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草鱼生长相关优势基因型的聚合效果分析

渔业科学进展 2021年第5期42卷 40-46页

作者：孙雪李胜杰杜金星姜鹏周家辉白俊杰中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

为研究草鱼(Ctenopharyngodon idella)生长性状相关分子标记聚合效果,本研究选择利用候选基因关联分析方法获得10个与生长性状相关SNP标记,分别位于草鱼载脂蛋白A-I-1基因(apoA-I-1)、丙酮酸激酶1型(PKL)、羧肽酶A1(CPA1)、柠檬酸合酶(... 详细信息

为研究草鱼(Ctenopharyngodon idella)生长性状相关分子标记聚合效果,本研究选择利用候选基因关联分析方法获得10个与生长性状相关SNP标记,分别位于草鱼载脂蛋白A-I-1基因(apoA-I-1)、丙酮酸激酶1型(PKL)、羧肽酶A1(CPA1)、柠檬酸合酶(CS)、醛缩酶B(Aldo-B)、生长催乳素α(SLα)和肌球蛋白重链(MYH)基因上。先在24尾雌鱼和24尾雄鱼亲本中对各标记进行基因型检测,挑选1对最有利于不同优势基因型发生聚合的亲鱼构建家系。在7月龄时,对子代进行生长性状测量和各SNP标记的基因型分型,采用一般线性模型分析含不同优势基因个数的组别生长差异。结果显示,家系子代个体中含生长相关优势基因型的数量为0、1、2、3、4、5、6、7个,对应的个体数量依次为44、67、83、85、44、38、15和6尾,对应的平均体质量依次为129.66、144.45、151.33、153.53、154.77、160.50、167.50和176.67 g,生长相关优势基因型的聚合个数与草鱼生长速度呈正相关。子代中优势基因型的平均数量为2.58,与亲本群体的优势基因型平均数量(1.00)相比显著提高。研究表明,对草鱼生长相关优势基因进行聚合可获得生长性状优良个体,为草鱼分子标记辅助育种应用提供理论依据。

关键词：草鱼生长性状分子标记优势基因型基因聚合

镜鲤与建鲤生长性状共享QTL标记及优势基因型

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中国水产科学 2015年第3期22卷 371-386页

作者：鲁翠云顾颖李超郑先虎程磊曹顶臣俞菊华何立川孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所上海海洋大学水产与生命学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

本研究以1个镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系(190个个体)构建的微卫星遗传图谱(992个标记)为基础,从体重、体长、体高和体厚的QTL区间内发掘了54个标记,其与性状具有显著相关性,进而通过对不同基因型性状间的比较,筛选出83个优势基... 详细信息

本研究以1个镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系(190个个体)构建的微卫星遗传图谱(992个标记)为基础,从体重、体长、体高和体厚的QTL区间内发掘了54个标记,其与性状具有显著相关性,进而通过对不同基因型性状间的比较,筛选出83个优势基因型。在此基础上,用54个镜鲤QTL标记分析了建鲤(Cyprinus carpio ***)作图群体,其中40个标记在建鲤中表现出多态性,比例为74.07%;相关性分析结果显示,其中22个标记与建鲤家系的体重、体长、体高或体厚性状具有显著相关性(P优势的基因型30个,可用于指导建鲤的选育。品种间共享QTL的发掘能够扩展QTL标记的使用空间,减少新品种重新构建图谱进行QTL标记定位的工作量和成本。

关键词：镜鲤建鲤共享QTL 优势基因型

生长相关优势基因型在大口黑鲈‘优鲈1号’选育世代中的聚合

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华南农业大学学报 2014年第1期35卷 7-11页

作者：徐磊白俊杰李胜杰孙成飞中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

【目的】以先前研究所获得的8个与大口黑鲈生长性状相关的分子标记为检测目标，分析其优势基因型在大口黑鲈选育群体中的分布数量，探索生长相关分子标记应用于大口黑鲈基因聚合育种的潜在可行性．【方法】采用STR基因分型技术对大口黑... 详细信息

【目的】以先前研究所获得的8个与大口黑鲈生长性状相关的分子标记为检测目标，分析其优势基因型在大口黑鲈选育群体中的分布数量，探索生长相关分子标记应用于大口黑鲈基因聚合育种的潜在可行性．【方法】采用STR基因分型技术对大口黑鲈‘优鲈1号’F2、F3、F5和F6选育群体的生长标记基因型进行检测，8个生长标记中含有4个单核苷酸多态性位点（分别位于IGF-I、POUIF1、PSS皿和MSTN基因上）和4个微卫星位点（分别是JZL60、JZL67、MisaTpw76和MisaTpw117）．【结果和结论】试验鱼所含优势基因型的数量为0—6个，F2、F3、F5和F6选育群体中优势基因型的分子标记平均数量依次为2．12、2．70、2．90和3．08，呈现逐代递增趋势；优势基因型的分子标记数量与大口黑鲈生长速度呈同步递增趋势，说明人工选育在一定程度上聚合了优势基因．

