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京海黄鸡体重性状全基因组关联分析

遗传 2015年第8期37卷 811-820页

作者：张涛王文浩张跟喜王金玉薛倩顾玉萍扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州225009 江苏京海集团南通226103

体重性状是肉鸡重要的经济性状。为了寻找可用于京海黄鸡体重性状遗传改良的分子标记及候选基因，本文以400只京海黄鸡核心群母鸡为基础，测定了0～14周龄体重，利用简化基因组测序技术（Specific—locusamplifiedfragmentsequencing，S... 详细信息

体重性状是肉鸡重要的经济性状。为了寻找可用于京海黄鸡体重性状遗传改良的分子标记及候选基因，本文以400只京海黄鸡核心群母鸡为基础，测定了0～14周龄体重，利用简化基因组测序技术（Specific—locusamplifiedfragmentsequencing，SLAF—seq）对京海黄鸡体重性状进行全基因组关联研究（Genome—wideassociationstndy，GWAS），筛选与京海黄鸡体重性状相关的SNPs位点。结果共检测到100个与京海黄鸡体重相关的SNPs位点，其中15个位点效应达到全基因组显著水平（P〈1．87E-06），85个位点效应达到全基因组潜在显著水平（P〈3．73E-05）。通过筛选每个显著SNP周围1Mb区域内的基因，共找到9个可能的候选基因，其中FAMl24A（Familywithsequencesimilarity124A）、QDPR（Quinoiddihydropteridinereductase）、WDRI（WDrepeatdomain1）和SLC2A9（Solutecarrierfamily2（facilitatedglucosetransporter），member9）4个基因可能是影响体重性状的重要候选基因。同时还发现，4号染色体75．6～80．7Mb区域集中了大部分与京海黄鸡中后期体重性状显著相关的SNPs位点，该区域可能是影响京海黄鸡中后期生长体重的重要候选区域。

关键词：京海黄鸡全基因组关联分析体重性状简化基因组测序

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河北省西门塔尔牛体重体尺性状遗传参数分析

中国牛业科学 2022年第6期48卷 1-4页

作者：彭朋王思伟李树静阎志刚赵增元苏硕青刘茁王昆河北省农林科学院粮油作物研究所石家庄050035 河北天和肉牛养殖有限公司石家庄050227 河北省作物栽培与绿色生产实验室石家庄050035 河北省畜牧良种工作总站石家庄050061 石家庄君乐宝乳业有限公司石家庄050227

[目的]研究旨在探究河北省西门塔尔牛体重和体尺性状的遗传参数,为育种提供参考。[方法]研究以2015—2021年河北天和肉牛养殖有限公司266头西门塔尔牛的体重体尺性状为研究材料,包括体重性状及体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围和管围... 详细信息

[目的]研究旨在探究河北省西门塔尔牛体重和体尺性状的遗传参数,为育种提供参考。[方法]研究以2015—2021年河北天和肉牛养殖有限公司266头西门塔尔牛的体重体尺性状为研究材料,包括体重性状及体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围和管围等6个体尺性状,使用DMU软件采用AI-REML结合EM算法并配合动物模型对体重、体尺性状进行了遗传参数估计。[结果]结果表明,体重、体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围和管围的遗传力分别为0.41、0.41、0.45、0.45、0.48、0.31和0.66。体重与体尺之间的遗传相关范围为0.20(体高)~0.79(胸围),表型相关范围为0.14(十字部高)~0.23(胸围);体尺性状间的遗传相关范围为-0.70(腹围和管围)~0.92(体高和十字部高),表型相关范围为(-0.10)(腹围和管围)~0.94(体高和十字部高)。[结论]体重与体尺性状均属于高遗传力性状,体重及体尺性状间除管围外其他体尺性状间均呈较强的遗传正相关,在选育过程中加强对这些性状的选育,有利于提高西门塔尔牛的生长发育性能。

关键词：河北省西门塔尔牛体重性状体尺性状遗传参数

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大菱鲆体重性状不同生长期的遗传分析

中国水产科学 2014年第2期21卷 244-249页

作者：马爱军王新安中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室农业部海洋渔业可持续发展重点实验室

采用条件数量性状加性-显性遗传模型和统计分析方法,对大菱鲆（Scophthalmus maximus）体重性状不同生长期进行遗传分析;基于von Bertalanffy模型,对大菱鲆6种交配组合的生长曲线划分为缓慢生长期、快速生长前期、快速生长后期和渐进期... 详细信息

