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作者：王艳鹏北京协和医学院

学位级别：硕士

目的:宿主遗传因素对疫苗诱导的抗体应答的影响是新兴疫苗基因组学研究的重要方向。本研究拟通过对MHC I类抗原提呈通路基因:低分子质量蛋白酶体(Low molecular weight proteasome,LMP)、抗原加工相关转运体(Transporter associated wit... 详细信息

目的:宿主遗传因素对疫苗诱导的抗体应答的影响是新兴疫苗基因组学研究的重要方向。本研究拟通过对MHC I类抗原提呈通路基因:低分子质量蛋白酶体(Low molecular weight proteasome,LMP)、抗原加工相关转运体(Transporter associated with antigen processing,TAP)和内质网氨肽酶(Endoplasmic Reticulum Aminopeptidase,ERAP)3 个基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)与脊髓灰质炎疫苗序贯免疫接种后诱导的脊灰抗体应答进行关联分析,初步探索MHC Ⅰ类抗原提呈通路基因对脊灰疫苗抗体应答的可能影响。方法:选取广西壮族自治区357名2-3月龄接种2剂灭活脊髓灰质炎疫苗(Inactivated polio vaccine,IPV)和 1 剂二价口服脊髓灰质炎疫苗(Oral polio vaccine,bOPV)的受试者,检测免前和基础免疫后28天血清中三种型别的脊灰病毒中和抗体水平。采用 TaqMan 探针基因分型法对 LMP2 基因 rs17587(G>A),LMP7 基因 rs2071543(G>T)、TAP1 基因 rs41549617(G>A)、rs1057141(C>T)、rs1135216(T>C)、rs1057149(C>T),TAP2 基因 rs1042116(G>A)、s2228396(C>T)、rs4148876(G>A),ERAP1 基因rs27037(G>T)、rs27044(C>G)、rs30187(C>T)、rs26618(T>C)、rs26653(C>G)、rs3734016(C>T),ERAP2基因 rs2549782(T>G)、rs2548538(A>T)、rs2248374(G>A)、rs2287988(A>G)、rs1056893(T>C)位点进行基因分型,计算各SNPs位点的等位基因和基因型频率,分析SNPs与脊灰抗体应答的相关性。结果:(1)LMP2 基因 rs17587、LMP7 基因 rs2071543、TAP1 基因 4 个 SNPs、TAP2基因3个SNPs的各等位基因、基因型携带者,在脊灰疫苗诱导的3个型别的中和抗体GMT水平均未显示差异;不同TAP1和TAP2等位基因型携带者也未显示GMT水平差异。(2)携带ERAP1基因rs3734016-C等位基因个体的Ⅰ、Ⅱ型脊灰病毒中和抗体GMT低于携带T等位基因个体(11.914±0.074 vs 12.375±0.166,P=0.024;6.093±0.072 vs 6.548±0.188,P=0.025)。ERAP2基因 rs2549782、rs2548538、rs2248374、rs2287988、rs1056893各基因型携带者间Ⅰ型脊灰病毒中和抗体GMT水平存在差异(均为 11.925±0.223 vs 11.741±0.141 vs 12.378±0.157,P=0.016)。但以上结果经Bonferroni校正后均无统计学差异。(3)LMP、TAP、ERAP各SNPs未显示单独或协同作用与脊灰Ⅱ型抗体阳转的相关性(P>0.05)。结论:LMP、TAP、ERAP基因多态性与脊灰疫苗免疫后抗体应答未显示显著相关,可能不是影响脊灰疫苗诱导的抗体应答的主要遗传因素。

关键词：多态性单核苷酸低相对分子量蛋白酶体基因抗原加工相关转运体基因内质网氨肽酶基因脊髓灰质炎疫苗

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云南省汉族人群LMP基因多态性与结核病易感性的关联性研究

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贵州医科大学学报 2020年第5期45卷 512-519页

作者：刘楠楠刘舒媛王辉张新文李传印史荔张淑琼中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所&云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 昆明市第三人民医院云南昆明650118

目的:研究云南省汉族人群LMP2、LMP7基因单核苷酸多态性(SNP)与结核病(TB)的相关性。方法:选取449例云南省汉族TB患者(其中肺TB 324例、肺外TB 125例)作为病例组,367例健康人群作为对照组;采用SNaPshot分型法对LMP 2基因的3个SNP位点rs1... 详细信息

