工学院河南商丘476000

为探寻高效防治番茄黄萎病(Verticillium dahliae)的薄荷内生优良菌株,首先采用平板划线法分离纯化薄荷根、茎、叶的内生菌,然后采用平板对峙培养法分析内生菌对葡萄座腔菌、尖孢镰刀菌、禾谷镰刀菌、黄萎病菌、串珠镰刀菌5种病原菌的... 详细信息

为探寻高效防治番茄黄萎病(Verticillium dahliae)的薄荷内生优良菌株,首先采用平板划线法分离纯化薄荷根、茎、叶的内生菌,然后采用平板对峙培养法分析内生菌对葡萄座腔菌、尖孢镰刀菌、禾谷镰刀菌、黄萎病菌、串珠镰刀菌5种病原菌的抑菌特性,并根据病原菌的形态特征、生理生化特征和16S rDNA测序鉴定内生菌的分类;利用盆栽试验分析内生拮抗菌对番茄黄萎病的防效。结果表明,从薄荷上获得25株内生菌株,其中菌株X7和X9具有广谱抗性,尤其是对黄萎病菌的抑制效果最为明显,抑菌率分别为73.33%、70.62%;菌株X7被鉴定为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis);盆栽试验表明,X7有效降低了番茄黄萎病的发病率和病情指数,防治效果达67.16%。来自薄荷的贝莱斯芽孢杆菌X7是一株具有生防潜力的菌株,可用于番茄黄萎病的生物防治。

关键词：薄荷内生细菌贝莱斯芽孢杆菌番茄黄萎病生物防治

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5个相思树种根内生细菌群落多样性特征研究

西南林业大学学报（自然科学） 2022年第5期42卷 165-170页

作者：潘辉刘芳曾志浩周丽丽袁宗胜闽江学院海洋研究院福建福州350108 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

采集了厚荚相思、卷荚相思、黑木相思、直干相思、马占相思共5种植物的根部样本,通过16S rRNA高通量测序,对不同种相思树中根内生细菌的群落结构进行解析。比较5种相思树种根内生细菌群落多样性,在纲水平上,厚荚相思、卷荚相思、黑木相... 详细信息

采集了厚荚相思、卷荚相思、黑木相思、直干相思、马占相思共5种植物的根部样本,通过16S rRNA高通量测序,对不同种相思树中根内生细菌的群落结构进行解析。比较5种相思树种根内生细菌群落多样性,在纲水平上,厚荚相思、卷荚相思、黑木相思和直干相思的根内生优势菌为Alphaproteobacteria,而马占相思的根内生细菌中,则以Gammaproteobacteria占主导地位。在目水平上,厚荚相思、卷荚相思、直干相思和黑木相思的根内生细菌优势菌为Rhizobiales,马占相思的根内生细菌则以Rhizobiales、Enterobacteriales和unidentified_Gammaproteobacteria占主导地位。在科水平上,厚荚相思、卷荚相思、直干相思和黑木相思的根内生细菌中优势菌为Xanthobacteraceae,马占相思的根内生细菌中,则以Enterobacteriaceae占主导地位。不同种相思树根内生细菌群落在纲、目、科水平上均存在较大差异性,与其他4种相思树种的优势菌群相比,马占相思表现出一定的特异性。

关键词：相思树种内生细菌群落结构多样性厚荚相思卷荚相思黑木相思直干相思马占相思

3种拮抗烟草疫霉及产IAA内生细菌的分离鉴定

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江苏农业科学 2023年第18期51卷 107-114页

作者：李颖颖康业斌李成军李淑君河南科技大学园艺与植物保护学院河南洛阳471000 烟草行业黄淮烟区烟草病虫害绿色防控重点实验室/河南省农业科学院烟草研究所河南许昌461000

为挖掘河南省洛阳地区烟株体内的内生细菌功能菌株,以期开发优良生防菌剂。采用稀释涂布平板法分离纯化烟株各生育时期内生细菌菌株,采用平板对峙法、生长速率法测定内生菌株对烟草疫霉的抑制作用,紫外分光光度计法测定菌株产生IAA的水... 详细信息

