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三个地方鸡种MHCB-LBII基因遗传变异与免疫性状的关联分析

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生物工程学报 2013年第7期29卷 904-913页

作者：李福伟李淑青逯岩雷秋霞韩海霞周艳武彬曹顶国山东省农业科学院家禽研究所山东济南250023 山东省家禽育种工程技术研究中心山东济南250023 山东省农业管理干部学院山东济南250100

旨在研究3个地方鸡品种（汶上芦花鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡）主要组织相容性复合体（MajorHistocompatibility Complex,MHC）B-LB II基因遗传变异与绵羊红细胞（Sheep red blood cell,SRBC）、禽流感（Avian influenza,AI）和新城疫（N... 详细信息

旨在研究3个地方鸡品种（汶上芦花鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡）主要组织相容性复合体（MajorHistocompatibility Complex,MHC）B-LB II基因遗传变异与绵羊红细胞（Sheep red blood cell,SRBC）、禽流感（Avian influenza,AI）和新城疫（Newcastle disease,ND）抗体滴度等免疫性状的关系,揭示不同品种间基因变异与免疫性状的相关性。以300只地方品种鸡为材料,运用直接测序和聚合酶链式反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）等技术检测MHC B-L BII基因的序列变异。在3个地方鸡品种中分别发现了19~22个核苷酸变异位点,可导致其中16~18个氨基酸的变异。3个地方鸡种MHC B-L BII基因中分别有7~8个（Single nucleotidepolymorphism,SNP）位点与部分免疫性状存在不同程度的显著相关性。变异位点G97A和T138A在3个品种中均存在,与SRBC、ND、AI抗体滴度均显著相关（P〈0.05）。其中,G97A突变在济宁百日鸡中与ND抗体滴度显著相关（P〈0.05）,在莱芜黑鸡中与SRBC抗体滴度显著相关（P〈0.05）,在汶上芦花鸡中与H9抗体滴度显著相关（P〈0.05）;变异位点T138A在汶上芦花鸡和济宁百日鸡中与H9抗体滴度显著相关（P〈0.05）。研究表明3个地方鸡种的MHC B-LB II基因遗传变异与免疫性状存在显著关联。

关键词：主要组织相容性复合体 MHCB-LBII 聚合酶链式反应-单链构象多态性免疫性状

山羊GOLA-DQB1基因外显子2多态性与免疫性状的相关分析

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遗传 2008年第7期30卷 870-876页

作者：邢凤李培培李珏李成渤王建民山东农业大学动物科技学院泰安271018

利用PCR-RFLP技术,对莱芜黑山羊、鲁波山羊和波尔山羊3个山羊种群共175只个体的GOLA-DQB1基因外显子2进行遗传多态性研究,并对山羊种群的血液免疫指标的效应进行了分析。结果表明:3个山羊种群共检测到(AA、BB、CC、AB、AC、BC、DD)7种... 详细信息

利用PCR-RFLP技术,对莱芜黑山羊、鲁波山羊和波尔山羊3个山羊种群共175只个体的GOLA-DQB1基因外显子2进行遗传多态性研究,并对山羊种群的血液免疫指标的效应进行了分析。结果表明:3个山羊种群共检测到(AA、BB、CC、AB、AC、BC、DD)7种基因型,GOLA-DQB1基因外显子2的第24、151位的碱基表现出多态性。多数指标品种效应是主要效应。莱芜黑山羊中,BC基因型的淋巴细胞百分比(W-SCR)显著高于AC、CC基因型(P0.05)。波尔山羊中,BC基因型的W-LCC低于AA、AB、BB基因型,但差异不显著(P>0.05)。鲁波山羊中,BC、AC基因型的W-LCC显著低于AA基因型(P免疫性状有一定的相关性。

关键词：山羊 MHC-DQB1 PCR-RFLP 免疫性状相关分析

鸭Toll样受体4基因(TLR4)第3外显子的多态性及其与免疫性状的关联分析

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农业生物技术学报 2012年第9期20卷 1055-1064页

