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2种野生岩生植物下土壤微生物生态分布研究

林业科学 2006年第8期42卷 139-143页

作者：王慧芳罗承德四川农业大学林学与园艺学院

Two kinds of petrophifle plants (Pogonatherum panideum and Erioophorum comosum) are broadly grown on the rock slope of roads in the southwest of China. The microfloras in the soil nearby the rhizosphere of two kinds of petrophifle plants were studied in different month in order to investigate the pattern of ecological distribution of soil microbes. The results of incubation by the dilution plate count showed the amount of soil microbes significantly varied with time. The amount of microbes in the soil under P. panideum got the peak in May, then decreased in September, November, July, March and January; and to E. comosum, the amount of soil microorganisms was greater in September than in other months and became less in November, May, March, January and July. Preliminary analysis showed there were the differences of soil microbial composition between two kinds of petrophifle plants; Bacteria was superiority in soil under P. panideum, while the average ratio of actinomyces was the greatest among the main soil microbial populations under E. comosum. Besides, 10 genera of heterotrophic bacteria, 13 genera of heterotrophic filamentous fungi and 2 genera of heterotrophic actinomyces were identified, ***, Trichoderma, Fusarium, Paecilomyces, Cladosporium, Griserubro_violaceus, Albosporus, Gloucus, Aureus, Cinereus, Grideofuseus, Bacillus and Pseudomonas were dominant in soils under two kinds of petrophifle plants, and it indicated the dominant genera of soil microbes were varied with season turning. When biochemical activities of soil microbes were detected, we found 42.7% of microbes excreted amylase and 53.4% of microbes could decompose cellulose.

关键词：土壤微生物区系岩生植物优势菌属

短期玉米秸秆还田对冷凉地区土壤真菌多样性的影响

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干旱地区农业研究 2018年第3期36卷 120-124页

作者：萨如拉杨恒山高聚林张丽娟张玉芹范秀艳李纯燕内蒙古民族大学农学院内蒙古通辽028000 内蒙古农业大学职业技术学院内蒙古包头014199

在玉米吐丝期,利用传统涂布平板法和高通量测序技术,设置常规秸秆不还田(CK)、秸秆深翻还田(SF)和秸秆旋耕还田(XG)3个处理,研究0~10 cm、10~20 cm和20~30 cm土层真菌群落丰富度、多样性和群落结构变化,揭示冷凉地区玉米秸秆还田真菌群... 详细信息

在玉米吐丝期,利用传统涂布平板法和高通量测序技术,设置常规秸秆不还田(CK)、秸秆深翻还田(SF)和秸秆旋耕还田(XG)3个处理,研究0~10 cm、10~20 cm和20~30 cm土层真菌群落丰富度、多样性和群落结构变化,揭示冷凉地区玉米秸秆还田真菌群落结构及其差异。结果表明:冷凉地区玉米秸秆还田对土壤真菌多样性的影响较大,秸秆还田土壤中可培养真菌数为SF>XG>CK;秸秆还田后土壤真菌优势菌群发生变化,CK优势菌为马拉色氏霉菌属、被孢霉属和葡萄孢属,XG优势菌为被孢霉属;XG和SF表层土壤中耐冷酵母菌属和被孢霉属是优势菌;SF处理20~30 cm土层优势菌为葡萄孢属。真菌菌群Alpha多样性、群落组成丰度、RDA(Redundancy analysis)和菌群相似性综合分析可知,SF和XG 0~20 cm土层菌群差异小;SF和XG均能增加10~30 cm土层真菌群落丰度。

关键词：秸秆还田真菌多样性高通量测序优势菌属

基于高通量测序的黄羽肉鸡屠宰过程中菌群多样性分析

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肉类研究 2024年第3期38卷 1-9页

作者：肖亚培王在天孙芝兰刘芳王道营南京农业大学食品科学技术学院江苏南京210095 江苏省农业科学院农产品加工研究所江苏南京210014

利用传统培养和高通量测序技术分析黄羽肉鸡打毛、净膛、预冷和包装屠宰过程中鸡胴体表面和预冷水的微生物污染情况。结果表明:经打毛、净膛和预冷后的鸡胴体菌落总数分别为4.82、5.03、4.68(lg(CFU/g)),说明该屠宰工艺未起到较好的减... 详细信息