为挖掘河南省洛阳地区烟株体内的内生细菌功能菌株,以期开发优良生防菌剂。采用稀释涂布平板法分离纯化烟株各生育时期内生细菌菌株,采用平板对峙法、生长速率法测定内生菌株对烟草疫霉的抑制作用,紫外分光光度计法测定菌株产生IAA的水平。对筛选出的功能内生菌株进行形态学、生理生化鉴定及16S rDNA、gyrB序列分析鉴定,并测定对种子萌发的促生作用。结果表明,筛选出的12株内生菌株的鉴定结果为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)7株,沙福芽孢杆菌(B.safensis)4株,奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)1株。芽孢杆菌属占菌株总数的91.67%,其中菌株LYYY63-1、LYRY39-1、LYSX141具有较强的抑制活性,对烟草疫霉的抑菌率分别为88.10%、84.55%和73.33%;沙福芽孢杆菌菌株LYYY61-2、LYYY117对烟草疫霉的抑菌率达62.10%、64.72%;奇异变形杆菌菌株LYRY45产IAA水平达11.06 mg/L,具有较高的产IAA水平。12株细菌对烟草7种病原真菌具有不同程度的抑制作用,抑菌谱广,对烟草种子根长和总长均有显著的促生效果,其中菌株LYRY45的促生效果最为显著,种子萌发率达98.00%,处理组根长增长37.76%,茎长增长21.43%,总长增长33.96%。研究分离鉴定了洛阳地区健康烟株中3类具有抑菌、促生效能的内生细菌菌株,希望为生防菌防治烟草病害提供理论基础。

关键词：烟草疫霉内生细菌分子鉴定 IAA 促生作用

基于高通量技术分析粉防己不同组织内生细菌多样性及功能预测

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江苏农业科学 2023年第17期51卷 19-28页

作者：杨立军徐源高涵贾艳娇陈琼叶润段鸿斌信阳农林学院制药工程学院河南信阳464000

为了探究粉防己内生细菌的多样性,挖掘粉防己内生细菌资源,采用Illumina MiSeq测序技术对粉防己根、茎、叶内生细菌的16S区进行测定,并分析群落组成、多样性、差异化及功能等生物学信息。结果表明,从粉防己不同组织中共获得212928个有... 详细信息

为了探究粉防己内生细菌的多样性,挖掘粉防己内生细菌资源,采用Illumina MiSeq测序技术对粉防己根、茎、叶内生细菌的16S区进行测定,并分析群落组成、多样性、差异化及功能等生物学信息。结果表明,从粉防己不同组织中共获得212928个有效序列,1130个操作分类单元(OTU),隶属于23门、38纲、78目、148科、304属、290种。α多样性分析结果表明,根部内生细菌的群落丰富度最高,叶部内生细菌的多样性最高,茎部内生细菌的丰富度、多样性最低。在门水平上,变形菌门在不同组织中的丰度均最高,为最优势菌门。在纲水平上,根部内生细菌的优势菌纲为放线菌纲;茎部、叶部内生细菌的优势菌纲均为γ-变形菌纲。在属水平上,根部内生细菌的优势菌属为拟无枝酸菌属(Amycolatopsis);茎部内生细菌的优势菌属为泛菌属(Pantoea);叶部内生细菌的优势菌属有泛菌属、金黄杆菌属。热图结果表明,同类型组织样本群落结构相似,不同组织样本间的群落组成差异显著。LEfSe分析结果表明,引起不同组织差异显著的菌门主要为变形菌门、放线菌门、TM7菌门,菌属主要为假诺卡氏菌属、酸杆菌属、慢生根瘤菌。PICRUSt2功能预测发现,粉防己内生细菌功能基因丰富,其中与新陈代谢、环境信息处理、遗传信息处理相关的基因数量相对最多。综上,粉防己内生细菌具有丰富的群落多样性及功能多样性,可为进一步开发利用粉防己内生细菌资源奠定基础。

关键词：粉防己内生细菌多样性高通量测序功能预测

马铃薯疮痂病不同抗性品种发病与健康块茎内生细菌群落结构及多样性

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江苏农业科学 2023年第14期51卷 134-140页

作者：杨鑫赖振光樊吴静李丽淑何虎翼唐洲萍广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所广西南宁530007

采用Illumina Miseq测序技术对比分析马铃薯不同抗性品种发病与健康块茎内生细菌群落结构多样性和优势菌群的差异性。结果表明,病原菌侵染改变了内生细菌原有的群落结构组成和多样性特征,与健康块茎相比,易感病品种闽薯2号发病块茎内生... 详细信息

