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探究影响结肠癌预后的基因及其与免疫浸润细胞的相关性

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探究影响结肠癌预后的基因及其与免疫浸润细胞的相关性

作者：刘雨莎内蒙古医科大学

学位级别：硕士

研究目的:肿瘤相关免疫浸润细胞作为肿瘤微环境中最主要的成分,具有调控肿瘤生长的重要作用。基于生物信息学技术筛选影响结肠癌预后的免疫相关差异表达基因,并分析其与免疫浸润细胞的相关性,以期为探究肿瘤发生发展、评估患者预后、开... 详细信息

研究目的:肿瘤相关免疫浸润细胞作为肿瘤微环境中最主要的成分,具有调控肿瘤生长的重要作用。基于生物信息学技术筛选影响结肠癌预后的免疫相关差异表达基因,并分析其与免疫浸润细胞的相关性,以期为探究肿瘤发生发展、评估患者预后、开发新的免疫治疗策略提供理论指导。研究方法:基于TCGA数据库下载结肠癌RNA-seq表达数据和相应临床数据,筛选出结肠癌肿瘤组织和正常结肠组织间的差异表达基因。检索IMMPORT、IRIS和Innate DB数据库,下载免疫相关基因与结肠癌差异表达基因进行维恩交集,获得结肠癌免疫相关差异表达基因。基于此基因集,进行GO和KEGG富集分析,并运用单基因COX回归分析筛选出影响预后的差异表达基因。构建蛋白质互作网络,根据邻接节点数目筛选核心基因,并与影响预后的差异表达基因交集,获得下游研究的目的基因。然后,通过TIMER线上数据库分析目的基因在泛癌中的表达情况。利用GEO数据库和实时定量PCR分别验证目的基因在结肠癌肿瘤组织和结肠癌细胞中的表达差异。绘制目的基因的Kaplan-Meier生存曲线,并进行临床相关性分析。单基因GSEA富集分析目的基因参与的生物学过程。通过CIBERSORT算法分析目的基因表达量与免疫浸润细胞的关系。研究结果:研究从TCGA数据库筛选得到2642个差异表达基因,与免疫相关基因交集后获得760个免疫相关的差异表达基因。经过蛋白互作网络和单基因COX回归分析后,筛选得到影响结肠癌预后的免疫相关差异表达基因PPARGC1A。PPARGC1A表达量在膀胱尿路上皮癌、乳腺浸润癌、结肠癌、食管癌、多形成性胶质细胞瘤、头颈癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、肝癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌中显著下调,在肾嫌色细胞癌中显著上调。经验证,PPARGC1A表达在结肠癌肿瘤配对和非配对组织样本,以及结肠癌细胞HCT116中均显著下调。PPARGC1A表达高低与患者生存时间显著相关,即PPARGC1A表达量高时,结肠癌患者生存时间长。在临床相关性分析中,与II期患者相比,PPARGC1A表达量在IV期患者中显著下调;与M0期患者相比,PPARGC1A表达量在M1期患者中显著下调。GSEA单基因富集分析结果显示,PPARGC1A在β样蛋白形成的正向调控和淀粉样前体分解代谢的正向调控过程中发挥了重要作用,参与了核糖体、RNA聚合酶、胞质DNA感受等信号通路。最后,采用CIBERSORT算法分析发现,PPARGC1A表达与树突细胞、静止的CD4+T细胞、γδT细胞数目呈正相关,而与NK细胞、M0巨噬细胞、M2巨噬细胞、中性粒细胞呈负相关。研究结论:PPARGC1A作为影响结肠癌预后的免疫相关差异表达基因,在结肠癌肿瘤组织中低表达,影响着肿瘤远处转移。PPARGC1A表达与患者生存时间显著相关,即PPARGC1A低表达的患者,生存时间较短。这可能与结肠癌肿瘤组织中CD4+T细胞和树突细胞数目的增多,NK细胞、M0巨噬细胞、M2巨噬细胞以及中性粒细胞的减少有关。

