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体细胞变异对神经系统常见肿瘤和发育异常类疾病的致病性

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遗传 2016年第3期38卷 196-205页

作者：刘芳宋小珍谢华陈晓丽首都儿科研究所儿童发育营养组学北京市重点实验室北京100020

在生物体发育过程中各种内源性及外源性因素均可造成DNA损伤,引起体细胞变异。研究表明体细胞变异对肿瘤具有致病性作用,而体细胞变异对神经系统发育异常类疾病的致病性鲜有报道。新一代测序技术的发展,尤其是全外显子测序、靶向深度测... 详细信息

在生物体发育过程中各种内源性及外源性因素均可造成DNA损伤,引起体细胞变异。研究表明体细胞变异对肿瘤具有致病性作用,而体细胞变异对神经系统发育异常类疾病的致病性鲜有报道。新一代测序技术的发展,尤其是全外显子测序、靶向深度测序的应用大大提高了低频体细胞变异检出的敏感性,使科研人员重新认识了体细胞变异在神经系统肿瘤和发育异常类疾病发生中的致病性。本文综述了体细胞变异在神经系统肿瘤和发育异常类疾病致病性方面的研究进展,旨在为今后研究该类疾病的遗传病因提供新的思路,同时也为新药开发提供理论依据。

关键词：体细胞变异神经系统肿瘤神经系统发育异常类疾病二代测序

连续回交对消除农杆菌介导转化引起水稻体细胞变异的影响

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作物学报 2012年第5期38卷 814-819页

作者：杨宙陈浩唐微林拥军华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室国家植物基因研究中心湖北武汉430070 江西省农业科学院水稻研究所江西南昌330200 湖北医药学院生物化学系湖北十堰442000

农杆菌介导的转化引起许多体细胞变异,影响了转基因植物的农艺性状。因此,转基因作物的培育需要大量的T0代再生植株。在本研究中,我们将转基因水稻株系与原始品种连续回交,然后评价其回交后代的表现,消除体细胞变异,恢复转基因亲本的农... 详细信息

农杆菌介导的转化引起许多体细胞变异,影响了转基因植物的农艺性状。因此,转基因作物的培育需要大量的T0代再生植株。在本研究中,我们将转基因水稻株系与原始品种连续回交,然后评价其回交后代的表现,消除体细胞变异,恢复转基因亲本的农艺性状。回交的供体亲本是3个转基因水稻株系,分别带有来自于苏云金芽胞杆菌(Bt)的抗虫基因。与原始品种连续回交至BC3F1代,每代BCnF1单株再自交两代,同时对各个世代进行抗虫性选择。通过发芽试验获得转基因纯合的BCnF3株系,在室内抗性试验中,所有的BCnF3纯合株系都能杀死100%的幼虫。在田间试验中,这些株系的单株产量明显高于供体亲本,大部分农艺性状与原品种没有显著的差异。这些结果说明连续回交能够在很大程度上恢复转基因水稻株系的农艺性状,从而减少转基因育种过程中所需的工作量。

关键词：连续回交体细胞变异农杆菌介导转化转基因水稻抗虫性农艺性状

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在组织培养中属间杂种的体细胞变异研究

中国农业科学 1995年第6期28卷 9-19页

作者：李立会董玉琛中国农业科学院作物品种资源研究所

近年来，属间杂种在组织培养中的体细胞变异，已成为向栽培作物转移外源期望基因的一项重要的生物技术或遗传工程。大量的证据显示，利用远缘杂种的愈伤组织培养能够增加亲本染色体间的遗传交换。特别是属间杂种再生植株中与染色体间部... 详细信息

近年来，属间杂种在组织培养中的体细胞变异，已成为向栽培作物转移外源期望基因的一项重要的生物技术或遗传工程。大量的证据显示，利用远缘杂种的愈伤组织培养能够增加亲本染色体间的遗传交换。特别是属间杂种再生植株中与染色体间部分同源性无关的许多易位的发生，使得转移利用其它遗传操作难以转移的外源基因变得容易。本文对近年来在属间杂种组织培养中体细胞变异的研究现状作了全面综述，包括试验材料和外植体、变异类型、影响因素、可能的遗传机理、已取得的成就和未来的研究方向。随着分子细胞遗传学技术的应用，必将使体细胞变异在作物改良中发挥巨大的作用。