利用传统培养和高通量测序技术分析黄羽肉鸡打毛、净膛、预冷和包装屠宰过程中鸡胴体表面和预冷水的微生物污染情况。结果表明:经打毛、净膛和预冷后的鸡胴体菌落总数分别为4.82、5.03、4.68(lg(CFU/g)),说明该屠宰工艺未起到较好的减菌效果,宰后胴体微生物污染严重;高通量测序技术分析发现,肉鸡屠宰加工过程中的胴体表面和预冷水的优势腐败菌在属水平上为莫拉氏菌属、假单胞菌属、葡萄球菌属、乳杆菌属、巨大球菌属、嗜冷杆菌属和不动杆菌属等。主成分分析表明,一阶、二阶预冷水、预冷后鸡胴体及包装后鸡胴体相距较近,差异性不大,但与打毛鸡胴体和净膛后鸡胴体2组样品有较大差异,说明预冷水中的污染菌组成决定了宰后胴体的污染菌种类。本研究说明不同屠宰流程后的黄羽肉鸡胴体污染菌的组成与丰度存在差异,需针对不同屠宰流程特性采取对应的控制手段保障黄羽肉鸡制品的质量与安全。

关键词：高通量测序黄羽肉鸡屠宰菌落总数菌群多样性优势菌属

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汾河流域修复中土壤生物结皮的功能研究

北方园艺 2021年第14期 100-106页

作者：李扬牛永华赵璐太原理工大学水利科学与工程学院山西太原030024 山西省水利水电科学研究院山西太原030002 四川大学水利水电学院四川成都610065

以汾河上游混交林系统为研究对象,测定了不同林地有无结皮条件下的土壤理化性质和5种酶活性,采用DGGE试验研究了藓结皮对土壤真菌和细菌的影响,测序比对确定了真菌细菌中的优势菌属,以期掌握生物土壤结皮对汾河上游土壤恢复的作用。结... 详细信息

以汾河上游混交林系统为研究对象,测定了不同林地有无结皮条件下的土壤理化性质和5种酶活性,采用DGGE试验研究了藓结皮对土壤真菌和细菌的影响,测序比对确定了真菌细菌中的优势菌属,以期掌握生物土壤结皮对汾河上游土壤恢复的作用。结果表明:藓结皮提高了土壤的田间持水量、有机碳、全氮及全磷的含量和土壤蔗糖酶、脲酶、过氧化氢酶、多酚氧化酶和碱性磷酸酶的活性,同时增加了土壤真菌细菌的复杂性,测序比对表明根瘤菌属、硝化螺旋菌属和酸杆菌属是细菌的优势菌属,丝盖伞属和锥毛壳属是真菌的优势菌属。生物土壤结皮在汾河土壤恢复中起到了重要的作用。

关键词：生物土壤结皮土壤理化性质土壤酶活 DGGE 优势菌属

贮藏温度对即食小龙虾品质及微生物菌群多样性的影响

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食品与机械 2019年第9期35卷 141-146页

作者：周涛吴晓营罗海波满文曾王芮万辰玥南京师范大学食品与制药工程学院

先通过测定理化指标确定即食小龙虾货架期,再分别从4,25℃两种贮藏温度下中、末期的样品中提取即食小龙虾总DNA,通过高通量测序技术探究贮藏期间其微生物菌群变化。结果表明:随贮藏时间的延长,物种多样性逐渐降低;4℃贮藏条件下,末期优... 详细信息

先通过测定理化指标确定即食小龙虾货架期,再分别从4,25℃两种贮藏温度下中、末期的样品中提取即食小龙虾总DNA,通过高通量测序技术探究贮藏期间其微生物菌群变化。结果表明:随贮藏时间的延长,物种多样性逐渐降低;4℃贮藏条件下,末期优势菌群为海洋杆菌属(Oceanobacillus,81.522%)和希瓦氏菌属(Shewanella,3.625%);25℃贮藏条件下,末期优势菌群为哈撒韦氏菌属(Hathewaya,78.700%)、芽孢杆菌属(Bacillus,12.380%)和狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto,8.707%)。