关键词：结肠癌差异表达基因免疫浸润细胞生存预后

基于机器学习算法筛选膀胱肿瘤预后相关基因并分析其与免疫浸润细胞的关系

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河南外科学杂志 2023年第1期29卷 1-5页

作者：周玉贺王成宇符博黄珍林宁向辉贾占奎杨锦建郑州大学第一附属医院泌尿外科郑州450052

目的筛选膀胱肿瘤预后相关的基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)获得的芯片数据(GSE13507、GSE40355)作为训练组,用于筛选出差异表达基因(DEGs)。利用套索算法(LASSO)与支持向量机的递归特征消除算... 详细信息

目的筛选膀胱肿瘤预后相关的基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)获得的芯片数据(GSE13507、GSE40355)作为训练组,用于筛选出差异表达基因(DEGs)。利用套索算法(LASSO)与支持向量机的递归特征消除算法(SVM-RFE)从DEGs中筛选出膀胱肿瘤的关键基因。以癌症基因图谱计划数据库(TCGA)下载的膀胱肿瘤RNA-seq FPKM数据为验证组,验证关键基因的敏感性与特异性。下载TCGA临床数据用于对关键基因的生存分析,并用GEPIA数据库进行验证。利用CIBERSORT网站对验证组数据进行免疫浸润细胞分析,并探索预后相关的基因与免疫浸润细胞的关系。结果训练组中得到了176个差异基因,其中上调基因21个、下调基因155个。LASSO回归和SVM-RFE算法分别获得13、34个特征基因,取交集后共得到5个膀胱肿瘤关键基因(CYTL1、SRPX、ADH1B、PMP2、IQGAP3)。关键基因在验证组中均表现出了较高的敏感性与特异性。生存分析发现不同表达量的PMP2(P=0.002)、CYTL1(P=0.032)患者生存率有显著差异。在肿瘤组织中M0、M1巨噬细胞表现为高水平,未活化的肥大细胞表现为低水平,PMP2、CYTL1表达量与滤泡辅助性T细胞,CD8 T细胞负相关,而与未活化记忆CD4 T细胞、初始B细胞正相关。肿瘤微环境中具有高丰度活化的CD4记忆T细胞(P=0.017)、CD8 T细胞(P=0.049)患者预后更好。结论 CYTL1、PMP2基因与患者预后相关,可作为今后治疗的潜在靶点。肿瘤免疫微环境中PMP2、CYTL1基因表达量与滤泡辅助性T细胞、CD8 T细胞负相关,而与未活化的CD4记忆T细胞、初始B细胞正相关。活化的CD4记忆T细胞、CD8 T细胞可能是膀胱肿瘤患者的保护因素。

关键词：膀胱肿瘤机器学习免疫浸润细胞

肝细胞癌肿瘤突变负荷与肿瘤微环境免疫浸润细胞关联性研究

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临床医学进展 2021年第6期11卷 2880-2890页

作者：曲家麟王力姜曼张晓春青岛大学附属医院肿瘤精准医学中心山东青岛

目的:肝细胞癌是我国常见肿瘤之一,并占癌症死亡人数的第二位。随着免疫治疗的普及,免疫检查点抑制剂也逐步应用于肝癌,部分患者取得了良好的治疗效果。但是目前仍缺少准确地预测免疫检查点抑制剂的生物标志物。肿瘤突变负荷及免疫浸润... 详细信息

目的:肝细胞癌是我国常见肿瘤之一,并占癌症死亡人数的第二位。随着免疫治疗的普及,免疫检查点抑制剂也逐步应用于肝癌,部分患者取得了良好的治疗效果。但是目前仍缺少准确地预测免疫检查点抑制剂的生物标志物。肿瘤突变负荷及免疫浸润细胞是常用的免疫检查点抑制剂的生物标志物,可以有效预测其疗效,在恶性黑色素瘤及非小细胞肺癌中已经得到证实。但在肝癌中此类研究尚少,为了探究肿瘤突变负荷及免疫浸润细胞之间是否存在协同关系以便更好预测免疫检查点抑制剂在肝癌中的疗效,我们展开了本次研究。方法:从TCGA数据库中下载肝癌患者的基因表达数据、基因突变数据及临床数据。将所有患者根据肿瘤突变负荷分为高突变负荷组及低突变负荷组,从两组患者的数据中鉴定出差异表达最明显的基因。利用功能富集分析及蛋白质–蛋白质相互作用网络分析差异基因的生物学功能。CIBERSORT算法用于分析两组患者之间肿瘤微环境免疫浸润细胞的特征,Kaplan-Meier生存分析用以分析两组之间患者的生存时间有无差别。结果:TP53是肝细胞癌中突变频率最高的基因,在高肿瘤突变负荷组及低肿瘤突变复合组中,MAGEA3、MAGEA6及MAGEA12基因表达差异最为显著,其功能与细胞增殖、上皮–间质转化等恶性表型密切相关。在肿瘤微环境免疫浸润细胞差别中,低肿瘤突变复合组的记忆性CD4+ T细胞数量显著高于高肿瘤突变复合组,且生存期明显延长。结论:在肝细胞癌患者中,低肿瘤突变负荷组的CD4+ T细胞数量显著高于高肿瘤突变复合组,并且有更好的临床预后。这显示在肝细胞癌中,以TMB高低作为判断肝细胞癌免疫检查点抑制剂的唯一生物标志物尚有待商榷,应结合更多指标综合评估。

