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生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌中的作用及临床验证

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临床肿瘤学杂志 2023年第6期28卷 488-494页

作者：黄亮高东周丹丹陈方红凉山彝族自治州第一人民医院肿瘤科四川西昌615000

目的生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术... 详细信息

目的生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术的BC患者(BC组),获取BC组织和对应的癌旁正常组织。另纳入同期150例体检健康女性作为对照组,获取其血清样本,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测组织及血清miR-16-5p表达。所有BC患者至少随访3年。结果共鉴定出195个差异表达基因(DEG),根据logFC≥1.5或logFC≤-1.5阈值,miR-16-5p表达显著下调,其受试者工作特征(ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线分析显示,miR-16-5p区分BC组织及正常乳腺组织的曲线下面积(AUC)为0.73(95%CI:0.68~0.79),且miR-16-5p低表达的患者预后较差(P=0.013),因此miR-16-5p可作为候选miRNA。在临床验证集中,BC组织miR-16-5p相对表达量明显低于癌旁正常组织[0.46(0.29,0.66)vs. 0.82(0.56,1.08),P<0.001]。且BC患者血清miR-16-5p相对表达量也显著低于对照组[0.34(0.15,0.50)vs. 0.99(0.70,1.20),P<0.001]。ROC曲线显示,当血清miR-16-5p相对表达量≤0.520时可良好地诊断BC患者,AUC值为0.897(95%CI:0.863~0.932)。BC患者血清样本和BC组织样本中miR-16-5p相对表达量呈正相关(rs=0.373,P<0.001)。血清miR-16-5p表达与T分期、N分期、TNM分期有关(P<0.05)。血清miR-16-5p低表达组是影响BC患者患者3年内发生局部复发/远处转移及死亡的独立预测生物标志物(P<0.05)。结论血清miR-16-5p表达对BC有诊断效能,低血清miR-16-5p表达预示着BC患者更差的疾病进展情况和3年内预后不良。

关键词：乳腺癌 GEO 癌症基因组图谱 miR-16-5p 临床验证

吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征诊断"南京标准"的初步临床验证

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中华消化杂志 2019年第2期39卷 119-123页

作者：刘璐张玮张明张峰肖江强王轶黄淑玲彭春艳张斌殷芹邹晓平诸葛宇征南京大学医学院附属鼓楼医院消化科 210008

吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征临床表现缺乏特异性,常被误诊而影响疾病的及时诊断和治疗。2017年《吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征诊断和治疗专家共识意见(2017,南京)》首次提出了该病诊断的"南京标准"。本研究通过回顾性分析南京大学医... 详细信息

吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征临床表现缺乏特异性,常被误诊而影响疾病的及时诊断和治疗。2017年《吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征诊断和治疗专家共识意见(2017,南京)》首次提出了该病诊断的"南京标准"。本研究通过回顾性分析南京大学医学院附属鼓楼医院消化科近年来收治的吡咯生物碱相关肝窦阻塞综合征及其他类似疾病患者资料,发现"南京标准"对该病具有较好的诊断效能。

关键词：综合征生物碱南京诊断阻塞肝窦临床验证标准

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基于HupB的细胞特异性IL-6及肺结核新标识分子临床验证

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基于HupB的细胞特异性IL-6及肺结核新标识分子临床验证

作者：周放武汉轻工大学

学位级别：硕士

目的:通过结核分枝杆菌HupB(Rv2986c)诱导人外周血单个核细胞(PBMC)后差异表达的细胞因子,评估HupB在肺结核临床诊断中的应用价值,为肺结核诊断提供新思路。方法:(1)HupB蛋白的表达纯化及鉴定:基于结核分枝杆菌H37Rv中Rv2986的基因序列... 详细信息

