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领域本体驱动的乳腺超声检查报告结构化研究与实现

领域本体驱动的乳腺超声检查报告结构化研究与实现

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作者：刘淑君东华大学

学位级别：硕士

乳腺超声检查因其高准确率、低检查费用、可多切面观察等特点,已经成为诊断乳腺疾病的重要方式。乳腺超声检查报告记录着患者的影像表现、医生对患者的临床诊断和诊断意见等内容,蕴含着丰富的乳腺医学知识,具有极高的研究价值。医生为... 详细信息

乳腺超声检查因其高准确率、低检查费用、可多切面观察等特点,已经成为诊断乳腺疾病的重要方式。乳腺超声检查报告记录着患者的影像表现、医生对患者的临床诊断和诊断意见等内容,蕴含着丰富的乳腺医学知识,具有极高的研究价值。医生为了更加准确的描述患者病情,通常以自然语言的形式描述影像表现和诊断意见,但是这种非结构化文本具有叙述性、无结构、数据描述不统一的特点,不利于计算机自动分析和挖掘数据,在一定程度上阻碍了医疗大数据的发展。因此,有必要对乳腺超声检查报告进行结构化处理,使其为更大规模的医疗数据研究服务。为解决上述问题,本文在传统结构化技术基础上,结合乳腺超声检查报告的文本特点,提出了一种领域本体驱动的乳腺超声检查报告结构化方法。该方法首先构建乳腺超声领域本体,然后基于领域本体实现了乳腺超声检查报告的结构化处理。本文所做的研究如下:1)构建了乳腺超声领域本体。本文采用自动构建本体的思想,结合病理学和解剖学的先验知识,获取乳腺超声领域本体的基础框架;然后对乳腺超声文本做数据预处理,包括中文分词、同义词替换和文本切分,并以切分后的描述块为处理单位,采用命名实体识别和实体关系抽取算法,获取实体关系三元组;最后向乳腺超声领域本体的基础框架添加内容,构建完成乳腺超声领域本体。2)提出了一种领域本体驱动的乳腺超声检查报告结构化方法。该方法首先对乳腺超声文本做数据预处理,得到文本切分后的多个描述块和对应的领域本体分支子树,以领域本体的叶子节点和路径为研究出发点,根据算法扫描器中的获取分支子树路径算法和生成语义子树算法,在领域本体中进行节点信息匹配,得到与乳腺超声报告对应的乳腺超声语义子树。最后将XML表示的乳腺超声语义子树转化为以关系型表结构存储的乳腺超声结构化数据。3)实现了超声报告结构化移动端系统。用户可以以拍照或输入文字的方式,上传乳腺超声检查报告,即可得到乳腺超声报告的结构化结果,方便患者用户了解自身病情,为患者提供更高效、更便捷的医疗服务。本文采用某三甲医院的乳腺超声检查报告作为实验数据集,通过实验验证本文所提出方法的有效性和可行性。实验表明,该方法能够达到预期目标,为后续的研究打下了基础。

关键词：乳腺超声检查报告文本结构化处理实体关系抽取领域本体本体构建

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