关键词：属间杂种体细胞变异转移外源基因

半夏缓慢生长法保存及体细胞变异的ISSR检测

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西北植物学报 2012年第8期32卷 1698-1703页

作者：王爱华文晓鹏贵州大学贵州省农业生物工程重点实验室贵阳550025

以添加了不同浓度的甘露醇、PP333和ABA的培养基对半夏试管苗进行缓慢生长法保存,并对保存材料再生后代的体细胞变异进行检测。结果显示,甘露醇、PP333和ABA均能有效抑制试管苗生长,且存活率高;最佳浓度分别为甘露醇2%～4%,PP3332.0mg·... 详细信息

以添加了不同浓度的甘露醇、PP333和ABA的培养基对半夏试管苗进行缓慢生长法保存,并对保存材料再生后代的体细胞变异进行检测。结果显示,甘露醇、PP333和ABA均能有效抑制试管苗生长,且存活率高;最佳浓度分别为甘露醇2%～4%,PP3332.0mg·L-1,ABA 2.0～4.0mg·L-1。保存在添加了2%～4%甘露醇或2.0mg·L-1 PP333培养基上的植株未检测到变异,而保存在添加了2.0～4.0mg·L-1 ABA培养基上的植株检测到1条新增标记和1条缺失标记,位点变异率为1.7%,个体变异率为30%。研究表明,ABA不宜用于半夏试管苗的缓慢生长法保存,但有助于新突变体的产生,在种质创新上具有特殊意义。

关键词：半夏离体保存缓慢生长体细胞变异

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禾谷类作物体细胞变异的研究(Ⅲ)

植物杂志 1994年第1期21卷 27-28页

作者：邵宏波初立业薛立萍四平师范学院

四、禾谷类作物体细胞变异的分子遗传学基础禾谷类作物体细胞变异的另一主要因素就是分子水平上发生的基因变化,这里通称为分子遗传学上的变异,包括点突变,基因扩增和丢失,转座子活化,核外基因组重排等。现分别阐述于下。

关键词：禾谷类作物作物体细胞变异研究

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日本结缕草体细胞变异表型和分子标记的研究

草业科学 2012年第12期29卷 1864-1869页

作者：刘莉包满珠华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室湖北武汉430070 华中农业大学楚天学院湖北武汉430205

结缕草(Zoysia japonica)是重要的暖季型草坪草。本研究以1粒种子诱导的愈伤长期继代后的再生植株为材料,在大田中分小区种植,测量其植株表型数据,并同时利用ISSR标记对遗传变异进行分析。在形态和遗传上研究日本结缕草的体细胞变异水... 详细信息

结缕草(Zoysia japonica)是重要的暖季型草坪草。本研究以1粒种子诱导的愈伤长期继代后的再生植株为材料,在大田中分小区种植,测量其植株表型数据,并同时利用ISSR标记对遗传变异进行分析。在形态和遗传上研究日本结缕草的体细胞变异水平和特征。结果显示,日本结缕草体细胞表型变异中匍匐茎数量和绿色期变异系数较大。10个表型性状经过主成分分析发现,重要表型指标分散,前5个主成分可以代表整体坪用表型,其中第1主成分可以代表直立茎指标,第2主成分代表匍匐茎蔓延能力和生殖枝高度。ISSR标记分析遗传多样性显示,再生植株多态性条带率83.6%,特异性条带15.1%,具有丰富的遗传多样性。本研究可为日本结缕草获得丰富优异变异提供快捷途径,并有利于根据结缕草体细胞变异特点确定育种方向,快速培育新品种。

关键词： ISSR 表型再生植株体细胞变异

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胃癌易感位点和体细胞变异的相互作用研究

胃癌易感位点和体细胞变异的相互作用研究

作者：张栩南京医科大学

学位级别：硕士

目的:胃癌是最常见的恶性肿瘤类型之一。胃癌的病因复杂,是由环境因素和遗传因素共同作用造成的。常见的环境因素包括吸烟和饮酒行为、高盐饮食习惯和一些感染性因素(包括幽门螺杆菌感染和EB病毒感染);遗传因素的存在会导致不同个体在... 详细信息

