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佛坪国家级自然保护区秦岭箭竹克隆结构的SSR分析

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生态学报 2016年第20期36卷 6496-6505页

作者：马青青刘建军余鸽刘伟马亦生西北农林科技大学林学院杨凌712100 西北农林科技大学风景园林艺术学院杨凌712100 陕西佛坪国家级自然保护区管理局佛坪723400

利用SSR分子标记技术分析了佛坪国家级自然保护区秦岭箭竹(Fargesia qinlingensis)的克隆多样性和克隆结构,以探讨小尺度范围内秦岭箭竹自然居群遗传变异的分布特征,对该种开花特性、高山地区生态环境维护和大熊猫的保护提供重要依据。... 详细信息

利用SSR分子标记技术分析了佛坪国家级自然保护区秦岭箭竹(Fargesia qinlingensis)的克隆多样性和克隆结构,以探讨小尺度范围内秦岭箭竹自然居群遗传变异的分布特征,对该种开花特性、高山地区生态环境维护和大熊猫的保护提供重要依据。结果表明7对SSR引物共扩增出79个位点,其中多态性位点77个,多态位点百分率(PPB)为97.47%。秦岭箭竹的142个分株共形成107个克隆,最大克隆可达5 m。克隆多样性略高于其他克隆植物的平均值(D=0.62,G/N=0.17,E=0.68),基因型比率(G/N)、Simpson指数(D)、平均克隆大小(N/G)和Fager均匀性指数(E)分别为0.7535、0.9680、1.3271和0.5109。克隆空间结构分析表明秦岭箭竹的克隆构型为密集型,各克隆呈镶嵌性分布,同一克隆的分株排列紧密。克隆聚类分析表明各克隆之间聚类不明显,总体上来自同一样地的克隆被聚为一类。空间自相关分析显示在空间距离为36 m范围内,分株比基株有更显著的空间遗传结构,空间自相关系数r的取值范围分别为0.084—0.626和0.024—0.288,说明克隆繁殖在一定程度上限制了空间遗传结构的范围。样地内秦岭箭竹个体在空间距离小于44 m时存在显著的正相关空间结构,特别是在4 m处表现出最大的空间自相关系数(r=0.626),表明空间距离相距4 m内的个体最有可能属于同一克隆,4 m比5 m更能表现出清晰的克隆结构,X-轴截距为52.280,代表了秦岭箭竹不规则克隆的平均最小长度。秦岭箭竹的克隆多样性和克隆结构与初始苗补充、花粉散播方式和微环境差异有关。

关键词：秦岭箭竹克隆多样性克隆结构 SSR

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匍匐茎草本植物蛇莓小尺度克隆结构

生态学报 2009年第7期29卷 3540-3548页

作者：李钧敏金则新台州学院生态研究所临海317000

采用ISSR分子标记技术比较分析了3个斑块匍匐茎草本植物蛇莓的遗传多样性、克隆多样性和克隆结构,探讨蛇莓克隆结构的形成机制及与环境的相关性。结果表明蛇莓的遗传多样性较低,多态位点百分率P为37.93%,Shannon信息指数I为0.2402,Nei指... 详细信息

采用ISSR分子标记技术比较分析了3个斑块匍匐茎草本植物蛇莓的遗传多样性、克隆多样性和克隆结构,探讨蛇莓克隆结构的形成机制及与环境的相关性。结果表明蛇莓的遗传多样性较低,多态位点百分率P为37.93%,Shannon信息指数I为0.2402,Nei指数h为0.1677;蛇莓的克隆多样性与其它克隆植物较为接近,基因型比率G/N=0.2013,Simpson多样性指数D为0.6396,基因型分布的均匀度E为0.5862;蛇莓的遗传变异大部分存在于斑块间,基因流较小,仅为0.1019。3个斑块蛇莓的遗传多样性以临海斑块(LH)最高(P=10.34%,I=0.0513,h=0.0344),安吉斑块(AJ)次之(P=10.34%,I=0.0443,h=0.027),而天台斑块(TT)最低(P=5.17%,I=0.0325,h=0.0227)。基株数目、基因型比率、Simpson多样性指数和基因型分布的均匀度均表明克隆多样性以LH斑块最大(G=12,G/N=0.3077,D=0.8677,E=0.8380),AJ斑块次之(G=9,G/N=0.1800,D=0.5870,E=0.4753),TT斑块最低(G=5,G/N=0.1163,D=0.4642,E=0.4453)。3个斑块中均存在优势克隆,但优势克隆的大小在3个斑块中均不相同,以LH斑块最小,AJ斑块次之,TT斑块最大。空间自相关分析显示LH斑块在20cm和40cm时存在显著性正相关,其X轴截矩为49.959;AJ斑块仅在20cm时存在显著性正相关,其X轴截矩为63.333;TT斑块在20cm、30cm、40cm和70cm时均存在显著性正相关,其X-轴截矩高达90.512。这表明3个不同斑块内蛇莓基因型的空间分布距离不同,TT斑块最大,AJ斑块最小;克隆所能到达的距离也不同,TT斑块最大,LH斑块最小。3个不同斑块蛇莓的遗传多样性、克隆多样性与克隆结构具有明显的差异。蛇莓的遗传多样性与克隆多样性与蛇莓较强的克隆繁殖能力和较低的种子萌发率有关。蛇莓的遗传结构、克隆结构及克隆的空间分布格局与不同斑块所处生境的生态因子及其它因素(如干扰、演替和突变)有关。

