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基于线粒体基因组的东方鲀属系统发育学及群体遗传学

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水产学报 2020年第11期44卷 1792-1803页

作者：周志雄刘波宫杰白玉麟阳俊逸徐鹏厦门大学海洋与地球学院福建省海洋生物遗传育种重点实验室福建省水产研究所

为了探究东方鲀属内系统发育关系,本研究首次基于群体尺度对东方鲀属物种进行系统发育分析。利用线粒体基因组,在包含10个种的124尾东方鲀中,挖掘了1 488个单核苷酸多态性(SNP)位点和4个插入缺失(INDEL),使用这些遗传变异位点进行了系... 详细信息

为了探究东方鲀属内系统发育关系,本研究首次基于群体尺度对东方鲀属物种进行系统发育分析。利用线粒体基因组,在包含10个种的124尾东方鲀中,挖掘了1 488个单核苷酸多态性(SNP)位点和4个插入缺失(INDEL),使用这些遗传变异位点进行了系统发育及群体遗传学分析。发现网纹东方鲀与铅点东方鲀可能是同种异名,且二者形成的姊妹群位于东方鲀属基部;暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、菊黄东方鲀与双斑东方鲀各自亲缘关系较近。此外,实验发现了4尾可疑的双斑东方鲀和菊黄东方鲀杂交个体,以及2尾可疑的横纹东方鲀杂交个体。遗传多样性方面,弓斑东方鲀遗传多样性最低。此外,实验在10种东方鲀中共找到595个种间特异性SNP位点。Ka/Ks分析表明,nd6基因的Ka/Ks最高(平均为1.19),说明在东方鲀属中nd6可能经历了正选择,而ATP合成酶基因可能在东方鲀适应淡水环境中受到选择。研究表明,东方鲀属内系统发育关系较为复杂,且在野生环境下东方鲀物种间广泛存在自然杂交现象,该研究为东方鲀物种快速鉴定提供可靠的分子标记,加速东方鲀属系统发育研究进展,并为东方鲀野生种质资源保护提供了理论依据。

关键词：东方鲀线粒体基因组单核苷酸多态性标记系统发育 Ka/Ks

东方鲀生长激素基因进化树构建及其遗传多样性研究

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东方鲀生长激素基因进化树构建及其遗传多样性研究

作者：黄军扬州大学

学位级别：硕士

生长激素(Growth Hormone,GH)能使鱼增进食欲,提高饲料转换率,刺激鱼的体重和体长增长,促进发育,参与生长代谢调节。本研究基于畜禽、鱼类生长激素基因方面的研究,参照GenBank数据库中红鳍东方鲀和其它近缘物种的生长激素基因序列,设计... 详细信息