目的:通过结核分枝杆菌HupB(Rv2986c)诱导人外周血单个核细胞(PBMC)后差异表达的细胞因子,评估HupB在肺结核临床诊断中的应用价值,为肺结核诊断提供新思路。方法:(1)HupB蛋白的表达纯化及鉴定:基于结核分枝杆菌H37Rv中Rv2986的基因序列,构建p GEX-6p-1-Rv2986c重组质粒;转化重组质粒到大肠杆菌DH5α并在BL21(DE3)诱导表达,SDS-PAGE分析HupB蛋白在大肠杆菌中的表达情况;GST柱纯化重组蛋白HupB,SDS-PAGE测定蛋白分子量;Triton X-114液相分离去除内毒素,BCA法检测蛋白浓度。(2)HupB诱导巨噬细胞IL-6释放:分别用BCG和mc155感染的THP-1源巨噬细胞,ELISA法检测HupB诱导前后IL-6的释放情况。(3)HupB蛋白特异性IL-6释放:在武汉市金银潭医院选取64例结核患者,4例健康临床血样,分离PBMC,检测血浆、诱导前和不同抗原结核分枝杆菌Htd Y、北京型结核分枝杆菌临床分离株和卡介苗LAM(脂阿拉伯甘露聚糖)、E6C10、肺炎克雷伯菌全蛋白诱导后IL-6的释放情况。(4)扩大临床样本验证HupB在结核病诊断中的应用价值:在武汉市金银潭医院、武汉长江航运总医院、校医院、襄阳结核防治院、襄阳中心医院分别收集结核病患者、非结核肺部疾病患者以及健康志愿者的样本780例,入组496例其中结核190例,非结核肺部疾病33例,健康273例。分离PBMC,与HupB共培养,24h后收集细胞上清,检测上清中IL-6的释放量,分析IL-6释放量的cut-off值,评估HupB作为临床诊断标志物的应用价值。(5)两种抗原诊断在菌阳、菌阴肺结核诊断中的对比验证:选取101例样本,其中,菌阳肺结核28例、菌阴肺结核25例、健康志愿者36例,预防性服药12例,分别用HupB和E6C10分别诱导入组样本的PBMC,检测HupB诱导后IL-6的释放量和E6C10诱导后IFN-γ释放量,对比两种抗原诊断肺结核的效果,并分析联合诊断的效果。结果:(1)成功构建p GEX-6p-1-Rv2986c重组质粒,纯化重组蛋白HupB,SDS-PAGE显示重组蛋白的分子量约为51k Da,与理论值相符;内毒素含量低于0.25EU/ml,可用于后续实验。(2)ELISA结果显示,M(?)组IL-6释放量为:16.74±1.491pg/ml,M(?)+HupB组IL-6释放量为:84.07±5.644pg/ml,M(?)+BCG组IL-6释放量为:82.56±7.131pg/ml,M(?)+mc155组IL-6释放量为:83.16±6.746pg/ml,与M(?)组相比,实验组显著释放IL-6(p临床样本临床验证结果显示:PBMC受到抗原HupB诱导后,肺结核组IL-6释放量为:490.5±487.5pg/ml、非结核肺部疾病组为:75.53±85.72 pg/ml,健康志愿者为:45.25±42.58 pg/ml。以肺结核患者为实验组,非结核肺部疾病患者与健康人为对照组,ROC曲线分析,AUC=0.8826,计算cut-off值,最终发现HupB抗原对作为肺结核诊断标志物时的特异性78.9%,敏感性90.15%。(5)两种抗原在菌阳、菌阴肺结核对比验证:菌阳肺结核对比验证中HupB的特异性为85.71%,敏感性为94.44%、E6C10的特异性为82.14%,敏感性为91.67%;菌阴肺结核对比验证中HupB特异性为80.00%,敏感性为77.78%、E6C10的特异性为9%,敏感性为77.22%。联合诊断菌阳肺结核的特异性为89.28%,敏感性为100%;联合诊断菌阴肺结核的特异性为96%,敏感性为80.56%。结论:(1)结核分枝杆菌HupB可以诱导THP-1源巨噬细胞释放IL-6。(2)结核分枝杆菌Htd Y、结核分枝杆菌和卡介苗LAM(脂阿拉伯甘露聚糖)、结核分枝杆菌E6C10及肺炎克雷伯菌全蛋白等其它抗原诱导释放IL-6,无显著差异。结核分枝杆菌HupB能够特异性诱导结核患者的PBMC释