关键词：优势基因型聚合 STR 基因分型大口黑鲈选育

大口黑鲈“优鲈1号”生长相关优势基因型的分析

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海洋渔业 2014年第1期36卷 24-28页

作者：徐磊白俊杰李胜杰樊佳佳中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

大口黑鲈（Micropterus salmoides）“优鲈1号”是经多年选育获得的生长性状改良的养殖新品种，与非选育大口黑鲈相比，生长速度提高了17．8％一25．3％。为了研究具有生长相关优势基因型经聚合后对生长性状的改良起的贡献作用大小，本... 详细信息

大口黑鲈（Micropterus salmoides）“优鲈1号”是经多年选育获得的生长性状改良的养殖新品种，与非选育大口黑鲈相比，生长速度提高了17．8％一25．3％。为了研究具有生长相关优势基因型经聚合后对生长性状的改良起的贡献作用大小，本研究从大口黑鲈“优鲈1号”与非选育大口黑鲈群体中各随机挑选140ind，应用STR基因分型技术检测8个生长相关分子标记在这两个群体中的分布情况。8个生长标记中有4个微卫星位点，分别为JZL60、JZL67、MisaTpw76和MisaTpwll7，其余4个是单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点，分别位于胰岛素样生长因子-I（insulin—like growth factor—I，IGF-I）、肌肉生长抑制素（myostatin，MSTN）、垂体特异性转录因子（pituitary specific transcription factorl，POUlFl）和生长抑素前体（preprosomatostatin，PSSIII）基因上。结果表明，“优鲈1号”与非选育群体中优势基因型的数量为1—6个，两个群体含有的平均数量分别为2．606、2．312，表明人工选育在一定程度上聚合了优势基因型，研究结果为下一步生长性状相关标记的聚合及辅助选育应用提供参考依据。

关键词：大口黑鲈短串联重复序列基因聚合优势基因型基因分型

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大口黑鲈生长相关优势基因型聚合效果研究

大口黑鲈生长相关优势基因型聚合效果研究

作者：徐磊上海海洋大学

学位级别：硕士

大口黑鲈(Micropterus salmoides)，俗名加州鲈，隶属鲈形目(Perciformes)、鲈亚目(Porcoidei)、太阳鱼科(Cehtrachidae)、黑鲈属(Micropterus)。目前主要采用的是人工选育进行育种，传统的选育方法是一种基于表型的选择方法，并不能真... 详细信息

大口黑鲈(Micropterus salmoides)，俗名加州鲈，隶属鲈形目(Perciformes)、鲈亚目(Porcoidei)、太阳鱼科(Cehtrachidae)、黑鲈属(Micropterus)。目前主要采用的是人工选育进行育种，传统的选育方法是一种基于表型的选择方法，并不能真正的反映出样本的基因型，而应用分子标记辅助选择技术进行基因聚合育种在水产动物研究中并未见过。基因聚合育种是将多个有利基因型通过杂交和选择的方法聚合在同一个材料中，以达到遗传改良的目的。对于多个基因共同调控的数量性状而言，往往需要同时对多个标记进行选择才能达到好的选育效果。该技术在作物和畜禽已得到开展和应用，但在鱼类还很少见到有类似的报道。在前期的工作中，本实验室已经筛选到一批与大口黑鲈生长相关分子标记，其中有8个分子标记与鱼的生长密切相关，他们是分别位于IGF-I、POU1F1、PSSIII和MSTN基因上的SNP标记，和微卫星标记JZL60、JZL67、MisaTpw76和MisaTpw117，本研究采用STR基因分型技术分析所选与生长相关标记的优势基因型数量在大口黑鲈新品种优鲈1号选育世代中的分布规律，寻找传统选育过程中优势基因型的聚合情况;分析大口黑鲈繁殖后代中优势基因型富集的数量与生长性状的关联性，探索应用少数生长优势基因型进行聚合育种的可行性。STR基因分型技术是一项通过毛细管电泳区分目的片段大小，对实验个体进行基因型确定的技术，研究结果可为生长性状的基因聚合育种提供理论依据。采用本实验室已经获得的8个与大口黑鲈生长性状相关的分子标记对大口黑鲈“优鲈1号”不同选育世代的30尾试验鱼的基因型进行检测和STR基因分型，统计和分析优势基因型在各世代中的布规律的。结果表明，所检测的试验鱼含优势基因型的数量为0个，F2、F3、F5和F6选育群体中优势基因型的分子标记平均数量依次为2.12、2.70、2.90和3.08，呈现逐代递增趋势;同时检测了140尾大口黑鲈优鲈1号和同等数量的非选育大口黑鲈，结果是优鲈1号优势基因型的平均数量为2.606，非选育大口黑鲈的平均数为2.312，选育群体的优势基因型数量要高于非选育群体。以上结果显示随着选育世代的累进，大口黑鲈优势基因型的数量呈同步递增趋势，说明人工选育使优势基因型发生了聚合，间接反映了优势基因型聚合会对生长性状产生影响。大口黑鲈基因聚合效果分析。分别选取来自不同养殖场的大口黑鲈400尾，采用与生长密切相关的8个分子标记检测每个个体的优势基因型数量，挑选含有4个和4个以上优势基因型的大口黑鲈20尾，其中雌鱼9尾，雄鱼11尾进行群体繁殖，产卵孵化后将鱼苗放在水泥池中进行培育，2月龄时从中随机挑选5000尾放于1114㎡池塘中饲养，9月龄时，随机采集288尾进行测量体重，采用STR基因分型技术检测子代中优势基因型的数量。结果显示：所检测的鱼体重为110-410g，含有优势基因型数量为1个，优势基因型数量为2或3的群体所占比例最多，分别为：34.72％和38.19％。优势基因型数量从1-6的大口黑鲈群体平均体重依次为：227.83g、239.56g、258.81g、273.02g、302.50g和305.60g，优势基因型数量越多，生长性状的表型越优良，优势基因型数量与生长速度呈正相关。对各个优势基因型群体的体重分别与剩余群体体重的关联分析结果表明：各基因座上优势基因型群体平均体重都高于其余群体：位于MSTN基因上的体重差异最大，为14.60％，其余基因座的差异为02.76％。说明优势基因型聚合对性状有改良作用，利用有限的生长相关分子标记进行基因聚合育种可得到生长性状优良的大口黑鲈，位于MSTN基因上的优势基因型对体重的贡献率较大。研究结果为基因聚合育种提供理论基础。

