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二级结构形成：蛋白质折叠起始过程的框架模型

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生物化学与生物物理进展 1994年第6期21卷 508-513页

作者：胡红雨杜雨苍鲁子贤中国科学院上海生物化学研究所

框架模型认为二级结构形成是蛋白质起始过程的结构基础。文章介绍蛋白质同源片段的溶液构象及其构象研究法和多肽二级结构的从头设计，并综述这些研究成果应用于折叠起始过程的理论模型和蛋白质折叠起始过程的最新研究进展。

关键词：框架模型二级结构从头设计折叠起始蛋白

pH值和钙离子对尖吻蝮蛇抗血小板凝集素二级结构的影响(英文)

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无机化学学报 2007年第5期23卷 849-853页

作者：陈结霞徐小龙王守业张立云刘清亮中国科学技术大学化学系合肥230026

尖吻蝮蛇毒中抗血小板凝集素是凝血因子IX/凝血因子X结合蛋白,它具有抗凝血和抑制血小板凝集双重活性。用红外光谱、拉曼光谱和CD谱研究了抗血小板凝集素的二级结构以及pH值和钙离子对其二级结构的影响。用CD谱测得,在水溶液中,抗血小... 详细信息

尖吻蝮蛇毒中抗血小板凝集素是凝血因子IX/凝血因子X结合蛋白,它具有抗凝血和抑制血小板凝集双重活性。用红外光谱、拉曼光谱和CD谱研究了抗血小板凝集素的二级结构以及pH值和钙离子对其二级结构的影响。用CD谱测得,在水溶液中,抗血小板凝集素的主要骨架构象为β-折叠(26.3%)和α-螺旋(19.6%)结构。拉曼光谱显示,在粉末状态,其α-螺旋含量显著降低。CD谱还表明,抗血小板凝集素在pH值3.0￣11.0范围内保持稳定的天然结构,钙离子诱导的抗血小板凝集素结构变化是可逆的,钙离子在稳定抗血小板凝集素的天然结构中起重要作用。

关键词：抗血小板凝集素二级结构圆二色谱拉曼光谱红外光谱

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施氮量对两个强筋小麦品种品质的影响

西北农业学报 2024年第4期33卷 595-605页

作者：张一智郭雷晏帅王鲁振赵一悦陈怡菲李红霞王中华高欣西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100 山东省农业科学院作物研究所/小麦玉米国家工程研究中心/小麦育种全国重点实验室/农业农村部黄淮北部小麦生物学与遗传育种重点实验室/山东省小麦技术创新中心济南250100

为了探究施氮量对强筋小麦品质特性的影响,以强筋小麦品种‘郑麦366’和‘郑农46’为试验材料,分别设置0、120、240和360 kg/hm^(2)的施氮量,研究不同氮水平对小麦面筋蛋白组成及二级结构、淀粉的粒度分布和粘度特性、面团流变学特性的... 详细信息

为了探究施氮量对强筋小麦品质特性的影响,以强筋小麦品种‘郑麦366’和‘郑农46’为试验材料,分别设置0、120、240和360 kg/hm^(2)的施氮量,研究不同氮水平对小麦面筋蛋白组成及二级结构、淀粉的粒度分布和粘度特性、面团流变学特性的影响。结果表明,‘郑麦366’和‘郑农46’分别在N_(1)(120 kg/hm^(2))和N_(2)(240 kg/hm^(2))水平下流变学特性达到最佳,这可能是因为两个小麦品种分别在N_(1)和N_(2)下蛋白质含量较高、总淀粉含量较低、B型淀粉相对含量较高;相比于N_(0)(0 kg/hm^(2)),N_(3)(360 kg/hm^(2))条件下的面团流变学特性显著降低,可能是由于过量施氮分别影响了‘郑麦366’的蛋白含量和‘郑农46’的B型淀粉含量。综上,相比于其他品质性状,蛋白含量对‘郑麦366’品质的影响更大,而B型淀粉含量的变化在‘郑农46’品质形成中起主导作用。本研究为强筋小麦‘郑麦366’和‘郑农46’的氮素施用提供理论依据。

关键词：施氮量强筋小麦面筋蛋白淀粉二级结构流变学特性

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基于ITS2一级序列和二级结构对土茯苓及混伪品的鉴别研究

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中国现代中药 2022年第6期24卷 1026-1032页

作者：郑梦迪贺紫涵张寒张彦西安医学院陕西西安710021

目的:使中药材土茯苓与其混伪品得到有效区分,确保土茯苓药材临床用药安全。方法:采用内转录间隔区2 (ITS2)一级序列联合二级结构信息鉴别土茯苓及其混伪品,收集土茯苓正品及混伪品30条ITS2序列,使用基于隐马尔可夫模型(hidden Markov m... 详细信息