作者：李国勤贾红敏马永升田勇李进军卢立志浙江省农业科学院畜牧兽医研究所

Toll样受体4(TLR4)是Toll样受体家族中重要的模式识别受体之一。为分析蛋鸭TLR4基因单核苷酸多态性(SNPs)及其免疫性状相关的分子标记,本研究采用直接测序方法在绍兴鸭与缙云麻鸭(Anas platyrhyncha domestica)TLR4基因第3外显子的2254b... 详细信息

Toll样受体4(TLR4)是Toll样受体家族中重要的模式识别受体之一。为分析蛋鸭TLR4基因单核苷酸多态性(SNPs)及其免疫性状相关的分子标记,本研究采用直接测序方法在绍兴鸭与缙云麻鸭(Anas platyrhyncha domestica)TLR4基因第3外显子的2254bp序列搜寻,结果共发现10个SNP位点,χ2检验表明,其中7个SNP位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。采用最小二乘法对基因型与蛋鸭部分免疫性状关联分析发现,T141G与T398C位点AB基因型个体的法氏囊指数与白细胞介素-2(IL-2)水平显著高于BB基因型个体(P免疫性状的重要分子标记,可尝试作为蛋鸭免疫性状的候选分子标记。

关键词：蛋鸭 Toll样受体4基因(TLR4) 遗传多态性免疫性状

Vps28基因敲除小鼠模型的构建及其对泌乳和免疫性状影响的研究

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生物技术通报 2022年第3期38卷 164-172页

作者：丁亚群丁宁谢深民黄梦娜张昱张勤姜力中国农业大学动物科学技术学院畜禽育种国家工程实验室农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室北京100193 山东农业大学动物科技学院泰安271018

尽管基于QTL定位和关联分析研究挖掘了许多奶牛产奶性状候选功能基因,然而仅有少数几个基因经过体内外的功能验证。本课题组前期全基因组关联分析(GWAS)研究结果表明Vps28基因与奶牛产奶性状表型显著相关,并在奶牛乳腺组织中特异性高表... 详细信息

尽管基于QTL定位和关联分析研究挖掘了许多奶牛产奶性状候选功能基因,然而仅有少数几个基因经过体内外的功能验证。本课题组前期全基因组关联分析(GWAS)研究结果表明Vps28基因与奶牛产奶性状表型显著相关,并在奶牛乳腺组织中特异性高表达。为了深入了解该基因对泌乳性状的作用和功能,本研究利用CRISPR/Cas9技术构建了Vps28基因敲除小鼠,对其进行体内功能研究。研究结果显示Vps28基因敲除纯合型小鼠(Vps28-/-)极可能导致胚胎早期死亡,故只获得杂合型基因敲除小鼠(Vps28+/-)。敲除小鼠模型构建成功后,检测乳腺组织和脾脏组织中Vps28基因mRNA和蛋白的表达,结果显示与野生型小鼠(Vps28+/+)相比,Vps28+/-杂合型小鼠Vps28的mRNA和蛋白表达量均显著下降。进一步对母鼠的泌乳量、乳房形态和血常规进行检测,发现Vps28敲除母鼠的泌乳量下降,乳头明显凹陷,且血常规中白细胞数量、中性粒细胞数量、淋巴细胞数量和中间细胞数量显著低于野生型小鼠,推测Vps28基因不但影响泌乳,而且影响相关免疫性状。

关键词： CRISPR/Cas9 基因敲除小鼠 Vps28基因泌乳免疫性状

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影响猪免疫性状的单倍型关联分析

畜牧兽医学报 2013年第6期44卷 843-852页

作者：罗维真陈少康张龙超程笃学颜华李勇王立刚宋欣马小军刘欣李稳梁晶赵克斌王立贤中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 三元种业畜牧研究院北京100192 北京市畜牧兽医总站北京100107 四川农业大学动物医学院雅安625014

旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红... 详细信息

旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因。分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著;8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因。结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究。

关键词：免疫性状单倍型关联分析猪

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不同鸡种间部分免疫性状的比较

中国兽医学报 2010年第3期30卷 317-322页

作者：王存波王克华包文斌雷黎丽周琼廖菁陈蓉秦玉蓉胡国顺龚琳琳陈国宏常国斌扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 中国农业科学院家禽研究所江苏扬州225003