目的:研究云南省汉族人群LMP2、LMP7基因单核苷酸多态性(SNP)与结核病(TB)的相关性。方法:选取449例云南省汉族TB患者(其中肺TB 324例、肺外TB 125例)作为病例组,367例健康人群作为对照组;采用SNaPshot分型法对LMP 2基因的3个SNP位点rs1351383(T>G)、rs17587(C>T)、rs2127675(A>G)和LMP 7基因的rs2071543(G>T)位点进行基因分型,比较这4个SNP位点等位基因和基因型在病例组和对照组中的频率,结合遗传模式分析和单倍型分析,研究LMP 2和LMP 7基因SNP多态性与TB的相关性。结果:经Bonferroni校正后,4个SNP位点的等位基因及基因型频率在病例组和对照组中差异均无统计学意义(P>0.0125);但在分层研究中,rs1351383位点的C等位基因在肺外TB患者中的频率显著高于对照组(P=0.010,OR=1.377,95%CI为1.030~1.841),加性遗传模式分析显示该位点基因型在病例组和对照组间频率的差异具有统计学意义(P=0.008,OR=1.520,95%CI为1.120~2.080);rs1351383-rs17587-rs2127675-rs2071543单倍型C-G-G-G在肺外TB患者中的频率显著高于对照组(P=0.003,OR=1.982,95%CI为1.246~3.154)。结论:云南省汉族人群中LMP基因的多态位点rs1351383的C等位基因及其rs1351383-rs17587-rs2127675-rs2071543单倍型C-G-G-G可能增加肺外TB的患病风险。

关键词：多态性,单核苷酸低相对分子量蛋白酶体基因结核病云南汉族

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LMP基因多态性与脊髓灰质炎疫苗诱导抗体应答的相关性

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贵州医科大学学报 2021年第5期46卷 529-535页

作者：王艳鹏史磊韩雪李菁李传印张新文杨净思姚宇峰史荔刘舒媛中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所云南昆明650118

目的探讨低相对分子量蛋白酶体(LMP)基因单核苷酸多态性位点(SNPs)与脊髓灰质炎疫苗序贯免疫诱导的脊髓灰质炎病毒抗体应答的相关性分析。方法选取357名2~3月龄的婴幼儿接种2剂灭活脊髓灰质炎疫苗(IPV,由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三类脊灰病毒灭活制成... 详细信息

目的探讨低相对分子量蛋白酶体(LMP)基因单核苷酸多态性位点(SNPs)与脊髓灰质炎疫苗序贯免疫诱导的脊髓灰质炎病毒抗体应答的相关性分析。方法选取357名2~3月龄的婴幼儿接种2剂灭活脊髓灰质炎疫苗(IPV,由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三类脊灰病毒灭活制成)和1剂二价口服脊髓灰质炎疫苗(bOPV),于疫苗免疫前和基础免疫后第28天时检测婴幼儿血清中3种型别的脊髓灰质炎病毒中和抗体水平;采用TaqMan探针基因分型法对LMP 2基因SNPs位点rs17587(G>A)和LMP 7基因rs2071543(G>T)进行基因分型,分析这2个SNPs位点与脊髓灰质炎病毒抗体应答的相关性。结果Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型脊髓灰质炎病毒中和抗体几何平均滴度(GMT)水平在携带rs17587和rs2071543位点不同等位基因的个体间比较,差异无统计学意义(P>0.05);rs17587和rs2071543不同基因型携带者的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型脊髓灰质炎病毒中和抗体GMT水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);rs17587-AA基因型携带者的脊髓灰质炎病毒Ⅱ型中和抗体GMT水平高于AG和GG基因型携带者(P基因型携带者的脊髓灰质炎病毒Ⅱ型中和抗体GMT水平与GG基因型携带者比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论LMP基因的SNPs位点rs2071543和rs17587与脊髓灰质炎疫苗免疫后抗体应答无相关性,不是影响脊髓灰质炎疫苗抗体应答的主要遗传因素。

关键词：多态性,单核苷酸脊髓灰质炎病毒疫苗低相对分子量蛋白酶体基因相关性抗体水平

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