采用Illumina Miseq测序技术对比分析马铃薯不同抗性品种发病与健康块茎内生细菌群落结构多样性和优势菌群的差异性。结果表明,病原菌侵染改变了内生细菌原有的群落结构组成和多样性特征,与健康块茎相比,易感病品种闽薯2号发病块茎内生细菌Shannon指数降低,独有OTU明显提高,抗病品种中薯566发病块茎内生细菌Shannon指数略有提高,独有OTU数量降低;不同品种发病和健康块茎门、属水平上的主要优势菌分别为变形菌门(Proteobacteria)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium);抗病品种块茎内生细菌多样性和有益微生物群落结构比易感病品种更丰富和稳定,闽薯2号发病块茎内慢生根瘤菌属、假单胞菌属(Pseudomonas)、黄杆菌属(Flavobacterium)等有益菌群不同程度降低,而中薯566发病块茎有益微生物的相对丰度明显提高;放线菌属(Actinobacteria)是健康块茎的重要细菌类群,对拮抗内生菌的挖掘具有一定的指导意义。

关键词：马铃薯疮痂病品种抗性内生细菌群体多样性丰富度指数

海南辣椒尖孢镰刀菌拮抗内生细菌的分离与鉴定

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分子植物育种 2023年第20期21卷 6767-6775页

作者：王宝严婉荣肖彤斌陈圆马瑞赵志祥海南省农业科学院植物保护研究所(海南省农业科学院农产品质量安全与标准研究中心) 海南省植物病虫害防控重点实验室农业农村部海口作物有害生物科学观测实验站海口571100

为了获得对辣椒尖孢镰刀菌具有较好防治效果的内生细菌,课题组于2022年1~3月份在海口、定安、澄迈、临高和陵水等海南辣椒主产区采样,并从健康辣椒样品中分离获得内生细菌192株,其中39株对辣椒尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum) CMTT4-1... 详细信息

为了获得对辣椒尖孢镰刀菌具有较好防治效果的内生细菌,课题组于2022年1~3月份在海口、定安、澄迈、临高和陵水等海南辣椒主产区采样,并从健康辣椒样品中分离获得内生细菌192株,其中39株对辣椒尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum) CMTT4-1有拮抗作用,分别来源于根系(23株)、茎秆(2株)、叶片(8株)和果实(6株),有拮抗作用菌株占比20.31%,抑菌率为10.68%~59.02%。通过形态学和16S rDNA序列测定及同源性分析,初步鉴定芽孢杆菌属(Bacillus spp.)细菌36株、短杆菌属(Brevibacterium spp.) 1株、农杆菌属(Agrobacterium spp.) 1株和假单胞菌属(Pseudomonas spp.) 1株。研究结果为辣椒枯萎病的生物防治提供了菌株来源。

关键词：辣椒尖孢镰刀菌内生细菌分离鉴定

高寒草地紫花针茅拮抗内生细菌263ZY2的功能测定及其鉴定

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草原与草坪 2023年第6期43卷 38-43页

作者：敖远冯疆蓉杨成德甘肃农业大学植物保护学院甘肃省农作物病虫害生物防治工程实验室甘肃兰州730070

【目的】为获得优良的紫花针茅内生细菌菌株并探究其生物功能,同时丰富高寒地区生防菌资源。【方法】采用传统微生物分离培养法,从东祁连山高寒草地紫花针茅体内分离得到一株内生细菌263ZY2,对其抑菌、分泌吲朵乙酸(IAA)、固氮和溶磷能... 详细信息

【目的】为获得优良的紫花针茅内生细菌菌株并探究其生物功能,同时丰富高寒地区生防菌资源。【方法】采用传统微生物分离培养法,从东祁连山高寒草地紫花针茅体内分离得到一株内生细菌263ZY2,对其抑菌、分泌吲朵乙酸(IAA)、固氮和溶磷能力进行了测定,并通过16S rDNA序列分析及对形态学特征进行了鉴定。【结果】菌株263ZY2对马铃薯坏疽病菌Phoma foveata、枯萎病菌Fusarium avenaceum和炭疽病菌Colletotrichum coccodes的拮抗能力均在60%以上,且具有良好的固氮能力;在含和不含色氨酸的King氏培养基中分泌IAA的量分别为10.07 mg/L和12.32 mg/L;在PKO培养基中有明显的溶磷效果,其溶磷能力达13.46 mg/L;在NA培养基平板上,菌落大小为2 mm,圆形,边缘整齐,表面光滑,干燥,中间隆起,呈奶白色,菌体杆状,大小为1.45×0.38~3.85×0.78μm,革兰氏阳性。16S rDNA序列在GenBank中登录号为KF831365.1。【结论】结合形态特征和16S rDNA基因序列同源性分析,将263ZY2鉴定为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),且其具有良好的抑菌、固氮、溶磷和分泌IAA能力。

