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鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium sp.)JCR5降解17α-乙炔基雌二醇的代谢途径

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环境科学 2006年第9期27卷 1835-1840页

作者：任海燕纪淑兰崔成武王道北京工业大学环境与能源工程学院北京100022

从北京某避孕药厂污水处理站曝气池的活性污泥中分离得到1株能够以17α-乙炔基雌二醇(17α-ethinylestradiol,EE2)为唯一碳源和能源生长的菌株JCR5.通过对其形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,鉴定该菌株为鞘氨醇杆菌属(Sphingoba... 详细信息

从北京某避孕药厂污水处理站曝气池的活性污泥中分离得到1株能够以17α-乙炔基雌二醇(17α-ethinylestradiol,EE2)为唯一碳源和能源生长的菌株JCR5.通过对其形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,鉴定该菌株为鞘氨醇杆菌属(Sphingobacteriumsp.).菌株JCR5在10d内对初始底物浓度为30 mg.L-1EE2的降解率可达87%.该菌株能够利用甾体雌激素(甾酮、17β-雌二醇、雌三醇以及炔雌醇甲醚)、避孕药生产中间体以及一些芳烃化合物为唯一碳源生长.对EE2降解中间产物进行质谱分析推测,EE2在降解过程中首先被氧化为雌酮(estrone,E1),后经过一系列生物催化作用生成2-羟基-2,4-二烯-戊酸和2-羟基-2,4-二烯-1,6-己二酸2种中间代谢产物.前者是与Comamonas testosteroniTA441代谢睾甾酮的途径类似的产物,而后者是3-羟基-4,5-9,10-二断雌甾烷-1(10),2-二烯-5,9,17-三酮基-4-酸不同于前者断键位置的另一产物.

关键词： 17a-乙炔基雌二醇鞘氨醇杆菌属代谢途径生物降解

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多溴联苯醚降解的代谢途径

材料导报 2016年第11期30卷 97-102,109页

作者：才满杜克久河北农业大学林学院保定071000 河北农业大学河北省林木种子资源与森林保护重点实验室保定071000

添加型阻燃剂多溴联苯醚(PBDEs)由于具有优异的阻燃性能,已被广泛应用于各种消费品中。PBDEs具有低水溶性,会强烈吸附有机物,导致PBDEs在环境介质和食物链中大量富积,对人类和动物都造成巨大危害。对多溴联苯醚生物降解、光降解和零价... 详细信息

添加型阻燃剂多溴联苯醚(PBDEs)由于具有优异的阻燃性能,已被广泛应用于各种消费品中。PBDEs具有低水溶性,会强烈吸附有机物,导致PBDEs在环境介质和食物链中大量富积,对人类和动物都造成巨大危害。对多溴联苯醚生物降解、光降解和零价铁降解过程中的代谢途径和代谢过程中所需的酶进行综述,为多溴联苯醚的修复提供理论基础。

关键词：多溴联苯醚生物降解光降解零价铁降解代谢途径

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反硝化聚磷污泥的基质利用及代谢途径

化工学报 2011年第9期62卷 2623-2628页

作者：刘晖孙彦富周康群李军陈捷美麦志宏李研仲恺农业工程学院环境科学与工程学院广东广州5102252 北京工业大学城建学院北京100124

利用A/ASBR富集反硝化聚磷菌,并利用乙酸和葡萄糖两种基质进行反硝化聚磷实验,跟踪实验过程水中的磷酸盐、硝酸盐、COD与泥中PHA和糖原的变化,研究代谢途径。结果表明:(1)厌氧时磷酸盐的释放将决定PHA的合成,缺氧时PHA的分解一方面作为... 详细信息

利用A/ASBR富集反硝化聚磷菌,并利用乙酸和葡萄糖两种基质进行反硝化聚磷实验,跟踪实验过程水中的磷酸盐、硝酸盐、COD与泥中PHA和糖原的变化,研究代谢途径。结果表明:(1)厌氧时磷酸盐的释放将决定PHA的合成,缺氧时PHA的分解一方面作为碳源将NO3--N还原成了N2,同时产生的ATP为聚磷过程提供能量,因此在研究反硝化聚磷效果时,应重点跟踪ΔPHA,而不是ΔCOD。(2)以葡萄糖为基质时只有先通过发酵型的菌将葡萄糖分解为小分子的挥发性有机酸,才能充分发挥非发酵菌的反硝化聚磷功能。(3)厌氧阶段合成PHA所需要的能量ATP约85%来自磷酸盐的释放,15%来自糖原的酵解。缺氧阶段,85%的PHA分解产生的ATP用于聚磷,15%转化为糖原,因此在考虑代谢途径时可将其进行简化。