关键词：肝细胞癌免疫检查点抑制剂肿瘤突变负荷免疫浸润细胞

膀胱癌肿瘤微环境中抑制性免疫浸润细胞的研究进展

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现代医药卫生 2021年第17期37卷 2966-2971页

作者：黄楠(综述) 邓红彬(审校) 重庆医科大学附属第一医院肿瘤科重庆400016

免疫治疗在早期及晚期膀胱癌患者中均可发挥作用,但是仍有部分患者不能从免疫治疗中获益。肿瘤微环境介导的免疫逃逸可能是这部分患者对免疫治疗无应答的主要原因之一。在肿瘤微环境中发现一群抑制性免疫浸润细胞,能够通过内在及外在途... 详细信息

免疫治疗在早期及晚期膀胱癌患者中均可发挥作用,但是仍有部分患者不能从免疫治疗中获益。肿瘤微环境介导的免疫逃逸可能是这部分患者对免疫治疗无应答的主要原因之一。在肿瘤微环境中发现一群抑制性免疫浸润细胞,能够通过内在及外在途径介导肿瘤免疫抑制的形成。该类细胞包括髓样抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、调节性T细胞、肿瘤相关中性粒细胞。该文就这些抑制性免疫浸润细胞在膀胱癌中的免疫抑制及促癌机制、潜在的治疗靶点、与预后的相关性进行综述。

关键词：膀胱癌肿瘤微环境免疫浸润细胞免疫抑制综述

LRP1B对Lewis细胞增殖、迁移、侵袭及免疫微环境的影响

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徐州医科大学学报 2024年第2期44卷 100-105页

作者：李艳闫屹嵇桂娟张文辉赵力陈碧陈昊徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科江苏徐州221002

目的探讨LRP1B基因对Lewis肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及免疫微环境的影响。方法采用TCGA数据库分析LRP1B基因在肺癌及其他癌种中的表达情况。使用CRISPR/Cas9技术构建LRP1B敲除的Lewis细胞(KO组),选择野生型Lewis细胞作为对照组(NC组)。... 详细信息

目的探讨LRP1B基因对Lewis肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及免疫微环境的影响。方法采用TCGA数据库分析LRP1B基因在肺癌及其他癌种中的表达情况。使用CRISPR/Cas9技术构建LRP1B敲除的Lewis细胞(KO组),选择野生型Lewis细胞作为对照组(NC组)。免疫印迹法验证上述2组细胞中LRP1B蛋白的表达。采用CCK-8法检测细胞存活率,划痕实验和细胞侵袭实验检测细胞的迁移和侵袭能力。将制备好的KO组或NC组细胞悬液注射到C57BL/6小鼠右侧腋窝皮下,分别标记为KO组小鼠和NC组小鼠,观察小鼠皮下移植瘤生长情况,流式细胞术检测荷瘤小鼠移植瘤中骨髓源性抑制细胞(MDSC)和CD8^(+)T细胞浸润的变化,免疫组化法检测程序性死亡受体-1(PD-1)及其配体(PD-L1)的水平。结果LRP1B基因在肺腺癌和肺鳞癌组织中的表达水平明显高于癌旁组织。与NC组细胞相比,LRP1B基因敲除后KO组细胞的增殖、迁移和侵袭能力均显著增加(P细胞比例减少,PD-L1、PD-1表达水平显著增加(P细胞的增殖、迁移和侵袭能力,促进PD-L1、PD-1表达。

