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FT-IR分析超高压处理对调配草莓汁蛋白二级结构的影响

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中国食品学报 2014年第11期14卷 200-206页

作者：张波波王丹马越张超霍乃蕊赵晓燕北京市农林科学院蔬菜研究中心农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室农业部都市农业(北方)重点实验室北京100097 山西农业大学食品科学与工程学院山西太谷080301

运用傅里叶变换红外光谱(FT-IR)研究不同超高压处理调配草莓汁蛋白结构的变化。以调配草莓汁为对照,对草莓汁红外光谱酰胺Ⅰ带拟合,分析不同压力、协同温度(≤60℃)、处理时间及处理次数对草莓汁蛋白二级结构的影响。结果表明,不同处理... 详细信息

运用傅里叶变换红外光谱(FT-IR)研究不同超高压处理调配草莓汁蛋白结构的变化。以调配草莓汁为对照,对草莓汁红外光谱酰胺Ⅰ带拟合,分析不同压力、协同温度(≤60℃)、处理时间及处理次数对草莓汁蛋白二级结构的影响。结果表明,不同处理都有使α-螺旋、β-转角向自由卷曲转化的趋势,β-折叠基本无变化。通过提高超高压压力,延长处理时间,升高超高压协同温度,增加间歇性处理次数,草莓汁蛋白结构变化增强。其中提高处理压力对蛋白二级结构影响最显著。

关键词：超高压草莓汁傅里叶变换红外二级结构

基于开环聚合的聚氨基酸材料的二级结构效应及调控

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科学通报 2021年第18期66卷 2217-2230页

作者：葛成龙刘勇殷黎晨苏州大学功能纳米与软物质研究院江苏省碳基功能材料与器件重点实验室苏州纳米科技协同创新中心苏州215123

聚氨基酸是一类蛋白模拟物,近年来在诸多领域都有着广泛的应用.同天然的蛋白质一样,聚氨基酸的主链氢键作用也赋予其丰富的二级结构,而二级结构的调控对材料的功能以及组装等都有着十分重要的意义.本文结合聚氨基酸近几年的最新研究进展... 详细信息

聚氨基酸是一类蛋白模拟物,近年来在诸多领域都有着广泛的应用.同天然的蛋白质一样,聚氨基酸的主链氢键作用也赋予其丰富的二级结构,而二级结构的调控对材料的功能以及组装等都有着十分重要的意义.本文结合聚氨基酸近几年的最新研究进展,分析了聚氨基酸二级结构的形成机制以及侧基功能化对二级结构的影响,总结了二级结构的影响因素,在此基础上,详细阐述了二级结构的调控方法,并探讨了二级结构的形成对穿膜、基因递送、抗菌性能、自组装行为以及蛋白修饰的影响.

关键词：聚氨基酸二级结构穿膜基因递送抗菌自组装蛋白修饰

过氧自由基氧化对花生球蛋白结构及聚集行为的影响

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食品研究与开发 2024年第7期45卷 49-54,65页

作者：汪海燕李玟君李玉蝶宋青云庞子皓肖一郎汪超李玮湖北工业大学生物工程与食品学院湖北武汉430000

采用不同浓度的2,2′⁃盐酸脒基丙烷[2,2′⁃azobis(2⁃amidinopropane),AAPH]有氧热分解产生的过氧自由基氧化花生球蛋白,研究AAPH氧化对花生球蛋白分子结构及聚集行为的影响。结果显示:随着AAPH浓度的增加,花生球蛋白表示浊度的吸光度由0... 详细信息

采用不同浓度的2,2′⁃盐酸脒基丙烷[2,2′⁃azobis(2⁃amidinopropane),AAPH]有氧热分解产生的过氧自由基氧化花生球蛋白,研究AAPH氧化对花生球蛋白分子结构及聚集行为的影响。结果显示:随着AAPH浓度的增加,花生球蛋白表示浊度的吸光度由0.20±0.01增加至0.44±0.01,平均粒径从(153.94±3.31)nm增加到(196.80±3.06)nm,而游离巯基含量从(14.62±0.08)μmol/g下降到(7.77±0.25)μmol/g,Zeta电位绝对值从(24.17±0.06)mV下降到(15.93±0.05)mV。对荧光最大发射波长的研究表明,在AAPH浓度为0~1 mmol/L时,内源荧光最大荧光峰位红移,在AAPH浓度为5~15 mmol/L时,内源荧光最大荧光峰位蓝移。过氧自由基氧化导致花生球蛋白α⁃螺旋结构含量下降,β⁃折叠和无规则卷曲含量上升,呈现出α⁃螺旋向β⁃折叠和无规则卷曲转化的趋势。扫描电镜观察结果显示,花生球蛋白经过氧自由基氧化后,蛋白由聚集紧实逐渐变得发散,浓度从10 mmol/L升高到15 mmol/L时,花生球蛋白表面形态变疏松,孔隙显著增大。因此,AAPH适度氧化可以通过改变花生球蛋白的结构影响其聚集行为,特别是浓度为5~10 mmol/L时有利于花生球蛋白的聚集。