关键词：蛇莓克隆多样性克隆结构 ISSR

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额尔齐斯河流域银白杨克隆结构及多样性研究

林业科学研究 2013年第4期26卷 426-432页

作者：郑书星张建国段爱国何彩云保尔江王健中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室北京100091 中国林业科学研究院资源昆虫研究所云南昆明650224 阿勒泰地区林业科学研究所新疆阿勒泰836500

新疆额尔齐斯河流域河谷的银白杨天然林分呈雌雄独立斑块状分布,为了解其成因及分布模式,利用SSR分子标记技术对根据2种采样策略采集的银白杨样本进行了克隆结构和克隆多样性研究。结果表明:(1)运用12对SSR引物对采自各雌雄独立斑块的... 详细信息

新疆额尔齐斯河流域河谷的银白杨天然林分呈雌雄独立斑块状分布,为了解其成因及分布模式,利用SSR分子标记技术对根据2种采样策略采集的银白杨样本进行了克隆结构和克隆多样性研究。结果表明:(1)运用12对SSR引物对采自各雌雄独立斑块的所有样本进行分析,发现所有样本单株是同1个无性系克隆,斑块内只有1个基株,即斑块居群是单克隆结构;(2)整个流域不同斑块所采集的90个样本用12对SSR引物进行扩增分析,共检测到53个基因型(克隆基株),银白杨居群克隆多样性水平较高,Simpson指数(D)平均为0.983,基因型比率PD平均为0.589。银白杨以根孽方式繁殖后代,其最初建群时由多个不同基因型克隆基株形成了较高的克隆多样性,现存植株是克隆后代或克隆后代的后代。

关键词：银白杨克隆结构克隆多样性 SSR

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不同年龄巴山木竹种群克隆结构

生态学报 2017年第14期37卷 4743-4753页

作者：余鸽龙凤来刘建军马青青康永祥黄建曹庆西北农林科技大学林学院杨凌712100 杨凌职业技术学院杨凌712100 西北农林科技大学风景园林艺术学院杨凌712100 陕西佛坪国家级自然保护区管理局佛坪723400

很多竹类植物是典型的克隆植物,也是大熊猫的食物。研究典型竹子种群克隆结构的形成和发展对竹林的生产和抚育具有理论和实践意义,可为预测该竹林群落的演替趋势和大熊猫保护提供科学依据。利用SSR标记研究不同年龄A(7龄)、B(>30龄)和C(... 详细信息

很多竹类植物是典型的克隆植物,也是大熊猫的食物。研究典型竹子种群克隆结构的形成和发展对竹林的生产和抚育具有理论和实践意义,可为预测该竹林群落的演替趋势和大熊猫保护提供科学依据。利用SSR标记研究不同年龄A(7龄)、B(>30龄)和C(>60龄)巴山木竹种群的克隆结构和多样性,探讨小尺度范围内不同年龄巴山木竹种群的克隆结构及斑块的建立和发展。8对SSR引物共扩增出了118个位点,3个种群样地的256个样本共检测到了49个克隆(基因型),A、B和C种群分别检测出31、10个和8个克隆。随着种群年龄的增长,巴山木竹克隆面积增加,克隆数量减少;A和B样地各克隆分布格局为团块状,而C样地克隆既有团块状又有离散状。这一结果显示出在幼苗定居的初期,基株可能以短距离的克隆延伸为主从而呈现出团块状;而随着年龄的增长,克隆面积不断扩大,当复轴混生型的巴山木竹克隆受到强大的压迫时,基株可能会进行较多的单轴和长距离克隆延伸,呈现出离散状。Mantel检测和空间自相关分析都支持3个样地在小尺度范围内存在明显的克隆空间遗传结构。3个样地在10 m等级下显著的正相关空间遗传结构距离为3.1、28、48 m,X-轴截距为9.051、30.698和50.536,空间自相关系数的范围分别为0.1—0.167、0.008—0.703和0.006—0.735。由此可推断,随着年龄的增长,巴山木竹克隆斑块的规模在不断地扩大,同一克隆的分株数量增加,在均匀取样情况下,正相关空间遗传结构距离范围内取到具有相同基因型的可能性越大。A、B和C 3样地的基因型比率(G/N)为1、0.14和0.055,Simpson多样性指数(D)分别为1、0.876和0.744。这说明巴山木竹幼苗期基因型比例远远高于成年的竹林,随着年龄的增长巴山木竹克隆多样性虽有所降低,但由于有性繁殖的作用仍然保持了较高的多样性。聚类和主坐标分析均表明总体上各样地的克隆被聚为一类,但不同样地少数克隆的基因型有重叠和聚集,可推断出不同巴山木竹种群之间可能存在着基因流动和近似的克隆起源。

