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1株伯克霍尔德菌生物吸附除镉影响因素筛选

环境科学与技术 2018年第A2期41卷 14-19页

作者：许爱清周奇潘飞陈晏湖南科技大学生命科学学院湖南湘潭411201 重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省普通高等学校重点实验室湖南湘潭411201

抗镉微生物在镉污染环境治理方面具有应用潜力。该研究从污染环境分离纯化出1株能耐受高浓度镉离子(>1 000 mg/L)的抗镉细菌Cd-r-A,经菌落和细胞形态特征、部分生理生化指标和16S rDNA序列测序检测,鉴定菌株Cd-r-A为1株洋葱伯克霍尔德菌... 详细信息

抗镉微生物在镉污染环境治理方面具有应用潜力。该研究从污染环境分离纯化出1株能耐受高浓度镉离子(>1 000 mg/L)的抗镉细菌Cd-r-A,经菌落和细胞形态特征、部分生理生化指标和16S rDNA序列测序检测,鉴定菌株Cd-r-A为1株洋葱伯克霍尔德菌,隶属洋葱伯克霍尔德菌群。运用Plackett-Burman设计筛选菌株Cd-r-A对镉离子生物吸附去除率的影响效应,7个试验因子中具有显著性正效应因子是培养时间,接种量和摇床转速具有正效应;显著性负效应因子是渗透压和酸碱度,镉初始浓度和培养温度具有负效应。

关键词：镉抗镉细菌伯克霍尔德菌属 Plackett-Burman设计

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基于群落组成的吲哚代谢菌筛选及特性研究

大连理工大学学报 2022年第6期62卷 559-569页

作者：杨婧陈卓赵博谭佳吴炜泽戴春晓曲媛媛大连理工大学环境学院辽宁大连116024

高通量测序技术能够揭示微生物群落中物种组成及优势菌属.与传统的纯培养技术相结合,更有利于微生物的研究.结合微生物群落物种组成数据,在同一阶段筛选菌株,考察了筛选得到的菌株菌属和微生物群落中优势菌属之间的联系,同时也考察了菌... 详细信息

高通量测序技术能够揭示微生物群落中物种组成及优势菌属.与传统的纯培养技术相结合,更有利于微生物的研究.结合微生物群落物种组成数据,在同一阶段筛选菌株,考察了筛选得到的菌株菌属和微生物群落中优势菌属之间的联系,同时也考察了菌株的相关特性.结果表明在同一阶段,纯培养一定程度上可以获得与微生物群落中的优势菌属对应的单菌株.Burkholderia sp. YJIP-F1的吲哚降解和靛蓝生成能力在8株菌中最优.采用响应面法(RSM)优化菌株合成靛蓝产率,最优条件为吲哚0.14 g/L,苯酚0.17 g/L,酵母浸粉0.16 g/L.相比初始条件,靛蓝产率提高了1.43倍,为生物法合成靛蓝类色素提供了新的菌株资源.

关键词：微生物群落纯种分离吲哚靛蓝合成伯克霍尔德菌属

一株高效解磷细菌的筛选及其在红壤性水稻土中的施用效果

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应用与环境生物学报 2011年第5期17卷 678-683页

作者：戴沈艳申卫收贺云举陈雯雯钟文辉南京师范大学环境科学与工程系南京210046 徐州华龙高效复合菌肥厂徐州221600

解磷菌能使土壤中被活性铁、铝等吸附固定的难溶性或不溶性的非有效态磷转化为易于被植物吸收利用的有效态磷,从而大大提高磷肥的利用率.通过对江西鹰潭红壤分离筛选,获得一株性状稳定的高效解磷细菌T4.经鉴定,菌株T4为伯克霍尔德菌属(B... 详细信息

解磷菌能使土壤中被活性铁、铝等吸附固定的难溶性或不溶性的非有效态磷转化为易于被植物吸收利用的有效态磷,从而大大提高磷肥的利用率.通过对江西鹰潭红壤分离筛选,获得一株性状稳定的高效解磷细菌T4.经鉴定,菌株T4为伯克霍尔德菌属(Burkholderia sp.);T4溶解AlPO4、磷矿粉的能力均比较高,分别为334.2 mg L-1、193.1mg L-1;研究了各种理化因子对T4解磷能力的影响,确定了T4的最佳培养条件为乳糖15 g L-1,KNO3 1.0 g L-1,pH为7.0,温度为30℃,在该条件下T4溶解AlPO4的量为806.3 mg L-1.在江西鹰潭红壤性水稻土的施用试验表明,将菌株T4制成微生物菌剂施用于水稻田可起到减施化肥的作用.