关键词：肺癌低密度脂蛋白受体相关蛋白1B 免疫微环境免疫浸润细胞程序性死亡配体1 程序性死亡受体-1

银屑病发病关键基因筛选、与免疫细胞浸润关系及有治疗潜力的中药预测

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山东医药 2023年第27期63卷 37-42页

作者：潘素跃王朴黄巧胡敏彭怡李伟佳戚嘉慧刘凌宇江千帆何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院皮肤科

目的筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考。方法在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因(DEGs)... 详细信息

目的筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考。方法在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因(DEGs);通过WGCNA包筛选出银屑病相关性最高的基因模块;将获取的银屑病DEG s与银屑病相关性最高的模块取交集,获得银屑病高度相关DEG s,并对其进行GO分析、KEGG分析。采用MCC、DEGREE、EPC和CLOSENESS算法从银屑病高度相关DEG s中筛选出与银屑病相关性更强的DEGs为银屑病发病关键基因。利用CIBERSORT反卷积法、Pearson相关分析银屑病发病关键基因与免疫浸润细胞比例的关系。通过将银屑病发病关键基因映射至COREMINE medical数据库,筛选出对银屑病有治疗潜力的中药。结果共筛选出348个DEG s。GO富集分析显示DEGs主要富集在对外部生物刺激的反应、线粒体蛋白复合体、内肽酶活性、丝氨酸型肽酶活性等方面;KEGG富集分析显示其主要涉及NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、P53信号通路、IL-17信号通路等与银屑病发病相关的信号通路。最终得到了PCNA、CXCL8、S100A9、CCNB1四个银屑病发病关键基因。银屑病发病关键基因PCNA和CCNB1与中性粒细胞和活化的树突状细胞均呈正相关性,S100A9和CXCL8与单核细胞均呈负相关性(P均免疫浸润细胞比例存在较强相关性;对银屑病具有治疗潜力的中药为厚朴花、大黄。

关键词：银屑病差异表达基因免疫浸润细胞中药材反卷积法生物信息学

HAPLN3基因在肾透明细胞癌中的表达及其与预后、免疫的关系

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中国现代医学杂志 2022年第22期32卷 53-62页

作者：张畅宋具昆袁东波陈伟明何虎钱城杨萌朱建国贵州医科大学研究生院贵州贵阳550004 贵州省人民医院泌尿外科贵州贵阳550002

目的探讨透明质酸和蛋白多糖链接蛋白家族基因成员3(HAPLN3)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与预后、免疫的关系。方法利用多个公共数据库分析HAPLN3在ccRCC中的差异表达、预后价值,以及与肿瘤微环境、免疫细胞浸润、免疫检查点及免... 详细信息

目的探讨透明质酸和蛋白多糖链接蛋白家族基因成员3(HAPLN3)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与预后、免疫的关系。方法利用多个公共数据库分析HAPLN3在ccRCC中的差异表达、预后价值,以及与肿瘤微环境、免疫细胞浸润、免疫检查点及免疫检查点阻断反应评分(TIDE)等的相关性,并行富集分析HAPLN3在ccRCC中的潜在作用机制。通过免疫组织化学法检测HAPLN3蛋白在癌组织和癌旁组织中的表达,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和Western blotting检测ccRCC细胞株(OS-RC-2、ACHN)HAPLN3 mRNA和蛋白的表达。细胞转染siRNA沉默HAPLN3,用qRT-PCR检测不同ccRCC细胞株中HAPLN3基因沉默的有效性。采用CCK-8法检测HAPLN3基因表达降低对不同ccRCC细胞株增殖的影响。结果生物信息学分析结果表明,ccRCC中HAPLN3 mRNA相对表达量高于正常肾脏组织(P细胞、CD4^(+)T淋巴细胞、CD8^(+)T淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润呈正相关(r_(s)=0.284、0.532、0.584、0.617、0.323和0.620,均P=0.000)。G4组CTLA4、LAG3、PDCD1、TIGIT mRNA相对表达量和TIDE评分高于G3组(P免疫及肿瘤通路相关。癌组织HAPLN3阳性表达率高于癌旁组织(P细胞HAPLN3 mRNA和蛋白相对表达量高于HK-2细胞(P细胞的OD值比较,采用重复测量设计的方差分析,结果:①不同时间点OS-RC-2、ACHN细胞的OD值有差异(F=481.158和292.321,均P=0.000);②两组OS-RC-2、ACHN细胞的OD值有差异(F=27.471和255.219,均P=0.002);③两组OS-RC-2、ACHN细胞的OD值变化趋势有差异(F=20.799和11.301,P=0.017和0.040)。结论HAPLN3在ccRCC中表达上调,并与肿瘤细胞增殖相关,可能是ccRCC患者的独立预后标志物,并有作为免疫治疗靶点的潜在价值。

