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南方农业学报 2022年第12期53卷 3489-3497页

作者：姚裕群兰可黄荣韶吴炫柯广西科技大学基础医学部广西柳州545006 广西中医药大学广西南宁530200 柳州市农业气象试验站广西柳州545003

【目的】分析比较越南槐野生与栽培根系内生真菌组的结构及宿主相似抑菌功能,为利用有益内生真菌组改善栽培宿主药材质量提供参考。【方法】采用组织块法分别从野生和栽培根系分离内生真菌,结合形态学和ITS序列特征鉴定内生真菌;分别采... 详细信息

【目的】分析比较越南槐野生与栽培根系内生真菌组的结构及宿主相似抑菌功能,为利用有益内生真菌组改善栽培宿主药材质量提供参考。【方法】采用组织块法分别从野生和栽培根系分离内生真菌,结合形态学和ITS序列特征鉴定内生真菌;分别采用琼脂块法和平板对峙法,以人体病原菌和丝状病原真菌为靶标菌,测定根系内生真菌组各分类单元的抑菌圈和抑制率。【结果】从越南槐野生和栽培根系分别分离鉴定得到234株36个分类单元和48株10个分类单元的内生真菌。野生根系内生真菌组的属、优势属、特有属、种、特有种的数目为栽培根系内生真菌组的3~5倍,其α多样性指数显著高于栽培根系内生真菌组(P内生真菌组是栽培根系内生真菌组的6~10倍,其中,分类单元Colletotrichum simmondsii对3种人体病原菌的抑菌圈直径均大于或等于阳性对照,***、Phoma sp.、Purpureocillium lilacinum、Trichoderma asperellum、Trichoderma sp.、Talaromyces funiculosus、Fomitopsis sp.、Fusarium solani和Rhexocercospo-ridium sp.等9个分类单元对3种丝状病原真菌的抑制率均超过50%。【结论】越南槐野生根系内生真菌组具有生境特异性,生物多样性更丰富,且有强广谱的宿主相似抑菌功能,有益于在宿主根系合成结构独特、生物活性多样的代谢产物,进而赋予宿主药材独特的药效,可应用于改善栽培宿主药材质量。

关键词：越南槐内生真菌组生物多样生境特异性宿主相似抑菌功能

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板栗果实内生真菌群落组成及分化特征

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林业科学研究 2022年第4期35卷 9-22页

作者：闾星窦桂铭汪慧华李如华江泽平李志朋严东辉中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所国家林业和草原局森林保护学重点实验室北京100091 北京农业职业学院食品与生物工程系北京100085 北京市怀柔区园林绿化局北京101400

[目的]探明果实内生真菌群落结构组成和多样性是了解果实健康微生物组功能和机制的基础。[方法]采用高通量测序技术和传统组织分离方法,对6个板栗品种的健康果实及其果肉(子叶)和果壳(含种皮)组织的内生真菌群落进行了多样性和组成分析... 详细信息

[目的]探明果实内生真菌群落结构组成和多样性是了解果实健康微生物组功能和机制的基础。[方法]采用高通量测序技术和传统组织分离方法,对6个板栗品种的健康果实及其果肉(子叶)和果壳(含种皮)组织的内生真菌群落进行了多样性和组成分析。[结果]6个品种的果实及其2个组织共36个样本总共产生3229205条高质量序列,注释出真菌1557个OTUs,分属10个门,38个纲,97个目,203个科,350个属。板栗果实中子囊菌门Ascomycota(平均相对丰度80.40%)丰度最高,其次为担子菌门Basidiomycota(平均相对丰度7.70%),优势纲为粪壳菌纲Sordariomycetes(平均相对丰度43.00%)和酵母纲Saccharomycetes(平均相对丰度15.10%)。品种间共有(Shared)真菌类群富集在座囊菌纲Dothideomycetes上,其丰度>90%。板栗果实品种间,子囊菌门在每一个品种中同样体现为最丰富类群,相对丰度为57.96%~90.15%,其次为担子菌门,相对丰度为3.28%~23.71%;纲水平上,优势类群出现变化,酵母菌纲真菌相对丰度(39.21%)在毛板红品种中是最高的,而粪壳菌纲真菌是另外5个板栗品种中最丰富类群(29.47%~59.56%)。果实组织间,果肉组织较之果壳具有更高的特有真菌多样性,果肉组织特有优势类群全部为担子菌,尤其是银耳纲Tremellomycetes的红菇目Russulales。LEfSe分析显示,果壳和果肉组织存在显著性差异群落组成或种群,镰孢属Fusarium、梅奇酵母属Metschnikowia、迈耶氏酵母属Meyerozyma和德巴利酵母属Debaryomyces真菌在果肉组织中具有显著优势。采用人工培养方法共获得有效菌株2346株,分属子囊菌、担子菌和毛霉菌门Mucoromycota。除酵母菌类需特殊培养基筛选外,可培养方法显示果实及其果壳、果肉上的真菌优势类群,在群落组成和丰度上与高通量测序技术结果相似。[结论]板栗果实具有丰富的以子囊菌粪壳菌纲和酵母菌纲为优势类群的内生真菌群落组成和种群多样性,但建群种类主要来自座囊菌纲。板栗果实品种间的内生真菌群落组成结构具有明显差异。板栗果肉较之果壳组织有更为丰富的特有内生真菌多样性。板栗果肉和果壳组织内生真菌群落组成具有明显分化。本文系统报道了板栗果实内生真菌组的组成结构,为利用板栗健康微生物组防控果实病害和了解坚果类果实微生物组提供了基础。

