检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

人副肠孤病毒的研究进展

中国病毒病杂志 2013年第4期3卷 310-316页

作者：罗雷朱汝南首都儿科研究所病毒研究室北京100020

人副肠孤病毒（human parechovirus,HPeV）是一种单股正链、无包膜的RNA病毒,属于小RNA病毒科（Picornaviridae）副肠孤病毒属（Parechovirus）。同属于副肠孤病毒属的还有永贝里病毒（Ljungan virus）。

关键词：人副肠孤病毒病毒学临床表现诊断

柯萨奇病毒A组10型和人副肠孤病毒构象表位的生物信息学预测

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

柯萨奇病毒A组10型和人副肠孤病毒构象表位的生物信息学预测

作者：戎浩宁波大学

学位级别：硕士

目的:利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CVA10)的构象表位进行系统性地预测,并将算法推广到小RNA病毒,对人副肠孤病毒1型(Human parechovirus 1,HPe V1)和3型(Human par... 详细信息

目的:利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CVA10)的构象表位进行系统性地预测,并将算法推广到小RNA病毒,对人副肠孤病毒1型(Human parechovirus 1,HPe V1)和3型(Human parechovirus 3,HPe V3)的构象表位进行系统性地预测,探讨这三种血清型小RNA病毒构象表位的分布模式。方法:1.选取三株CVA10(FY01/AH/CHN/2013、CVA10-FJ-01和A10/S0148b),从RCSB PDB数据库中下载它们的三维结构文件,从NCBI的Nucleotide数据库下载结构蛋白的氨基酸序列。利用MEGA软件和ESPript工具比较CVA10结构蛋白的氨基酸序列和二级结构,利用Py MOL软件绘制CVA10结构蛋白的三维结构和衣壳表面结构。利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对CVA10进行构象表位预测。通过文献检索获取已报道的实验表位,利用RIVEM绘制CVA10足迹图,评估算法的预测准确性,同时分析抗体与构象表位的相互作用关系。2.选取HPe V1代表株(Harris)和HPe V3代表株(A308/99),从RCSB PDB数据库中下载三维结构文件,从NCBI的Nucleotide数据库下载结构蛋白的氨基酸序列。从Nucleotide数据库下载所有具有完整结构蛋白序列的HPe V病毒株的氨基酸序列,从中随机选择16株HPe V(HPe V1:4株;HPe V2:2株;HPe V3:4株;HPe V4:2株;HPe V5:2株;HPe V6:2株),用作序列保守性分析。利用MEGA、ESPript、Py MOL和UCSF Chimera软件比较HPe V1、HPe V3和CVA10结构蛋白的氨基酸序列、二级结构、三维结构和衣壳表面结构。将实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法扩展到小RNA病毒,对HPe V1和HPe V3进行构象表位预测。通过文献检索获取已报道的实验表位,利用RIVEM绘制HPe V1和HPe V3足迹图,评估算法的预测准确性,同时分析抗体与构象表位的相互作用关系。结果:***10的45个氨基酸残基聚集成三簇构象表位:site 1、site 2和site 3。site 1位于五倍轴附近的north rim区域,由VP1的BC环和HI环构成。site 2位于峡谷南侧的puff区域,主要由VP1的GH环和C-端以及VP2的EF环构成。site 3可以分为两部分,一部分位于峡谷南侧的knob区域,由VP1 C-端和VP3 N-端构成,与site 1和site 2更接近,构成“品”字形分布;另一部分位于三倍轴,由VP2 HI环和VP3 HI环构成。site 2和site 3与已报道的两个表位2G8和VP2-P28高度重叠。*** V1和HPe V3的构象表位的分布模式高度一致,构象表位都呈现三簇分布,分别为site 1、site 2和site 3。site 1位于五倍轴附近的north rim区域,由VP1的BC环和HI环构成。site 2位于峡谷南侧的puff区域,主要由VP1的C-端构成。site3分为两部分,一部分位于knob区域,主要由VP3的N-端构成,另一部分靠近三倍轴,主要由VP0(VP2)的HI环和VP3的HI环构成。与CVA10相比,由于HPe V1和HPe V3的VP0(VP2)EF环和VP1 GH环上的残基较少,导致puff区域变得平坦,整体上难以形成构象表位,因此HPe V1、HPe V3与CVA10的site2构象表位存在明显差异。同时由于CVA10的VP1 C-端较长,导致构成site 3的knob区域的构象表位也存在明显差异。构象表位site 1上的VP1-85N-87D这两个氨基酸残基可能是单抗AT12-015结合HPe V3的关键残基。VP3-91N/94S-92H/95S和VP0-257S/A这三个关键残基的变异影响了单抗AM28的结合能力点,说明表位上的残基突变产生了不同的HPe V血清型。结论:***10、HPe V1和HPe V3都具有相似的构象表位分布模式,构象表位都聚集成三簇,分别为site 1、site 2和site 3。*** V1和HPe V3的site 2和site 3构象表位与CVA10存在明显差异。site 3上的三个关键氨基酸残基可能决定了HPe V1和HPe V3的血清学差异。

