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假单胞菌属微生物对尼古丁降解的研究进展

微生物学通报 2024年第8期51卷 2797-2808页

作者：王坤金伊楠李翔蔡君兰于宏晓张豪洋岳勇张东海山东中烟工业有限责任公司山东济南250104 北京生命科技研究院北京102200 江苏中烟工业有限责任公司南京卷烟厂江苏南京210012

尼古丁是烟草中含量最多的一种生物碱,对环境和人体都会造成很大的危害。微生物能将尼古丁作为生长所需的能量来源,是高效的环境修复能手。假单胞菌属(Pseudomonas)生长迅速且对环境具有较强的适应力,能够利用尼古丁作为唯一碳源、氮源... 详细信息

尼古丁是烟草中含量最多的一种生物碱,对环境和人体都会造成很大的危害。微生物能将尼古丁作为生长所需的能量来源,是高效的环境修复能手。假单胞菌属(Pseudomonas)生长迅速且对环境具有较强的适应力,能够利用尼古丁作为唯一碳源、氮源来生长,具有高效的降解能力及研究价值。为阐明假单胞菌属微生物对尼古丁降解的特点及作用机制,本文介绍了假单胞菌属降解尼古丁的菌株及特点,分析了假单胞菌降解尼古丁的中间产物和代谢途径,总结了假单胞菌降解尼古丁的相关基因,最后对如何提高假单胞菌属降解尼古丁的能力等进行了展望,以期为微生物降解尼古丁的研究与应用提供指导。

关键词：尼古丁降解假单胞菌代谢产物生物转化途径

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假单胞菌生物被膜形成机制及控制:基于群体感应与第二信使关系

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食品科学 2024年

作者：袁旖旎周广晖董鹏程刘昀阁朱立贤韩广星仝林李航张一敏山东农业大学食品科学与工程学院国家肉牛牦牛产业技术体系临沂站国家肉牛牦牛产业技术体系通辽站国家肉牛牦牛产业技术体系恒都综合试验站

作为生鲜肉中的优势腐败菌，假单胞菌对肉品质量与安全构成严重威胁，其形成的生物被膜能够增强抗逆性，并发挥生物保护作用，从而使假单胞菌的消减更加具有挑战性。近年来，关于假单胞菌生物被膜形成机制的研究颇多，其中群体感应（Quo... 详细信息

作为生鲜肉中的优势腐败菌，假单胞菌对肉品质量与安全构成严重威胁，其形成的生物被膜能够增强抗逆性，并发挥生物保护作用，从而使假单胞菌的消减更加具有挑战性。近年来，关于假单胞菌生物被膜形成机制的研究颇多，其中群体感应（Quorum Sensing，QS）系统和环二鸟苷酸（cyclic di-guanosine monophosphate，c-di-GMP）对生物被膜的调控作用一直是研究的焦点，并且二者之间可能存在复杂的调控关系。此外，相较于传统的生物被膜抑制策略，开发基于假单胞菌QS系统和c-di-GMP以及二者关系的抑制策略针对性更强且更具现实意义。因此，本文综述了QS系统和c-di-GMP信号分子的合成过程，并从QS系统、c-di-GMP以及二者关系的角度阐述假单胞菌生物被膜形成机制，并总结了针对QS系统和c-di-GMP的靶向抑制策略，旨在为食品工业中假单胞菌生物被膜控制提供理论依据。

关键词：假单胞菌生物被膜群体感应系统环二鸟苷酸肉品安全

儿童社区获得性铜绿假单胞菌血流感染的临床特征与耐药分析

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中华儿科杂志 2024年第8期62卷 727-733页

作者：邱悦林道炯席佳男徐翼单庆文朱春晖成怡冰王芳陈益平曾玫复旦大学附属儿科医院感染传染科上海201102 海南省妇女儿童医学中心感染科海口571103 温州医科大学附属第二医院育英儿童医院儿童感染科温州325000 广州市妇女儿童医疗中心感染科广州510623 广西医科大学第一附属医院儿科南宁530021 江西省儿童医院感染科南昌330046 郑州大学附属儿童医院急诊科郑州450018 郑州大学附属儿童医院感染科郑州450018

目的调查儿童社区获得性铜绿假单胞菌(CAPA)感染的临床特征、预后和细菌耐药性。方法回顾性队列研究,纳入2016年1月至2018年12月在我国6家三级医院进行血培养铜绿假单胞菌阳性的社区获得性感染的91例患儿为研究对象。根据菌株分离地区,... 详细信息