关键词：即食小龙虾高通量测序优势菌属菌群多样性

基于高通量测序技术分析腐乳自然发酵过程微生物多样性

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中国酿造 2021年第2期40卷 144-149页

作者：石黎琳牟方婷李安张惟广西南大学食品科学学院重庆400715

采用高通量测序技术对腐乳自然发酵过程中的微生物多样性进行分析。结果表明,发酵第一阶段,占比较大的细菌门为变形菌门(Proteobacteria),细菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、乳球菌属(Lactococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas),真菌门... 详细信息

采用高通量测序技术对腐乳自然发酵过程中的微生物多样性进行分析。结果表明,发酵第一阶段,占比较大的细菌门为变形菌门(Proteobacteria),细菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、乳球菌属(Lactococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas),真菌门为担子菌门(Basidiomycota),真菌属为久浩酵母属(Guehomyces)和假丝酵母属(Candida);发酵第二阶段,占比较大的细菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes),细菌属为类香味菌属(Myroides)、丛毛单胞菌属(Comamonas)和假单胞菌属(Pseudomonas),真菌门为担子菌门(Basidiomycota),真菌属为久浩酵母属(Guehomyces)和假丝酵母属(Candida);发酵第三阶段,占比较大的细菌门为厚壁菌门(Firmicutes),细菌属为乳球菌属(Lactococcus)、果胶杆菌属(Pectobacterium),真菌门为子囊菌门(Ascomycota),真菌属为链格孢属(Alternaria)、赤霉菌属(Gibberella)。整个发酵过程中微生物群落结构分布变化明显,不同阶段主要存在的菌属不同,既有利于发酵的有益菌属,也有影响食品安全的有害菌属。

关键词：腐乳自然发酵高通量测序微生物多样性优势菌属

乳化油碳源原位治理地下水中Cr(Ⅵ)静态批实验研究

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乳化油碳源原位治理地下水中Cr(Ⅵ)静态批实验研究

作者：赵阅坤中国地质大学(北京)

学位级别：硕士

近年来地下水中Cr(Ⅵ)的污染事件频繁发生,通过投加碳源原位治理地下水中Cr(Ⅵ)的应用越来越广泛。碳源的选择是影响治理效果好坏的重要因素,乳化油作为一种新兴碳源在治理地下水污染物方面已经得到了广泛的应用。本实验使用乳化油作为... 详细信息

近年来地下水中Cr(Ⅵ)的污染事件频繁发生,通过投加碳源原位治理地下水中Cr(Ⅵ)的应用越来越广泛。碳源的选择是影响治理效果好坏的重要因素,乳化油作为一种新兴碳源在治理地下水污染物方面已经得到了广泛的应用。本实验使用乳化油作为碳源,研究了微生物利用乳化油还原Cr(Ⅵ)的效果,探讨了温度、NO、SO和不同初始pH对微生物还原Cr(Ⅵ)的影响,利用宏基因组测序技术对实际土壤组分内微生物群落结构的改变做了检测,论文主要取得以下结论。(1)活性污泥驯化液实验结果表明微生物利用乳化油还原Cr(Ⅵ)的过程符合零级反应动力学。在350C条件下,2ml乳化油可以支持微生物还原浓度为10mg/L的Cr(Ⅵ)溶液进行6个阶段,Cr(Ⅵ)的总还原量为18.2mg,总还原率为89.04%,1L乳化油可以治理0.91m3浓度为10mg/L的Cr(Ⅵ)溶液。(2)原位土壤实验结果表明乳化油可以使Cr(Ⅵ)在各阶段的还原率均为100%。Cr(Ⅵ)的还原规律则符合一级反应动力学,一级反应动力学常数k在0.689.777d-1之间。在250C条件下,0.5ml乳化油支持微生物还原浓度为5mg/L的Cr(Ⅵ)溶液进行了7个阶段,Cr(Ⅵ)的总还原量为0.581mg,实验结束时微生物对Cr(Ⅵ)的还原能力未见减弱,因此1L乳化油支持微生物还原浓度5mg/L的Cr(Ⅵ)溶液的体积应该远大于0.232m3。乳化油明显促进了Azospirillum和Natranaerovirg菌属的生长繁殖,但是却降低了各组中微生物的多样性。(3)原位土壤实验结果表明,NO和SO都可以促进微生物还原Cr(Ⅵ),其Cr(Ⅵ)的总平均还原速率分别是对照组的2.2倍和1.4倍,SO的促进作用弱于NO。pH值为8.7.1时比8.3.7更适合微生物对Cr(Ⅵ)进行还原。NO和SO的加入分别使能够吸附和还原Cr(Ⅵ)的单胞菌属(Pseudomonas)和能够还原SO的脱硫肠状菌属(Desulfosporosinus)成为了优势菌属,是促进微生物还原Cr(Ⅵ)的主要原因。