关键词：柯萨奇病毒A组10型人副肠孤病毒构象表位抗原表位生物信息学预测

中枢神经系统感染和脓毒症患儿人副肠孤病毒和非脊髓灰质炎肠道病毒感染的特征

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中华实验和临床病毒学杂志 2016年第2期30卷 153-156页

作者：吴迪宋秦伟张又钱渊丁雅馨赵林清邓洁王芳孙宇朱汝南首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

目的通过检测患儿脑脊液和血清标本中的HPeV和NPEV,结合临床探讨其在儿童中的感染特征.方法收集2014年1月至12月首都儿科研究所附属儿童医院来自600例16岁以下怀疑中枢神经系统感染或脓毒症患儿的脑脊液标本543份和血清标本173份,其中... 详细信息

目的通过检测患儿脑脊液和血清标本中的HPeV和NPEV,结合临床探讨其在儿童中的感染特征.方法收集2014年1月至12月首都儿科研究所附属儿童医院来自600例16岁以下怀疑中枢神经系统感染或脓毒症患儿的脑脊液标本543份和血清标本173份,其中116例患儿同时收集到脑脊液和血清标本.通过实时荧光RT-PCR和巢式RT-PCR的方法对HPeV和NPEV进行筛查及分型.结果在最终诊断为CNS感染的136例患儿中,HPeV阳性率为1.5％,NPEV阳性率为16.9％;诊断为脓毒症的51例患儿中,HPeV阳性率为5.9％,NPEV阳性率为3.9％;其他诊断的413例患儿中,HPeV阳性率为3.4％,NPEV阳性率为2.9％.HPeV感染患儿以0月～＜3月年龄组最多,而NPEV则以3岁～＜7岁组最多.NPEV感染的高峰为7月～9月,而HPeV感染的高峰为11月和12月.结论 HPeV感染患儿年龄低于NPEV感染患儿,HPeV和NPEV可在儿童中引起脓毒症或CNS感染等严重疾病.

关键词：人副肠孤病毒非脊髓灰质炎肠道病毒中枢神经系统感染脓毒症儿童

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

人副肠孤病毒流行病学研究进展

心理月刊 2020年第1期15卷 235-236页

作者：叶郁辉吴延杰张海龙张振缪家清靳兴汉北京大学深圳医院深圳市疾病预防控制中心清华大学医院管理研究院安徽医科大学

人副肠孤病毒(HPeV)是小RNA病毒科,肠道病毒属,有16个基因型。儿童为易感人群,传播方式为粪-口途径与呼吸道途径,临床表现因分型不同而症状不同,其致病机制尚不明确,难以在临床上有效鉴别。其流行呈现季节性,流行于秋冬季,在春季呈现较... 详细信息

人副肠孤病毒(HPeV)是小RNA病毒科,肠道病毒属,有16个基因型。儿童为易感人群,传播方式为粪-口途径与呼吸道途径,临床表现因分型不同而症状不同,其致病机制尚不明确,难以在临床上有效鉴别。其流行呈现季节性,流行于秋冬季,在春季呈现较低的流行趋势,HPeV3有隔年流行趋势。目前我国尚未建立关于人副肠孤病毒的监测和疾控体系,建议完善监测网络、多方位预防并进行宣传教育,以达到良好的防控效果。

关键词：人副肠孤病毒生物学特征流行病学临床特征

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

深圳市人副肠孤病毒感染的危险因素分析

实用临床医学（江西） 2019年第10期20卷 100-102页

作者：钟景成叶郁辉吴延杰北京大学深圳医院预防保健科

目的探讨深圳市人副肠孤病毒(HpeV)感染的危险因素。方法回顾性调查分析2016年1月至2017年12月北京大学深圳医院收治的5岁以下腹泻儿童220例,根据HpeV感染情况分为2组:未感染组186例,感染组34例。收集2组患者一般临床资料及可能的危险因... 详细信息