目的调查儿童社区获得性铜绿假单胞菌(CAPA)感染的临床特征、预后和细菌耐药性。方法回顾性队列研究,纳入2016年1月至2018年12月在我国6家三级医院进行血培养铜绿假单胞菌阳性的社区获得性感染的91例患儿为研究对象。根据菌株分离地区,分为海南地区组和其他地区组,分析比较菌株的耐药模式、临床特征、治疗和预后资料。组间比较采用χ^(2)检验、Mann-WhitneyU检验。结果91例患儿中男63例、女28例,就诊年龄22.5(5.4,44.0)月龄。海南地区组74例、其他地区组17例。24例(26%)患儿有基础疾病,常见首发症状有发热79例(87%)、咳嗽64例(70%)、喘息8例(9%)、腹泻3例(3%)和呕吐4例(4%)。28例(31%)患儿合并其他器官感染,肺炎22例(24%)、皮肤感染5例(5%)、脑膜炎、腹腔感染和上尿路感染各1例(1%)。CAPA菌株对头孢吡肟[4%(4/90)]、阿米卡星[1%(1/90)]、环丙沙星[2%(2/90)]、左氧氟沙星[1%(1/89)]的耐药率较低,对头孢他啶、哌拉西林、哌拉西林-他唑巴坦、碳青霉烯类药物的耐药率分别为12%(11/90)、3/16、18%(10/56)和6%(5/90)。52%(47/91)患儿接受联合抗菌药物进行合适的经验性治疗,59%(52/88)患儿接受联合目标治疗。放弃治疗2例(2%),死亡3例(3%)。其他地区组CAPA感染不良预后比例高于海南地区组[4/17比1%(1/74),χ^(2)=9.74,P菌株耐药率低。海南地区患儿不良预后较其他地区患儿比例低。

关键词：假单胞菌铜绿社区获得性感染血流感染儿童

假单胞菌噬菌体裂解酶生物信息挖掘与系统分析

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微生物学杂志 2024年

作者：惠潇然黄振华刘静吴倩许天明段为旦潘迎捷赵勇张昭寰上海海洋大学食品学院农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海) 上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心

假单胞菌属(Pseudomonas spp.)是一类重要的食源性致病菌和腐败菌。噬菌体裂解酶具有高效裂解活性和靶向性等特征,可作为有效控制假单胞属细菌的新型抗菌剂。随着组学技术的高速发展,大量噬菌体的基因组信息得到破译,为噬菌体裂解酶生... 详细信息

假单胞菌属(Pseudomonas spp.)是一类重要的食源性致病菌和腐败菌。噬菌体裂解酶具有高效裂解活性和靶向性等特征,可作为有效控制假单胞属细菌的新型抗菌剂。随着组学技术的高速发展,大量噬菌体的基因组信息得到破译,为噬菌体裂解酶生物信息的挖掘提供了数据资源。本研究基于NCBI等数据库,深入挖掘假单胞菌噬菌体裂解酶的理化参数、核心结构域、三维结构等生物信息。结果表明,共筛选获得了81个噬菌体裂解酶的序列,此类裂解酶大多为亲水蛋白(80/81),均具有较高的等电点,蛋白总体带正电。在所筛选的裂解酶序列中共发掘9个保守结构域,分别为Lyz-like super family,lyz＿endolysin＿autolysin,Muramidase,PGRP super family,NlpC/P60,LT-like,Phage＿lysis Superfamily,PG＿binding＿1,PG＿binding＿3。同源建模分析发现,裂解酶末端α-螺旋上均分布一定的正电荷基团,预测该结构可能赋予其穿透假单胞菌外膜的功能。本研究为假单胞菌噬菌体裂解酶的设计、改造和生产提供理论支撑,为假单胞菌的靶向防控提供重要的数据基础。

关键词：假单胞菌噬菌体裂解酶生物信息学分析结构功能预测

草菇响应假单胞菌(Pseudomonas sp.)Z9侵染后的代谢组分析

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微生物学通报 2024年第7期51卷 2435-2449页

作者：陈晗黄在兴丁承培韦植元苏广林刘斌广西大学农学院食用菌研究所广西南宁530005

【背景】假单胞菌(Pseudomonas sp.)Z9是引起草菇黄斑病的病原,称之为草菇黄斑病菌,但其致病机制尚未明确。【目的】研究草菇黄斑病菌侵染草菇后的差异代谢物及代谢通路,为认识其致病机制提供依据。【方法】以被病菌侵染前后不同时间的... 详细信息