随机抽取如皋鸡、文昌鸡及安卡鸡各80只,每个品种分为A、B2组,每组分别于49日龄腿肌注射25%绵羊红细胞(Sheep red blood cell,SRBC)0.5、1mL。分别检测了41、56、71、89日龄的异嗜性粒细胞/淋巴细胞(Hetero-phil/Lymphocyte,H/L)值,56... 详细信息

随机抽取如皋鸡、文昌鸡及安卡鸡各80只,每个品种分为A、B2组,每组分别于49日龄腿肌注射25%绵羊红细胞(Sheep red blood cell,SRBC)0.5、1mL。分别检测了41、56、71、89日龄的异嗜性粒细胞/淋巴细胞(Hetero-phil/Lymphocyte,H/L)值,56、71、89日龄的SRBC抗体滴度以及30、41、56、71、89日龄的新城疫(Newcastle disease,ND)和禽流感(Avian influenza,AI)抗体滴度。结果显示,同一检测日龄H/L值在不同品种间存在差异,随着日龄的增加品种间的差异逐步减小;不同品种H/L值随时间变化的趋势不同,如皋鸡4个日龄变化平缓,文昌鸡和安卡鸡呈先高后低趋势。3个品种SRBC抗体滴度均在56日龄达到最高,其中文昌鸡最高,安卡鸡最低,且差异显著(P免疫ND疫苗后3个品种抗体滴度表现出相似的变化规律,但是变化幅度有所差异,安卡鸡前3个检测日龄滴度介于如皋鸡和文昌鸡之间,但免疫后期迅速上升,71和89日龄滴度极显著高于其他2个品种(P免疫性状在品种间存在遗传差异,中国地方鸡种比外来鸡种在多个免疫性状上存在不同程度的优势。

关键词：鸡免疫性状抗病性品种

中国北京油鸡和引进白来航蛋鸡免疫性状的比较

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畜牧兽医学报 2007年第12期38卷 1383-1388页

作者：吴春梅赵桂苹文杰陈继兰郑麦青陈国宏扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100094

选取同期孵化出雏的中国地方鸡种北京油鸡(Beijng-You Chicken,BYC)和引进蛋鸡品种白来航鸡(WhiteLeghorn,WL)各250只母雏,在相同饲养条件和免疫程序下饲养,测定和对比异嗜性粒细胞(Heterophil)数量、淋巴细胞(Lymphocyte)数量和异嗜性... 详细信息

选取同期孵化出雏的中国地方鸡种北京油鸡(Beijng-You Chicken,BYC)和引进蛋鸡品种白来航鸡(WhiteLeghorn,WL)各250只母雏,在相同饲养条件和免疫程序下饲养,测定和对比异嗜性粒细胞(Heterophil)数量、淋巴细胞(Lymphocyte)数量和异嗜性粒细胞/淋巴细胞比率(Heterophil/Lymphocyte,H/L)、白细胞总数(Bloodwhite cell count,BWCC)、绵羊红细胞(Sheep blood red cell,SRBC)免疫抗体滴度和不同日龄的禽流感(Avian Influ-enze,AI)、新城疫(Newcastle disease,ND)的免疫抗体滴度等免疫性状的差异。试验结果表明:①北京油鸡的H/L值为0.36±0.21,白来航蛋鸡为0.52±0.51,二者呈极显著差异(P0.05);③14、28日龄两次免疫禽流感疫苗(H5N1毒株)后,在免疫后21、41、71、105天的4个测定日中,两个品种的禽流感免疫抗体滴度值均呈现先升高后降低的变化趋势,北京油鸡在4个测定日龄的AI免疫滴度值都均高于白来航蛋鸡,差异均达到极显著水平(P免疫新城疫疫苗(LaSota毒株),在免疫后21、41、71和105天测定ND抗体滴度,北京油鸡在免疫后21天时达到最高,之后随日龄的增长而呈逐渐降低趋势;白来航蛋鸡在免疫后41天时抗体滴度水平达到最高,以后随日龄增长而下降。4个测定日龄的ND滴度水平北京油鸡均高于白来航蛋鸡。该研究结果初步显示,中国地方鸡种北京油鸡和引进白来航蛋鸡品种的免疫性状具有明显的遗传差异,北京油鸡的综合免疫性能和抗应激能力优于白来航蛋鸡。