目的探讨深圳市人副肠孤病毒(HpeV)感染的危险因素。方法回顾性调查分析2016年1月至2017年12月北京大学深圳医院收治的5岁以下腹泻儿童220例,根据HpeV感染情况分为2组:未感染组186例,感染组34例。收集2组患者一般临床资料及可能的危险因素,通过单因素分析和多因素分析识别深圳市HpeV感染的危险因素。结果单因素分析提示2组患儿神经系统感染、脓毒症、肠炎、轮状病毒感染、呼吸道疾病比较差异有统计学意义(P肠炎(95%CI-2.981 2~3.290 3,P病毒感染(95%CI-2.918 2~3.227 3,P肠炎、轮状病毒感染、呼吸道疾病等,因此,患儿一旦发生腹泻应立即送院诊治,以降低不良事件发生率。

关键词：深圳市人副肠孤病毒危险因素单因素分析 Logistic回归分析

深圳地区5岁以下腹泻儿童人副肠孤病毒感染情况

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国热带医学 2018年第5期18卷 456-458,468页

作者：唐屹君叶郁辉张海龙吴延杰张振深圳市疾病预防控制中心广东深圳518055 北京大学深圳医院广东深圳518036

目的研究深圳市腹泻儿童中人副肠孤病毒(HPeV)的感染情况和流行特征。方法收集2016年深圳市5岁以下腹泻儿童粪便标本280例,采用荧光定量PCR方法检测粪便中的HPeV核酸,同时对患者的流行病学资料进行统计分析。结果 2016年深圳地区5岁以... 详细信息

目的研究深圳市腹泻儿童中人副肠孤病毒(HPeV)的感染情况和流行特征。方法收集2016年深圳市5岁以下腹泻儿童粪便标本280例,采用荧光定量PCR方法检测粪便中的HPeV核酸,同时对患者的流行病学资料进行统计分析。结果 2016年深圳地区5岁以下腹泻儿童HPeV的检出率为15.36%(43/280),其中5~病毒的感染;男性检出率为14.59%(27/185),女性检出率为16.84%(16/95),男女患者检出率的差异无统计学意义(P>0.05);夏季HPeV的检出率最高(25.64%,30/117),秋季次之(14.29%,11/77),冬季(3.57%,1/28)和春季(1.72%,1/58)的检出率都较低。结论深圳地区5岁以下腹泻儿童中HPeV有较高的检出率,持续开展HPeV监测有助于进一步明确深圳地区儿童腹泻的病因构成。

关键词：人副肠孤病毒 5岁以下腹泻儿童实时荧光定量PCR

深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

实用医学杂志 2020年第3期36卷 400-405页

作者：祝亚楠张海龙陈龙姚相杰杨洪韩敏关心何雅青胡贵方南方医科大学公共卫生学院流行病学系广州510515 深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所广东深圳518036

目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3... 详细信息

目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3/VP1连接区片段进行分型,同时对患儿的流行病学和临床资料进行统计分析。结果497例患儿中,HPeV的阳性率为8.2%;男性HPeV阳性率为7.6%,女性HPeV阳性率为9.4%(χ2=0.491,P=0.501);0~6月龄患儿HPeV阳性率最高,且92.7%的HPeV阳性患儿月龄6次/d,以黏液便为主,常伴有呕吐,呕吐频率平均每天5次,呕吐物以胃内容物为主。HPeV阳性患儿较阴性患儿在有无呕吐和呕吐物性状差异具有统计学意义。本研究中共检测到HPeV⁃1(HPeV⁃1A和HPeV⁃1B亚型)、3、4、5、6和14在内的6种基因型,其中HPeV⁃1B(56.1%)为优势流行株,其次是HPeV⁃1A(17.1%)、HPeV⁃3(7.3%)、HPeV⁃4(7.3%)、HPeV⁃5(4.9%)、HPeV⁃6(4.9%)和HPeV⁃14(2.4%)。系统进化分析结果显示,大部分深圳分离株与兰州和广州来源的参考株核苷酸序列一致性高。结论本研究首次在深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便中检测到HPeV,且在2017年和2018年有稳定的感染率,检测到6种HPeV基因型别可能与急性肠胃炎相关,HPeV夏季检出率最高,好发于0~6个月患儿,可能是引起急性肠胃炎住院患儿呕吐胃内容物的病因。开展HPeV监测以更充分地掌握其在深圳地区的流行和临床特征,有助于进一步明确深圳地区住院患儿病毒性急性肠胃炎病原谱构成。

关键词：人副肠孤病毒急性肠胃炎儿童基因分型系统进化分析