【背景】假单胞菌(Pseudomonas sp.)Z9是引起草菇黄斑病的病原,称之为草菇黄斑病菌,但其致病机制尚未明确。【目的】研究草菇黄斑病菌侵染草菇后的差异代谢物及代谢通路,为认识其致病机制提供依据。【方法】以被病菌侵染前后不同时间的草菇子实体为材料,测定其细胞膜透性的丙二醛(malondialdehyde,MDA)和相对电导率的变化,以及活性氧代谢相关酶即超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)和多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)的活性变化,同时利用非靶向代谢组学探究菌株Z9侵染草菇24 h后的代谢物差异。【结果】接种病菌48 h内的草菇MDA含量随时间延长呈上升趋势,且均显著高于CK组(P菌Z9侵染后含量增加最大的代谢物,其计算变量投影重要度(variable important for the projection,VIP)值达1.3556。【结论】草菇受黄斑病菌侵染后细胞膜被持续过氧化;推测草菇通过产生丁香酸清除由Pseudomonas sp.Z9刺激产生的活性氧(reactive oxygen species,ROS)来避免细胞氧化损伤,酪氨酸代谢途径是病原侵染草菇产生病斑的一个重要代谢途径。

关键词：草菇假单胞菌侵染抗氧化酶代谢组

不同包装方式对冷鲜猪肉品质及假单胞菌生长的影响

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河南农业大学学报 2024年第3期58卷 487-495页

作者：庄军辉付丽刘雪颖高雪琴河南牧业经济学院食品与生物工程学院河南郑州450046

【目的】探索冷鲜猪肉贮藏期间品质劣变情况及假单胞菌生长状况,为冷鲜肉贮藏期品质判断提供依据。【方法】采用真空、保鲜盒和热收缩膜3种方式包装冷鲜猪肉,检测4℃下贮藏第0、2、4、6、8天时肉样中假单胞菌菌落数及细菌菌落总数、感... 详细信息

【目的】探索冷鲜猪肉贮藏期间品质劣变情况及假单胞菌生长状况,为冷鲜肉贮藏期品质判断提供依据。【方法】采用真空、保鲜盒和热收缩膜3种方式包装冷鲜猪肉,检测4℃下贮藏第0、2、4、6、8天时肉样中假单胞菌菌落数及细菌菌落总数、感官指标、pH值、色差、水分活度值、TVB-N值的变化。【结果】相对于保鲜盒包装,真空包装和热收缩膜包装均能抑制冷鲜猪肉中菌落总数及假单胞菌菌落数增长;贮藏第4天,保鲜盒组肉样的菌落总数达到6.99 lg(CFU·g-1),真空包装组第6天才达到6.46 lg(CFU·g-1);贮藏第6天,保鲜盒组肉样中假单胞菌数最高达到7.58 lg(CFU·g-1),真空包装组和热收缩膜组分别达到了5.00 lg(CFU·g-1)、6.27 lg(CFU·g-1),显著低于保鲜盒组;贮藏期间,3组肉样的TVB-N值均呈现出上升的趋势,保鲜盒组第6天TVB-N值达到158.7 mg·kg-1,真空包装组和热收缩膜组在贮藏第8天时超过150 mg·kg-1;水分活度测定中,第4天真空包装组和热收缩膜包装组AW值大于保鲜盒包装组,贮藏第6天起,各组肉样的水分活度趋于稳定差异不显著(p>0.05);贮藏前2 d,保鲜盒组肉样L*值较高,而贮藏后期,热收缩膜组和真空包装组能维持较高的L*值;保鲜盒组肉样的a*值均整体先上升后下降趋势,热收缩膜组和真空包装组呈下降趋势,真空包装能较好延缓a*值下降;第8天,保鲜盒组肉样pH值最高,已接近7.0,热收缩膜组与真空包装组肉样pH值差异不显著(p>0.05),且均低于6。在反映肉质新鲜度上,猪肉的感官与a*值、pH值、AW值、TVB-N值、假单胞菌数相关性比较大。【结论】真空包装可以能抑制冷鲜猪肉细菌的增长、延缓TVB-N值的增长,在短期内能更好维护冷鲜猪肉的品质。

关键词：冷鲜猪肉品质变化假单胞菌挥发性盐基氮相关性

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罗非鱼优势耐冰温假单胞菌的分离鉴定及耐冰温基因

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广东海洋大学学报 2024年第4期44卷 96-104页

作者：陈惠萍梁桉婕吕冉晖陈鸿卢盛佳薛佳缪小兰段杉华南农业大学食品学院/广东省功能食品活性物重点实验室/广东省天然活性物工程技术研究中心广东广州510642

【目的】分析罗非鱼(Oreochromis mossambicus)中优势耐冰温假单胞菌(Pseudomonas)特有的基因特征和耐冰温基因。【方法】采用全长16S rDNA测序找出冰温贮藏罗非鱼中的优势假单胞菌,进行分离、鉴定;通过Illumina平台对其进行基因组从头... 详细信息