关键词：北京油鸡来航蛋鸡免疫性状抗体滴度

鸡白细胞介素-1β基因内含子1、2多态与部分免疫性状的相关性分析

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中国农业科学 2010年第6期43卷 1255-1264页

作者：王存波常国斌周琼廖菁龚琳琳陈蓉胡国顺雷黎丽张海波王克华包文斌陈国宏扬州大学动物科学与技术学院中国农业科学院家禽研究所扬州翔龙禽业发展有限公司

【目的】以白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)基因为候选基因,研究其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),及其与部分免疫性状的关系。【方法】根据红色原鸡IL-1β基因序列设计引物一对,利用PCR-SSCP方法检测了... 详细信息

【目的】以白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)基因为候选基因,研究其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),及其与部分免疫性状的关系。【方法】根据红色原鸡IL-1β基因序列设计引物一对,利用PCR-SSCP方法检测了如皋鸡、文昌鸡以及安卡鸡IL-1β基因内含子1、2的SNP,同时检测了56日龄的血清IL-1浓度、异嗜性粒细胞/淋巴细胞(heterophil/lymphocyte,H/L)值、绵羊红细胞(sheep red blood cell,SRBC)抗体滴度、新城疫(newcastle disease,ND)抗体滴度、禽流感(avian influenza,AI)抗体滴度5个免疫性状,并进一步分析了SNP位点与免疫性状的关系。【结果】共检测出6个SNP位点,分别为T107G突变、T130A突变、C143T突变、A208C突变、T241G突变及T274C突变。经关联分析,发现107、208、241及274位点存在显著的基因型效应(P性状上存在显著效应(P免疫性状均优于野生型,有望在鸡的抗病育种中筛选为新的标记位点。利用基因型组合选择效果优于对单个位点的选择。

关键词：白细胞介素-1β基因单核苷酸多态性免疫性状鸡

山东地方鸡MHCB-F基因遗传变异与免疫性状相关性研究

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农业生物技术学报 2013年第2期21卷 179-184页

作者：李福伟逯岩雷秋霞韩海霞周艳李桂明武彬曹顶国山东省农业科学院家禽研究所山东省家禽育种工程技术研究中心

鸡主要组织相容性复合体(MHC)由一组紧密连锁的、高度多态的基因座位所组成,在机体的免疫应答和调控等方面具有极其重要的作用。本研究旨在研究3个地方鸡(Gallus domesticus)品种(鲁禽鸡、琅琊鸡、石岐杂鸡)Major histocompatibility co... 详细信息

鸡主要组织相容性复合体(MHC)由一组紧密连锁的、高度多态的基因座位所组成,在机体的免疫应答和调控等方面具有极其重要的作用。本研究旨在研究3个地方鸡(Gallus domesticus)品种(鲁禽鸡、琅琊鸡、石岐杂鸡)Major histocompatibility complex(MHC)B-F基因遗传变异与Sheep red blood cell(SRBC)、Avianinfluenza(AI)和New castle disease(ND)免疫抗体滴度等免疫性状的关系,揭示不同品种间基因变异与免疫性状的相关性。研究结果表明:3个品种SRBC免疫抗体滴度石歧杂鸡最高,与另外两个品种差异极显著(P0.05)。通过PCR-SSCP方法分析了包括MHCB-F基因外显子2在内长度为396bp的片段。在这3个品种中分别发现了49、45和41个核苷酸变异位点,其中分别有40、37和32个引起了氨基酸突变,关联分析结果表明:3个品种中分别有6、9、4个SNPs位点与所检测的免疫性状显著相关(P免疫性状相关性基本一致,二者共有5个变异位点与免疫性状相关性一致,其中位点A192C、A217G均与新城疫抗体滴度显著相关(P<0.05),位点A217G与禽流感H5抗体滴度显著相关(P<0.05),位点A211G与禽流感H9抗体滴度显著相关(P<0.05),位点G232A与绵羊红细胞抗体滴度显著相关(P<0.05)。在石歧杂鸡中位点C183G与新城疫、禽流感H9抗体滴度显著相关(P<0.05)。研究结果对于临床疫苗的使用具有重要的指导作用。

关键词：鸡 MHC B-F PCR-SSCP 免疫性状