关键词：结核分枝杆菌 HupB 标志分子 IL-6 临床验证

基于MATLAB的微创骨科穿刺规划平台构建与临床验证

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中国数字医学 2023年第2期18卷 86-92页

作者：季达峰张长青张愈峰南通大学医学院数字医学中心江苏南通226001 河北医科大学南通大学附属医院分院骨科

目的:探讨MATLAB的影像微创骨科穿刺规划平台建立所需技术及临床应用指标。方法:利用MATLAB建立图像导入、三维重建与定位平台。选取重度椎间盘脱出患者40例,随机分为试验组与对照组各20例。试验组所得CT数据导入三维骨科微创定向系统(3... 详细信息

目的:探讨MATLAB的影像微创骨科穿刺规划平台建立所需技术及临床应用指标。方法:利用MATLAB建立图像导入、三维重建与定位平台。选取重度椎间盘脱出患者40例,随机分为试验组与对照组各20例。试验组所得CT数据导入三维骨科微创定向系统(3DDisplay2.0)中进行三维重建,利用平台进行穿刺点定位、角度与穿刺深度测量;对照组CT数据打印成醋酸酯胶片,在术中进行定位、角度与深度测量。利用C臂机进行术中透视确认穿刺效果,记录穿刺耗时与术中并发症并做统计学处理。结果:建立起图像导入,三维显示与断层定位3个主要模块;试验组与对照组穿刺时程卡方值为14.546>10.828(P=0.001),透视次数卡方值为28.972>10.828(P=0.001);穿刺时程与透视次数的t值分别为6.022>4.144(P=0.001),10.314>4.144(P=0.001);试验组术中出现酸胀与疼痛为2例(10%),低于对照组的15例(75%)。结论:以MATLAB为基础的模块设计可有效对CT术前影像进行重构、定位与三维重建;病灶、棘突与穿刺点的三角关系可对穿刺方向进行有效修正;基于三维可视与夹角修正的骨科微创引导平台在椎间孔镜穿刺中可显著降低穿刺时程,减少透视次数与术中并发症。

关键词：医学影像骨科微创穿刺穿刺技术指标计算机辅助手术临床验证

直径≤5cm的临床早中期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移数学预测模型的建立及临床对比验证分析

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直径≤5cm的临床早中期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移数学预测模型...

作者：范懿魏扬州大学

学位级别：硕士

目的:随着影像学技术的进步和健康体检的普及,早期肺癌的检出率越来越高。非小细胞肺癌(NSCLC)的术前分期,尤其是纵隔淋巴结分期是决定能否手术并判断患者预后的关键。研究直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者发生纵隔淋巴结转移的独立危... 详细信息