关键词：伯克霍尔德菌属解磷菌微生物肥料红壤性水稻土

湛江地区类鼻疽伯克霍尔德菌特征与流行病学研究

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中国感染控制杂志 2008年第4期7卷 268-271页

作者：黄云平聂晓辉黄妙儿李艳陈华英郭晓华广东医学院附属医院湛江中心医院广东湛江524037

目的研究类鼻疽伯克霍尔德菌与常见其他伯克霍尔德菌间病原学特点及对药物敏感性的差异,为临床诊断、检验和治疗提供参考。方法对类鼻疽伯克霍尔德菌感染病例进行流行病学研究,并将其与常见医院感染皮氏伯克霍尔德菌、洋葱伯克霍尔德菌... 详细信息

目的研究类鼻疽伯克霍尔德菌与常见其他伯克霍尔德菌间病原学特点及对药物敏感性的差异,为临床诊断、检验和治疗提供参考。方法对类鼻疽伯克霍尔德菌感染病例进行流行病学研究,并将其与常见医院感染皮氏伯克霍尔德菌、洋葱伯克霍尔德菌对常用抗菌药物的药敏结果进行比较分析。结果类鼻疽伯克霍尔德菌具有两端浓染,银白色菌落形态特征。在湛江,此菌感染以遂溪、廉江、吴川为主要疫区,好发于秋季,接触疫水、农民、免疫功能低下、年龄≥50岁为易感因素。其对复方磺胺甲口恶唑、头孢哌酮/舒巴坦、米诺环素、哌拉西林及其酶抑制复合制剂、头孢他啶、亚胺培南敏感率达100%,对氨基糖苷类、喹诺酮类和非抗假单胞菌属类药敏感性较差或耐药。结论类鼻疽伯克霍尔德菌感染属热带或亚热带地区传染病,水患易导致该菌流行;细菌具有染色、菌落形态特征,对药物的敏感性具有伯克菌属共同特征,易产生耐药,建议联合用药治疗。

关键词：伯克霍尔德菌属类鼻疽伯克霍尔德菌洋葱伯克霍尔德菌皮氏伯克霍尔德菌假鼻疽病湛江

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不常见非发酵菌对常见抗菌药物敏感性分析

中国抗生素杂志 2007年第12期32卷 741-744页

作者：邬全会卓超苏丹虹陈冬梅袁锦屏中山大学附属第一医院广州510080 广州呼吸疾病研究所广州510120

目的了解临床分离的伯克霍尔德菌属、金色杆菌属、产碱杆菌属等不常见非发酵菌的耐药性。方法从2004年～2006年临床各种标本中分离到的不常见革兰阴性杆菌用VITEK-2全自动微生物分析仪进行检测鉴定，药物敏感性试验采用纸片扩散法。数... 详细信息

目的了解临床分离的伯克霍尔德菌属、金色杆菌属、产碱杆菌属等不常见非发酵菌的耐药性。方法从2004年～2006年临床各种标本中分离到的不常见革兰阴性杆菌用VITEK-2全自动微生物分析仪进行检测鉴定，药物敏感性试验采用纸片扩散法。数据分析采用WHONET5．4软件进行处理、统计和分析。结果两年中中山大学第-附属医院共收集患者首次分离株118株，其中伯克霍尔德菌属47株（其中洋葱伯克霍尔德菌41株，皮氏伯克霍尔德菌6株），金色杆菌属44株（其中脑膜脓毒性金黄杆菌17株，产吲哚金黄杆菌23株），产碱杆菌属27株（其中粪产碱杆菌13株，木糖氧化无色杆菌12株）。96．6％的菌株来源于痰标本。对伯克霍尔德菌属有较强体外抗菌活性的依次为：复方磺胺甲曙唑（87．2o,4）、哌拉西林／_-唑巴坦（87．0％）、左氧氟沙星（85．3oA）、头孢吡肟（83．0％）、头孢他啶（78．6％）和头孢哌酮／舒巴坦（78．3％）。对金色杆菌属有较强体外抗菌活性以复方磺胺甲哩唑（87．5％）最高。对产碱杆菌属敏感性较高的药物分别为头孢哌酮／舒巴坦（84．6％）和美罗培南（77．8%）。结论头孢哌酮／舒巴坦对三种非发酵菌都有较高体外抗菌活性。常规实验室鉴定方法易将三种菌相互混淆，甚至与氧化酶阴性的非发酵菌混淆，这可能是造成各地报道药敏结果差异的原因之一。