采用条件数量性状加性-显性遗传模型和统计分析方法,对大菱鲆（Scophthalmus maximus）体重性状不同生长期进行遗传分析;基于von Bertalanffy模型,对大菱鲆6种交配组合的生长曲线划分为缓慢生长期、快速生长前期、快速生长后期和渐进期,并与各生长期所对应的遗传分析结果进行比对。结果表明,6种交配组合的缓慢生长期、快速生长前期和快速生长后期基本上是一致的。在缓慢生长期,检测到新的条件加性方差和条件显性方差,其相应的条件加性方差分量比率均未达到显著水平,相应的条件显性方差分量比率均达到显著（P体重性状在特定生长发育期的遗传机理,深入了解复杂数量性状时空动态变化的遗传生态学机制及其遗传规律,旨在为提高大菱鲆育种的预见性和选择效率提供理论参考。

关键词：大菱鲆体重性状快速生长期遗传分析

凉山半细毛羊3号染色体体重性状QTL定位研究

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西南农业学报 2014年第1期27卷 408-412页

作者：周明亮杨平贵吴登俊四川省草原科学研究院四川成都611743 四川农业大学四川雅安625014

以四川凉山半细毛羊为资源参考群体,选择位于绵羊3号染色体上的9个微卫星标记,用Win QTL cart软件对凉山半细毛羊的5个体重性状进行QTL检测。结果显示:①在191家系中,检测到影响羔羊断奶重的QTL,位于110.01 cM,加性效应为6.860,解释表... 详细信息

以四川凉山半细毛羊为资源参考群体,选择位于绵羊3号染色体上的9个微卫星标记,用Win QTL cart软件对凉山半细毛羊的5个体重性状进行QTL检测。结果显示:①在191家系中,检测到影响羔羊断奶重的QTL,位于110.01 cM,加性效应为6.860,解释表型变异为29.3%;②在190家系中,检测到影响断奶日增重的QTL,位于227.41 cM,加性效应为0.013,解释表型变异为1.7%;③未检测到影响羔羊初生重、育成体重和成年体重性状的QTL。

关键词：凉山半细毛羊体重性状遗传连锁图谱微卫星标记

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绵羊体重性状全基因组关联分析

中国畜牧兽医 2014年第2期41卷 194-203页

作者：张莉刘佳森徐凌洋赵福平陆健张世芳王慧华张晓宁魏彩虹陆国彬郑友民杜立新中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 全国畜牧总站北京100125

本研究旨在利用全基因组关联分析方法(genome-wide association studies,GWAS)挖掘影响绵羊体重性状的遗传标记和功能基因。采用Illumina OvineSNP50BeadChip中密度商业化羊芯片,对3个品种(苏尼特羊、德国肉用美利奴羊和杜泊羊)共计329... 详细信息

本研究旨在利用全基因组关联分析方法(genome-wide association studies,GWAS)挖掘影响绵羊体重性状的遗传标记和功能基因。采用Illumina OvineSNP50BeadChip中密度商业化羊芯片,对3个品种(苏尼特羊、德国肉用美利奴羊和杜泊羊)共计329只绵羊的体重性状(初生重、断奶重、6月龄重、断奶前日增重、断奶后日增重、日增重)进行GWAS分析。统计分析和基因注释基于TASSEL软件、混合线性模型和2012年10月公布的最新版绵羊基因组Ovis_aries_v3.1序列信息。结果表明,有10个SNPs位点在全基因组显著水平上与断奶后日增重相关,部分位点分布在羊注释基因内(MEF2B、RFXANK等);除此之外还检测到22个SNPs在染色体显著水平上与其他体重性状存在相关性,获得一批重要的候选基因。这些基因对绵羊体重性状功能基因的挖掘具有重要的理论意义和参考价值。

关键词：绵羊体重性状全基因组关联分析

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不同猪种ADIPOQ基因外显子2多态性及其与山西白猪体重和体尺性状的关联分析

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中国畜牧兽医 2018年第12期45卷 3497-3504页

作者：周胜花赵园园王媛媛王鹤洁秦本源张宁芳乐宝玉成志敏高鹏飞郭晓红李步高曹果清山西省农业科学院畜牧兽医研究所太原030032 铜仁学院乌江学院铜仁554300 山西农业大学动物科技学院太谷030801

本研究旨在检测猪脂联素(adiponectin,ADIPOQ)基因外显子2的多态性,并分析其对山西白猪体重和体尺性状的影响。采用PCR-SSCP技术检测了长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个猪种392个个体ADIPOQ基因外显子2的多态性... 详细信息