关键词：花生球蛋白过氧自由基氧化二级结构红外光谱聚集行为

聚L-丙氨酸-聚乙二醇嵌段共聚物溶液的二级结构

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高分子材料科学与工程 2006年第3期22卷 159-161,166页

作者：张国林马建标王亦农辽宁大学化学科学与工程学院沈阳110036 南开大学吸附分离功能高分子材料国家重点实验室天津300071

分别以氨基聚乙二醇(PEG-NH2)和氨基聚乙二醇单甲醚(M PEG-NH2)为大分子引发剂,制备了三嵌段(ABA)和两嵌段(AB)的聚L-丙氨酸-聚乙二醇嵌段共聚物;利用圆二色光谱(CD)研究了共聚物在溶液中的二级结构及其影响因素。结果表明,在水溶液中... 详细信息

分别以氨基聚乙二醇(PEG-NH2)和氨基聚乙二醇单甲醚(M PEG-NH2)为大分子引发剂,制备了三嵌段(ABA)和两嵌段(AB)的聚L-丙氨酸-聚乙二醇嵌段共聚物;利用圆二色光谱(CD)研究了共聚物在溶液中的二级结构及其影响因素。结果表明,在水溶液中嵌段共聚物主链主要以α-螺旋构象存在;在一定范围内,α-螺旋含量随共聚物溶液浓度的增大而增大,随溶液离子强度的增大而降低;相同条件下,AB型共聚物在溶液中的α-螺旋含量比ABA型共聚物高。

关键词：聚氨基酸嵌段共聚物二级结构 α-螺旋

体外模拟消化对大豆蛋白组成及二级结构的影响

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中国食品学报 2018年第11期18卷 44-49页

作者：齐宝坤赵城彬檀政朱建宇孙禹凡钟明明江连洲李杨东北农业大学食品学院哈尔滨150030 吉林农业大学食品科学与工程学院长春130118

采用胃蛋白酶在37℃和pH 1.2条件下对大豆分离蛋白(SPI)进行体外模拟消化,探究体外模拟消化对SPI组成及二级结构的影响。随着消化时间的延长,蛋白质的消化程度逐渐增大,当消化反应超过2 h后,蛋白质的消化速率减慢。在整个消化过程中,SP... 详细信息

采用胃蛋白酶在37℃和pH 1.2条件下对大豆分离蛋白(SPI)进行体外模拟消化,探究体外模拟消化对SPI组成及二级结构的影响。随着消化时间的延长,蛋白质的消化程度逐渐增大,当消化反应超过2 h后,蛋白质的消化速率减慢。在整个消化过程中,SPI的不同亚基受胃蛋白酶的消化或降解行为的影响存在明显的差异。7S比11S更难被胃蛋白酶消化降解,11S蛋白中B亚基较A亚基更难且更慢被消化,这与亚基的空间结构紧密度及疏水基团的暴露有关。红外光谱中酰胺I带处具有强吸收峰,对酰胺I带的拟合分析表明,经胃蛋白酶的消化后,SPI的二级结构发生显著改变。总体上看,随着消化时间的延长,α-螺旋含量增加,β-折叠和β-转角含量下降,而无规卷曲含量先增加后降低,且有部分平行式β-折叠结构向反平行式β-折叠结构转变。

关键词：体外模拟消化大豆蛋白蛋白组成二级结构

基于离散Hopfield网络求解极大独立集的茎区选择算法以及在RNA二级结构预测中的应用

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计算机学报 2008年第1期31卷 51-58页

作者：刘琦张引叶修梓俞荣栋浙江大学沃森基因组科学研究院杭州310008 浙江大学计算机科学与技术学院杭州310027

提出了一种利用离散Hopfield网络求解图论极大独立集的启发式算法,并将其应用于RNA二级结构的茎区选择和预测当中.算法通过映射RNA序列的茎区为无向图中的节点,将预测RNA二级结构的问题转化为求解图的极大独立集的问题.定义了合理的能... 详细信息