关键词：肾透明细胞癌 HAPLN3 差异表达免疫浸润细胞生物信息学分析

基于生物信息数据库分析HAPLN3基因在肾透明细胞癌（ccRCC）中的表达、预后价值及免疫特征

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基于生物信息数据库分析HAPLN3基因在肾透明细胞癌（ccRCC）中的...

作者：张畅贵州医科大学

学位级别：硕士

目的:基于癌症基因组图谱(Hyaluronan and proteoglycan binding link protein gene family 3,TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)、免疫浸润分析(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)等多个公共数据库,对透明质酸和蛋白多糖结合的链接蛋白基因家族成员3(Hyaluronan and proteoglycan binding link protein gene family 3,HAPLN3)在肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中的表达、预后价值及免疫特征相关性分析。方法:首先通过TCGA、GTEx数据库对HAPLN3的m RNA表达水平进行泛癌分析。利用TCGA数据库获取了ccRCC的m RNA数据和相应的临床信息,使用R软件分析HAPLN3在ccRCC中差异表达,并观察HAPLN3在ccRCC不同组织学亚组WHO/ISUP分级III级(G3组)和IV级(G4组)之间的差异表达,研究HAPLN3对ccRCC生存期影响以及G3、G4亚组间生存差异。单因素和多因素Cox回归分析用于评估HAPLN3和五个主要因素,包括年龄、p T分期、p N分期、p TNM分期、WHO分级与总体生存期关系。基于TIMER数据库分析了HAPLN3与多种免疫细胞亚型浸润水平的相关性。通过基因共表达分析评估HAPLN3与各种免疫相关基因的关联性。通过免疫检查点分析和肿瘤免疫功能障碍和排除(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion,TIDE)评分比较G3和G4亚组之间免疫治疗的差异。最后应用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)来研究HAPLN3在ccRCC中的潜在免疫通路。构建人肾透明细胞癌细胞株OS-RC2、ACHN与人肾皮质近曲小管上皮细胞株HK-2,通过WB观察HAPLN3蛋白在肾癌细胞与正常细胞的差异表达。结果:泛癌分析发现HAPLN3在既往已有文献报道过的乳腺癌、前列腺癌、皮肤黑色素瘤等多种肿瘤组织与其正常组织中确实存在差异表达,并发现HAPLN3在c c RCC与正常组织之间表达也存在差异表达,其中在肾透明细胞癌中HAPLN3基因的表达量明显高于正常肾脏组织(P免疫相关性,通过XCELL算法发现HAPLN3在ccRCC中的表达与免疫评分、基质评分、肿瘤微环境均密切相关(P细胞、中性粒细胞、B细胞、CD8 T+细胞、巨噬细胞以及CD4+T细胞的浸润均呈正相关(P免疫细胞亚型浸润相关性评估中,我们发现HAPLN3表达与多种T细胞亚型相关,并与活化NK细胞、巨噬细胞M1等免疫细胞亚型呈正相关(P免疫检查点相关性分析中发现CTLA4、LAG3、PDCD1、TIGIT在G4组表达更高,并且G4期的ccRCC患者的免疫检查点阻断TIDE评分更高(P免疫基因呈正相关(P免疫相关通路显著富集,包括细胞因子受体相互作用,NK细胞介导的细胞毒性、趋化因子信号通路、自身免疫性甲状腺疾病、JAKTAT信号通路、粘附分子cam、造血细胞系、T细胞受体信号通路、原发性免疫缺陷、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、TOLL样受体信号通路、Notch信号通路、癌症相关通路、wnt信号通路等。通过对肾癌细胞株进行免疫印迹试验发现,HAPLN3表达水平在OS-RC2、ACNH肾癌细胞株中要明显高于HK-2正常肾脏细胞株。结论:基于生物信息数据库,HAPLN3在ccRCC中表达上调、并与组织学分级相关,可能是ccRCC患者的独立预后标志物,并具有作为免疫治疗靶点潜在价值。

