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中国畜牧兽医 2010年第1期37卷 95-99页

作者：樊睿王志刚刘丑生罗军张桂香韩旭胡志帅徐丽梅西北农林科技大学动物科技学院杨凌712100 农业部全国畜牧总站畜禽牧草种质资源保存利用中心北京100193 山西农业大学动物科技学院太谷030801 甘肃农业大学动物科学技术学院兰州730070

采用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的数据库中选取的16对微卫星引物对中国9个地方山羊品种和1个引进品种(波尔山羊)的遗传多样性及群体结构进行分析。结果表明,在15个微卫星位点上共检测到159个等位基因;9个地... 详细信息

采用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的数据库中选取的16对微卫星引物对中国9个地方山羊品种和1个引进品种(波尔山羊)的遗传多样性及群体结构进行分析。结果表明,在15个微卫星位点上共检测到159个等位基因;9个地方山羊品种的Fst值为89.5%,说明89.5%的遗传变异存在于品种内,而10.5%的遗传变异存在于品种间;依据Da遗传距离构建UPGMA系统发生树,表明波尔山羊分开独自聚为一类,9个地方山羊品种分为两类;采用Structure软件对10个山羊品种的群体结构进行分析,可以将其分为4组。所得到的群体关系同聚类图得到的结果基本一致。

关键词：中国地方山羊品种微卫星遗传多样性群体结构

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中国9个地方山羊品种遗传多样性的微卫星分析

中国9个地方山羊品种遗传多样性的微卫星分析

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作者：樊睿西北农林科技大学

学位级别：硕士

本研究以9个中国地方山羊品种（河南牛腿、广丰、赣西、马头、宜昌白、湘东黑、福清、戴云和川东白山羊）和1个引进品种（波尔山羊）共计563个个体作为研究对象,采用联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的16对微... 详细信息

本研究以9个中国地方山羊品种（河南牛腿、广丰、赣西、马头、宜昌白、湘东黑、福清、戴云和川东白山羊）和1个引进品种（波尔山羊）共计563个个体作为研究对象,采用联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的16对微卫星引物,以ABI3100-Avant全自动基因序列分析仪为平台,结合荧光-多重PCR技术对10个山羊品种的遗传多样性进行分析研究,为我国地方山羊遗传资源的合理利用及保护提供依据,实验结果如下: 1.16个微卫星位点在这10个品种中共检测到162个等位基因,其中15个微卫星位点的等位基因数大于4个,故采用15个微卫星位点进行分析。等位基因数目最多的是DRBP1,共检测到16个等位基因,ETH10和SRCRSP3检测到的最少,为6个等位基因。不同品种中相同微卫星位点的等位基因的分布规律不同。 2.哈代-温伯格平衡检验结果显示:每一个品种在2-8个位点上偏离哈代-温伯格平衡（P＜0.05）,15个微卫星位点中,只有DRBP1在所有的品种中偏离哈代-温伯格平衡。 3.15个微卫星位点在10个山羊群体中,除了ETH10微卫星位点在福清山羊和戴云山羊两个品种中没有多态性,其他14个微卫星位点在9个地方品种和引进品种中均呈现多态性。10个山羊群体的多态信息含量（PIC）在0.4429-0.6442之间,观察杂合度的范围在0.3732-0.6442之间,期望杂合度的变化范围在0.5040-0.6890之间。 4.F-统计检验结果显示:9个地方山羊品种在15个位点上的亚群体固定指数（Fis）的平均值为0.113,反映了9个山羊群体存在一定程度的近交。Fst的平均值为0.105,说明89.5%的遗传变异存在于品种内,而10.5%的遗传变异存在于品种间。群体间的基因流（Nm）在0.878-20.583之间变动。 5.根据Nei氏标准遗传距离（DS）和DA遗传距离进行系统发生树的UPGMA法聚类和N-J法聚类,结果表明,图（DA,UPGMA）较为可靠。马头山羊和宜昌白山羊首先聚为一类,然后是川东白山羊加入,赣西山羊和湘东黑山羊作为一类加入,然后河南牛腿山羊和广丰山羊依次加入,福清山羊和戴云山羊聚在一起作为另一类加入。最后,9个地方山羊品种同波尔山羊聚在一起。 6.用Structure软件对10个山羊品种的群体结构进行分析,可以将其分为4组。所得到的群体关系同聚类图得到的结果基本一致。

关键词：中国地方山羊品种微卫星遗传多样性群体结构

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