生长激素(Growth Hormone,GH)能使鱼增进食欲,提高饲料转换率,刺激鱼的体重和体长增长,促进发育,参与生长代谢调节。本研究基于畜禽、鱼类生长激素基因方面的研究,参照GenBank数据库中红鳍东方鲀和其它近缘物种的生长激素基因序列,设计了两对引物扩增出了暗纹东方鲀GH基因,构建了东方鲀生长激素基因的进化树,确证了该基因在进化史中的地位,另外以暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)、红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、星点东方鲀(Takifugu niphobles)共82个个体为对象,运用PCR产物电泳检测、单链构向多态性(SSCP)技术和克隆测序技术检测到了GH基因的长度和序列多态性。研究结果如下:1、暗纹东方鲀GH基因含有6个外显子和5个内含子,编码196个氨基酸。2、从GenBank数据库中得到的24种脊椎动物的生长激素基因的mRNA序列以及氨基酸序列,通过Clustal W排列,用UPGMA法构建了GH基因的分子系统树。在UPGMA一致树中,25种脊椎动物分为两大类:第一大类包括野猪、狗、猫、褐鼠、小鼠、绵羊、牛、鸡、鸭、蝾螈、鳗鲡、鳝鱼和人;第二大类包括暗纹东方鲀、红鳍东方鲀、斑马鱼、草鱼、大比目鱼、大马哈鱼、斗鱼、杜父鱼、鲋鱼、金鲈、鲤鱼和鲶鱼。第一大类中,哺乳动物(猪、狗、猫、褐鼠、小鼠)先聚为一类,逐次与反刍动物(绵羊、牛)、家禽(鸡、鸭)、爬行动物(蝾螈)、鳝鱼、人以及鳗鲡聚为一大类。第二大类中,杜父鱼与金鲈首先聚为一类,然后逐次与斗鱼和东方鲀(暗纹东方鲀和红鳍东方鲀)聚为第1类;斑马鱼与草鱼,鲋鱼与鲤鱼各自先聚为一类,然后与大马哈鱼和鲶鱼聚为第2类。3、在GH基因内含子2中,存在9种长度类型,分别为A、B、C、D、E、F、G、H、I,变异频率达到24.22%。对这9种序列进行比对分析,发现9种长度类型A、G、T、C的平均百分比为17.15%、20.77%、37.38%、24.70%,其中G+C(45.47%)含量与A+T(54.53%)的含量差异不是很大;9种序列分别长351bp、327bp、319bp、303bp、295bp、291bp、287bp、283bp和271bp,引起长度变化的主要原因是短串联序列TCTG的重复次数(重复次数从20到40不等);发现4个突变位点,其中3个转换位点为83(C-T),101(A-G),296(G-A),一处颠换位点103(C-A)。用UPGMA法构建分子系统树,发现DD与II首先聚为一类,然后依次与GG、AA聚为一大类,BB与CC,EE与HH分别聚为一类,最后再与FF聚为一大类,由此可见GH基因内含子2在品种间的差异远大于品种内差异。4、在GH基因内含子5中,扩增的片断长度有差异,其中AA基因型长353bp,BB基因型长360bp,CC基因型长337bp,DD基因型长327bp,经Clustal W软件排列生成394个核苷酸位点,变异位点数为7个,占总位点数的1.77%。引起长度变化的主要原因是第28位A缺失,193-195位ATGATG缺失,244位G缺失,274-284位TGGTGAAGATG缺失,312-320位ATGATGATG缺失。发现7个突变位点,其中1处颠换即位点251(T-A),6处转换即位点181、190、268、251、262、271(C-T),颠换频率14.29%明显低于转换频率85.71%。5、在GH基因3′非翻译区存在两种长度多态性,分别为320bp和317bp,与GenBank (登录号为:FRU63807)的序列(316bp)有差异;共检测到6种基因型,分别命名为aa、bb、ab、bc、cd、dd,变异频率达4.36%,其中在暗纹东方鲀中检测到四种aa、bb、ab、bc,cd和dd基因型分别只在于星点东方鲀和红鳍东方鲀检测到;7个突变位点中有1处颠换即位点212(T-G),6处转换即位点120、180、227、265、287(C-T),和位点199(A-G)。6、在红鳍东方鲀、暗纹东方鲀和星点东方鲀这三个种中经过哈代-温伯格平衡鉴定,发现都不处于平衡状态;另外从基因杂和度、多态信息含量和有效等为基因数分析,在intron 2中具有较多的遗传学意义,其它位点的三个值都很低。

关键词：东方鲀生长激素基因进化树单链构象多态性遗传多态性

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对我国4种东方鲀营养价值的评价

中国水产科学 1999年第4期6卷 90-94页

作者：卢敏德葛志亮张纪顺姚建敏江苏正大特种水产有限公司!扬中212000 江苏漕湖渔工商实业公司!吴县215144 苏州大学水产学院!苏州215151

为科学评价河鲀的营养价值，对我国主要４种东方鲀肌肉、肝、睾丸进行了１５项营养成分分析比较。３年研究结果表明：４种东方鲀均富含高蛋白质、高氨基酸等营养成分，出肉率３４．３２％～４６．０７％，可食率３８．８０ ... 详细信息