提出了一种利用离散Hopfield网络求解图论极大独立集的启发式算法,并将其应用于RNA二级结构的茎区选择和预测当中.算法通过映射RNA序列的茎区为无向图中的节点,将预测RNA二级结构的问题转化为求解图的极大独立集的问题.定义了合理的能量变化函数,利用离散Hopfield网络进行迭代,以获得能量最优的预测结构.文中将算法与传统的最大匹配数算法以及最小自由能算法在运行时间上进行比较,并且选择特定的序列在茎区和碱基对水平上进行精度测试,结果证明该算法在效率和精度上具有一定的优势.算法的时间复杂性为max{O(n2),O(N2)},空间复杂度为O(N2),其中n为RNA序列长度,N为RNA的茎区段个数.

关键词： RNA 二级结构极大独立集离散Hopfield神经网络茎区

二级结构模拟预测HBV脱氧核酶有效作用靶点

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中国药科大学学报 2007年第1期38卷 84-86页

作者：吕静竹钱中清安徽理工大学医学院淮南232001

目的:通过二级结构模拟预测作用靶点,观察HBV特异性脱氧核酶的体外切割活性,探讨其用于抗病毒制剂的可能性。方法:以HBVX基因mRNA序列为靶设计脱氧核酶DRz-X29,对其特异的切割活性进行体外实验。结果:特定反应条件下,DRz-X29成功对二级... 详细信息

目的:通过二级结构模拟预测作用靶点,观察HBV特异性脱氧核酶的体外切割活性,探讨其用于抗病毒制剂的可能性。方法:以HBVX基因mRNA序列为靶设计脱氧核酶DRz-X29,对其特异的切割活性进行体外实验。结果:特定反应条件下,DRz-X29成功对二级结构模拟预测的底物靶点进行了特异切割。结论:底物二级结构模拟能够有效预测HBV脱氧核酶作用靶点,为其发展成一种新型抗病毒制剂奠定了实验基础。

关键词：乙型肝炎病毒 X基因脱氧核酶二级结构

分子动力学研究MeV质子辐照对生物分子二级结构的影响

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核技术 2005年第4期28卷 292-296页

作者：林树薛建明赖江南魏雄辉颜莎王宇刚北京大学教育部重离子物理重点实验室北京100871 北京大学化学与分子工程学院应用化学系北京100871

利用分子动力学方法对MeV质子辐照多肽分子所引起的分子空间结构变化进行了研究,对比了不同质子能损和模拟条件下分子构象变化的差异。结果表明,在质子轰击下,分子的二级结构在其得到3—5eV能量后出现明显的变化,从α螺旋结构向β折叠... 详细信息

利用分子动力学方法对MeV质子辐照多肽分子所引起的分子空间结构变化进行了研究,对比了不同质子能损和模拟条件下分子构象变化的差异。结果表明,在质子轰击下,分子的二级结构在其得到3—5eV能量后出现明显的变化,从α螺旋结构向β折叠逐渐转变,并且这种变化与质子能量的沉积方式有关。与温度效应的对照显示,质子辐照引起的变化与温度所引起的变化有明显的差异:质子辐照产生的分子构象更丰富多样,而温度所引起的变化则比较单一。

关键词：辐照多肽分子二级结构分子动力学

人巨细胞病毒融合蛋白pp150/MDBP二级结构及其抗原表位预测

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生物医学工程学杂志 2007年第5期24卷 1123-1127页

作者：郭大东高雪芹韩金祥国家卫生部生物技术药物重点实验室山东省医药生物技术研究中心济南250062

用Garnier-Robson和Chou-Fasman方案预测人巨细胞病毒融合蛋白pp150/MDBP的α-螺旋、β-折叠及转角的二级结构,用Kyte-Doolittle及Hopp-Woods亲水性方案预测其B细胞表位。研究结果表明,pp150/MDBP融合蛋白可能含有较少的α-螺旋,但可能... 详细信息

用Garnier-Robson和Chou-Fasman方案预测人巨细胞病毒融合蛋白pp150/MDBP的α-螺旋、β-折叠及转角的二级结构,用Kyte-Doolittle及Hopp-Woods亲水性方案预测其B细胞表位。研究结果表明,pp150/MDBP融合蛋白可能含有较少的α-螺旋,但可能含有较多的β-折叠及转角;B细胞识别的表位可能在7-56氨基酸残基或附近以及137-192残基或附近。

关键词：人巨细胞病毒融合蛋白二级结构表位预测