目的:随着影像学技术的进步和健康体检的普及,早期肺癌的检出率越来越高。非小细胞肺癌(NSCLC)的术前分期,尤其是纵隔淋巴结分期是决定能否手术并判断患者预后的关键。研究直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者发生纵隔淋巴结转移的独立危险因素,构建一种判断纵隔淋巴结转移的数学预测模型,为术前预测直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者纵隔淋巴结转移提供数据支持,以期提高术前纵隔淋巴结分期的准确性,协助临床医师做出合理的诊疗决策。方法:回顾性分析2012年1月至2017年8月扬州大学临床医学院(江苏省苏北人民医院)胸外科收治的符合入组标准的NSCLC患者608例。将入组的病例以3:1的比例随机分为两组,前者为建模组(A组),用于建立模型;后者为验证组(B组),用于进行模型的外部验证及与其他模型的比较。总结A组456例患者相关临床病史资料、影像学资料及病理情况,通过单因素和多因素分析遴选出与直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者纵隔淋巴结转移相关的独立危险因素,并建立二元Logistic回归数学模型。通过Hosmer-Lemeshow拟合优度检验评估模型的拟合程度,通过受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)评估预测模型的准确性,并确定最佳截点值。应用B组152例患者资料,通过卡方检验判断纵隔淋巴结转移实际与预测的一致程度,并用Kappa值评价其一致率。将B组资料代入各模型,比较各数学预测模型的预测能力,判断本研究模型的临床应用价值。结果:多因素分析结果显示,患者年龄、肿瘤直径、肿瘤部位、病理类型以及胸膜牵拉征5项因素是判断直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者纵隔淋巴结转移的独立危险因素。通过对A组资料的相关分析,建立的数学预测模型为P=ex/(l+ex),其中x=-2.831+(0.825X肿瘤直径)+(1.53X肿瘤部位)+(0.779X胸膜牵拉征)+(1.883X病理类型)-(0.06X年龄),其中e为自然对数。Hosmer-Lemeshow拟合优度检验显示,预测值和观察值间差异无统计学意义,ROC曲线下面积为0.763(95%C.0.697～0.829)。外部验证结果显示,应用本模型预测直径≤5 cm的临床早中期NSCLC患者纵隔淋巴结转移的一致性良好,灵敏度为68.75%,特异度为92.65%。与VA模型及Fudan模型相比,本研究模型的适用范围更广,准确率更高。结论:1.患者年龄、肿瘤大小、肿瘤部位、病理类型以及胸膜牵拉征这5项因素是判断直径≤5cm的临床早中期NSCLC纵隔淋巴结转移的独立危险因素。2.本研究建立的直径≤5cm的临床早中期NSCLC纵隔淋巴结转移数学预测模型为:P=ex/(l+ex),x=-2.831+(0.825 × 肿瘤直径)+(1.53 × 肿瘤部位)+(0.779 × 胸膜牵拉征)+(1.883×病理类型)-(0.06×年龄),其中e为自然对数。3.本研究所建立的数学模型对直径≤5 cm的临床早中期NSCLC纵隔淋巴结转移判断具有较高的灵敏度和特异度,其预测能力和准确性均高于其他同类模型。4.结合本研究预测模型,对于纵隔淋巴结转移高风险患者,建议行进一步检查以明确纵隔淋巴结有无转移。

关键词：非小细胞肺癌淋巴结转移预测模型临床验证

中重型颅脑损伤中西医结合诊疗方案临床验证疗效分析

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时珍国医国药 2016年第3期27卷 637-640页

作者：刘启华凌江红黄李平黄熙范学政李凯谢天一广西医科大学第一附属医院广西南宁530021 中南大学湘雅医院湖南长沙410008 广西中医药大学附属瑞康医院广西南宁530011

目的根据国家中医药管理局"十一五"重点专科(专病)工作计划和要求,对中西医结合颅脑损伤诊疗方案进行验证,确定其临床疗效和安全性,为进一步优化诊疗方案奠定基础。方法采用非随机、多中心、治疗前后自身对照法,中、重型颅脑损伤患者,... 详细信息

目的根据国家中医药管理局"十一五"重点专科(专病)工作计划和要求,对中西医结合颅脑损伤诊疗方案进行验证,确定其临床疗效和安全性,为进一步优化诊疗方案奠定基础。方法采用非随机、多中心、治疗前后自身对照法,中、重型颅脑损伤患者,接受西医常规治疗,并按诊疗方案进行中医综合治疗。以3周为1个疗程,治疗并观察4个疗程,观察其治疗前后Glasgow(GCS)评分、日常生活活动能力评分、神经功能缺损程度评分及安全指标等,并进行疗效分析及安全性评估。结果颅脑损伤方案能显著改善颅脑损伤患者GCS评分(中型)、神经功能缺损评分及日常生活活动能力评分,总有效率达58.1%,无安全不良事件发生。结论颅脑损伤验证方案能够有效地改善颅脑损伤患者临床症状,是一套疗效可靠、安全的中西医结合综合治疗方案,值得临床推广。