关键词：巴山木竹克隆结构克隆多样性

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珠芽蓼种群克隆多样性及克隆结构的初步研究

植物生态学报 2007年第4期31卷 561-567页

作者：陆建英马瑞君孙坤西北师范大学生命科学学院兰州730070 韩山师范学院生物系广东潮州521041

珠芽蓼(Polygonum viviparum)是青藏高原东缘广泛分布的克隆植物,具有有性和无性(根状茎和珠芽)两种生殖方式。该研究采用RAPD技术对分布于不同海拔的珠芽蓼7个自然种群进行了克隆结构和克隆多样性(是单克隆种群还是多克隆种群)以及克... 详细信息

珠芽蓼(Polygonum viviparum)是青藏高原东缘广泛分布的克隆植物,具有有性和无性(根状茎和珠芽)两种生殖方式。该研究采用RAPD技术对分布于不同海拔的珠芽蓼7个自然种群进行了克隆结构和克隆多样性(是单克隆种群还是多克隆种群)以及克隆多样性与海拔因子之间的相关性研究,为了解高山克隆植物对环境的适应性策略及揭示克隆植物的繁殖和分布特点提供科学依据。研究结果表明:1)采用13条RAPD引物对珠芽蓼7个种群共140个样本进行扩增分析,共扩增到117个位点,其中多态性位点84个,多态位点百分率PPL达到71.79%,检测到43个基因型,且全部为局限型基因型;2)与Ellstrand和Roose(1987)总结的克隆植物的克隆多样性平均值相比(PD=0.17,D=0.62),珠芽蓼种群克隆多样性水平稍高,Simpson指数平均为0.639,基因型比率PD平均为0.307;3)克隆结构分析表明,珠芽蓼种群内克隆之间的镶嵌明显,这可能与珠芽蓼过渡型的克隆构型有关。研究中珠芽蓼种群的构型有游击型、密集型以及这两者之间的过渡类型;4)采用SPSS软件对珠芽蓼种群的克隆多样性与海拔高度进行相关性分析,结果显示它们之间并无明显的相关性。

关键词：珠芽蓼克隆植物克隆多样性克隆结构 RAPD

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艾纳香野生种群克隆多样性及克隆结构研究

广西植物 2010年第2期30卷 209-214页

作者：庞玉新王文全张影波莫廷辉袁媛北京中医药大学中药学院北京100102 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海南儋州571737 海南大学儋州校区农学院海南儋州571737 海南大学儋州校区环植学院海南儋州571737

艾纳香是具有克隆生长习性的多年生宿根性草本植物,其广布于中国南部,为了更有效地保护和合理利用艾纳香资源,本文利用RAPD分子标记技术,对4个野生艾纳香种群进行了克隆结构和克隆多样性(单克隆种群或多克隆种群)进行了初步研究。结果表... 详细信息

艾纳香是具有克隆生长习性的多年生宿根性草本植物,其广布于中国南部,为了更有效地保护和合理利用艾纳香资源,本文利用RAPD分子标记技术,对4个野生艾纳香种群进行了克隆结构和克隆多样性(单克隆种群或多克隆种群)进行了初步研究。结果表明:(1)10对10bp随机引物共检测到70条谱带,其中多态带为60条,占85.71%,检测到64个基因型,且全部为局限基因型;(2)与Ellstrand & Roose(1987)总结的克隆多样性平均值(PD=0.17,D=0.62)相比艾纳香的种群克隆多样性水平稍高,Simpson指数平均为0.973,基因型比率PD平均为0.800;(3)遗传一致度和遗传距离分析表明,4个艾纳香野生种群被分成两组,一组是海南的所有种群,另外一组是云南类群。