关键词：反硝化聚磷代谢途径基质利用 PHA 非发酵菌

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寡养单胞菌对S2-氧化特性及主要代谢途径

中国环境科学 2019年第8期39卷 3373-3382页

作者：徐瑶瑶宋晨路金霞王进岳正波刘晓玲中国环境科学研究院北京100012 合肥工业大学资源与环境工程学院安徽合肥230009 南京瑞迪建设科技有限公司江苏南京210029 南京水利科学研究院江苏南京225600

以无机硫(S2)-为目标污染物,从北京东沙河黑臭水体筛选出一株能够高效氧化S2-的土著硫氧化菌,并对其进行16S rRNA测序及生理生化特性鉴定,结果表明,该菌株属于寡养单胞菌属(Stenotrophomonas),命名为Stenotrophomonas ***3.菌株sp3在温... 详细信息

以无机硫(S2)-为目标污染物,从北京东沙河黑臭水体筛选出一株能够高效氧化S2-的土著硫氧化菌,并对其进行16S rRNA测序及生理生化特性鉴定,结果表明,该菌株属于寡养单胞菌属(Stenotrophomonas),命名为Stenotrophomonas ***3.菌株sp3在温度25℃,初始pH值7.0,初始葡萄糖浓度0.25%,初始菌浓度1.00g/L时,菌株sp3对S2-的氧化率最高.在此适宜条件下,反应60h后,菌株sp3对S2-的最高氧化率达到86.6%.S2-的浓度在整个氧化过程中持续下降后保持稳定,在此过程中产生了S0,S2O3^ 2-,S2O3^2-以及SO4 ^2-这4种其它存在形态的硫.随着S2-被氧化,SO4 2-的浓度呈缓慢上升的趋势.利用高通量测序技术推测菌株sp3主要是通过副球菌硫氧化途径(PSO)将非稳定态的S2-逐步转化为稳定态的SO4 2-.在此代谢途径中,一部分S2-被氧化为S0,另一部分S2-则直接氧化为S2O3^2-;S0与S2O3^2-可自发反应生成S2O3^ 2-,而S2O3^ 2-发生歧化反应再释放出S2O3^2-和S0;反应生成的部分S2O3^2-继续直接氧化为SO4^ 2-.菌株sp3在黑臭水体的水质净化过程中有一定的应用前景.

关键词： S^2- 筛选硫氧化特性代谢途径

包装方式和贮藏温度对羊肉微生物数量、细菌多样性和代谢途径的影响

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食品科学 2022年第21期43卷 305-314页

作者：王莹张建海王勇亮来静张鑫周丽媛朱迎春山西农业大学食品科学与工程学院山西太谷030801 山西农业大学动物医学学院山西太谷030801 山西省食品研究所山西太原030000

为探究包装方式和贮藏温度对羊肉微生物数量、细菌多样性和代谢途径的影响,将宰后羊肉分别经空气包装(air packaging,AP)、真空包装(vacuum packaging,VP)和贴体包装(skin packaging,SP)后置于冷藏(4±1)℃和冰温(-1.7±0.2)℃下贮藏30... 详细信息