关键词：高寒草地紫花针茅内生细菌抑菌溶磷分泌IAA

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莼菜不同组织内生细菌多样性的比较分析

中南民族大学学报（自然科学版） 2022年第3期41卷 285-291页

作者：张秋玉陈晶周雪妹龚汉雨余光辉中南民族大学生命科学学院&中国莼菜研究所&武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室武汉430074

为研究莼菜内生细菌的多样性,挖掘莼菜的内生细菌资源,采用IlluminaMiSeq高通量二代测序技术对莼菜不同组织及水样进行了Alpha、Beta多样性分析,分析细菌群落的结构组成以及对比KEGG数据库进行内生细菌菌群基因功能预测.莼菜样品和水样... 详细信息

为研究莼菜内生细菌的多样性,挖掘莼菜的内生细菌资源,采用IlluminaMiSeq高通量二代测序技术对莼菜不同组织及水样进行了Alpha、Beta多样性分析,分析细菌群落的结构组成以及对比KEGG数据库进行内生细菌菌群基因功能预测.莼菜样品和水样中获得16S rRNA基因V3-V4区高质量序列1124709条,1391个细菌OTUs隶属于21个门和399个属.分析结果表明:莼菜内生细菌的优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes),水样和莼菜组织间共有29个共有菌属,占内生细菌所有种类的7.27%.PICRUSt2功能预测发现内生细菌菌群共有34个子功能,菌群功能丰富,代谢为最主要的功能.莼菜茎的内生细菌多样性大于其他组织,且不同组织均有各自特异的菌属,推测植物组织结构可能会促进内生细菌选择合适的组织生态位为植物体提供动力.

关键词：莼菜内生细菌多样性生态位功能预测

大麻(Cannabis sativa L.)内生细菌的分离与鉴定

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分子植物育种 2023年第12期21卷 3946-3956页

作者：王宪菊许艳萍字淑慧金洪伶斯那永宗刘涛云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心昆明650201 云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 云南省农科院经济作物研究所昆明530111

为分离与鉴定大麻(Cannabis sativa L.)雌株及雄株3个部位的叶片(从植株茎基向茎尖方向第二轮叶,第五轮叶,雄花周围叶)和花的内生细菌,本研究采用微生物培养和分子生物学鉴定方法,探讨其种类及其分布特征。结果显示,从大麻雄株中分离到6... 详细信息

为分离与鉴定大麻(Cannabis sativa L.)雌株及雄株3个部位的叶片(从植株茎基向茎尖方向第二轮叶,第五轮叶,雄花周围叶)和花的内生细菌,本研究采用微生物培养和分子生物学鉴定方法,探讨其种类及其分布特征。结果显示,从大麻雄株中分离到6属35株内生细菌,大麻雌株中分离到11属39株内生细菌。内生细菌种属在大麻雌雄植株不同部位的叶和花中的分布存在显著差异,大麻雌株与雄株的内生细菌种类只共有葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、芽孢杆菌属(Bacillus sp.)和马赛菌属(Massilia sp.),其余均不共有。大麻雄株3个部位叶片中共有阿尔莱特葡萄球菌和溶血葡萄球菌而雄花中不存在;在雄花中分离到地衣芽孢杆菌、木糖葡萄球菌和贝莱斯芽孢杆菌而叶中不存在。大麻雌株3个部位叶片共有贝莱斯芽孢杆菌和特基拉芽孢杆菌而雌花中不存在;在雌花中分离到粪短波单胞菌、谷粒申氏菌、农杆菌、香料葡萄球菌、缺陷短波单胞菌、地衣芽胞杆菌和弗留明拜叶林克氏菌而叶中不存在。结果表明大麻内生细菌在不同植株、叶和花中的多样性以及不同内生细菌的分布差异。本研究结果为进一步研究大麻内生细菌的多样性提供科学依据,同时为未来大麻内生菌功能性促生菌种的筛选提供基础。

关键词：大麻内生细菌分离与鉴定