目的:使中药材土茯苓与其混伪品得到有效区分,确保土茯苓药材临床用药安全。方法:采用内转录间隔区2 (ITS2)一级序列联合二级结构信息鉴别土茯苓及其混伪品,收集土茯苓正品及混伪品30条ITS2序列,使用基于隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMM)的方法注释,采用MEGA 7.0比对序列,基于Kimura-2-Parameter模型计算种内、种间的遗传距离,并构建邻接法(neighbor-joining,NJ)系统发育树;通过ITS2 Database预测各品种的ITS2二级结构,利用4Sale软件进行二级结构的比对,运用ProfDistS软件基于距离法构建联合一级序列及其二级结构的剖面邻接(profile neighbor joining,PNJ)系统发育树。结果:土茯苓的平均ITS2序列长度为245 bp,平均碱基G+C占比为82.8%,各物种种间遗传距离均显著大于种内遗传距离,NJ系统发育树和PNJ系统发育树的物种分支关系基本一致,土茯苓与其各种混伪品均分别各自聚为一支,可以有效鉴别土茯苓正品与混伪品。结论:ITS2可以作为鉴定土茯苓及其混伪品的DNA条形码,结合二级结构信息可使基于ITS2一级结构结果得到修正和优化,为中药材土茯苓临床安全应用和质量评价提供了参考。

关键词：土茯苓二级结构 DNA条形码物种鉴定

基于红外光谱分析热处理对牛乳蛋白质二级结构的影响

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食品科学 2017年第23期38卷 82-86页

作者：孙佳悦钱方姜淑娟妥彦峰牟光庆大连工业大学食品学院辽宁大连116034 东北农业大学食品安全与营养协同创新中心黑龙江哈尔滨150030

运用傅里叶变换红外光谱技术对乳蛋白及其酰胺Ⅰ带进行解析,进一步用红外解谱法对其二级结构进行表征。以原料乳为对照,研究65℃/30 min(低温长时巴氏杀菌)、80℃/15 s(高温短时巴氏杀菌)、95℃/5 min(酸乳热处理)、137℃/5 s(超高温灭... 详细信息

运用傅里叶变换红外光谱技术对乳蛋白及其酰胺Ⅰ带进行解析,进一步用红外解谱法对其二级结构进行表征。以原料乳为对照,研究65℃/30 min(低温长时巴氏杀菌)、80℃/15 s(高温短时巴氏杀菌)、95℃/5 min(酸乳热处理)、137℃/5 s(超高温灭菌)等不同热处理条件对乳中蛋白质二级结构的影响。结果表明,热处理会导致乳蛋白间发生相互作用,乳蛋白原空间结构受到破坏,导致分子内氢键被破坏。不同热处理程度的乳蛋白酰胺Ⅰ带均向低波数方向发生了不同程度的红移,表明乳蛋白变性过程中疏水氨基酸残基暴露形成分子间氢键。同时热处理后乳蛋白各二级结构比例发生明显改变。α-螺旋含量显著降低(P结构向无规卷曲结构转化,蛋白质热变性后会发生热聚集现象,且β-折叠、β-转角结构在热聚集体的形成过程中具有重要作用。

关键词：傅里叶变换红外光谱热处理乳蛋白热聚集二级结构

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RNA二级结构预测系统构建

生物化学与生物物理进展 1996年第5期23卷 449-453页

作者：李伍举吴加金军事医学科学院基础医学研究所

运用下列ＲＮＡ二级结构预测算法：碱基最大配对方法、Ｚｕｋｅｒ极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的ＲＮＡ二级结构绘图技术，构建了ＲＮＡ二级结构预测系统Ｒｎａｆｏｌｄ．另外... 详细信息

运用下列ＲＮＡ二级结构预测算法：碱基最大配对方法、Ｚｕｋｅｒ极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的ＲＮＡ二级结构绘图技术，构建了ＲＮＡ二级结构预测系统Ｒｎａｆｏｌｄ．另外，通过随机选取２０个ｔＲＮＡ序列，从自由能和三叶草结构两个方面比较了前４种二级结构预测算法，并运用ｔ检验方法分析了自由能的统计学差别．从三叶草结构来看，以随机堆积方法最好，其次是螺旋区最优堆积方法和Ｚｕｋｅｒ算法，以碱基最大配对方法最差．最后，分析了两种极小化自由能方法之间的差别．

关键词： RNA 二级结构预测

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不同筋力小麦面筋聚集特性及结构特性分析

食品研究与开发 2024年第2期45卷 72-79页

作者：邢金金张霞母梦羽田郁彭瑞芳冷昱彤王琦梁赢王金水河南工业大学生物工程学院河南郑州450001

通过分析面团质构特性、面筋蛋白聚集特性、面筋蛋白含量、分子量分布、二级结构以及微观结构,研究“郑麦103”、“郑麦136”、“新麦26”3种不同筋力小麦面筋蛋白聚集特性及结构特性并探讨其差异。结果表明:随着小麦筋力的增强,面团的... 详细信息