关键词：大口黑鲈基因聚合基因分型分子标记优势基因型世代

不同基因型丙型肝炎病毒混合感染者体内病毒优势基因型和优势序列的研究

同方学位论文库评论

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中华肝脏病杂志 1999年第S1期7卷 60-61页

作者：宋宏彬王海涛唐时幸吉保新王天祥张习坦军事医学科学院微生物流行病研究所北京100071 新疆军区军事医学研究所

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半滑舌鳎生长相关的微卫星标记及优势基因型

水产学杂志 2016年第2期29卷 1-8页

作者：鲁翠云李超郑先虎曹顶臣程磊崔恒全毛成全孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室黑龙江哈尔滨150070 海阳市黄海水产有限公司山东海阳265122

本研究利用SPSS 19.0的GLM模型分析28个微卫星标记与半滑舌鳎Cynoglossus semilaevis生长性状的相关性,结果获得14个与半滑舌鳎体质量(BWe)、体长(BL)或体宽(BWi)显著相关的微卫星标记。与雄性个体生长性状显著相关的7个标记中,cse56与... 详细信息

本研究利用SPSS 19.0的GLM模型分析28个微卫星标记与半滑舌鳎Cynoglossus semilaevis生长性状的相关性,结果获得14个与半滑舌鳎体质量(BWe)、体长(BL)或体宽(BWi)显著相关的微卫星标记。与雄性个体生长性状显著相关的7个标记中,cse56与体质量、体长和体宽3个性状均显著相关(P优势基因型,29个雌性个体的优势基因型。

关键词：半滑舌鳎微卫星标记优势基因型

宁波地区幽门螺杆菌优势基因型及其与耐药性的关系

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现代实用医学 2010年第2期22卷 148-151页

作者：寿佩勤费红军岑叶平王布江柯海萍方夏英宁波天一职业技术学院浙江宁波315104 宁波第一医院浙江宁波315010

目的探讨宁波地区幽门螺杆菌(Hp)优势基因型及其与Hp耐药性的关系。方法选取宁波地区慢性胃炎和消化性溃疡患者的胃镜活检标本,对40株临床分离菌株,采用PCR法检测Hp的cagA、vacAm1、vacAm2、vacAs1a和babA2基因型;采用纸片扩散法作药敏... 详细信息

目的探讨宁波地区幽门螺杆菌(Hp)优势基因型及其与Hp耐药性的关系。方法选取宁波地区慢性胃炎和消化性溃疡患者的胃镜活检标本,对40株临床分离菌株,采用PCR法检测Hp的cagA、vacAm1、vacAm2、vacAs1a和babA2基因型;采用纸片扩散法作药敏试验。结果40株Hp中cagA、vacAm1、vacAm2、vacAs1a和babA2基因型的阳性率分别为100%、52.5%、85.5%、92.5%和57.5%;慢性胃炎和消化性溃疡患者中分离的Hp基因型的检出率差异均无显著性(>0.05);Hp对甲硝唑的耐药率高于阿奇霉素(基因型分布差异无显著性(>0.05)。结论宁波地区慢性胃炎和消化性溃疡患者中分离的Hp以cagA、vacAm2、vacAs1a、babA2、vacAs1a/m2基因型为主。Hp基因亚型的确定尚不能对Hp根治疗法中抗生素的选择提供帮助。

关键词：微生物敏感性试验幽门螺杆菌优势基因型耐药性

生长相关优势基因型在大口黑鲈“优鲈1号”选育世代中的富集

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生长相关优势基因型在大口黑鲈“优鲈1号”选育世代中的富集