目的:胃癌是最常见的恶性肿瘤类型之一。胃癌的病因复杂,是由环境因素和遗传因素共同作用造成的。常见的环境因素包括吸烟和饮酒行为、高盐饮食习惯和一些感染性因素(包括幽门螺杆菌感染和EB病毒感染);遗传因素的存在会导致不同个体在对胃癌的易感性上存在差异。胚系突变(germline mutations),又称生殖系突变,是生殖细胞(将发育成性细胞的细胞,即精子和卵子)的谱系中任何可检测和可遗传的变异。近年来随着大规模全基因组关联研究的应用,研究人员发现了大量与癌症相关的胚系易感位点/基因,其中包括1q22(MUCl)、3q13.32(ZBTB20)、5p13.1(PRKAAl)、5q14.3(lnc-POLR3G-4)、6p21.1(UNC5CL)、8q24(PSCA)和10q23(PLEl)等多个胃癌易感位点。体细胞变异(somatic alterations)在人体内不断的积累发生,这些突变中的一部分可以赋予细胞选择性优势并导致克隆的优先生长或存活,这种突变被称作驱动突变。目前越来越多的全外显子组测序或全基因组测序研究被用来检测胃癌中的体细胞突变情况,这些研究鉴定出了许多胃癌相关的驱动基因,同时也发现体细胞拷贝数变异和特征性突变信号同样在胃癌发生发展中发挥着重要的作用。最近的一些研究揭示了某些肿瘤中胚系突变与体细胞突变之间的关联现象,然而令人遗憾的是迄今为止的研究中仍然缺乏对于胃癌中遗传因素与体细胞改变之间相互作用的研究。因此,本研究拟探讨胃癌易感位点与体细胞突变在胃癌发生中的相互作用。方法:本研究分别通过富集分析设计和单纯病例设计研究胃癌患者中的易感位点和体细胞突变事件间的相互作用。纳入研究的病例为来自TCGA胃癌测序计划中的443个胃癌病例,该测序计划已经对包括新鲜冷冻的胃腺癌原发性肿瘤组织和血液或非恶性胃粘膜进行了全外显子组测序,测序数据包含了每个患者的基因突变信息和拷贝数变异信息。我们基于已报道的胃癌GWAS研究确定了 11个胃癌风险相关的单核苷酸多态性位点(SNP),定义易感基因为胃癌易感SNP位点上下游200kb范围内的蛋白质编码基因,或与胃癌易感SNP(以及跟胃癌易感SNP位点之间有高连锁不平衡关系(r2≥0.8)的SNP)存在eQTL关联的蛋白质编码基因(基于GTExv6p,胃组织中),同时以易感SNP为中心并上下游各延伸50kb、100kb、200kb、500kb作为胃癌的易感区域。另一方面我们通过COSMIC数据库和IntOGen数据库以及以往的胃癌测序研究收集了胃癌的驱动基因。随后,我们通过富集分析研究了胃癌驱动基因在癌症易感区域中的富集情况,以及易感基因和驱动基因在一些生物学通路上的富集情况。基于单纯的胃癌病例采用Logistics回归模型和线性回归模型分析了胃癌易感位点和包括体细胞突变信号、拷贝数变异等在内的体细胞突变事件之间的相互作用。结果:富集分析结果显示,胃癌的易感基因较GENCODE中的其他基因,更有可能同时是胃癌驱动基因(P=5.78×10-3),但胃癌驱动基因并未显著富集于易感区域。胃癌易感基因和驱动基因共同富集在8条REACTOME生物学通路上,包括PDGF信号通路(Signaling by PDGF)和PPARA激活基因表达通路(PPARA activates gene expression)等。单纯病例的交互作用分析显示,胃癌易感位点rs2285947(7p15.3)与体细胞PDGF信号通路上的截短突变存在显著关联(OR = 0.26,95%CI = 0.12-0.55,P = 3.93×10-4);易感位点 rs1679709(6p22.1)与COSMIC数据库中的第15号体细胞突变信号(Signature15)显著相关(P =0.026)。进一步研究发现,rs1679709与RFC4(Signature15相关基因)的基因拷贝数值显著相关(P= 0.01)。结论:上述研究结果提示胚系突变和体细胞突变在胃癌发生中存在相互作用,为深入研究胚系突变与体细胞突变在胃癌发生中的作用机制研究奠定了基础,并为胃癌高危人群的筛查和早期诊断提供了理论及技术支持。