通过分析面团质构特性、面筋蛋白聚集特性、面筋蛋白含量、分子量分布、二级结构以及微观结构,研究“郑麦103”、“郑麦136”、“新麦26”3种不同筋力小麦面筋蛋白聚集特性及结构特性并探讨其差异。结果表明:随着小麦筋力的增强,面团的硬度、弹性、内聚性、胶着性、咀嚼性和回复性升高,黏性降低。相比于“郑麦103”和“郑麦136”,“新麦26”的峰值形成时间较长、峰值扭矩较大且面筋蛋白聚集能较高,面筋蛋白含量更高。随着小麦筋力的增强,面筋蛋白各亚基含量及种类增多。与“郑麦103”和“郑麦136”相比,“新麦26”面筋蛋白的二级结构中β-折叠和β-转角含量增多,α-螺旋含量降低,无规则卷曲含量先减少再增加。小麦筋力越强,面筋蛋白网络结构连续性越好,包裹淀粉能力越强。综上所述,相比于“郑麦103”和“郑麦136”,“新麦26”面筋蛋白含量较高,面筋蛋白亚基种类较多,可促进面筋蛋白的聚集,面筋蛋白中增多的β-折叠结构促进面筋蛋白结构的稳定性,面筋网络结构的连续性增强,进而提高面团的强度和弹性。

关键词：面筋蛋白质构特性聚集特性二级结构微观结构

布氏锥虫自噬蛋白ATG12的表达、纯化及二级结构预测

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生物技术 2022年第2期32卷 146-152页

作者：王瑞崔冲郑伟涂晓明河南科技大学基础医学院河南洛阳471023 洛阳船舶材料研究所双瑞特装有限公司河南洛阳471000 中国科学技术大学合肥微尺度实验室安徽合肥230026

[目的]表达纯化布氏锥虫自噬蛋白TbATG12,并对其二级结构进行预测。[方法]克隆TbATG12编码序列,采用酶切连接方法构建表达载体TbATG12(pET-28a),转化进入BL21(DE3)表达菌株诱导蛋白表达,利用Ni^(2+)-NAT亲和层析及分子筛层析方法纯化蛋... 详细信息

[目的]表达纯化布氏锥虫自噬蛋白TbATG12,并对其二级结构进行预测。[方法]克隆TbATG12编码序列,采用酶切连接方法构建表达载体TbATG12(pET-28a),转化进入BL21(DE3)表达菌株诱导蛋白表达,利用Ni^(2+)-NAT亲和层析及分子筛层析方法纯化蛋白。采用核磁手段,采集一维和二维谱图,利用JPred 4预测其二级结构。[结果]16℃、0.5 mmol/L IPTG诱导20 h,TbATG12以可溶蛋白形式存在。纯化后蛋白纯度可达95%。TbATG12谱峰分布均匀,强度较强,二级结构预测其含有3个α-螺旋和5个β-折叠,为后续解析TbATG12溶液结构提供指导。[结论]克隆、表达纯化得到纯度>95%可溶TbATG12蛋白,二级结构预测和比对发现其结构在进化上很保守。

关键词：布氏锥虫 TbATG12 自噬蛋白表达纯化二级结构保守结构

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椰子蛋白化学结构和热稳定性研究

食品安全质量检测学报 2024年第1期15卷 296-302页

作者：肖容雍李铭盛政张海华高峰三亚航空旅游职业学院三亚572000 三亚中瑞酒店管理职业学院三亚572000 浙江农林大学食品与健康学院杭州311300 松阳县绿丰农业开发有限公司丽水323000

目的研究椰子全粉中蛋白质的结构和热稳定性,为深度开发椰子蛋白资源提供理论基础。方法采用碱提酸沉法提取椰子全粉中蛋白质,酸水解法结合氨基酸自动分析仪测定氨基酸组成,利用傅里叶变换红外光谱法分析蛋白二级结构,热重分析仪分析蛋... 详细信息

目的研究椰子全粉中蛋白质的结构和热稳定性,为深度开发椰子蛋白资源提供理论基础。方法采用碱提酸沉法提取椰子全粉中蛋白质,酸水解法结合氨基酸自动分析仪测定氨基酸组成,利用傅里叶变换红外光谱法分析蛋白二级结构,热重分析仪分析蛋白热降解曲线,纳米粒度分析仪研究溶液中蛋白颗粒的Zeta电位和粒径大小。结果椰子蛋白含有18种氨基酸,富含精氨酸和谷氨酸,8种必需氨基酸含量丰富、比例合理,是营养良好的蛋白质来源。椰子蛋白的二级结构以稳定态的β-折叠为主,含量达44.18%,椰子蛋白降解起始温度273.12℃,峰值温度332.91℃,至最终实验设定温度790℃时仍有25.9%残余未热降解完全,60℃时椰子蛋白溶液Zeta电位和粒径与25℃无显著变化。结论椰子蛋白具有良好的营养价值和热稳定性,可为椰子蛋白资源的深度开发和广泛利用提供理论参考。

关键词：椰子蛋白氨基酸二级结构热重分析粒径