【目的】分析罗非鱼(Oreochromis mossambicus)中优势耐冰温假单胞菌(Pseudomonas)特有的基因特征和耐冰温基因。【方法】采用全长16S rDNA测序找出冰温贮藏罗非鱼中的优势假单胞菌,进行分离、鉴定;通过Illumina平台对其进行基因组从头测序,并通过基因家族分析确定耐冰温假单胞菌的核心基因家族,再与不耐冰温的铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa PAO1)的基因组比较,筛选出耐冰温假单胞菌特有的核心基因家族;结合文献报道的假单胞菌的寒冷适应基因筛查出耐冰温假单胞菌潜在的耐冰温基因。【结果与结论】发现并分离出冰温贮藏罗非鱼中丰度最高的5株腐败菌,经鉴定均为布氏假单胞菌(Pseudomonas bubulae)和莓实假单胞菌(Pseudomonas fragi)。这5株假单胞菌的核心基因家族有3 692个,其中861个在不耐冰温的铜绿假单胞菌的基因组中不存在,此861个特有的核心基因家族在群体感应、类固醇的降解、某些氨基酸和肽的代谢、脂肪酸降解、抗坏血酸和醛糖酸代谢、柠檬烯和蒎烯降解、丁酸代谢、苯乙烯降解和香叶醇降解等途径中显著富集。进一步筛查发现上述5株耐冰温假单胞菌带有不耐冰温的铜绿假单胞菌没有的des、cbpM、ousA、treP、treR、trxC和grX等基因。

关键词：罗非鱼冰温贮藏假单胞菌鉴定基因组测序耐冰温基因

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杀菌剂复配对羊肚菌细菌性病原菌假单胞菌的室内活性测定及田间防效

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农药 2024年第09期 689-693页

作者：胡淑慧张邦喜孙敬祖安建松晏畅吴文能贵阳学院食品科学与工程学院贵州省农业科学院土壤肥料研究所中国科学院微生物研究所

[目的]研究针对羊肚菌Morchella spp.细菌性病原菌假单胞菌Pseudomonas的高效防治策略。[方法]自贵州本土染病羊肚菌子实体中分离纯化出致病菌假单胞菌。采用浊度法研究14种商品农药及不同复配组合对假单胞菌的室内生物活性，并通过大... 详细信息

[目的]研究针对羊肚菌Morchella spp.细菌性病原菌假单胞菌Pseudomonas的高效防治策略。[方法]自贵州本土染病羊肚菌子实体中分离纯化出致病菌假单胞菌。采用浊度法研究14种商品农药及不同复配组合对假单胞菌的室内生物活性，并通过大田试验进一步验证其防效。[结果]室内生物活性测定结果显示将20%辛菌胺醋酸盐AS和80%乙蒜素EC以3∶1的比例复配具有增效作用，SR为2.0229，其他组合及配比均为相加作用或拮抗作用。大田试验结果表明将20%辛菌胺醋酸盐AS与80%乙蒜素EC以3∶1进行复配具有较好的防效，在质量浓度为12 mg/L时，防治效果达到78.64%±2.05%。[结论]将20%辛菌胺醋酸盐AS和80%乙蒜素EC以3∶1的比例复配对于因假单孢菌引起的羊肚菌细菌性病害具有较好的防治效果。

关键词：羊肚菌假单胞菌复配农药生物活性防效

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假单胞菌Rs-198的IAA合成途径分析

生物加工过程 2024年第1期22卷 17-24页

作者：王立娟杨义琳高慧鑫张延妍何艳慧武占省卢华丹西安工程大学环境与化学工程学院西安市纺织化工助剂重点实验室陕西西安710048 石河子大学化学化工学院新疆石河子832003

为探索假单胞菌Pseudomonas putida Rs-198的吲哚-3-乙酸(IAA)合成途径,本研究考察色氨酸及中间物对Rs-198菌株生长和IAA产量的影响。结果表明:在培养基中,只有少量色氨酸并不影响*** Rs-198菌株的生长,Rs-198菌株的IAA产量却可以显著增... 详细信息

为探索假单胞菌Pseudomonas putida Rs-198的吲哚-3-乙酸(IAA)合成途径,本研究考察色氨酸及中间物对Rs-198菌株生长和IAA产量的影响。结果表明:在培养基中,只有少量色氨酸并不影响*** Rs-198菌株的生长,Rs-198菌株的IAA产量却可以显著增加2~5倍。添加50 mg/L的色氨酸培养Rs-198菌株96 h后,其IAA产量可以达到55.52 mg/L,是纯营养培养基(NA)发酵液的3.58倍。另外,经高效液相色谱(HPLC)分析中间代谢产物的消长后发现,随IAA浓度的增加,发酵液中色胺、吲哚丙酮酸浓度逐渐降低,而吲哚乙酰胺和吲哚乙腈浓度未见显著变化,由此可以推断色胺(TAM)、吲哚丙酮酸(IPyA)途径为Rs-198合成IAA的主要途径。盆栽实验也表明,培养基中添加色氨酸培养*** Rs-198菌株对辣椒种子成苗及生长有较大的促进作用。

关键词：假单胞菌吲哚-3-乙酸色氨酸合成途径促生