关键词：乳化油 Cr(Ⅵ) NO3- SO42- 优势菌属

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甘肃东乡及裕固族牙周炎微生物群落结构研究

甘肃东乡及裕固族牙周炎微生物群落结构研究

作者：焦康礼兰州大学

学位级别：硕士

目的：以甘肃东乡及裕固族慢性牙周炎患者为研究对象,通过构建16S rRNA克隆文库,从不同的分类学水平,对比两组人群唾液微生物群落结构差异。探寻两个民族的主要牙周炎致病菌,为进一步研究微生物的致病机制提供理论支持。并从病因学角度... 详细信息

目的：以甘肃东乡及裕固族慢性牙周炎患者为研究对象,通过构建16S rRNA克隆文库,从不同的分类学水平,对比两组人群唾液微生物群落结构差异。探寻两个民族的主要牙周炎致病菌,为进一步研究微生物的致病机制提供理论支持。并从病因学角度入手,积极采取相应措施进行早期预防,降低牙周炎发病率,促进牙周组织健康。方法：按照WHO的采样标准,采集两个民族牙周炎患者唾液样本各20例,标记为：DP(东乡族牙周炎样本),YP(裕固族牙周炎样本)。提取细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得目的片段,并转化至*** DH5a,构建16SrRNA克隆文库。进行16S rRNA测序,剔除不合格序列后,应用MOTHUR、RDP、NCBI、MEGA等软件和数据库进行相关分析,并获得微生物分类学信息。结果：(1)两组唾液样本共检测到129个OTU,归属于7个门及37个属;(2)7个细菌门：厚壁菌门(Firmicute)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、互养菌门(Synergistetes)以及TM7菌门,对菌门丰度进行秩和检验,发现7个菌门在两组之间的差异均无统计学意义(P>0.05)。(3)两组样本中优势菌的检出情况存在差异：DP组中为链球菌属(Streptococcus,36.81%)、奈瑟菌属(Neisseria,10.44%)、普氏菌属(Prevotella,4.95%)、韦荣氏球菌属(Veillonella,3.85%)、伴放线放线杆菌属(Actinobacillus,3.30%)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas,2.75%)、梭杆菌属(Fusobacterium,2.20%)、嗜血杆菌属(Haemophilus,2.20%)、颗粒链菌属(Granulicatella,1.10%)、纤毛菌属(Leptotrichial,10%)、消化链球菌属(Peptostreptococcus,1.10%)及TM7菌属(TM7,1.10%)。YP组中的优势属为：链球菌属(Streptococcus,43.70%)、 Methyloversatilis(7.10%)及假单胞菌属(Pseudomonas,5.20%)、不动杆菌属(Acinetobacter,4.40%)、 Schlegelella菌属(Schlegelella,4.00%)、奈瑟菌属(Neisseria,3.60%)、孪生球菌属(Gemella,3.60%)、普氏菌属(Prevotella,3.20%)、嗜血杆菌属(Haemophilus,1.60%)、真细菌属(Eubacterium,1.60%)及梭杆菌属(Fusobacterium,1.20%);(4)链球菌属存在于所有20例样本中,为两组人群牙周炎患者唾液中的核心微生物。除目前已能分类的菌属之外,还有11个菌属不能准确分类,这些菌属在牙周炎的发生、发展中的作用需进一步探索研究;(5) Aggregatibacter菌属(DP组：0.00%,YP组：3.30%)、奈瑟菌属(Neisseria)(DP组：10.40%,YP组：3.60%)及韦永球菌属(Veillonella,DP组：0.40%,YP组：3.85%)在两组样本中的分布具有明显的差异(P菌属、奈瑟菌属及韦永球菌属在两个民族牙周炎患者之间的差异性需要深入研究,并且链球菌属、普氏菌属、梭杆菌属及嗜血杆菌属等常见的牙周致病菌在牙周炎患者口腔中的作用值得进一步研究。