为科学评价河鲀的营养价值，对我国主要４种东方鲀肌肉、肝、睾丸进行了１５项营养成分分析比较。３年研究结果表明：４种东方鲀均富含高蛋白质、高氨基酸等营养成分，出肉率３４．３２％～４６．０７％，可食率３８．８０％～６５．２６％，肌肉含蛋白质１７．６３％～１８．７０％、脂肪０．３０％～０．５６％，肝脂肪含量高达４７．４８％～４９．１０％，肌肉、肝、睾丸中氨基酸种类俱全，尤以肌肉中含量高（２．７２９ ×１０５ｍｇ／ｋｇ）；必需氨基酸与鲜味氨基酸含量分别比鳜鱼、对虾、鲜贝等名贵水产品高２．４９ ×１０４～５．８３ ×１０４ｍｇ／ｋｇ和２．１２ ×１０４～４．５１ ×１０４ｍｇ／ｋｇ。各项营养成分均以暗纹东方鲀居首，营养价值最高。

关键词：东方鲀营养价值营养成分

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东方鲀几种常见病害及防治措施

科学养鱼 2022年第10期44卷 48-50页

作者：李水根福建省水产技术推广总站福建福州350002

随着养殖规模的扩大,东方鲀养殖病害时有发生,给养殖业造成较大经济损失,制约了东方鲀养殖业健康可持续发展。因此,病害防治是东方鲀养殖的关键技术,本文对近年东方鲀养殖过程中的常见病害及防治措施进行了概述,以期为东方鲀的健康养殖... 详细信息

随着养殖规模的扩大,东方鲀养殖病害时有发生,给养殖业造成较大经济损失,制约了东方鲀养殖业健康可持续发展。因此,病害防治是东方鲀养殖的关键技术,本文对近年东方鲀养殖过程中的常见病害及防治措施进行了概述,以期为东方鲀的健康养殖提供参考。一、细菌性疾病1.细菌性皮肤溃烂(1)病原:哈维氏弧菌等。(2)主要症状:病鱼体色发白、游动缓慢、摄食困难,口角、表皮等部位溃烂(图1),溃烂周边皮肤发红,鳍条缺损,肾脏、肝脏、脾脏充血。

关键词：细菌性疾病哈维氏弧菌东方鲀皮肤溃烂养殖病害健康养殖鳍条养殖过程

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东方鲀营养需求研究概况

内陆水产 2008年第7期33卷 28-31页

作者：张春晓王玲集美大学省高校水产科学技术与食品安全重点实验室

本文综述了东方鲀对蛋白质和氨基酸、脂肪、糖类、矿物质和维生素营养需求的最新研究进展,以期为东方鲀营养学研究和饲料开发提供参考。

关键词：东方鲀营养需求饲料

东方鲀属主要经济鱼种繁育养殖、育种和基因研究现状

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东方鲀属主要经济鱼种繁育养殖、育种和基因研究现状

第三届全国现代生态渔业可持续发展交流研讨会

作者：马爱军陆丽君陈超王新安孟雪松中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室上海海洋大学水产与生命学院大连天正实业有限公司

作者叙述了东方鲀属(Takifugu)鱼类的分类以及主要经济种红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)等的养殖和育种相关研究现状,重点叙述了红鳍东方鲀纯种培育以及QTL定位辅助育种相关研究进展。此外,还就红鳍东... 详细信息

作者叙述了东方鲀属(Takifugu)鱼类的分类以及主要经济种红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)等的养殖和育种相关研究现状,重点叙述了红鳍东方鲀纯种培育以及QTL定位辅助育种相关研究进展。此外,还就红鳍东方鲑相关的RFLP标记、微卫星标记以及ISSR标记在遗传多样性和亲缘关系的分析应用作了叙述,并分析了白介素基因、主要组织相容性复合体

关键词：东方鲀育种分子标记基因

来源： cnki会议评论

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东方鲀生长激素基因3′-UTR多态性分析

生物技术 2006年第5期16卷 9-13页

作者：黄军严美姣程金花束婧婷许盛海陈国宏扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009

以暗纹东方鲍(***)、红鳍东方纯(***)、星点东方鲍(***)共82个个体为对象,运用单链构向多态性(SSCP)技术和测序技术分析生长激素(Growth Hormone,GH)基因3’非翻译区的多态性。结果表明3个群体中3’非翻译区存在两种长度多态性,分别为32... 详细信息