关键词： HAPLN3 肾透明细胞癌免疫浸润细胞免疫检查点预后模型

SECTM1在胶质母细胞瘤中作为生物标志物的功能研究

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SECTM1在胶质母细胞瘤中作为生物标志物的功能研究

作者：程宛月宜春学院

学位级别：硕士

背景与目的:胶质母细胞瘤发病率和死亡率不断上升,是最常见的恶性肿瘤并且威胁着人类的健康。虽然化疗是胶质母细胞瘤患者的常规治疗,但是胶质母细胞瘤患者的治疗预后仍然严峻并且已经有化疗耐药性的报道。因此,为解决胶质母细胞瘤患者... 详细信息

背景与目的:胶质母细胞瘤发病率和死亡率不断上升,是最常见的恶性肿瘤并且威胁着人类的健康。虽然化疗是胶质母细胞瘤患者的常规治疗,但是胶质母细胞瘤患者的治疗预后仍然严峻并且已经有化疗耐药性的报道。因此,为解决胶质母细胞瘤患者化疗抗性去寻找新的治疗靶点。分泌型跨膜蛋白1(SECTM1)是通过在染色体17q25上发现CD7基因上游的DNase超敏反应位点而发现的,但SECTM1在胶质母细胞瘤(Glioblastoma,缩写GBM)中的作用及其临床意义尚不清楚。本文通过生信、体内和体外实验研究SECTM1在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达、临床病理特征之间的关系、对细胞功能的影响以及SECTM1对逆转U251/TMZ细胞耐药性的影响。本研究还探索了两个潜在的SECTM1靶向抑制剂。方法:使用http://***/(UALCAN数据库官网)分析探讨胶质母细胞瘤中SECTM1的蛋白水平差异表达情况,使用KM-plotter官网https://***/analysis/对SECTM1进行生存分析验证。采用GSEA4.1.0对SECTM1进行KEGG通路和GO功能富集分析。运用R语言、T检验对SECTM1基因表达水平和临床关系进行分析。通过TCGA数据库提取所有胶质母细胞瘤患者的临床数据,并计算风险分数与这些临床资料的相关性。用GEPIA筛选SECTM1差异表达基因,并使用CIBERSORT算法计算胶质母细胞瘤肿瘤浸润免疫细胞。最后构建低表达SECTM1的GBM细胞系,体外验证稳定低表达SECTM1细胞系的蛋白表达(western blot法)、以及对增殖能力、迁移能力和克隆能力的影响(细胞划痕实验和软琼脂克隆实验);体内验证稳定低表达SECTM1对肿瘤生长和胶质母细胞瘤耐药的影响(裸鼠皮下移植瘤模型实验)。基于Alphafold2进行SECTM1蛋白质结构预测。结果:SECTM1在胶质母细胞瘤组织中表达上调。较高的SECTM1水平与较低的生存率相关。SECTM1相关基因的差异表达分析结果以及SECTM1表达水平与胶质母细胞瘤组织中各种免疫细胞浸润的关系也表明,SECTM1可能在肿瘤发生、发展或肿瘤免疫应答中发挥重要作用。SECTM1的低表达抑制胶质母细胞瘤细胞和肿瘤的生长。实验研究表明,敲低SECTM1能够显著抑制胶质母细胞瘤细胞系替莫唑胺耐药细胞下调,低表达增强细胞对替莫唑胺的敏感性。结论:SECTM1在胶质母细胞瘤组织中是高表达的,是胶质母细胞瘤的一种生物标志物。敲低SECTM1后U251和U87细胞迁移、侵袭、增殖、以及细胞成球能力减弱;敲低SECTM1后也可以抑制小鼠体内移植瘤的生长。其次,药敏实验发现敲低SECTM1能逆转胶质母细胞瘤皮下移植瘤对替莫唑胺的敏感性。最后,本研究还探索了两个潜在的SECTM1靶向抑制剂。以上这些结果表明,SECTM1可能会成为胶质母细胞瘤治疗和解决化疗抗性的潜在靶点之一。

关键词： SECTM1 差异表达基因免疫浸润细胞替莫唑胺抗性胶质母细胞瘤