关键词：艾纳香克隆植物克隆多样性克隆结构遗传多样性

青藏高原东缘中国沙棘的克隆多样性及克隆结构

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草业学报 2012年第3期21卷 117-124页

作者：许璐苏雪董莉娜张辉陈纹江龙龙刘泾霞孙坤西北师范大学生命科学学院甘肃兰州730070

应用随机扩增多态性DNA标记(RAPD markers)对青藏高原东缘中国沙棘的克隆结构、克隆多样性进行了初步的探讨。结果表明,1)14条RAPD引物在8个中国沙棘居群共184个样本中平均形成55.75种条带,平均有15.13种条带在居群内表现出多态性,平均... 详细信息

应用随机扩增多态性DNA标记(RAPD markers)对青藏高原东缘中国沙棘的克隆结构、克隆多样性进行了初步的探讨。结果表明,1)14条RAPD引物在8个中国沙棘居群共184个样本中平均形成55.75种条带,平均有15.13种条带在居群内表现出多态性,平均多态条带百分率为27.64%;鉴别出26种基因型,平均每基株形成3.4个分株;2)与应用DNA分子标记研究的其他克隆繁殖能力较强的植物相比,中国沙棘的克隆多样性水平偏低,Simpson’s多样性指数(D)平均值为0.85;Fager’s均匀度指数(E)平均值为0.87;3)克隆结构分析表明,中国沙棘每克隆内分株间的平均距离为1.75m,克隆繁殖的生长型主要为游击型,并且在居群内存在以某一优势基株为主的克隆分布方式;4)居群的定居时间、生境及群落结构等对中国沙棘的克隆多样性有一定影响。

关键词：中国沙棘克隆结构克隆多样性 RAPDs

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黄河下游湿地芦苇种群克隆结构的等位酶分析

山东大学学报（理学版） 2003年第2期38卷 89-92,96页

作者：郭卫华张淑萍宋百敏王仁卿山东大学生命科学学院生态学系山东济南250100

以等位酶为标记 ,采用水平切片淀粉凝胶电泳技术 ,对黄河下游湿地 15个芦苇 (Phragmitesaustralis (Cav .)Trin .exSteud)种群的克隆结构进行了初步研究 .8个酶系统 17个等位酶位点的检测表明 ,芦苇种群克隆多样性很高 ,基因型比率PD =0... 详细信息

以等位酶为标记 ,采用水平切片淀粉凝胶电泳技术 ,对黄河下游湿地 15个芦苇 (Phragmitesaustralis (Cav .)Trin .exSteud)种群的克隆结构进行了初步研究 .8个酶系统 17个等位酶位点的检测表明 ,芦苇种群克隆多样性很高 ,基因型比率PD =0 .5 3( 0 .10～ 0 .85 ) ,不同克隆在规模上相差很大 .克隆结构分析表明。

关键词：芦苇克隆结构等位酶

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青藏高原东缘鹅绒委陵菜种群克隆结构的研究

草业学报 2008年第2期17卷 68-74页

作者：陆建英杨晓明马瑞君甘肃省农业科学院作物研究所甘肃兰州730070 韩山师范学院生物系广东潮州521041

本研究采用RAPD标记对不同海拔下分布的鹅绒委陵菜6个种群进行了克隆结构、克隆多样性以及克隆多样性与海拔因子之间相关性的研究。研究结果表明,13条随机引物对120个个体进行PCR扩增,扩增到132条带,其中多态性条带117,多态位点比率(PPL... 详细信息

本研究采用RAPD标记对不同海拔下分布的鹅绒委陵菜6个种群进行了克隆结构、克隆多样性以及克隆多样性与海拔因子之间相关性的研究。研究结果表明,13条随机引物对120个个体进行PCR扩增,扩增到132条带,其中多态性条带117,多态位点比率(PPL)为88.64%,共检测到68个基因型,且克隆多样性水平较高,Simpson指数平均为0.875,基因型比率PD平均为0.527。鹅绒委陵菜种群内克隆之间的镶嵌明显,这可能与它的克隆构型有关。采用SPSS软件对鹅绒委陵菜种群的克隆多样性与海拔进行相关性分析,结果显示,它们之间并无显著的相关性。

关键词：鹅绒委陵菜克隆植物牧草克隆结构克隆多样性 RAPD