为探究包装方式和贮藏温度对羊肉微生物数量、细菌多样性和代谢途径的影响,将宰后羊肉分别经空气包装(air packaging,AP)、真空包装(vacuum packaging,VP)和贴体包装(skin packaging,SP)后置于冷藏(4±1)℃和冰温(-1.7±0.2)℃下贮藏30 d,采用平板计数和高通量测序相结合的方法对贮藏过程中的微生物群落进行分析。结果表明,贮藏过程中SP组的菌落总数(total viable count,TVC)、乳酸菌、假单胞菌等6种菌群数量均低于AP组和VP组,冰温组6种菌群数量均明显低于冷藏组。随贮藏时间延长羊肉菌群多样性均呈下降趋势,冷藏组较冰温组多样性更复杂。采用高通量测序技术对羊肉菌群16S rDNA的V3~V4区域测序,共获得10个菌门和30个菌属,所有样品中丰度最高的菌门均为变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);假单胞菌属(Pseudomonas)在AP组中为优势菌属,而在SP组和VP组中丰度较低,肉食杆菌属(Carnobacterium)、环丝菌属(Brochothrix)和乳杆菌属(Lactobacillus)均为AP、VP和SP组贮藏末期的优势菌属。基于京都基因与基因组百科全书富集分析发现碳水化合物代谢、氨基酸代谢和核苷酸代谢为羊肉贮藏过程中主要代谢途径,其中贮藏前期以氨基酸代谢为主,贮藏后期主要为碳水化合物代谢和核苷酸代谢,包装方式和贮藏温度导致的菌群结构差异主导了代谢丰度的不同。结论:SP协同冰温贮藏能够降低羊肉贮藏过程中微生物的数量和细菌群落多样性,有利于保持羊肉品质。

关键词：贮藏温度包装方式微生物数量细菌多样性代谢途径

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代谢途径在中性粒细胞抗感染免疫过程中的作用

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第11期44卷 965-969页

作者：王晓璐苏建玲冯诗琪何石萍李洋中山大学附属第八医院(深圳福田)综合(特需)一病区深圳518033 南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)风湿免疫科广州510180

中性粒细胞是抗感染免疫过程中快速识别和消除病原体的一线细胞,主要依靠糖酵解来发挥其杀伤功能。尽管关于影响中性粒细胞功能的代谢途径研究开始较早,但中性粒细胞在抗感染过程中如何进行代谢转变仍然知之甚少。目前,已证明糖原代谢... 详细信息

中性粒细胞是抗感染免疫过程中快速识别和消除病原体的一线细胞,主要依靠糖酵解来发挥其杀伤功能。尽管关于影响中性粒细胞功能的代谢途径研究开始较早,但中性粒细胞在抗感染过程中如何进行代谢转变仍然知之甚少。目前,已证明糖原代谢对多种中性粒细胞的功能具有重要作用,除糖酵解以外的其他代谢途径,如线粒体相关代谢、中性粒细胞分化过程中的脂肪酸氧化,也对中性粒细胞功能的调控具有潜在贡献。本文综述了目前关于中性粒细胞抗感染反应过程中的代谢调节作用,旨在为中性粒细胞的代谢研究提供一定的理论参考。

关键词：中性粒细胞代谢途径感染免疫

湖泊沉积物的氮代谢微生物、功能基因及代谢途径分析:以贵州省红枫湖为例

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环境科学 2024年第10期45卷 6086-6095页

作者：刘倩陈晓李彦澄何雨含李江贵州大学资源与环境工程学院喀斯特地质资源与环境教育部重点实验室贵阳550025 贵州喀斯特环境生态系统教育部野外科学观测研究站贵阳550025

氮循环是湖泊生态系统中物质循环和能量流动的重要过程,在湖泊沉积物中,由微生物驱动的氮循环在维持湖泊生态系统平衡中发挥了重要作用.选择贵州省红枫湖作为研究对象,采集湖泊沉积物进行理化性质分析,并利用宏基因组学技术分析沉积物... 详细信息

氮循环是湖泊生态系统中物质循环和能量流动的重要过程,在湖泊沉积物中,由微生物驱动的氮循环在维持湖泊生态系统平衡中发挥了重要作用.选择贵州省红枫湖作为研究对象,采集湖泊沉积物进行理化性质分析,并利用宏基因组学技术分析沉积物中的氮代谢微生物、功能基因、代谢途径及其相互关系.结果表明,红枫湖沉积物中的氮代谢微生物主要为细菌,其相对丰度前3的优势菌属分别为硫杆菌属(Thiobacillus,16.64%)、红长命菌属(Rubrivivax,9.43%)和硝化螺旋菌属(Nitrospira,7.09%);共检测到6条氮代谢途径,分别为固氮、硝化、反硝化、同化硝酸盐还原、异化硝酸盐还原和完全硝化,主要以反硝化和异化硝酸盐还原途径为主,未检测到厌氧氨氧化途径;细菌和古菌参与了6条氮代谢途径,真核生物参与了3条途径,分别是异化硝酸盐还原、反硝化和完全硝化;氨氮、硝酸盐氮和总磷是氮代谢功能基因分布的主要环境影响因子,但在不同环境中存在差异;氮代谢功能基因与微生物之间绝大多数呈正相关关系(95.04%),其中,丰度最高且宿主最多的氮代谢基因分别为narG、narZ和nxrA.研究结果进一步阐释了贵州喀斯特地区典型湖泊的氮循环过程.