以暗纹东方鲍(***)、红鳍东方纯(***)、星点东方鲍(***)共82个个体为对象,运用单链构向多态性(SSCP)技术和测序技术分析生长激素(Growth Hormone,GH)基因3’非翻译区的多态性。结果表明3个群体中3’非翻译区存在两种长度多态性,分别为320bp和317bp,与GenBank(登录号为：FRU63807)的序列(316bp)有差异；共检测到6种基因型,分别命名为aa、bb、ab、bc、cd、dd,变异频率达4．36%,其中在暗纹东方纯中检测到四种aa、bb、ab、bc,cd和dd基因型分别只在于星点东方纯和红鳍东方纯检测到；7个突变位点中有1处颠换即位点212(T→G),6处转换即位点120、180、227、265、287 (C→T)和位点191)(A→G)。

关键词：东方鲀 GH基因 3'非翻译区 SSCP 多态性

暗纹东方鲀、菊黄东方鲀和条纹东方鲀乳酸脱氢酶的比较研究

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浙江海洋学院学报（自然科学版） 2005年第2期24卷 114-117页

作者：胡庚东尤洋陈家长吴伟瞿建宏范立民马晓燕中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法分析比较了暗纹东方鲀、菊黄东方鲀和条纹东方鲀的乳酸脱氢酶同工酶在不同组织中的电泳酶谱谱带的差异,结果表明:三种河鲀的心脏和肌肉组织都出现1条酶带,眼睛组织都有4条酶带,菊黄东方鲀和条纹东方鲀的大... 详细信息

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法分析比较了暗纹东方鲀、菊黄东方鲀和条纹东方鲀的乳酸脱氢酶同工酶在不同组织中的电泳酶谱谱带的差异,结果表明:三种河鲀的心脏和肌肉组织都出现1条酶带,眼睛组织都有4条酶带,菊黄东方鲀和条纹东方鲀的大脑组织都出现4条酶带,而暗纹东方鲀的大脑组织却只有3条酶带;三种东方鲀的肝脏中都有5条LDH酶带,但酶带的分布却有着显著的差异,菊黄东方鲀和条纹东方鲀酶带分布比较相似。从LDH酶带迁移率可以看出,三种东方鲀眼睛和大脑组织中乳酸脱氢酶(LDH)酶带迁移率略显差异,但差异不显著(p>0.05),在大脑中,菊黄东方鲀和条纹东方鲀比暗纹多出现一条酶带(该酶带的迁移率为0.118)。上述结果表明淡水养殖的暗纹东方鲀与海水养殖的菊黄东方鲀和条纹东方鲀具有一定的差异性。

关键词：东方鲀聚丙烯酰胺凝胶乳酸脱氢酶迁移率

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中国东方鲀属鱼类命名历史和名称辨析

水产科技情报 2016年第4期43卷 214-217页

作者：纪元中国农业大学烟台研究院山东烟台264670

为规范鲀科鱼类命名,通过查阅、比较国内外的参考资料,对鲀科鱼类近代科学命名的历史,东方鲀属的建立和命名以及几种常见东方鲀属鱼类分类及命名的问题进行了研究和辨析。认为东方鲀属Takifugu的属名应终止"Fugu"和"多纪鲀属"的使用;暗... 详细信息

为规范鲀科鱼类命名,通过查阅、比较国内外的参考资料,对鲀科鱼类近代科学命名的历史,东方鲀属的建立和命名以及几种常见东方鲀属鱼类分类及命名的问题进行了研究和辨析。认为东方鲀属Takifugu的属名应终止"Fugu"和"多纪鲀属"的使用;暗纹东方鲀的学名应由***恢复为***;假睛东方鲀***与中华东方鲀***为同物异名,***为有效种名;虫纹东方鲀***等同于辐斑东方鲀***,***为有效种名等。建议加强学术公开和交流,从而促进此类命名问题的进一步解决。

关键词：东方鲀学名分类