关键词：颅脑损伤中医药疗法临床验证疗效分析

“心痹证”挑区阳性指数评分量表的初步制定与临床验证

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“心痹证”挑区阳性指数评分量表的初步制定与临床验证

作者：徐赛山东中医药大学

学位级别：硕士

目的:完成对具有中医特色的“心痹证”挑区阳性指数评分量表的初步制定、评价与临床验证,以期望该量表可作为一种指导挑络疗法的进行及评估挑络疗法的疗效评判工具广泛应用于临床。方法:1.初步制定量表:纳入符合“心痹证”（冠心病兼有... 详细信息

目的:完成对具有中医特色的“心痹证”挑区阳性指数评分量表的初步制定、评价与临床验证,以期望该量表可作为一种指导挑络疗法的进行及评估挑络疗法的疗效评判工具广泛应用于临床。方法:1.初步制定量表:纳入符合“心痹证”（冠心病兼有颈肩腰腿疼等痹证）的患者276人,采用克朗巴赫α系数法、重测信度法、主观评价法、离散趋势法、相关系数法、因子分析法等多种方法对“心痹证”挑区阳性指数评分量表进行条目筛选,并对量表的信度、效度、反映度进行测评,最终完成《“心痹证”挑区阳性指数评分量表》的初步制定。2.临床验证:纳入“心痹证”患者41例。患者在进行挑络疗法治疗前填写“心痹证”挑区阳性指数评分量表、心绞痛分级积分量表;患者治疗后12～24小时内和第4周,分别进行两次如下试验:填写“心痹证”挑区阳性指数评分量表、心绞痛分级积分量表、血常规、尿常规、肝功能、肾功能、凝血四项（凝血酶原时间、国际标准比率、活化部分凝血酶时间、凝血酶时间、纤维蛋白原浓度）。数据分析使用统计学软件SPSS23.0进行数据的相关处理和分析。结果:1.“心痹证”挑区阳性指数评分量表的条目筛选结果:该研究无脱落病例,最终观察病例276例。最终筛选出18个条目作为“心痹证”挑区阳性指数评分量表的内容,共分为3个公因子:患者自查、医者望诊、医者切诊。2.初步制定的“心痹证”挑区阳性指数评分量表考评结果:量表的平均答题时间为:7.47±3.59分钟,小于20分钟。量表的克朗巴赫α系数为0.711,重测信度为0.897,经KMO检验结果为0.844,Bartlett球形检验结果为2502.300,P＜0.01。且经最大方差旋转分析后,累计方差贡献率为66.605%。3.初步制定的“心痹证”挑区阳性指数评分量表临床验证时,脱落病例1例,最终观察病例40例。治疗后患者的总得分低于治疗前患者的总得分,各条目治疗后测量平均值较治疗前测量时均有不同程度降低（P＜0.01）。三次测量中初步制定的“心痹证”挑区阳性指数评分量表与心绞痛分级积分量表的相关性逐渐降低。后两次测量结果表明“心痹证”挑区阳性指数评分量表与凝血酶时间存在显著相关性（P＜0.05）,而理化检查对比结果显示:血常规、尿常规、肝功能、肾功能、凝血四项（凝血酶原时间、国际标准比率、活化部分凝血酶时间、凝血酶时间、纤维蛋白原浓度）等指标并无明显变化（P＞0.05）。结论:初步制定的“心痹证”挑区阳性指数评分量表具有较好的信度、效度、反应度,临床可操作性强,该量表对于指导挑络疗法的进行具有重要作用,并可作为挑络疗法的初步疗效评判工具广泛应用于临床,在运用挑络疗法治疗“心痹证”时对患者的肝肾及其他脏腑功能影响较小,安全性高。