关键词：伯克霍尔德菌属金色杆菌属产碱杆菌属敏感性头孢哌酮/舒巴坦

桃重茬土壤细菌库建立及Bacillus、Burkholderia菌功能初探

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桃重茬土壤细菌库建立及Bacillus、Burkholderia菌功能初探

作者：曾康华中农业大学

学位级别：硕士

桃连作障碍问题由来已久,严重阻碍了我国桃产业的健康发展。桃连作障碍的成因复杂,其中,有益细菌的减少和有害真菌的增加,所引起的根际土壤微生物结构失衡是主要原因之一。根际土壤微生物被认为是植物的第二基因组,其种类和数量影响植... 详细信息

桃连作障碍问题由来已久,严重阻碍了我国桃产业的健康发展。桃连作障碍的成因复杂,其中,有益细菌的减少和有害真菌的增加,所引起的根际土壤微生物结构失衡是主要原因之一。根际土壤微生物被认为是植物的第二基因组,其种类和数量影响植物健康生长发育,对根际土壤细菌资源的发掘和利用可为桃连作障碍的绿色防控提供新思路。本研究运用高通量分离培养的方法,分离培养了桃第三茬根际土壤的细菌,建立了桃重茬根际土壤细菌资源库;并筛选纯化了Bacillus、Burkholderia属的共10个菌株,以属为单位分别接种到模拟连作障碍环境下的桃露白种子,探究了根际细菌对桃连作障碍的缓解效果,以期从合成菌群角度为桃连作障碍提供良好微生物菌剂。本研究主要内容如下:(1)基于高通量测序技术,采用分离培养方法获得了桃重茬根际土壤细菌的481个扩增子序列变异,其中在门分类水平上主要为变形菌门、放线菌门和厚壁菌门,而科分类水平上以伯克霍尔德氏菌科、慢生根瘤菌科和芽孢杆菌科为主,建立了桃重茬根际土壤细菌资源库;(2)在构建的细菌资源库内,筛选并纯化鉴定了Bacillus属中3个菌株BA3、BA31和BA80;Burkholderia属中7个菌株BU9、BU11、BU13、BU19、BU41、BU56和BU64;(3)在根皮腐解液模拟的连作环境下,根皮腐解液处理严重抑制桃苗生长,而接种了Bacillus和Burkholderia两个属的处理显著缓解了根皮腐解液对桃苗生长的抑制作用,其中接种Burkholderia的处理效果最为显著,与对照相比,桃苗总根长、根总表面、根总体积、总根尖数以及侧根总数分别提高了110.8%、89.4%、63.2%、126.6%和179.3%。

关键词：桃连作障碍高通量分离培养细菌资源库芽孢杆菌属伯克霍尔德菌属

一株硫代双乙醇降解菌遗传学特征及降解性能的研究

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一株硫代双乙醇降解菌遗传学特征及降解性能的研究

作者：孙蓉云南大学

学位级别：硕士

硫代双乙醇(thiodiglycol, TDG或者TG)作为中间体合成糜烂性毒剂芥子气,同时也是芥子气的水解产物,被定义为具有“双重使用价值”的化合物。芥子气是目前为止使用过的毒性最强的化学武器之一。TDG在环境中相对持续存在,同时可残留在土... 详细信息