本研究旨在检测猪脂联素(adiponectin,ADIPOQ)基因外显子2的多态性,并分析其对山西白猪体重和体尺性状的影响。采用PCR-SSCP技术检测了长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个猪种392个个体ADIPOQ基因外显子2的多态性,并采用GLM程序分析了ADIPOQ基因外显子2多态性与山西白猪体重和体尺性状的关联性。结果显示,在ADIPOQ基因外显子2的89bp处检测到G→A错义突变,引起缬氨酸(Val)向异亮氨酸(Ile)的转变。ADIPOQ基因外显子2存在3种基因型:AA、AB、BB,2个等位基因:A和B。杜洛克猪中只有BB基因型,长白猪、大白猪、山西白猪和山西黑猪中BB基因型为优势基因型,马身猪中AA基因型频率最高。在引入品种长白猪、大白猪和杜洛克猪中B等位基因为优势等位基因,基因频率分别为0.96、0.96和1.00;在地方品种马身猪中A等位基因频率(0.52)略高于B等位基因(0.48);在培育品种山西白猪和山西黑猪中B等位基因频率分别为0.76和0.78,介于引入猪种和地方品种之间。基因型频率分布在马身猪、山西白猪和山西黑猪之间无显著差异(P>0.05),杜洛克猪与长白猪、大白猪间差异均不显著(P>0.05),而长白猪和大白猪间差异显著(P0.05),但对其他性状无显著影响,说明该位点只在个体发育早期阶段起作用。

关键词：猪脂联素(ADIPOQ)基因多态性体重性状体尺性状

山西白猪的微卫星标记与其体重、体尺性状的关联分析

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家畜生态学报 2012年第6期33卷 16-19,62页

作者：石建中高鹏飞郭晓红李步高曹果清大同市种猪场山西大同037000 山西农业大学动物科技学院山西太谷030801

采用单变量动物模型分析了21个微卫星标记对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重、体长、体高、胸围和活体背膘厚等7个性状的影响。结果表明,S0227和S0218标记对6月龄活体背膘厚有显著影响(P<0.05)。在S0227座位上,杂合子AB型个体的6月... 详细信息

采用单变量动物模型分析了21个微卫星标记对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重、体长、体高、胸围和活体背膘厚等7个性状的影响。结果表明,S0227和S0218标记对6月龄活体背膘厚有显著影响(P体重的影响也接近显著水平(P=0.0854)。在S0101座位上,CC型个体的6月龄体重最大,显著高于AB型个体,而与其他类型差异不显著;BC型个体的体高最高,显著高于AB型,而与其他类型差异不显著。

关键词：山西白猪微卫星标记体重性状体尺性状

南江黄羊GHR基因5′-调控区多态与体重性状相关性研究

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中国畜牧杂志 2007年第15期43卷 4-7页

作者：张春香罗海玲陈喻张国俊贾志海中国农业大学动物科技学院山西农业大学山西太谷030801 四川南江黄羊育种科学研究所

试验采用PCR-SSCP方法检测392只南江黄羊和49只波尔山羊GHR基因5′-调控区多态性,并与体重性状进行关联分析。结果表明:GHR基因5′-调控区存在(G)10、(G)11与(G)14多态和(TG)13、(TG)14与(TG)17多态。经最小二乘分析,在2个山羊群体中基... 详细信息

试验采用PCR-SSCP方法检测392只南江黄羊和49只波尔山羊GHR基因5′-调控区多态性,并与体重性状进行关联分析。结果表明:GHR基因5′-调控区存在(G)10、(G)11与(G)14多态和(TG)13、(TG)14与(TG)17多态。经最小二乘分析,在2个山羊群体中基因型效应对初生重的影响不显著(P>0.05),对周岁体重影响显著,基因型BB所对应周岁体重的最小二乘均值显著高于基因型DD所对应的最小二乘均值(P<0.05)。

关键词：生长激素受体基因体重性状南江黄羊

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荷斯坦牛体尺体重性状与繁殖性状的相关分析

中国奶牛 2002年第4期 30-32页

作者：于孟虎韩广文孙晓玉黑龙江省农垦科学院畜牧兽医研究所哈尔滨150038

母牛的繁殖性能对奶牛生产的经济效益有很大的影响,一方面繁殖性能的高低可通过直接影响牛群的生产水平来影响奶牛场的经济收入,另一方面,繁殖性能的好坏关系到牛群的数量和质量,进而影响未来的奶牛业生产.因此,提高母牛的繁殖性能是奶... 详细信息

母牛的繁殖性能对奶牛生产的经济效益有很大的影响,一方面繁殖性能的高低可通过直接影响牛群的生产水平来影响奶牛场的经济收入,另一方面,繁殖性能的好坏关系到牛群的数量和质量,进而影响未来的奶牛业生产.因此,提高母牛的繁殖性能是奶牛生产中的一个非常重要的环节.而奶牛的体尺、体重性状不仅反映了奶牛体格的大小和结实程度,而且也直接反映了奶牛生长发育阶段饲养管理水平及遗传因素影响的大小,进而间接影响奶牛终身生产性能.

关键词：荷斯坦牛体尺体重性状繁殖性状相关分析