关键词：挑络疗法心痹证 “心痹证”挑区阳性指数评分量表临床验证

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原发性高血压病中医诊疗方案临床验证及分析

中国全科医学 2013年第1期16卷 98-100页

作者：刘宏祥赵永辰杨光福史曼刘涓王颖王珍罗金华河北大学附属医院中西医科河北省保定市071000 河北大学附属医院心内科

目的验证国家中医药管理局"眩晕"(原发性高血压病)协作组诊疗方案的临床疗效,为进一步优化该诊疗方案奠定基础。方法 250例高血压患者按4∶1比例随机分成中药组(n=200)和西药组(n=50)。中药组患者按协作组诊疗方案进行辨证分型治疗,西... 详细信息

目的验证国家中医药管理局"眩晕"(原发性高血压病)协作组诊疗方案的临床疗效,为进一步优化该诊疗方案奠定基础。方法 250例高血压患者按4∶1比例随机分成中药组(n=200)和西药组(n=50)。中药组患者按协作组诊疗方案进行辨证分型治疗,西药组给予卡托普利治疗,疗程均为4周,试验期间不应用其他任何降压药物。观察并比较两组患者的临床疗效及其血压下降情况。结果肾虚证组总有效率为91.7%(57/62),痰浊壅盛证组总有效率为89.8%(44/49),肝阳上亢证组总有效率为95.7%(44/46),肝肾阴虚证组总有效率为85.1%(28/33),西药组总有效率为79.2%(38/48)。治疗2周后,肾虚证组、痰浊壅盛证组、肝阳上亢证组与西药组比较,舒张压、收缩压差值差异均有统计学意义(P0.05);治疗4周后,肾虚证组、痰浊壅盛证组、肝阳上亢证组、肝肾阴虚证组与西药组比较,舒张压、收缩压差值差异均有统计学意义(P临床疗效,可作为该病中医诊断、治疗的规范,具有推广意义。

关键词：高血压眩晕中医诊疗方案临床验证

血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案临床验证研究

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中国全科医学 2015年第21期18卷 2498-2501页

作者：薛斐然张昕洋牛焕敏陈宝鑫姬少珍贾蓓李涛王建伟刘玥侯小兵曹晓岚黎明全田军彪张玉莲戴中金香兰国家食品药品监督管理总局药品审评中心北京市100038 北京中医药大学北京市第一中西医结合医院北京中医药大学东方医院中国中医科学院望京医院山东中医药大学附属医院长春中医药大学附属医院河北医科大学中医院天津中医药大学第二附属医院北京大学人民医院

目的临床验证血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案(A、B卷)的应答率、鉴别度和同质性。方法于2008年2月—2014年9月采用临床流行病学横断面调查的研究方法选取山东中医药大学附属医院、北京中医药大学东方医院、天津中医药大学第二附属... 详细信息

目的临床验证血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案(A、B卷)的应答率、鉴别度和同质性。方法于2008年2月—2014年9月采用临床流行病学横断面调查的研究方法选取山东中医药大学附属医院、北京中医药大学东方医院、天津中医药大学第二附属医院、长春中医药大学附属医院、河北医科大学中医院、北京大学人民医院、北京市丰台区丰台社区卫生服务中心、蒲黄榆社区卫生服务中心、方庄社区卫生服务中心、右安门社区卫生服务中心共计10个调查点门诊、住院患者及所辖社区居民4 008例。根据血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案制定问卷,分为A、B卷进行题项筛选,采用题项分析、项目分析、同质性分析的方法。分析问卷的应答率、鉴别度和同质性。结果血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案(A、B卷)各题项通过了题项筛选。其中,A、B卷各题项遗漏率均在5.00%以内;A、B卷高分组与低分组各题项得分比较,差异有统计学意义(P3.00;A、B卷各题项与总分呈正相关(P<0.01),但A卷中A23、A24题项与总分的相关系数小于0.450;A卷总体Cronbach'sα系数为0.899,B卷总体Cronbach'sα系数为0.885,均大于0.700;删除题项后Cronbach'sα系数无升高;A卷中A23、A24题项因素负荷量均小于0.450。结论血管性认知功能障碍自我辨识筛查方案(A、B卷)各题项具有较好的应答率、鉴别度和同质性。

关键词：认知功能障碍诊断性自我评价临床验证