关键词：牙周炎唾液口腔微生物优势菌属 16s rRNA克隆文库

活性炭纤维基OMS-2活化PMS体系-SBR联合降解卡马西平的效能和机理研究

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活性炭纤维基OMS-2活化PMS体系-SBR联合降解卡马西平的效能和机理...

作者：杨宁武汉纺织大学

学位级别：硕士

近年来,药品和个人护理用品(Pharmaceuticals and Personal Care Products,PPCPs)作为一类新兴污染物,其导致的环境污染问题受到了科研工作者的广泛关注;如何有效控制PPCPs污染已成为水污染控制领域的研究热点与难点。以PPCPs抗癫痫类... 详细信息

近年来,药品和个人护理用品(Pharmaceuticals and Personal Care Products,PPCPs)作为一类新兴污染物,其导致的环境污染问题受到了科研工作者的广泛关注;如何有效控制PPCPs污染已成为水污染控制领域的研究热点与难点。以PPCPs抗癫痫类药物卡马西平(Carbamazepine,CBZ)为例,CBZ在我国多个省份的河流湖泊等环境水体中均有检出。基于活化过硫酸盐产生硫酸根自由基(SO)的新型高级氧化技术,因其氧化能力强、反应不受pH影响、氧化剂稳定性好等优点,在难降解有机污染物的去除方面获得广泛的研究。因此,本研究首先通过一步水热法制备了氧化锰八面体-活性炭纤维(OMS-2@ACF),采用多种表征技术分析了OMS-2@ACF的理化结构;其次,以CBZ为目标污染物,开展了OMS-2@ACF+UV/PMS和OMS-2@ACF+UV/PMS耦合序批式污泥反应器(Sequencing Batch Reactor,SBR)两个体系降解CBZ的研究。最后,探讨了OMS-2@ACF对SBR系统稳定性的影响,主要结果如下:(1)在OMS-2@ACF+UV/PMS体系中,CBZ(20 mg/L)的降解率为98.1%,矿化率为53.3%,高于传统的UV/PMS体系。通过自由基淬灭实验和电子顺磁共振(Electron Paramagnetic Resonance,EPR)捕获反应体系中的自由基,确定该体系的活性物种为SO、O、O和·OH。通过反应前后催化剂x射线光电子能谱(X-ray photoelectron spectroscopy,XPS)结果分析可知,反应过程存在Mn-Mn-Mn之间的氧化还原反应;该材料经过5次循环重复实验,CBZ的去除率约为62%,且浸出的Mn离子浓度低于0.2 mg/L。(2)在OMS-2@ACF+UV/PMS耦合SBR体系中,该体系降解CBZ和COD的去除率分别为98.6%和73.1%,与单独的SBR工艺处理相比,CBZ和COD的去除率分别提高了94.1%和45%。通过高通量测序技术(High-throughput Sequencing)分析可知,该体系对菌群多样性影响较小,且索氏菌属(Thauera)、单螺菌属(Simplicispira)、毛球菌属(Trichococcus)和丛毛单胞菌属(Comamonas)是降解CBZ的优势菌属。(3)OMS-2@ACF对SBR体系处理COD和CBZ具有促进作用,且随着OMS-2@ACF(0.05-1 g/L)浓度的提升去除率逐渐升高,同时污泥沉降性能、混合液悬浮固体浓度(MLSS)、混合液挥发性悬浮固体浓度(MLVSS)也逐渐增大;而OMS-2@ACF对SBR体系中污泥的构成未发现明显影响。

关键词： CBZ OMS-2@ACF SBR 过硫酸盐优势菌属