关键词：胃癌体细胞变异胚系突变富集分析关联研究

体细胞变异育种方法及获得辣椒、水稻两个新品种(品系)的研究

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现代农业科技 1996年第7期 14-15页

该项任务为安徽省科委下达的研究项目。主要由安徽省农科院园艺所完成。主要完成人有宋宗森、陈静切、聂凡、张其安、刘祖林、刘淑们。该项目获安徽省科技进步三等奖。该项研究：①提出一个基本可行的育种新方法。该项目是在研究了作物... 详细信息

该项任务为安徽省科委下达的研究项目。主要由安徽省农科院园艺所完成。主要完成人有宋宗森、陈静切、聂凡、张其安、刘祖林、刘淑们。该项目获安徽省科技进步三等奖。该项研究：①提出一个基本可行的育种新方法。该项目是在研究了作物不同基因型和不同部位外植作对体细胞变异发生频率影响的基础上，利用辣椒、水稻的组织、细胞高体培养能引起植株形态、特征、生理活性等综合农艺性状的广泛变异，用以改良生产上的一些主栽品种，引入理想株形育种，品质育种等常规育种指标初步形成了一套行之有效的体细胞变异方法。实践证明，该方法具有取材方便、变异广泛、后代稳定、群体大等特产、，为作物育种提供了新的有效途径。②育成了一个辣椒新品种（代表

关键词：体细胞变异育种方法新品种水稻新品系辣椒理想株形育种再生植株综合农艺性状生理活性双子叶植物

桑黄原生质体体细胞变异及高压电晕电场诱变的研究

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桑黄原生质体体细胞变异及高压电晕电场诱变的研究

作者：宋天磊内蒙古大学

学位级别：硕士

桑黄(Sanghuang)是一种珍贵的药用真菌,因在抗肿瘤方面具有较好的辅助治疗效果而受到越来越多的关注,目前被国内外学者公认为最好的抗癌药用真菌,但目前存在桑黄子实体生长速度慢、药效含量低等问题,尤其在原生质体再生方面严重低于其... 详细信息

桑黄(Sanghuang)是一种珍贵的药用真菌,因在抗肿瘤方面具有较好的辅助治疗效果而受到越来越多的关注,目前被国内外学者公认为最好的抗癌药用真菌,但目前存在桑黄子实体生长速度慢、药效含量低等问题,尤其在原生质体再生方面严重低于其它食药用菌,本文以桑黄菌丝体为材料,首先制备原生质体再分别进行自然再生和电晕电场诱变再生,筛选长势好的再生菌落进行单独培养,以期最终获得了较出发菌株生长速度快、药效含量高的桑黄诱变菌株,并用再生后的菌落人工栽培培养桑黄子实体。实验结果如下:1.桑黄菌丝体细胞壁在2%溶壁酶25℃--30℃条件下酶解3小时达到较好的脱壁效果,原生质体的产量与菌龄没有明显的线性关系。2.原生质体最大再生率为0.05%-0.065%,原生质体再生菌株菌丝体生长速度发生变异,测序后发现碱基内部发生了变异。3.电场处理时间为40 s时,对桑黄再生菌丝的生长速度有明显的促进作用,平均日生长较对照组提高1%;电场处理时间为30 s时,电场对桑黄再生菌丝的生长有较强的抑制作用,最大较对照组日均生长速度降低16%。4.菌株zsh经电场处理10 s后再生菌株蛋白酶活力有所增加,菌株zhs-1经40 s电场处理后再生菌株蛋白酶活力有所增加,其分别提高了2.8%和6.8%,且菌株生长速度的快慢与蛋白活力的高低保持一致,可见菌丝生长速度与蛋白酶活力是有关系的;菌株zhs-1经电晕电场处理30 s后胞外淀粉酶的活力较对照组提高了57%,而另外一组菌丝体淀粉酶活力却很弱,并伴随菌丝体生长速度慢的情况,桑黄菌丝体生长快慢与淀粉酶活力是有关联的。5.再生菌株和出发菌株袋料培养菌丝体在生长速度上差异明显,获得部分较早形成子实体的桑黄菌株。

关键词：桑黄原生质体制备体细胞变异高压电晕电场出菇栽培