关键词：板栗果实内生真菌组多样性子叶果皮非培养技术

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板栗果实的内生真菌群落组成及在组织中的分化

板栗果实的内生真菌群落组成及在组织中的分化

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中国菌物学会2023年学术年会

作者：闾星窦桂铭汪慧华李如华李志朋严东辉中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所北京农业职业学院食品与生物工程系北京市怀柔区园林绿化局

以来自辽宁、河北、山东、安徽、浙江和江西等板栗主产区或产区当年的6个品种板栗成熟果实为研究对象,利用Illumina MiSeq高通量测序方法,调查了板栗果实内生真菌群落组成以及在果肉和果壳多样性与组成,结果表明板栗果实中相对丰度平均... 详细信息

以来自辽宁、河北、山东、安徽、浙江和江西等板栗主产区或产区当年的6个品种板栗成熟果实为研究对象,利用Illumina MiSeq高通量测序方法,调查了板栗果实内生真菌群落组成以及在果肉和果壳多样性与组成,结果表明板栗果实中相对丰度平均最高的是子囊菌门Ascomycota(80.40%),其次为担子菌门Basidiomycota(7.70%);纲水平的丰度最高为粪壳菌纲Sordariomycetes(43.00%)和酵母纲Saccharomycetes(15.10%)。品种间共有(Shared)真菌类群在纲水平上,富集在座囊菌纲Dothideomycetes上,其丰度>90%;而品种间的优势类群有变化,除酵母菌纲在毛板红品种中最高(39.21%)外、粪壳菌纲真菌在另外5个板栗品种中最丰富(29.47%～59.56%)。果实组织间,果肉组织较之果壳具有更高的特有真菌种类,而果肉组织特有优势类群均来自担子菌,尤其是银耳纲Tremellomycetes的红菇目Russulales。LEfSe分析结果指出果壳和果肉组织显著性差异种群来自镰孢属Fusarium、梅奇酵母属Metschnikowia、迈耶氏酵母属Meyerozyma和德巴利酵母属Debaryomyces真菌,这些真菌在果肉组织中具有显著优势。采用组织分离和常规培养了6品种果肉组织的真菌,共获得有效菌株2346株,分属子囊菌、担子菌和毛霉菌门Mucoromycota。果实及其果壳、果肉上的真菌优势类群,在群落组成和丰度上与高通量测序技术结果相似。分析认为板栗果实具有丰富的、以子囊菌粪壳菌纲和酵母菌纲为优势类群的内生真菌群落组成和种群多样性,但建群种类主要来自座囊菌纲。板栗果实品种间的内生真菌群落组成结构具有明显差异。板栗果肉较之果壳组织有更为丰富的特有内生真菌多样性。板栗果肉和果壳组织内生真菌群落组成具有明显分化。研究为利用板栗健康微生物组防控果实病害和了解坚果类果实微生物组提供了基础。

关键词：板栗果实内生真菌组 illumina MiSeq测序群落组成多样性

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