关键词：红枫湖宏基因组学氮循环功能基因代谢途径

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厌氧氨氧化脱氮除碳功能菌群结构及代谢途径

中国环境科学 2022年第3期42卷 1138-1145页

作者：常尧枫郭萌蕾谢军祥谢嘉玮陈重军苏州科技大学环境科学与工程学院江苏苏州215009 江苏省环境科学与工程重点实验室江苏苏州215009 江苏水处理技术与材料协同创新中心江苏苏州215009

为明确不同有机物浓度(50~150mg/L)和竹炭同时存在下厌氧氨氧化颗粒污泥系统的脱氮除碳功能菌群结构及代谢途径差异,采用宏基因组测序技术对其微生物分布规律和碳氮代谢基因表达进行了研究.结果表明,当COD浓度为50,150mg/L,添加竹炭显... 详细信息

为明确不同有机物浓度(50~150mg/L)和竹炭同时存在下厌氧氨氧化颗粒污泥系统的脱氮除碳功能菌群结构及代谢途径差异,采用宏基因组测序技术对其微生物分布规律和碳氮代谢基因表达进行了研究.结果表明,当COD浓度为50,150mg/L,添加竹炭显著提升了厌氧氨氧化菌(AnAOB)的相对丰度,Candidatus_Kuenenia的相对丰度分别由2.0%和2.9%增加至1.8%和4.5%.与只添加有机物的对照组相比,添加竹炭的处理组显著改变了微生物群落结构,在炭存在下异化硝酸盐还原为铵(DNRA)细菌丰度下降,反硝化菌属和碳代谢相关菌属丰度增加,说明竹炭的投加有助于维持厌氧氨氧化、反硝化和DNRA3个氮代谢途径群落结构的稳定.微生物共现网络分析表明,不同脱氮菌群的协同作用提高了总氮(TN)的去除率,竹炭可以通过Halomonas的富集提高Candidatus_Brocadia和Candidatus_Jettenia的抗逆性.通过KEGG数据库注释表明,有机物存在条件下竹炭提升了厌氧氨氧化颗粒污泥系统的碳氮代谢效能,尤其促进了糖酵解途径(EMP)与三羧酸循环(TCA cycle)的衔接.

关键词：宏基因组厌氧氨氧化颗粒污泥脱氮除碳菌群结构代谢途径

肌醇在植物体内的代谢概述——肌醇作为细胞壁木聚糖和果胶前驱物的代谢途径

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林产化学与工业 2013年第5期33卷 106-114页

作者：张梦谢益民杨海涛姚兰湖北工业大学制浆造纸工程学院湖北武汉430068

肌醇又称环己六醇,在植物发育中有着重要的生物学功能,肌醇有9种同分异构体,其中肌肉肌醇(myo-肌醇)是植物细胞中含量最为丰富的一种异构体,在植物体内,myo-肌醇是葡萄糖在己糖激酶、肌醇-1-磷酸合成酶和碱性磷酸酶的作用下成环生成的产... 详细信息

肌醇又称环己六醇,在植物发育中有着重要的生物学功能,肌醇有9种同分异构体,其中肌肉肌醇(myo-肌醇)是植物细胞中含量最为丰富的一种异构体,在植物体内,myo-肌醇是葡萄糖在己糖激酶、肌醇-1-磷酸合成酶和碱性磷酸酶的作用下成环生成的产物,参与植物体内重要的氧化代谢途径。植物细胞壁生物合成与肌醇代谢有着紧密联系,木聚糖和果胶是植物细胞壁多糖的重要组成成分,可由肌醇通过氧化途径代谢生成,这为同位素示踪法研究植物细胞壁中木质素与木聚糖和果胶之间的连接形式提供了重要依据,对植物纤维化学和制浆造纸研究有着重要意义。

关键词：肌肉肌醇生物合成代谢途径多糖细胞壁