硫代双乙醇(thiodiglycol, TDG或者TG)作为中间体合成糜烂性毒剂芥子气,同时也是芥子气的水解产物,被定义为具有“双重使用价值”的化合物。芥子气是目前为止使用过的毒性最强的化学武器之一。TDG在环境中相对持续存在,同时可残留在土壤中几年至几十年。TDG与水混溶,对地下水造成威胁,且在环境中能与芥子气的水解产物和其他化合物反应形成毒性更强和持续性更强的化合物。TDG必须降解处理被列入了《化学武器公约》。应用生物来治理有毒、难降解、环境危害性的有机污染物不仅经济、安全,而且所能处理的污染物阂值低、残留少,受到世界各国的普遍重视,相关研究也十分活跃。生物降解在世界各国销毁芥子气储备中发挥了重要作用。生物降解TDG不仅是要筛选到能够降解相应有机化合物的培养物,更重要的是对降解微生物的遗传性能和降解特性的研究,后者不仅能有助于控制降解过程,亦可揭示在环境压力下微生物进化的机制。英国兰卡斯特大学李红教授的前期研究中分离获得了具有TDG降解能力的微生物,因此本论文对具有TDG降解能力的微生物进行了遗传学特征和降解性能的研究。研究结果如下： 1.降解菌株的纯化和鉴定。以李红教授提供的降解细菌为研究出发点,采用选择性培养基对菌落进行梯度稀释和涂布培养,纯化出2株菌株：01S和01B。分别提取其总DNA进行16SrDNA测序。采用BLAST进行同源搜索并比较,得到01S菌株和01B菌株的16SrDNA序列与多株伯克霍尔德菌属(Burkholderia)的16SrDNA序列高度相似,相似度大于97%,初步确定这两个菌株为伯克霍尔德菌属(Burkholderia),命名为Burkholderia sp.01S和Burkholderia sp.01B。通过系统进化树的构建,发现01S菌株和01B菌株与Burkholderia xenovorans LB400具有更接近的分类学地位,为Burkholderia sp.01S与相邻物种的比较基因组学和功能基因组学分析提供了基础。 ***降解菌的生长和降解特性研究。选取Burkholderia sp.01S为研究对象。通过正交实验,表明Burkholderia sp.0lS的最佳生长条件为：pH7.0,温度30℃,碳源TDG的浓度为500ppm。通过对照试验以及LC-MS检测,TDG能被菌株降解,排除非生物损耗的可能。采用在基础盐培养基中进行富集培养的方式,逐渐加大碳源TDG的浓度,驯化培养降解菌。与原菌相比,驯化菌对TDG的耐受浓度提高到1100ppm。底物降解广谱性试验结果显示,菌株Burkholderia sp.01S可利用的碳源为正丁醇、TDG、甘油和丁二酸。含硫有机物(TDG)为伯克霍尔德菌属新增加的有机物降解类型。通过生物功能比较,发现与Burkholderia sp.01S分类学地位最接近的B. xenovorans LB400无TDG降解能力。 3. Burkholderia sp.01S的全基因组测序与分析。Burkholderia sp.01S基因组大小为9.12Mb,共编码8632个预测基因,基因区总长度为7,601,499bp, GC含量63.07%,基因区占基因组百分比85.36%,基因平均长度880bp,基因间区长度1,303,046bp,基因间区占基因组百分比14.63%。与B. xenovorans LB400进行比较基因组学分析,二者有5812个直系同源基因,且直系同源基因进化树的构建结果二者最为接近。B. xenovorans LB400的两个核心染色体序列在Burkholderia sp.01S基因组中对应关系较好,而巨型质粒序列在Burkholderia sp.01S基因组中几乎未曾发现。推测Burkholderia sp.01S可能由B. xenovorans LB400进化而来。利用含硫有机物的降解相关基因,在B. xenovorans LB400和Burkholderia sp.01S基因组中进行相似性搜索,几个相关基因都是存在的。结合Burkholderia sp.01S的蛋白质组数据,LysR型转录调控因子BdhR (LysR-type transcriptional regulator BdhR)的同源基因可能在降解过程中发挥作用。 4.初步探究降解基因的水平转移。以自然土壤中的微生物和B. xenovoransLB400为研究对象,调节TDG和降解基因源两个关键因素来模拟降解菌株的水平基因转移过程,目前未筛选到降解菌。在无选择压力TDG的存在下,菌株Burkholderia sp.01S出现了降解能力屏蔽的现象。用复合碳源培养B. xenovoransLB400,发现B. xenovorans LB400对TDG的存在表现出极度的不适应

关键词：硫代双乙醇生物降解伯克霍尔德菌属基因组测序

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不常见非发酵菌对常见抗菌药物敏感性分析

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